Special

RnoINT0085883 @ rn6

Intron Retention

Gene
Description
LIM homeobox transcription factor 1 alpha [Source:RGD Symbol;Acc:1304784]
Coordinates
chr13:86017080-86050291:+
Coord C1 exon
chr13:86017080-86017312
Coord A exon
chr13:86017313-86050118
Coord C2 exon
chr13:86050119-86050291
Length
32806 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGT
5' ss Score
10.67
3' ss Seq
TGTTCTCTGCTTCATTTTAGGCA
3' ss Score
10.25
Exon sequences
Seq C1 exon
ACTGTTTGCTGTCAAATGTGGGGGCTGCTTCGAAGCCATTGCGCCCAATGAGTTTGTCATGCGTGCCCAGAAGAGTGTGTACCACCTGAGCTGTTTCTGCTGCTGTGTCTGCGAGCGACAGCTGCAGAAGGGTGATGAGTTTGTCCTGAAGGAGGGCCAGCTGCTCTGCAAAGGAGACTATGAGAAGGAGCGAGAGTTGCTGAGCCTGGTGAGCCCAGCAGCCTCAGACTCAG
Seq A exon
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Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]