Special

BtaINT0051348 @ bosTau6

Intron Retention

Gene
Description
dynamin 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29125]
Coordinates
chr16:40387638-40404581:+
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Length
16718 bp
Sequences
Splice sites
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Exon sequences
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000014319:ENSBTAT00000017776:10
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.000 A=NA C2=0.103
Domain overlap (PFAM):

C1:
PF0103115=Dynamin_M=FE(15.5=100),PF086515=DASH_Duo1=PU(51.1=48.9)
A:
NA
C2:
PF0103115=Dynamin_M=FE(9.5=100),PF086515=DASH_Duo1=PD(44.4=69.0)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Pre-implantation embryo development