RnoINT0076631 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000007104 | Itpr1
Description
inositol 1,4,5-trisphosphate receptor, type 1 [Source:RGD Symbol;Acc:2933]
Coordinates
chr4:140248336-140268543:+
Coord C1 exon
chr4:140248336-140248405
Coord A exon
chr4:140248406-140268435
Coord C2 exon
chr4:140268436-140268543
Length
20030 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGT
5' ss Score
10.67
3' ss Seq
GCATGTTTTACTTTGTCTAGGCT
3' ss Score
5.25
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGCTGACTACAAAGGATTTGCATCCTTGGCTGGGAGTCCATTGGCTACAGAGTGCCTGACCTGGGTCAG
Seq A exon
GTGAGTGTGGGAGCTGAGTTCTGTAGTCAAGAATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTCCTAAGCATTTTGTAACTCCGCTTGTAACGTACATAGAGGTAGAGTAGGGAAGAGAAAGAAACTGTGGTCAAAATTGGTCATGGTCTTGAGTAAAGATCCAGTGACAGCTACTTTTGAAGGTTGCTTAGAATCGAAGCATGGGGGTAAAGGGGTGGTGGGTAAGCAACAGCAACAAGCAGTAAATTGCGGTAGATTGTAAAGTGGGTGGTCCCTTACCAGCCTGAAAGGCACCCTCATTATTTAGACTCCCAAAGATGCAGAACTTTTCGTTTGCCAAGATCCCTAAGCAAAAGTGAGATACTCCTCCCTTTCACAAACTGTCACTTGGTTCTGTTCTGTCGTGGGCTTTCACCACGTAACCAGAGTGGGCTGGGTTGCAAGAAATGAAAGCGACAAATTGAAAGAATGAGAACTTAACAGGAAGTAAGAGCTTAAAGAATACCACTGTAGCTTCCAGGATTTCACAGGAGCCACCTGCATATCAAGGAACCCAGCGTGCTTCTCTTGCTTTGGTACCTGTTCCCGGATGAGGGGCTGAGGGCAGTGTTTCTGTCAATATAATGACATTTATCACAGCCCATTCCTAGAAAATAAAGCCTCTCTCTGTAGGTACACAGACGCCCCTATGGTTTCAGGTTTGTCTATCAAGTTTTTTCTTCTAAAATGTCTGGTAATTGAGTAAACAACAGGTTAATAGGAGTGGGGAGCTGTGGGCAGCTGGTCCTTGGTAACTTCTTTAATGTCCTAAATATTTAGCTGTTCCCTGGGCTACAATCTTTGGGCTTTTCTAATTAGTGAATGAAAGCCAGATACTTCATTATGGTAGCACAGTGCTTTTGTTTCCTGTTGATAAGGTCCTCAGGAGTACTGGTGGAGTGGGAAACATTTGGATGGGAAGGCTAGTTCTCCTATGGACTAATGTCTGTGTTGATCAAAGAGGGGTCAGTCTTCTCTTTGAAGTATGCTACAGACACCGTTAACTGGTCCACAGACTCTTCTCTATCTTTTGCCTAAAAATAATGAGGCTGTCCCATTAGGTTAGAGCAAGCCAGGTGCAAAGCTGTATATCACAGAAGACCTTAGATACGGGTGAAGAAACCGAGATTCAGAATGAAGTCACTGGGCAGCCCAGGCAGTAATGTGTACCACTTGTGCTTAAGTTTATGGGGAGAGAGAGAGAGAGATGCTAGGAAAAATAGTGAACCCATTGCTCTTAATGCCTTAACTCTGATTTATGTCTCACCAACAATGTACCAGCTATTTAGTTTGATGTAAGAAGGAAATGATACAGCCCTTGGCAGGGATAAAAGAATGTAGTTATTTGTAGGAGGATTTAATGTTGGGCTGAATTCATGTTAGAAAAGCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGAAAGCTTGAATCAGGACAGTTAAGAAGGAAAACCAGAGGAAACCCAGTGTCTACGTGCAGTGTTAGTCCTGGCTCATAGTTGGAGTAGCTTTTGGTCATTCCCATCAAGGCACCTGAGCAGGTTGAAAGAGTCAGGTGTGTCTCTAGCTGAATAATTGGAAATCTTAAACTGCTTCAGTTCAACCTGTGGAATGTTGGTAGCTTGTCCTGTGGTCTCTGGTTTGCCTGGTTGCTAGTTGTATGCAGTGTTTTTCTTCTCCATTTCTTCTTCAGTCATGTGGATGTATGCATGTTATGAGTATACATTGAACGTATAATTTGCTCCTTGACTACATCAATTCGAAACAGAAAATCCCATCAAGATTTCCTTCTATCCGAGCAGGGCAAGTTCTTTATGTTCCGAAAGACTCACTCTGGCCTCTCCATCGAGGCCCATGAAAGTCACCGAGGTGCTATCACCCATTCAAACATGGCTCCTTTTGCCAGCCTTCCTTGAAGAATATGAGGCGAGGGGTGGCTTAGAAGAGAAATAGGTTAATGCCACAAGAACGATCTATTGACTTTGCCCTCCAAGTGTTTTCAGCTGCAAAAGCACTAGACTGTGGAGGTGGGGGGCAAGAGTGGGACGCCCTGGAACTAATTCAATGGTGTGCAAGGAATGGACTTGAGAAAAATTCACATGGCTTTTTAGCTCATAATGATCTCATGGAGTTTCTGTTGACTTTTTTTTTTTTAATACAAGCAGCTTTTTTAAAAACAGACCAAATGAAACAACAGATACCAAATATGAACAACAGACCCCCCCCCCAAAAAAAAATCTACCAAAATAAAAGCAGGCCTGGAGTTAGGTTTCTAGGTCAAGCTGTCCTTGGATACTTCTAATTAAGGAATCTACACAAGGACAGTGTCCTGTCTTGTCTGCTTTTGGTTTGATGTTTTAAAATATAATGCGTTTGCATTCGCAGATCTCTGATAACTAAAATTGCATGCAGTTGTGTTAGCTCTTTTTTTTTATTTTATTTATTTCTTTGCTGTTGAAGTTTGATGAATGAGATTAGGCTTGAAGTCAATGGTATGAATTACAGTGCTTTTATGGGTCATTCTTCCTGTCAGAGTGTCTGTCGTTCTGAGAACATTGCTGGTGAGGGATGAGCTGAATAAACTCCTGAAGCTACCACCTGGTAAACCATGACGTTCCCTAGGCTGGTCAGAGTTGAAGGCGGTTGGTGGCATCCATGGACCTCACAGACTTTCACCCTGTTAAAATTGTTTCAATTCAAGGGTTTTGTGTTGCTTACCCAACAGATTTCTTGAATACCTGCTATGTGCCAACTGTGTTCTAGGTGCTTGGGGTATGGCAAGTTGGTTCCTCAGGGGTTTACATTGCAGCTAGTAGGAAGCGATCAATGTAAACAACCAGGTAGTGTAGTAGGGCAGGTGGAGAGTGTTGTGAAATAGTCAAACAAGGAGGGGATGAGCAGAGAATAACGGTGGCCAAAGTGTGGAGGAACCAGAATCCTTGTGTATCGTTGGTGGGAATGCAAGAGGTAGCTCTTGGATATAACAGTATGGTAACTCCTGAAAATATGAAACAGGATTATTATAAGATTTGGCATTTCCATTTGTAGTTATCAGAGGAATTTAAAACAAGAACTTAAGGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGCTAAGAGTACTGATTGCTGTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAATTTCCGGCAAGCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGGATCTGATGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGATAGCAACAATGTATTCATATAACTAAAATAAATAAATCTTTTAAAACAAAAAACAAAAACAAAAGCCAACTTAAGCGTTTGTTTTACGTTGAAAGTTGCCTCATTAACCTATACCTAAAGGCCAAAATGCAACCTCAAAGTATCTATTATTACATGATTGAAAACCAAAGTGCTGTTCATGTGTTCAGTGAACTATTATGCAGCCCAGAAAAGGAAGGAACATGTTTCATAGTGTATTCAAACCATGAAAACGTTATGTAACTGAAAGAAGCCAGCCATCAGCAGATATATATTGTATGATTCTCATGGTGTGGAGTGTCCCAGATGAGTATACAGATTGATAGGGCCAGAATGTGGATTGATGAAGTATCAGGGGTTAAAGGAAGGGGAAGTTGAATTAATGGACACAGACTTTCTGTTTGTAAACATTAAAAATTTCTGGAAATTGATATGTATTACCCAAATAAAAAAATGAAAAAACAAAAGTTTGAAGCATGTTAAGGGTGTATTATGGGTTGGGGAGGCAAGGCAGGGTTCTTTGCTGTGGTGACATTTGAGGAGAGCTCTGAAGGAAGCGGGCCAGACAACCATGTAGATGCTCCAGGAGTCCAGAGTAGAAAGTGCAAAGGCCCTGAGTTGGAAGGAGGTGGGGTGTGTTGGAGGCAGGACTAGGAGACTGAGTGGCTGCAGGTAGGGAGCAGGGGTGAGGCTTGAGGTGAGGGGGTAGTCAAGGTCCAGTGACAAAAGCCGAATTTTGCAGATCAGCAGTTCTGAGGATTTCTGAACCCTGACGGGGTCCTCAGTGTGGTTTTCAGCATTGCTGAACTCCACTGTGCTCTCTAAAGAGACCGGCCAGGCTGGCAAGACCACATACCAGCTGGAAACTTGATACAGGGGGCATGAGGGAGGCCTAGATTTCCAGACTGGTTTGTCATGTGACATTTCCTGGCGTTAAGTAGGAAAGGAAGTCTCCTCTGCTGAAGAATAGAAGCTGCCTCTGCTTTGCTCAGCATGTTCTAAGAACCATCTGGTGGTCCTGGGGTCCCTGCCCTGTGGCCACCCTGCTGTCCACCAGATTTCACCTGGGGATGGCCTGACGATGAGAGCTATGTTCTCATCATCCTTGGGTATAAGAAGCTCGACATTAGTGATTCTCCTTGAAAGCGGGAAAGAGGCATGCCTTCACGGTGCAGAACTTAAATCCCTTGCTGCATCGCTACAAAGATTACGTGTTCATTGTCAAATGCTAGGAAGCAATGGACGAGCCACATAGCAAAACAATAACTCTGCCTCAGCATCCCACACTCAGTTCCTAGGCTTTTTACCATGTGTAAAAATGAGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAGGTCACTGACTGCTCTCCCAGAAGATCCAGGTTCAAATCCCAGCACCTACATGGCAGCTCGCAACTGCCTGTAACTGCCCGACACTGTCATGTAGACATACACACAGGCAAAACACCAATGCACATAAAGTAAAGGTAAATGAATAAATACAAATTTTAAAAATTAGATGTGTATTTGAGTTTCACAGTCGCAGCCCTTCCCAATCGCTCTCCTTCCTTTTGTTCACAGTTGAGTCTCTCTCCTCCCTAGAAATAGGATACCTGATGCCTGTATTTTTTTCCCTCCAAAGGTCTGTCTCTCTGCTGGTATTTCATTTCATTGAAAAAAGTTTGTTTTAATTTTATGGGTTCTGCCTGCATTTATAGAAGTGCACTGCACACATGCCTGGTGCCCTCAGAAGCCAGAACAGACACTTGTTCCCGTGAACTGGAGTCCAGATGGTGTGTGCCGTTGTATAGGTGGTGGGGACAGAGTCCCAGCCCACTGGAAAAGGAGCACGTGCTCATAACTGCTGAGCCATCCCTCCAGCCCCCGGGAAGGGAATTTATTTAAGTTATGACATATATGGAATGAGTAGAGTACAAAAGTACTACATCCTCCAGAGTTCGTCCTTATTGCACAATCCAAATTGGTGCATTTTGTCCTTTGAAGAAAAGGAAATGACAGTTGAGGTGTTGTTCACTGAATAACCTAATCCTGTGAAATAGGCACTCTCTGCTGTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTGTGTGCTTTAAATTTGTGCAAAGCAAGTATTTTGAGCTATCTCCCCAGCCCTGCTTACTTGCAAGGAAAACTTACTATAGAAGATGTCAAACATAAGCTAGCAGTATGTGTTGTGGGGTCTGCAAGGACCGGGAAAGGGTTCTGGATTTAATGGAAGTGGAGTTACAAGCAGTTGTGAACTGTACAGTGTAGGTGCTGGGAACCGCACTTGGGTCTTCTGTAAAAGCAGCAAGTGCTTTTAGCCACTGAGCTGCCTCTCCATCCTCAACAGTCGCTCCTTACTGCGTGGAAACCACTTTGTTCACCACGCTTGGTGCTCAGCTATTGCTAACTCACAGCTAATCTTGTTACGTCTGCATCTGAAAACACTATTTGGTTATTTTCAAGCCCATCTCAGGCGCACGGGTGCGTCTGTATTTCAGTGTGAATCCGTAGGATTTGAATTCTTTATGTAGGCACATAATGCAAGGCTTAAAAAAGTCTGTGGCCCTGGGTGCTGTCCTATGCAGGTGCTGGGGGAGGGAAGGCTGCTGGCATTCAGTGCACGGAACTGTGTTAGCTCAGAGACCTACTGTAGATCGGATTTTGGTAGTTAGATGTAAAGACTCAGTCCACGTCTGATTTCTTTTTTATTTTTGTTTGTTTATTTTGGCCAAATCTATTTTATGCCCTTCAGGGTCACAGCATTATCCATTTCAGAATATTGGCCAGTGGTGCCATTGCTGGGCATCCCTGCATATAGTATTCTTTAAAATTTCCCTGCGAGCTCACAGATTTAAGCATACTTTGTCTGCTTTTCTTCCTGTGGTTACTTCCCTCCCGCTTTCCCTCACCCTCCTCCCGTTGCTCATCTTTGGATACAGGGTTTCACTGTGAAGTCCAGATGGCCCTCAACTTGATGATCCTCCTGCCTCCCGAGTTCGTGGATTATGGTTGGGTGCCACTGTCGTTGTTATTGATATTGTTGATAACTATCTGCCGTTGTCATCGAGTTACTGATGTCAGTGTTCAAGTCGGGTCCAGAAACTTTTGACAAGACCTTGAGAGTTCCCATAGTTTTCTTGCTTTCCGTGTGACCAAATGTTCCAGGCTTCTCTTTTGTATTTCTCATCCCAGACCATGAATCACTGTTTTTTGTCAGGAAGCCCTTGTTCTTTTGAGAGGGAAATAATCACATTGAGAGACCTTTGCTTAGGACCACTTGCTTTCCTCTCTAGACAATACAAAAAACAAATAAGGAAGAGTTAGCACCTGAGTGCATCTTTCTCTGCCTGTTTGTCTTTCCCTTCTTCCTCCTTCTTCCTCTTTCTCTTCCTCCTCCTTTTCTAATTCCTCTTCCTTTTCTTCTTCTTTGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTTCTTTGAGACAGGGACTCACTGTTAGCTCCGGCTGTTCTGGAACTCACTATATAGTAAGCCTGGTCTCTTACTCACAGAGATCCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTACTGGGATTAAAGCCATGTACCCCTACCCCTGACCTGAATGTTTCTTAGTGACAGCATTTCCAAAATGTATTTAATATGTCTGTGTTTATCTCAAAAGATTCTGAAAATGATTTGACTTAAAAAATGACCATTTTAGCACATTCCTGGATAAACAAAAATGCTATCCATATCCCTTAATGGCTCCTCACCTATAGGTGGGGAAATCAAATTTGTGGGCCTTGCTCAGCTTTTGCACATATGTGAAGTAGGACGTATAGAAGACAGCAAGTGTTCTACAGTGCTGGAGATGGAGGTGTCTTGGGAATGGATCCTAAGTCTAAAGACTCATGCTCACTTCTAGTCTATGCGTCTTAAACGCATAGCCTGAAGATATTCAGAGAATCCTTCAGTGGTTTTTGTATGTGGAAGTAGTTTTATGGTGTGGAATTTCCTTTGTGGTGTCATGTCAGCATTCAAGAGGCCATGGAATTTTGAGCACTTTCAGTTTTGGATCATCCTGGCTTAACCTGTACTGAAACTGGTCTGTGGTAATAGCTCAGAGGTAGAATTGTGCTGTGTGTGAGGTGCCCCAGCATCAAAACATCAATAACAAAAATAACCTGTGTGTCCCCTGCAACAACTAACGCCCTCATAGAAAGACACAGAAAGACAACGCATGTGCTATTATGAAGTTCAGTATTTCTCTTGCTGTTGGATTCAGTCAAAAGTTTGAGACACTATTTACATTTTCCTATCCTTGTGGCCCACAGATCAGCATTTGGTGTGACCTGGGAACTTGTTAGTAATTGTACTCTCAGGTCCCACCTAGACCTACTGGATCAGGGTGGCGTTCAGTTAGACCTTCAGGTAATGTGCACCCATCGATGCTGGATAAGTGTGTCCTGGAGGGTGCCTGCCCAGTCCTGTTAGTGGCCCTTTATAGTTGCTGTGTTTCATGGCTCTTTCTTAACATTGAAGCTCACCTTTGTACATGTATGTCCCTGGCAGCCTTCTCCTTTTCAGGGAGATAGAAAGACAGGCTAACTCACCAGGCCAAATTGTGACAAAAACAAAACAAAACCAAGAAAAAAAAAAACTCAAAACCCCAAGAACCCTGTGTTTACATTTGAGGATACTTTTATGGCTGTGGACCTAGAAGTACAAAGAGACCACAAGCTATTTGTGGGCATAGGGGCCATGGAGTCACATGGAGAAACACGTGTAGCTGAGTTTAAAACCTATTGTTGTTAGACACTTGGGGGAATTGACATTTTAGGAAGTTTGAGGACTTCTTTCCTTACAGAACTTCTGGACTGCTGGATATAATGTTCTCATCAGAAAAATCTGAGCAAAGGAAAACAGCCCAGGCCTCCAAGTGTCCTGGTTCATTTGCATTGGGGGAGGAGCTCTGTCTGGGGAATGATTTTTGTTTTGTAAAGGCAACTTAAAAGCATTCCGTATCTATTTCTGAATAGAAAAAGACTTAAGGACGTTCATTTTGTTTGCCTTGTCTCTCTCTCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTATTCTGCCTGCTGTGTACTTTACCAACTTCTATATCTTCAAGTCCTTCTACTCCTTAGGATCTTGGCCAAATTCCTCCTCCTCTAAGCAGCTTTTCCTTTTCCTTGAGGCTTCTGTCATTTGATAACTCTGTCTCTTGAGCTCCAGTTTCTTTGTGGGTTTTATTGTTGTTGTTTGCTTAGCCCTCAAGAGTACCTAGCACATTGGAAGAGCTCACAAAATATTTGTTGAATGAAGTAATCCATACTTCAAGTCCATTTTGTCTTTGAAGGTTGCGGGTTACCTCTCAGAAGAAACTATGGTTTTGTACCTCTCCGCTAATTGAACCTTTTCCGAATTGTCCTACTACTTTGGAAAACCCTTTTGGTGTACAGAGAGCTGTGAAAACATGTAGACATGTACTAAGCTGCTCCTTTGGGAGGGGTTTGAGCTGCTGTTCACTACAGCTCTCTAGAGAGCACACGGCCTGAGGAATGGCTACTGGTAGTGGGAGAGTGGAAGTGAGACCAGGTAGTGAAACACAACTGCTCAAACTGCTGTCAGACTGGTGTGCCCTGCTGTTCCACAGGACGGGGGTTCCTGTGCCACCCCCTTGGATATCAACAAAATATGGAACATCTGTGTCTTTTTCCTCTTGTGTAGATTAGGTATAAAATACATGCTGGGGGGTGAGGTGGGGCTGGGAGATGTCTGTCAGTAACGTACTTGCTGTGGCAAGCAGGAAGACCTGAGTCCAATCCCCAGAGCCACACAAATAGTCAGGTATGATGGTTCATGCTGGTGTTCCCAATGCTGGGGAGTGGGAGTCAGACATATCCCAGGAACTCACTGACCAGTCAGCCTGTCTTAATCAGAGGTCCCCATATCAAAGTGAGAGAGAGAGATTCTCTCAGAAACAAAACAAAACCAACAAGAACGAGGTTCCTGAGGAGAGGCACTCAAGGTTGACCTCTGACCTGTGCACACATACGCACACAGGTACTCTTTCCCACCTGCTATGGATCACTGCCACCAAGTTGTATAAGCAGACTGGAAAACAAGTGCTATTGAAAGATCAAAAAGCAAAGACCTATCCCTAGGGCCATGACAGGTCTTAGCCAGGAAGCTCTTTTGGCCTTATCAGGAGACGTGTTTCCTTGTCGCACCTGTGGCTCTTGAGGTGACGGGCATGCTAGTTTCCAGTGTAGAGGTTCGTCATGCTGTGGTGCTGAGGAAAACGTCTCTATCGTGAAGAACTGCTCCAAAAGTCAGTCATGCTGGGATTGAGGAACCCATGGTCTGAGTAGGTTTGTAGATAAAGTTAGCGACACTCACCTCTTAGGAAACTGACTTCACTTGATTTGCTGACTCAGGCTAGACAGGCAGAGGACTTTCTTTGGAGGCCGGTGCCAACTTTCAAAATGTTTAAGTTACATTTCTTCATTTATTTATTTCATATCTGCATGTTCGTGTCCACGCCATGGCACATGTTCGGAGGTCAGAGGACAACTTCGAGCGATCAGTTCTCTTTCCCTGGGGGACTAACTTAGGTTGTCAGTTGTGGTTAAGGTGGAAAGCATCTTCCTAACCCTTCACACTGACTCTACTTGAACTTTGTACCAAAATAAACACCCTTTCTCTCCTCTCCCAAGAGCTGGTCTTAGTCTCTGAAGTACTGAGTCCTGGCATTGGCTTCTCATAGGCTATATGACAGCCACAAGATCATGAGACAGTTGAATCGACTAACTGGTTTTTCTCCATATAAAACGAGCACTGTTCGATGCTTTTACCCACAAATTCTCCAGCACTTTAAAAGGCCACATTTGAACTTGCAGTTGCCTTCTTTTACCTCAGTCTTGAGGGGACAAAAGAACAGATACAAGTACTACATCTTTTTTTGAAAAATAACTTTTTGTAGAAGTTGTACCTGTTTCCAGGGTAGACTACTTAGCAGATGTATGTGGAAGGCCAAATAGCTTTGTGTGTTGGAGATGGAATCCAGGAATTTGTGGTGCAGCCCCAGCAAGGTTCATCATTCAAACTTAACAGTTTTCTCTGAGCTTCAGATTTAGTCACCGTTTCTGGGATCATCTTAAAGGGCCCTGGGACTTCTGAGATGGTCACTTCCTTTGGGACGGGCCAAAAGTGGTGAAGTATTTCAGTACGGTTTCCTATGTTCTGAGCAGTGGTTTTTATAACACAATAAATTACATGGTGGCAGGAATGTGCTGTTCCCAAGGATGGCTTTTGATGGGACAAGCCTGTGTGTGAATGTGTGGTGAGGCTGGGGTGGCATTGTGTCCAACTCAAAAATATTCTGAGGCTCCTCTGACTTTCACAGTACAAATCACATCCGGCATTTCTGCCCGGAGGACATTCCCGAGAGAGCCCAGAAAGAGAAACAGACTGCTGTAAAGGAAACCTTTTCCCCTGTCTTGGGAAAGTCAACCATAAATGTGTTGGGCTTTCTCTACCCTGGGTTTACAGCCATATATGTACCTGGGTGAGGACATGGTGAGGAGACTTCTGCTCCTCCGGACAGTTTTCTTGGCCTCGGGCCAGGAGATTGATCACAGGCCAGCCACTCTTCCTTCTTGGGGCATTCCTTTTTCTTCCCTCTCCAAGACCTTATGGTTTGTCTGACTCTGCCCACGGTTAATCTCTCCCACCTGAAGACTGCTTGACCTAAAAGTGACAAGGTGCCTTTTTGTTCTGGTCCCTGACCTCAGTTCTAAGAGATCTGCTTGTATTCCAGATGCTCTTAAACATGTCTTTATGCAAAAGCCCCCTTTTACTGTCCTAACTTTAGACAAATTTGTTGATGTTATTTTTCTTTAAATGGGGCAACAGGAAATCAGTGCTAGAGGATTTTGGCAAGAGTTCATTGTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTGTGCTGCATAAGAGGTATGCAAGCATCCTCCCTCCTCGTCTGTGCATGGCACCTTTGGTTTTATTAGGAATGGCATGGAGAATGTGCTGGAGTTGGTGCTGGCTTGCTTTTATATGTGTGACTTGTAATGTGTCCCTCATCATTGGGAGTCGCTAGGAAGGGTTTCTCTACAACCAATTCCCAGAAGCCTGAAAGCAGGCAGCAGCTTAGAAAGGACAGTAACAACAGGGCTGTCTCCCTTGTTCTCTCTGCGGTGTGCTAAGCACACATGCTATTTTCTTCCCTTGGTTTACTTACTTTACAGCATAGCTTTATATATGGTATCTTCACCTTACAGGAGAGGAAGCTGTGGGCCAGGAAACTAAGTAACTGTCAAAGTTACCATGAGTGGGGCTGGACTTCGGACAAGGGAAGAACCTACTTTAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAGGCCCATGCTCCACTCTGGCTTTTATCCCTGTGGCTTGGCTCCATTCCTCTACCTTTCCCCTTCCCCCAATATAGCTGCATACTTTATGGCCGGCTGCCTGTTTTTGAACTAGCGGCTCTTTCCTGCCCTTAGGGCCTTGTGTCAGCATTCTCTCCCTCCACGGAGCTCTTCTGCTCACTCCCACCCCTCCCCCTTTTCCTAGGATGGCCTGTTTTCCCCTTCATATCTCAGCCTAAATGTCTCAGCTATGTTTCTTCACCAGTCAAAATTAAGCTGCTGCCTAATTCTATATCACCCAGATTTAATTCCTACTCTTTCGGGGAGGGGGGTACTGCTGGGGGTGTAACCCAGGGAATTGTGACTATGAGGCAGCTGCTCTCCTGCTGGCCCCCTCCCCCACCCCCGGGCTGGTTCTAATTCTTTGCATGCATGTACAGTGGCCTAATTGACCTTGTTTTGATCTTGTTTGTTTACTGTCTGCCTGGACTTGCATGTCTCTGTTAGGGCAGGGTCCTAATGTATGTGGAATGTGCATGTCTTTAGGACAGGGTCTTGGTTGAATGTCAGGACAGGGTCTTTCTAAGTTTTGATCATCTTTCAGTGTCTTTGGGTTGAGTCACAGCCAGTGTTTGGCCAATGCTAATCAAAGAGAATTTCAACTCTGTTGTTTTCAAATTCTTGGGTCCCAGGGGTTCTTCACGTGCTTAAACACTGTTGAGAAACTCCAAACACCTCCATGGATATGAGATGTTTGCCTGTATCTAGCATATTAGAAACATTTTTAAAAGTTACACATGAGCATAGTAAGATTTTTTTTTTCAAATGCTAAAATGATAATGCCCTCTAGAACAAAACAAAGCAAAATTTAACAACGTGGCTGGGCGTGATGGAGTATACCTTTAATACCAGCACTCCAGAAGTAGACAGACAGATAGATCTCTGTTAATTTACAGCCAGTGTGATCTACATAGACCAACACCCCACTCCATCCCTCTCCTCTCTCTGTTGTTGGATAGTTTTATAGAGCACTTTAAGGCCTGGTTGAATGGAAGATTCACATATAGCACACATCTTCATTGCCCTCCAGTCTGTAGTGATGTCATCTCTTAAGCCTCTGAGGGACTCCAATGTACACGCACAAGACCGGACAAAGATGCAGAGCAAAGAAGTACTTTGGTAGTGTTGTGAAACTAATTTTGTCCTTGAATCTTGACTGAAAGGGTCTTGGGGACCCTATTGAAATCACGGAATTCTGGGATAAATGAACCCTTTGAGATGTGGGGATGGCAGGGAACTTCTGGAAGAGGGAGGAAGGAGCTGAAGGCTCTGGTAGCAGGATGCCACCCAGCATCCCCCAGGCTGGAGGCTATATATCATTTCTTCCTTTTCAGGAAGAAGTGCATTTCAGCAGTCTTAGCAAAACAAAACTGCTCTGAGAACTTGGAAGCCAGTAGTGCTTGTCTCTCTTCAGTTTCTGTAGCGCTTGCCTCTGTTTCTACGGAGAAGCATAGCAAACAGCCTAGAAGCTGTGCAGTGGGAGCGGTCATTCGGTGACTGAGAATAGCAGCTTGAAAAAAACCTCAAATCAGCGGCCACTCCACAATCTGTTCTGGGCCCTTGGTGCAACTTTTGGCTACATAGTATTCTACTGTGGAAATTAGATTGTCTTCGCTGAAAGTGTAGCTCCCTGGTAGGGTGCTTGCCAACATGCATGGGCCGCAGAGTTCTGTCCCCAAGACTGGGGACAAGAGGTCCTGTGGGAATTATATTGACGAGGTTTTATGGTTGTCCTGCCCTGCTGCAATTGAGGTTAGAAGGCTCAGGGGGGGCCTTGGTAATACACTGGCCTGCTGAGCTGTTTGGGAAGGTAAGTGGTTACAGTTTCGACTTGTGAGGGAGTATTTTCCCTCGGCTGAAGCTATGCAAGGTTGTCACTGTGACGGTAATAGTGTATTAAAGCATCTGTCACCAGGAAGTGAATGGTGTGCTGGGGAGGTCCCTAAGAGTCTCATTTAAGGTCAGATTGTCAGTGGGCTTCTGTCTTCCCCAGTTACTGAAAGGCAACTGTTCAGCTCTGAGACCCAGGTCCCTTCATCTTAGCATAGAAAATGCTTGCTATTCTTGGCACAGATGTGCAAATATGGTTTTTTTTCTTCTTGTTTTGAAAGTAGGCCTTATTTTGTAGTCTTGGTAGACCTAGCCCTCATGCTAAAGTACAGGCTTGAACCTGTGGTTTTAAAGTTCACAGACTGGTCCTAACTTGGCTTCCTTGAGCGTCCTGTCCACTTGTAAGGATCTTGTGACAGGCGACAGGTGTGGTGTTCTGATGACTTCTCAGTTAATGAAAAGCGTTCTAATTTGGACTCAGTTTGAGCAGTTCCCAACTTTTAAGTTCTGAGTTGTGTGTGTAGGCGAAAGTTAAGTTTTTTTTTTTGGAAAAGGAATGTAAGTGCTATTAAATTAAGTGTGTGCAGGAGATATAATAGATGGAAAAATGATAATAAACGAGCCCCCCCCCCCACACACACACTTGGAGCTTTTAGAAAACGAAATGTAAAATCTGTCTGGAGTTGTTTAAAATTAAATGAACATAGTTCTTTTTTTTTCAGTGAGGCTTTGCTTCAGCCTGTTTTTACAGCAGAATAGGAGAGGTTTTTAAATAATTAAATTATCAGCCCTTTGAAGAGGTCTCTACCATCTCCTCCTTCCCAGCAGGGCCTCTGGTTTGATGTGGGAAGGAGAGGGAGAGAGGGAGTTGTGGGTTGACTGACTCTCTGGGTGGTGTGAATCCGGGTACCTGGGACGTGCTGTGCTGGCAGCAGACACCCCATGGGCTTGCAGAGGATTTAAATATCTCCGGGCCTGTGGTTCCTGCTCCTCCAGCATTGTTCTTAGCACTGGCAACCAAGTAGAGGACTCACCACAAGTTAGGGCAGAGGTGAACGAAAATGTTGAGGTCAGTGTTTCTGTTTCAGATTTGTTCAAAGATGCAAGAATGAACGCCCAGAGGCAGGCGCTAAAGTTGAGTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGGTGGATTGTTTGCTTTATGCCCCATAATAATATTGAAAGTTGCAAAGAATTACTCCTTCCTTCCACCTTCTTTTAATATAAGGGAGCTGTGGTTCAGAGAGGCTAGCTCTGTTGCTTAAGAACACACAGCCAGAGTGTACTCGTTTGAGCCCATGTTTCTAAGCATACCTATTCTCGCCAGCATTCATGAGCCATTTTTGACATATGGAGTGGAGGTTCAACATGAGCTTGGAGCACCTATCCCAGAATAAGAAAAGGTCTGTTTCTTGTTCTTTAATTTCTCATAAAATTAAAAAAAAAGTGTGCCATTAAAATTAAGTTCTATGTATCAGTGATCCAAGAGCTTATAAACTTAGCTTTAATCAGCTTTAGAAGATAACCGTTCCCAAATAGTATCAGCAGGGAACTTTGGCCACAGATAAGAGGGCACCATGGTGACAATCCCAGTGTGATCACCATGTCCCTGGTACTGGGCTGCTACAGAGTGAGGCTACCTTCCCTCATGAGTTTGAGGAGCTAAGAGATCAAGTCAGAGAGCAGACATGTGATGGGAGATGGTGGTGACAGGTCCAGGAAGGCGATAGGGTGCAGGGGAGGGAAGTGTGGGTGTATGCAAGTCAGGCTTGGGAAGAGACGAGCAGCTTAGTAGTGGTCTGTGTAGCTGCAGAGGTATGGGAAAGTAGCCATTTTAGGGAGGGAAGGGAGTGCCACAGGTAGTAAGGATCCTGGGAAATATTCACTCTGTTGAGGATGGGAGGGAGGGCAGGCAGGACTGCAATAGACTTTGGGTATTTGGGGTTTTTTTTTTTTTGAGGTGGGGGGTCTCTGGTCTCTGTTATACATACTATGTCAGGGAAGAAGAAAAGTGCTAAGCCTTTGTGACAGAAGCTATGCATGCAGCCTTCAGATTTAGAGGCTATTGAGGCTTCCGAGGACAGGTGAGAAGGGAAAGTTTTGGGAGGTGGCTGCCTCCCTGTGGGGACAGCGGTAATTGCTGTGTGCTTAAGCAGGGGCTGAGACCTTCCAGAGAAGGCATTTTGCTGGATTCCAGCAGTGCACCAGAGACATGCATGGCATGCTTAGCCAGTGGCTCAGCCACTGTGTATTCAGCCCCTGGTCCCGTGCCTTCAGAAAGGCCCACGTGCTTCCTGACTGGGAGTCGAGAGTCGTTGTGTATTGTTCAGCTTTTTCCCAGTAGGGGGATTAGCAAGGATAATTATCTTCCCCTAAAGTAAAATACATCATCACAGGTCTTATAGGAGGTCACTTGTTGCAACACCGAGCTGACATTTTATACAGAGGAGCTTCCCCCGCCTCCTTATGGAGGTTGAAACCTTAGGTTCTTTTAGAATTATTATCTTCTAACTGAAGAATAATAAAAATAGCTAGCAGTGAACACTGAAAGCATGTCAGCTGCTGTCTTAGGCACTCCGAATTCATGAGCCCATCCCTTCCCTGTGACTTGTCTCTGAAGTCGATGCCCGGTGTAGATATGTACAGAGGTCTGCATCAGCTGAGAAACCTCGGTGGGCTGACAGCAATAGCTTGTACGTAGAGAGCCGGAGTGGAGTCTTAGGTGGCCTGAGTTTTGTAGAGCTGTTGGTGAGGAGCCCTGGGTGTCCTTGTAGTATTGAAAGCTGCACAGTTGTGACACAGTTCCGTGGCAGGTTGGTACATGTCCTGTTTTTCTCATAGTGACTGGGTCACTGTGTATGGGGGTATTGGGAGCCTTGAGTGCAGCTGGTAGAAGCTATCCACAATCAGATAAAGAAGTGGCCTCCCGCCCAGCTTCTTAACAACAGGAAGTCTTCCTGAAGATGTTGCCAGGCTGACTTCCTACCTATTCCCTCCAGCCCCAAATGCCTGTCATTTGGATTCTGCTAGCCCTGGTTTTCCCTTTCAGTGCCCAACTGAGAATTGTTTCAGGGTCTCTCCTCTGAGTGCTCTCCTATCCCTGTGTTATTAAACTCAGACCAGCGAGACCCAGATGCTTCCAACCAGACCTGGAAGTGGTTTGCTTACTCAATCCAAATCTTATCCAAGGAGGGAATCTGCCTGATTCCCCCAGGGAGGAATCTGCTCAATGATACTTAATTTTTTTTTTAATTGGGACCTTTGGCAGATGGCCCAGTTGAGGATCATTAACTGTGGTGGGTACTGGCCTCTGTTTTCAGGGGNNGGCAAAAGGTTACTTGTTCAATTATCTTGTCTACTTAATAAGCATATGGATAAGAAAGAAGACGCTTAACCTTTCTTCTGACTTTACAGAAGTGTTATATGGCCAAGGTAGGAAAATGAGAAATGCAGCAGTAGGAAAAAAATGAATTAGAATTGTCCATAAAGGAAAAGAAATGTGGAAGGAGAAGAGGCTGTGGTTGGGATATATTGTATGAGAGAAGAGTAAATTAAACAAAGAAAAGAAAAACGAACAGTTCTCCATTGTCACCCGGAGAATAAGAACAGTAAACATATTCCCTGTGCCCTGGGAGTACAGTTGATGAAAAGGTCTATGTCAGAATTCAGTAGCCCTGGTATACCTCTGTGCCTTCTGTCTGTTAATTATCTATGACGAACATGTGAACCTTTCTGTTCTTCAGTTTCCTCAAGAACAGAAGAGGGGTGTGTCTATGTCACGCCATGCCACACGTCTGGAAGATTCTGAGACGATACTATTCTCAGCACAGAGGTGGACAGGATAGTCCTTGACAGGCGTTAGCTGTTTAGCTCAGCAGTGGGACTGAAGCATTCTAGAGCCAGGCTTCTCAGAAAGTTTCTCATCTGCTCTGTTCTCAGATGCTATCAGGGTGGGGTCAGGCTGGAACCTGGATGGGATAAACAGGACTAATGTAGATTCTTAGTGTCAATTGCAGTCTAGGAAGCTGTTCTGATTGTCAGGTTGTAGGCTCACTCATTCTGTCATGTCTTGCCATTACTGTAAGGTCGCAGGCCTTCCAGGTTATGTCACATTCTGCTATTACAGAACACTGGGCTGTATCTGCTGCTTTACAGTTAGAGAAACTTTCAGTAAGATACCCAGAAGATGATGCAGATTTGAAGGACAGCGTCATCGTGTTGCTCTTGTCTGACTTGGTCTTCATTGGAACCAAATGCCCTTCCGAGGGGCATGGCCTGTGAGGAGAACTTTAGTCACTCTGGATTTGGCCCTGGTTGTCTTCCTAAATACATTTCTGCCCTCCTGCATCCAGCAGCTCCCCATTGGTCCTCTGGGAGGCCCGTATGTACAGACACAAATTTGGTCTGACTTAGAAGTCAGGCAGAAATTGCTTTCCTAATAGTCCTCAAGCTGGGATATAGCTACATAACAGAGCACTTGCCTAGTAAATCAAAATCCTGGGTTTGATCCTTTAATGCAGGGAAACGAAGCAATCCTATGCCTGTTCATGTAAAGGGCATGGCTCAGACGTAGAGCAGTTGCCCAGCATCCAGCTGTGGGCTTGATTCCTAACAGTGAGCCAGGTATGGAGGGCCAGCTTTAATCTCAGCAGAGAATCTGAGTCAGCAGTCTCTCTTGAGTTCAAGGCCAGCCTCGGCTACATCATCTGATGCTATCTCAAGTCCCTTTCTTTTTTCAAAAGAAAAAAAAATATTGATCCCAGAAGTACACTAACTTTTTGGCCATTTATGATAAAGCTTTTAAATTGGTCATAAAGTGATTTATTTTTTGGGGGTTTCCATTGGTACTTCTTTTGTGCATGTTGTTCAAACACTGGTCTGACTCCAGGTATAATAGCCTCATGAATAAAGACAGCATGGTTGACAGGATTCTAGAGTGGGAGCTGGCCTCTTGGCTCTCTGCATGCTCCTTGGGTGCTTTTCCTTCAGATCTGAGAGATGGGAGTTGCTTTTTCTGAGAGTTGGTTATGTTCTCAGTTGCCGACTCTTCTATAAATAAGTCTGAGCCTTTGTCTCTCCTGAAGTGTCCGGGTCTTTGGAACAGTGGGCAGCTCTCCTGGAGCTTCTCCCAGTCAGGGAGGCGCTTCTCCCAACTGTTTGCTTGCTGCATCTGACATTCCTGCTGAAGGAGGATAATGCTTCCAGAAGTTTGCAGAGAAAAACTTGGCACCCAGAAAACAGTTGAAGGGGAGAGAGGACATTTTACCCCTCCACATCCTTACAACTCTTGTGGCCTGTGGAGTAAACGATTTATTGGAGTCAGTAGAAGGGGAAAGATTTCAAGTGGAGTCTGGACTGGGAGGAAAACCCCAACACTTCATGCATCAGCACAGCAGGTGCTGAGGAAATGCTGGGAAACTCTGCAGGCCACTGCTGCTTTCCCTGTAGCTGAGCCTGTTTGCTAAATGTCATTTCAACGTCTTGCAGTTGGCTCCTGTTCCTCAGTGTTCATGGCCTGGGTGAGAGCTGTTGTTAGGAATCACTTCAATATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATTGTGTGTGATAGTTTCTGGGCTTTGTAGAGATTTCCTGGAATAGAGGAATATATTTCTTGAATTACTTCTAACTAATCCCAGCCAGGGAATCTTAGAATTGATTAGTGTCTGAATAGGGAAATCTGGGCCTGGACCTGGGCAAGGGTCTTGCTACATCAGAAATGTTTCCTGGTAAAGAAGGAGAGTGTGTCATAGCATTTGTGTTGAGTGTGTACTGCTGGCCTTTGGAAAGGCCTCTGAGGCACTGTGATACTCATTCCCAGGTTTCCTCTGATTTGATTCCTCTGTCTCTTTGATTCCTTAACTCAGGCCCCATGGCTTTGCTAGACCTAAGGTTTTTACCAGGTGCTTCCTTGTGACTTGACATTCCCTGAGGCACATTGAATATGTTACTGTGTCATAAGTCAGACTTTCCAGCTGCTTAATCACTACCGAGTTCTTGGCTGGGTTCCCTGGTGTCTGGGTGGTTCAGTATTACTGAAGGGTCCTCAAAGCATTGAATCTGGCTGGGTGTGGCCTTATAGAATCAAATGCTGATATGATTGGGATATCCAGAAATTTAATATGCAGGACAGAATGTAGTTGCATATGTCCTCATTTGGCTCGTGGAATCGCCTGCCTGTCAAACTGCTTAAAATTTGAATTTTAAGCAGTGCGCTGGGGGAAATTGAACTAAGCTAAATCTTAGTGACTTTTTTTTTTTCCTGCTTCATCATGTCTCTTCTGCTAACAGTGTTGCATGTTTTACTTTGTCTAG
Seq C2 exon
GCTTTTCAACAAGGACATGTCTGACAAAATGTCTAGTTTCCTACATATCGGAGACATTTGTTCTCTGTATGCAGAGGGATCTACGAATGGATTTATCAGCACCTTGGG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000007104:ENSRNOT00000040255:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
PF087096=Ins145_P3_rec=PU(11.9=87.1)
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]