RnoINT0167796 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000001789 | Zfp148
Description
zinc finger protein 148 [Source:RGD Symbol;Acc:62063]
Coordinates
chr11:70516813-70539762:-
Coord C1 exon
chr11:70539679-70539762
Coord A exon
chr11:70516932-70539678
Coord C2 exon
chr11:70516813-70516931
Length
22747 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTGGTGAGT
5' ss Score
10.1
3' ss Seq
ATTTTTAAATCACATACTAGGTG
3' ss Score
5.05
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Vast-tools module Information
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Mappability confidence:
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Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
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Other Inclusion Isoforms:
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Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]