RnoINT0031930 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000010253 | Cd163
Description
CD163 molecule [Source:RGD Symbol;Acc:1310382]
Coordinates
chr4:156767018-156778772:+
Coord C1 exon
chr4:156767018-156767338
Coord A exon
chr4:156767339-156778460
Coord C2 exon
chr4:156778461-156778772
Length
11122 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ACGGTGAGT
5' ss Score
11.45
3' ss Seq
TCTGATTTCTTTTTTTCCAGACA
3' ss Score
9.05
Exon sequences
Seq C1 exon
AGTTCATGTCTCTGAGGCTGACCAATGAAGCCCACAGAGTGAACTGTACAGGCCGTCTGGAAGTGTTTTACAATGGTACATGGGGCAGTATTGGCAGCAGCAATATGTCTCCAACCACTGTGGGGGTGGTGTGCCGTCAGCTGGGCTGTGCAGACAATGGAACAGTGAAACCTACATCTTCAGACAAGACACCAACCAGGCCCATGTGGACAGATAGTGTGCAGTGTCCAAAAGGAGTTGACACTTTGTGGCAGTGCCCCTCATCACCTTGGAAACAGAGACAAGCCAGCCCCTCCCAGGAGTCCTGGATTGTCTGTGACG
Seq A exon
GTGAGTATCCATTTTCAACATGAAATTTCCATTCTACCACCCCCCTCTGGCTGGTTTTTACTGGTAAGCACTCCGGTGCTTAGTTGTGGCCCTAATTTTTAACCTTTTATTTATCTATTCAGCAAGATCATATATTAATAGTGACATTACAATAAAATACCTGGTACACTTTGAAATGTTCCATAGCTTTCAAAATTAAAATTTTTTAAAGTTGTTTTGAAAACGTCAGGGTTTTTTTTTTTTAATTATCTGTAAAGCTTTCTTTAAAGAAGCTTAAAATCTCTCAATCGTCTGTATTTGCAATATCAAAATAAAGCATCTTTATTAAGAGTGAAGACAGAGAGTGTAACCATAATTTTTACAAGGCAAAACCAAATTCTAACAGTGTAAACTATTTAGTTTCCACAATCAATACAAAGTTTAGCTTCCCAGAAGAAAAGTTCTTATATATGAATACATGTAGGTACAACTATAATACCTCTTATTTATTAAAAAAAAACTAGTTTTTAAGACAGGGTAGAAATTATATAAAATGTTATCCCAATTTGAAAGTATCTTTGGACACCTGTTTCCTTGGTTGCCTCTTGCCATGTGTTACTGCCCAGAATGGCTCCAACCCTAAGTTAAGAGTTTTCAGTTAACTTTTTGTTACAAATGTTACAGATTTTTAACCATACCCAATATACATAACATAGTAATCTCATACATTTCAGAGCAGGCAAAAACAAACACATAGTGACAACGTACACTATACAGTCAAAACAGTCAGACAAAACTTTTCTTACTTTCTCCAGCTGTAATTTCAAGAGAAGAGGCTACCTACTGAATCCAATTCCCATGGACCCCGTGGTTCTGTAGCGAGAGTAGCCACCGGCTTCCTGACCGGACAAAGCTGACGAGCTGTTCATGCAGCTTGAACAGCAGCCTGTACAAACGCCAACCACCCTTCCACCCCACTCCCAGCTTCGCTGTCAGCTTGATCCAGGGGAAGAGGGTGGGGCTATGCCTGTAGCGCTCAGCTCCTAATTGCGGGTGCGGGGCTCTAAGAGCAGTACCAGTTTAATCAGTTTTTGTTGTCCCAATTCAGCCTCTTTTTTTTCTGAAAATACTTGAGATGGCTTAAGACTAAGTCAAGGGGTGAATGCTCAGCAGATGAAGTATGGCCCTTTTTTTTTTTCAGAATATGAAACAGAGCAACAATCAAGCTAAACGAAACTATAAACACAAATTGACAGACCTGGACAGTCTGGCATGCCCAAAACCAAGTGCTATCCCAATGGGAACCAATATAGGGCAGGATGTCTTAGGTCCATTTCTGATCGTATGTCCAATTTCTCCTTTCCTGGGTCCCAGACATGTTCCAACCAGAAATCAGAATACAGATATAAGCTTACTTCTGATTGGTGTTTGGTTCCCAGCCAGTGCATCAAATGTAAGGGTTCAAAAATCCAAAATGCAAGCAGGAGCAAGAGTTCACACAAAGCCAGATCCTTATTTGAATTAGGCAGCAAAAACTGACGGGCACAACAGACTCAGGAGCTGACTGAATCTTCAAACGTTTATCCTAGTGAGTATTTACGCAGACGATAAAAGTTTATCATAAGCAGGCCACTACTGATTGATCAGAGCTGCAGAACAAATTAGAGGGCTGAACTGCGGCCTTCCCCGTCCCCCTCCCAGAGCCAGACCCTCCCTCCCCTCCCCTTCTCCCTCCCTCTCCCAGAGCCGGAATGTTAATTTTTTTTTAAAGCTCCAAACCACAAACATCTGCGCCAAGTTTTCCCACCAGTAATGATTTAGGGGTAGAGGACGTCCTTAGGAACATGTCTTTGTGGTACACTTATACGGTTCCGTTGATTATTCAACTGTGGCAACTTGCCTAAGATTCTTGTCTCAGCTTGTCAACCATAATGTCAGTTACCCATATGCATGTCTCTTTCTGCCAAGCAGGATGTCAGTTACCCAGGGAGGTTTTAGGAACTTAAACTTTATTTGGCCCCTATTCAAAATGGAGATTTGATTCAAAATGGATTCAGTTTGGTTTCTTCTTGCATCCACCTCCTGAGAAAACATGAGATTTTATTTCCCTGTTCAAAACCTGGCTTGACTTGTTAGGTCTCATTAAGCAGAGATGGGTAACTTCCAGGTACTACTTAGAATTGAAATGGTTGGTTTTATGTGATTGTTATCTGTATATATGCACATACAAGGTCAGAGTGGTCATTATTCCAGATCTTCATGTGCATGTACTTGAAAGTTCTATTCAATCGTTTTCTCTAAGAAAACCAAGAAACAGAGAATGCCTGATTGATAAATAGATCATTAAAAGGCCTACTTTCCTTTCCCTGCATTAATTTCCAAATAGTTAACCTTGCTACACTGATGATCAGGCAAAACTCAGAATGGTCAGTCCTGAACTATCTTTTCACTATGCATCTGCTTAAGCTAGGAGCCTGATGTTTCTGTCCACATCACTTTTGCCCATGCGAGGAAGTTTAACTTTCCACGTGATTCACGTTAACTTCGTTCACCGGCAGTTTCTTGGGTCACACTATGATTCTTTCAAAATAACATCTTCCACAGTTCTTTGGAAATTCCATGCTGTGTATTTCGATCAGATCTGCTCCTCTGGACTCCTCCCAGACCCACCCCCACCCCTCTATGTACCCAACCTTGCTGTCTCTTGTATTTTTATAACCCATTAAAAAATCCGAATACTCATGGGTGTGGGTGTCTTCCCAGGGTTTACACCCTTTAAGAAAATGATCATCCCTCTCCCAGGACCTATGGGTTACTGACAGATTCTCAGCTGCAGGGAGACTTCACACCCACCTCTCTTCTCCATGCTGGAATTGTTGTCTAGCTTGAACTTGCACAGGTCTGGTGCATGTGGTCATGAATGCTATGAACTCACATGTGCAGGTATCCTGTTGTATCCAGAATATCCTGTCTCCCTGTAGTCACTCACCATGTTTGGATCTTACCATCTTTCCATCCCATCTTTGGCAAAAACCCCTGAGCCTTGAGGAAGGGGCTATAATATAGACGTTCTATTTAAATCTTAGAAGCGTGGTATCTCTTACTCTATGCTTATTGACAAGTTATATGTCTCAGTTACCCTCCCCATACTCTTTCCTCTACCCTGCCCTCCCATTCCACACCCGATTTAACCCTTCCTTTTCCCCTATTCCTGTTTGCCCTTCTGTATCGCTGCATTCTATCTCCCCGCCAATGAAATAGCCCCCTCCTCAAGGTCCCATTCTAGTTTTCCGACATCGATGGGTCTCTCAAATGAAGTACACATAGCTAAAGACTCAAAGCAGGTGGTGTTTGTCTGTGTGGGTTGTTAACTCACACAGGACGATTGTTTCTAGCTACTTCTATTTACCTGAAATGATTATAATTTCATTTTTCTCACAAGCCAAAGAATATCCCATTGTGTAAATGTACCACCTTTTCATTTTTCTATTCATCCAGTGGTACACAAATAAGTTGGCTCTATTTCCCTGGTTATTATGATTAGAGTAGCAATAACTATGGATGACCAAGTATCATTATAAGATATAGGGGGCCTTTGTGTATATGCCCAAAAGTGCTATCACGATATCACCTGGTAAATCTATTTCCAGCCTTTTGGGAATGTTCACATTGATTTTCATAGTGTCTGCACGAGGTTACTCTCTTACCATCATTGAAAAAATGCCCCCCTTTCCCTAAACCCACACCAGGATCCACTGTCATCTGCTTTGTTTTGTTTTATTTTTAATTTTAGCTGTTCTGAGTGAGGTAAGAGGAAATCTTAATGTAGTTCATATTTACATGTCCCTAGTAACTTGGGATGCTAAATCTTTTCAAATTATTTCCCAGCTATTTTCACCTCATGTTTTGAGAATTCTGTTTCATCCCTCTCCCTGGATTTTTTAACTTTTTATTGGATATATTTCTTTAATTACATTCCAAAGGTTATTCTCCTGCATGGTTTCCTGTCCATTAACCCCGGTTTTCCTTCTCCTGCCCCTCCCCCATACAGGTATTCCCCCTATACAGCCCCCTTATTGCCCCCATATTCCCCTGCACTGGGGGTACAACCTTGGCAAGACCAAGGGCTTCCCCTTCCCCTGGTGTCCCAACAAGGCTATTCTCTGCTACATATGCAGTTGGAGCCCTGGGTCAGTCCATGTATAGTCTTTCTGTTGTGGTTTAATCCCTGGAAGCTCTGGTTGTTTGGCATTGTTGCTTTTATGGGGTTGCAAGCTCCTTCAACTCTTTCAATCCTTCCTCTAATTCCTCCCAAGGGGGTCCTATTCTCAGTTCGATGGTTTGCTGCTAGTGTTGACCTCTGTATTAGACATGCTGTGGATGTGTCCCTCAGGAGAGATCTATATGCAGTCCCTTTCAGCATGTATTTTCTAGCGTCATCAATCTTATTTAGTTTTGGTGGCTGTATATATATGGCCCACATGTGGGTCAGGCTCTGAATGGCCATTCCTTGAGTCGCTGCTCTAAACTTTGCTTCCATATCCCCTCCTATAGATATTTATTTCCCCTTTTAAGAAGGAGCGTGAGCATCCACATTTTGGTCATCCTTCTTCTTGAGCTTTGTGTAGTCTGTGGATTGCATCGTGGTTAATTCGAGCTTTATGGCTAATATCCACTTATCAATGAGTGCATACCAAGTGTATTTTTCTGTGATTATGTAACCTCACTCAGGATGATAGTTTCTTGTTCATTCCATTTGCTTATGAATTGCATGAAGTCGTTGTTTTTGATAGCTGAGTAGTACTCCATCGTGTAGATGTACCATATTTTTTAATCCATTCCTCTGTTGAAGGGCATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTAATATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCATGTGCCTTTGTTGTATGTTGGAGCATCATTTGGGTATATGCCCAAGAGAGGTTTAGCTGGGTCCTCAGGTAGTGAAATGTCCAATTTTCTGAGGAACCTCCAGACTGATTTCCTGAGTTATTATACCAGTCTGCAATCTCACCAACAATGGAGGAGTATTCCTCTTTCCCCACATCCTGGCCAGCATCTGCTGTCACCTGAGTTTTTTATCTTCACCATTCTGACTGGTGTGATGTGGAATCTCAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGACTAAGGATGTTGAACATTTCTTTAGGTGCTTTTTGGCCATTCGATAATCCTCAGCTGAGAATGTTGTGTTTAGCTCTGGACCCCATTTCCTAAGAGGGTTATTTGTCTCTCTGGAGTCTAACTTCTTGAGTTCTTTGTATATTTTGGATATTAGCTCTCTATCGGATGTAGGATTGGTAAAGATCTTTTCCTAATCTGTTGGTTGCCGTTTTGTCCTAATGACAGTGTCTTTTGCTTTACAAAAGCTTTGCAGTTTTGTGAGGTACCACTTGTCAATTCTTGATCTTAGAGCATTAGCCATTGGTGTTTTGCTCAGGAAATTTTCCCAAGTGTCCAAGTGTTCGAACTCTTCCCAAATTTTTCTTCTATTAGTTCGAGTGTATCTGGTTTGATGTGGAGGTCCTTGATCCACAAGGACTTAAGCTTTGTACATGGTGATAAGAATAGATTGATTTGCATTCTTCTACATGCTGACCTCCAGTTGAACCAGCACCATTTGTTGAAAAAGCTATCTTTCTTCCCTTCGTGGTTTTAGCTCCTTTGTCAAAGACCAAGTAACCAAGGGTGTGTGGGTTCATTTCCTGGTCTTCAATTCTGTTCCACTGGTCTATCTGCCTGTCTCTATACCAATACCATACAGTTTTTATGACTGTTGCTCTGTAATACTGCTTGAAGTCAGGGATGGTGATTCGCCCAGAACTTCTTTTATTGTTGAATATACTTTTCCCTATCCTGGTTTTTTTGTTATTCCAAATGAATTTGCAAATTGCTCTTTCTATCTCTATAAAGAATTAGTAAGGATTTTGATGAGAATTGCATTGAATCTGTAGATCGCTTTTGGCGAAATGGCCATCTTTACTATATTAATGCTCCCAATCCATGAGCATGGAAGATCTTTACATCTTATGAGATCTTCCTCAATTTCTTTCTTCAGAGACTTGAAGTTATAGTCAGACAGATCTTTCACTTGCTTGGTTAAAGTCACACCAAGATATCTTATGTTATTTGGGACTATTGTGAAGGGCGTCATTTCCTTGATTTCTTTCTCAGCCTGTTTATCCTTTGAGTAGAGGAAGGCTACTGATTTGTTTGAGTTAATTTTATACCCAGCCACTTTGCTGAAGTTGTTTATCAGCTTTAGTAGAACTTTTGGGATCAGTTAAATATACTATCATATCATCTGCAAATAGTGATATTTTGACTTCTTCTTTTCCAATCTGTATCCCCTTGATCTCCTTTTGTTGTCTGATTGCTCTGGCTAGAACTTCAAGAACTATACTGAATAAGTAGGGAGAGAGTGGGCAGCCTTGTTTAGTCCCTGATTTTAGTGGGATTGCTTCAAGTTTCTCATCATTTAGTTTGATGTTAGATACTGGTTTGCTGTATATTGCTTTTACTATATTTAGATATGGGCCTTGAACTCCTAATCTTTCCAGGACTTTAATCATGAAGGGGTGTTGAATTTTGACAAATGCTTTCTCAGCATCTGATGAAATGACCATGAGATTCTTATCTTTGATTTTGTTTATGTAGTGGATTACATTGATGGATTTCTGTATATGGAACCATCCCTGCATGCCTGGGATGAAGCCTACTTGATCATGATGGATGATTGTTTTGGTGTGCTCTTGGATTCGGTTTGCAAGAACTTTATTGAGTATCTTTGTGTCAATATTCATAAGGGAAATTGGTCTGAAGTTCTCTTTCTTTGTTGGGTCTTTGTGTGGTTTAGGTATAAGAGTAATTCGGTAGTGCTCTGTCTGTTTCAATTTTGTGGAATAGATTGGATAGTATTAGTATGAGGTCTTCTATGAAGGTCTGATAGAATTCTGCAGTGAACCCATCTGGACCTGGGCTCTTTTTGGTTGGGAGACTTTTAATAACTGCTTCTAATTCTTTAGGAGTTATGGGGTTGTTTAACTGGTTTATCTGTTCCTGATTTAACTTTGGTACCTGGTATCTGTCTAGGAAATTATTCATTTCCTGCAGATTTTCCAGTTTTGTTGAAAATAGACTTTTGTAATAGGATCTGATGATATTTTTAATTTCCTCTGATTCTGTTGTTATGTCTCCCTTTTCATTTCTGATTTTGTTAATTTGGACAGACTCTCTGTGACCTCTGGTTAGTCTGCCTCAGGATTTATCTATCTTGTTGATTTTCTCAAAGAACCAATTCCTGTTTTTGTTGATTCTTTCTATGGTCCTTTTTGTTTCATTGCTTGATTTCAGCTCTGAGTTTGATTATTTCCTGCCGTCATTCCTCTTGGGTTTATTTATTTATTTATTTTTGTTCTAGAGCTCTTAGGTGTGCTGTCAACCTGCTGACATATTCTCTCTCCTGTTTCCTTTTGCAGGCACTCAGAGCTATGAGTTTTCCTCTTGGTACCGCTTTCATTGTGTCCCATAAGTTTGGGAATGTTGTATCTTCATTTTCATAAAATTCTAAGAAGTCTTTAATTTCTTTCTTTATTTCTTCCTTGACCAGGTTGTCCTTGAGTAGACCACTGTTCAACTTCCATGTATAGGTGGGCTTTCTGTCATTATTGTTGTTTTTGAAAACCAGTCTTTTTTTTTCTTTTTTTCGGAGCTGGGGATCGAACCCAGGGCCTTGCGCTTGCTAGGCAAGTGCTCTACCGCTGAGCTAAATCCCCAACCCCTGAAAACCAGTCTTAGTGCATGGTGATCTGATAGGATGCATGGGATTATTTCTATCTTCCTGTATCTGTTGAGGCCTGTTTTATAGATTATAAAACAGATTGACGTACAGATTATACGGTCAACTTTAGAGAAGGTTCCATGAGGTGCTGAGAAGTTATATCCTTTTGTTTTAGGATGGAATGTTCTATAAATATCTGTTAAATCCATTTGGTTCATAATTTCTGTTAGTTTCTCTATGTCCCTGTTTCTATGATCTGTCCATTGATGAAAATGGGGTGTTGAAATCTCCTACTCTTATTGTGTGAGGTGCAATGTGTGTTTTGAGCTTTAGTAAGGTTTCTTTTATGAATGTAGGTGCCTTTGCATTTGGAGCCTAGATATTTATGATTGAAAGTTCTTCTTGCTGGATTTTTCCTTTGATGAATATGAAGTGTCCTTCCTTGTCCTTTTTAATGACTTTAGGTTGAAAGTCAATTTTATTTGATATTACAATGGCAACTCCAACTTGTTTCTTCAGGCCATTGTGCTTGGAAAGTTGTTTTCCAGCCATTTACTCTGAGGTAGTGTCTGTCTTTTTCTCTGAGGTGTGTTTCCTGCATGTATCAAAATGCTGGGTCCTCTTTACATATTCAGTCTCTTTACATATCTATGTCTTTTTCTTGGGGAGTTGAGCCCATTGATGTTGAGAGATATTAAGGAATAGTGATTGTCACTTCCTGTTATTTTCATTGTTAGAGGTTTAGTTATGTTTGTTTGACTGTCTTTTGGTTTCATTTCGAGGAAGTTATATTCTTGCTTTCTGTACGGTGTAGTTCTCTCCTTGTGTTGGAGTTTTCCATCCATTATCCTTTGTAGGGTTGGATTTTTAGAAAGATAGTGCATAAATTTTGTTTTGTCGTGGAATATCTTGGTTTCTCCATCTATGTTAATTGAAAGTTTTGCTGGATACAGTAACTTGGGCTGGCATTTGTGTTCTCTTAGGGTATATATGACATCTGTCCAGGATGTTCTGGCTTTTATAGTCTCTGTTGAGAAGTCTGATGAAATTCTTATAGGTCTGCCTTTATATGTCACTTGACCTTTTTCCCTTGCTGCTTTTAATATTCTTTCTTTGTTCTGGGCATTTGGTGTTTTAACTATTATGTGATGGGAGGAATTTCTCTTCTGGTCCAATCTATTTGGAGTTCTGTAGGCTTCTTGTATGTTTATGGGAATCTCTTTCTTTAGGTTAGGGAAGTTTTCTTCTATGATTTTGTTGAATATATTTACTGGTCCTTTGAGTTGGGAGTCTTCACTCTCTTCTATAACTATTATCCTTAGGTTTGATCTTCTCATTGTGCCCTGGATTTCCTGTATGTTTTGGGCTAGGAGCTTTTTGCATTTTACATTATCTTTGACCGTTGTTTCAGTGTTTTCTATGGTATCTTCTGCCCCTTAGATTCTCTCTTCTATCGCTTGTATTGTGTTGGTGATGCTTGTCTCTATGGCTCCTTGTCTCTTCCTTTGGTTTTCTTTATCCAGGGTTGTCGCCCTTTGTGCTTTCTTTATTGTTTCTATTTCCATTTTCAATTCCTTCACCTGTTTGATTGTGTTTTCCTGTAATTCTTTTAGGGACTTTTGTGTTTCCTCTCTAAGGACTTCTACTTGTTTATTTGTGTTTTCCTACATTTCTCTAAGGGAGTTCTTTATGTCTTTCTTCAAGTCCTCCATCACTATCAAAAAATGTGATTTTAAATCTAAATTTTGATTTTCTGGTGTGTTTGGATATCCAGTATCCAAACCAGTATCTGGTGGGAGTACTGGGCTCTGATGATATCAAGTAGTCTTGGTTTCTGTTGCTTGGGTTCCTGCACTTGCCTCTAGTCATTGGGTTGTCTCTGGTGTTTGCTTGTCTTGCTGTTTCTGGGAGTGACTTGACCCTGCTGTACGCCTCTGTGTCAGCACTCCAGTAGAACTGCTTTCCTGTTTCTTTCAGCCTTTTCTGAGAACAGGTGCTCTGATTTCAGGTGTGTAGGTGCTCCTGGAGACTGTCTTCCAGCTCTAGGCACGGGCAGGAATCAAAGGGTCCTGCCCCTGATTGCTCGTGTAGGTCCTTGCACCCAGCAGGCACAGTTGGCACTATACGGTTCCCTCTTGGGTCTGGACTATGGGGAGAGGGTATTCTCCTCTGTCTTCTCAGGAGTATCCACACTTCTGAGGGTCCAGCTCTCTCCCCCAGGGGATTTGGGTGCAGGGAGCTGTTTGGCAAGATCAGTTCTGTCCTGGGCACAGACCAGAACCACTCGTACCCACGGTTGTCTGTTGCTATATCCCTGTGTCAGGTCCCCTTGGACCAGGAAAGTGGGTCGAGGTGTGCAGAGGTGGCAGTCTGTCCTTGCCCTGGTTTTTTAATTGGGTCATTTGTTTTATTGGCATTAGTTTTCTGAGCTCTTTGTGTATTCCAGATACTAGCTCCTTGTCAGGCTTATAGCCGGTAAAGATTGTTTCTTATGCTGTAGACTTCATTTTCACCAGGATAATGGTGTACTTTGTTGAATCGTTTTCTGTTCCATGTGGTCCCATTTGTCATCTGCTTGAATGAAAGGGCACATACTTTTATAAAAGAGAAATTTTATGAACAGTGTAGTATTTTAAAGCCTGCTTTAGTTTTTATATAATTTATTAATTCTTGGAGAGTTTCATACATGCATACAGTATATTTGGGTTATATTAACCCCTTGCACTCCTCCTCCAATGCCTCACAGATCCAGGTCCGTAACTCCCCTTCCAACTTCATGTCCTCTTTATTGTTTTGCTTCACAACCCACTCAGACCAGTCTGCTGCCCACGTACTCATGGATATAGGTTCATCTACTGAAACAAGGTCAACCTACCAGGGATCACATCCCCAAAGAAAACCGACTCACCAGCCTCCAAGAGCTGTCAGCTGCCAATACTTCCTCAGTCAGAGCGGGCACTTCCTCCCATCCCTGCTCCACCCTGAAATGTTGACTGGCTTGATTTTCTGCAGGTTACCAAAGCTGCTGTGAATGCAGTGGTCCTGTCATGTCCAGAAAAGATTGCTTTGCCTCCGTGTTTCTCAACCTCTGGACTTTACAATCTTCCCACGTCTTCTCCCAAGATGGTCCCTGAGCCTCAGAAGAGAGGAGTGTAATATCTCTCATTTATGGCTGTCACTTTCTGCACTGTGACCACTGCACATTGAATAGTTTTTAAAGCAATCAAACCTCCCTGTTTTGTAGCCTTTCAGCACCTCAGGAATAAGCCAGATGTCTCTGATTTCTTTTTTTCCAG
Seq C2 exon
ACAAAATAAGACTACAGGAAGGGCATACAGACTGTTCTGGACGTGTGGAGATCTGGCATAGAGGTTCCTGGGGAACAGTGTGTGATGACTCCTGGGATCTTAATGATGCTGAGGTTGCATGTAAGCAGCTGGGCTGTGGTCAAGCTGTGGAGGCACTAAAAGAAGCAGCATTTGGTCCAGGAACTGGGCCCATATGGCTGAATGAAATGAAGTGTAGAGGGAATGAGTCTTCCCTGTGGGATTGTCCTGCCAGACCATGGAGTCACAGCGACTGCGGGCACAAAGAAGATGCTTCTGTGAAGTGCCTCCCAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000010253:ENSRNOT00000068407:11
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.157 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0053013=SRCR=WD(100=89.8)
A:
NA
C2:
PF0053013=SRCR=WD(100=93.3)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]