RnoINT0041700 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000009172 | Cpvl
Description
carboxypeptidase, vitellogenic-like [Source:RGD Symbol;Acc:1563609]
Coordinates
chr4:84052309-84081155:-
Coord C1 exon
chr4:84080982-84081155
Coord A exon
chr4:84052492-84080981
Coord C2 exon
chr4:84052309-84052491
Length
28490 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTGAGC
5' ss Score
9.6
3' ss Seq
AGGGTGGGATTTCATTTCAGGTT
3' ss Score
5.92
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
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Protein Impact
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Features
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Other Inclusion Isoforms:
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Associated events
Conservation
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]