RnoINT0144535 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000027447 | Stam2
Description
signal transducing adaptor molecule 2 [Source:RGD Symbol;Acc:1311497]
Coordinates
chr3:38254077-38277440:-
Coord C1 exon
chr3:38277288-38277440
Coord A exon
chr3:38254162-38277287
Coord C2 exon
chr3:38254077-38254161
Length
23126 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TGGGTGAGT
5' ss Score
8.73
3' ss Seq
TGTGTTAATACATCTTACAGAAA
3' ss Score
6.28
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Features
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Main Inclusion Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
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Other Skipping Isoforms:
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Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]