Special

DreINT0124471 @ danRer10

Intron Retention

Gene
Description
RAP2A, member of RAS oncogene family b [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-090312-116]
Coordinates
chr1:2074569-2092325:+
Coord C1 exon
chr1:2074569-2074885
Coord A exon
chr1:2074886-2092087
Coord C2 exon
chr1:2092088-2092325
Length
17202 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTAAGA
5' ss Score
10.06
3' ss Seq
CATGTGTTGCTCTTTGACAGGTA
3' ss Score
10.14
Exon sequences
Seq C1 exon
GCAATGCGCGAGTATAAGGTGGTGGTGCTCGGCAGCGGAGGGGTCGGCAAATCCGCGCTCACCGTGCAGTTCGTGACCGGGACCTTCATCGAGAAGTACGACCCGACCATCGAAGACTTCTACCGCAAGGAGATCGAGGTGGACTCGTCGCCGTCGGTGCTGGAGATCCTGGACACGGCCGGCACCGAGCAGTTCGCGTCCATGCGGGATCTCTACATCAAGAACGGGCAGGGCTTCATCCTGGTCTACAGCCTGGTCAACCAGCAGAGCTTCCAGGACATCAAGCCCATGAGGGACCAGATCATCCGGGTCAAGAG
Seq A exon
GTAAGATCTTCGTGGAAACACCAGCCTATTGAGTTATTAACATTTTAGCAGGACTTGTTCATTACGGAACCATAACTTTCAAATGGTACTTCAGTACACGTCCATAAACATTTCATCTCAAACGTACAGTATTTACCATGGTAAATTGACAGTATCACACACTAACACAATTGTACAAGACTAAATACCTATTTACATCTCTTGATGTTTAAATACAGCTGTGTGATGATCAAATGACATACTACTGTGACAAAACTTGGAAATTTACCATGGTAAATTTCCTAAAGCAGGGTAATACTTGTTTTTGTTGCTTTTTCTCAATATTACTGAATGTAGCTTGGCAAAATGACAATATTATACAGTAACACCATGGTGTAAACCAAAATACCCTCTTACATTGCTTCATGCTGTACCATGGTAAATGTCCAAAAACATCGCCTACTCAAATTTCCATTGTGTCACCATCATTTTAGCAGGATGAATATAATATGGATTTATTGCATCACAACTTTACATGGCACCACCGTGTTTTTTCATGTCATGGTACTTCAGTATTGACACCATGGTACAAGACCAAAATGCCCACTTACATTTGCTGATGCTTTACTATCGCTGTGTGATGATAAAGTAGCATACTACTATGACAGAACTTGGAAATTTACCATGGTAGATGTAATTATTTTTTATTTGTTGCTTTCATTTCAATCTTACAGTATGTACCATGGTATAATCACAGTATCATACACTTACACCATCATACAAGACCCAAATACCCACTTGCATTTCTAGATGCTTTATTATAGCAGTGCAATGGTTGATATGTACATTTACAATGTGTTAATCATTTTAGCTGGATGACTATAATATGGACTTATTTCTTAAGACATCATAACTTTACATGGTAAATACTGGGTGTTTTACTTCAGCAGTGTGATGGTTGGAAATGTGCCATGGTAAATGTCCAAAAACATGGTATTTCCAGCTTTCCAAGGCACCACCTTGTTTTTTCATGTCATGGTACTTCAATATTTGTTACACGTCCATAAACATTTCATGTCAAACCTACAGAATGTACCATGGTAAAATGACAGTATCATACACTAACACCATCATGCATAACCAAAATACCCACTTACATTTCTGAATGTTTTATCATAGCAGTACAATGGTTAAAATATACCATGGTAAATGTCCTAAAATGGAGTAATACATGTTTTTTTTCTTTGTTGCATTCATCTCAAACTTACAGAATGTACCATGGTAAAATGACAGTATCATACACAAACACTTTTGTACAAGACCAAAATACCAACTTACATTTCTGAATGTTTTACTAGCTGTGCGATGGTAAAACAGCATACTACTATCACAAAACATGAATATTTACCATGGTAAATGTGCATTTTTTTCAGTGTGCTGCTTTCAACTTGATCTTACAGTATGTACCATGGTAAAATGACAGTATCATACACTAACACCATCATACAAGACCAAAATACCCACTTACATTTCTAGATGTTGTTATTTGGAAATTTACTATGGTGAATGTCCAAAAACATAGTATAACCTACTTAAATTTCCATTGTGTTACCATCATTTAAGCAGGATGAATATAATATAAACTTATTCCTCATGACATCATAACTTTGCATGGCACCAGCGTGTTTTTTTATCATGTCATGGTACTTCAGTATTTGGTGCACATCCAAAAACAATTCATCTTAAATGTACAGTAAGTACCACGGTAAAATTACATTATCATACACTAACACTTTTGTACCGGATCAAAATACCCACTTACATTTCTCAAAGTTTTACTATAGCTGCGTGATGGTAAAATAGCATACTACTATCACTAAACTTGGACATTTACCATGGTAAATGTCTTAAACGGGGTAATACATGTTGTTTTTAGTTTGTTGCTTTCGTCTCAGTCTTACAGGGTGTACTATTTTTCAATACCAAAATACCCACTTACATTTCTGGATGTTGTTATTTGGAAATTAACTATGGTAAATGTCCAAAAACATGGTATTGCCTACTCAAATATCCATTGTGTTACCATCATTTTACCAGGAGGAAAATAATATGGATTTATTGCATCATAACTGTACATGGCACTTCAGTATTGACACCATGGCCAAAATACCTACTTACATTTGTTGTATGTTACTATAGCTGTGTGGTGGCTTTCTGGGACCGTTCTTCATCGGACTCGAACCCCGTCTTCATGGTCAACTCTATCCTTTAGTTGTTCATTTAGTTGAACTCAGTGCTTGATGTTCAACCGAGGCTCATCGTGGAAATGTAGTCCCGCGGACGTTTCTGGAGACCGCGGAATACGTCCCGGCAGGTACGTACGGCTGCAGTTTTTGTTTTCACGAGAGGCCGCTGTTGCGCGCTTTTTCGCACCTCAGACCCATCTCGCGGGCGCAAACATTTGCGTGAACCCGCCGGGGGCCGCTGTCTGACTGACCGGATGATTGACTGCGCGCCCGGCCAATCGGCCGACTCGCCCTCCTCCTTCCCCGAACCCAACCAATTTTACCGATCGACCCGCCCGCCCGCTCGCTTCCCTAAACCCGAGCAACAATTCACAAAAGCCGTCCAAAAAATAAAAGCCCTGATTTTTTTTTTAAATTCCACCGCGTTTTCGGATTTCGCCGCGTTCTCACCGTCACGAAACTCGTTCACTTAATTTTTGGGATTCTGTTTTCGTCTTACCTGATTGCTGGAACTGCTCTTCCCCGGACTCGAAACCGGTCGCCGTGGTCGACCCCTCTCCGCATCTCGAGCCTGCCGACGTACACGCTGAGCTGTTATGAACTGGGAATGACAGAATGCCTTTCTAACAGAGTCTACATGTGCTGCTGAAGATTACAGACACACATGAGAGGTTTGCAGGGCTATATTGCGTGTTGTTTTTGAACCCAAATAAGGACTAAATGTCTGCTGTGTGTAGTTCTTTTGTAGTTGGTAACATATCAAAGACTGTAAGGGTCTGCATGTGCTCATATATGTTCATTTATTTATTTATTTTATGTAATTGCAGACGTTACAGTGGGCTATTTCACGCTGTTATTGATCTGTAGTTATAATCAAATCATGTTGATAGAAAAGTAAACATTTAAACACAAGTATTTATGTGTGTAAAGCATCTGTTTTGTGCTTCTCATATGATTTGTCAACGACCTGTATATGGCTTTACTGTAGACATTTTCTCGAGTGAGAATGACGTTGACTTAAACTTTCTGTAGTACACCACGCCCACTAAAAGAGTACCCTTGGTAGTGGAAAATCAAGCCTGACAAAGGTGACCCGTACTGACCTGAACCGTACCATTCTGCACCAGTCAGTGGAAACGAGCCATCATGTTTACTTGTCATTTACTACACTAATGAAGGGCAGAGGGTTGCTGAAGGACTACTGAGAGATTTCAGCTGCTGTCTGGGCTTTCACTGCCGAGCTACACCTTCCTTATTTCATGTGTTCAACACTTTTTTTTTTCCTGCGTCGTTTCATTTTATTACACAGAACTTCATTTGTAAACTAATTAGTTTTGCCTATATGGATTTCTAACATCTGGGGAAAGTTTCAAGTCAAGAGCATCTTTAAAATATATGGGAATACTTTAGAAAATATTCAATACTTATTCCCCCCGCTGTATATAAAGAAAAAGTGCTAAGCAAGATTTAAATCACTTAACTAGAAAAAAATGCAGCAAATAAATACATAAGTACAAAACTTTCTGAGGTTTTCCAGGATGGAAACACTTGAGTGTGTAGTCGAACAGCAGCACCTGTTAGTAATCTATAGACCCACCTGGAATCTGTGCACGCAGATTTTTAGCCCATCATTAATTCTGTTTATTTACTTGAGTAAATGTGTGTAAATCTATATTTATTCAGTTTTTATTAATTTCAGTAATATTATTGACTAATGTGAAAATGTTCATCTGATTTATGTACAATGCAGCTTATACAGTAATATTTTATGTCTAGATAAGTACTAAATATATTACATGACAAACTTTCTTTATTTACCAAATAAAGTTAATCTAATTGGATCTGTATTTTAAACATTAAATAAAAGTTAAAAAGATATTATTTTTTATTTCATATACTAAGGTTTTAGTTATGATACTCCCAAAATAATTTTTACCATCAGGGCTCAACAATAAGGACTGCCCGGTGGCCTAGGGCCAGCGTGAGAGACACTTGGGACAGTAGACCGGATCATTACTGGCCCGATTGGGACAGTGCTGCCTTGTCACTAACATTTAATTTGTCAGTGACTATTTGTCAATTGCGTGCATTTTAAGTTTGTGCTTTTAAATCTTTAAATGCTACCTTCTCTGTAATGTCGTAAACAACATATTGCTTTCCGATTCATCTTATCTGATTGATTTGACCATGCTATTTTTTTTTTCTTACCTGGTAACAACCAGTACAGCGTAGAAACAGCAACATGGCGGCAACACCAAATTAAAAGGCTAAACGAAAATGTCTCTAACATGTTGGAAGTAGACATTTACATGGAAACAACACGACAAAACAATAATGAAGTGATGTTATGCACAGTTTGCCGTCAGTTTGACAAGTCAGCCACCTTTTGTTAAATAATTTCAAACTGCAATAAAATGCCTCCACATTTTCCATACTACTCTTTTAGTTTGCATAGCATAACAATTGTTTTTTAAGTACTGAAATTCTAGATTTACAGACTTTATTTTTGACGCATTATTTAAAATATGTGGTTAAAAATAGCTATTAACTTCCCTTTTTTTGGTGGGGCCAGTGAAAATTTGGCAGGGCAAGTAAAAATCTAAACCACTTGCCCGATCGGACCAGTAGAAAAAAATCCTTAGCGTTGAACCCTGACCAAAATTCTCTGCAGAAATAGCAAAAAACGTCAGCAGATTCCGTCTGGCCCTAGTAATCTCCAATGGGAGGCAGCGTCCATTATAATCGTTCATAATTTAACCTAAGGCCCAGAAACAGATGCTGCATTGTTTGTGTGTGTTTTTCTCCAGAAAGAGCTCTGAACACACCGCCGTCATAAACCCGACCTACAGAAACAATTCAACGCCACACAGAGACAAAAGATTCAGCCGTGCAACCTGAAAGGCCTGAATTATCCCGTCAGATCCTCAAGCAGAAACGCTCTTATTTATGCACTTTTTCCCACATTGTCTACTTTCATTTGCCGTCTATTCAGATGTGTCGTGAGAAATACAGTAACCCATGCATTTAATATCAGGAGCACCCTGGAGTATTGTGCGATGATATCACTGTGAACAGTAGTGCTAGCAAAGAGCTTTATTTATTCAGGTGATGTCACGGTAAATGGCCACTTTACTGCAGTAAGCACATCATGACACAGAGCTCAATTCCCTGACAGTGTATAATAGCAAAAGTGAATTTGGACATGCCCTTTTACACCTGCGCTGTAGGGCTCTATTTTAATAATCCAGGTGTAATGGAGTGCTGTGCAGGTAAACCTCACTCCTCTGACCTCTAAAGGTGCTCTAGCGACAGACGCTAGAGGCTCTCCTTGTTAGAGCAACCGACTCCCATGCGGAAGGTCGCCGGTTCGATACCAGCTCGGAGCGGGTTGGTTCGATCCCAGCTTGGGTTGGGTTGGTGGCATAGGACCGACGGGGTTACATTGGTGCCGTGACCCGGATGGGAGTGAGGTTTAGGGGGTGAGTGTAACGGAGGCCAGCTAGTAAGTGCTGCGCAGGTAAAACTCACTCCTCTGACCTCTAAAGGTGCTCTAGCGACAGATGCTAGAGGTCATAGTCTTTAGCCTCCTTGGTAGAGCAACCGACTTCCATGCGGAAGGTCGCCGGTTCGATTCCAGCTCGGGTCGGGTTGGGTGGCGTAGGACCGGCGGGGTTACATAGGCACAAAGTCTAATTAATTATTAAATTTTTAGGCTATTTAGGCTATTCAATTAGTTTGTCATGGGGGCCGGTCCATGAAAAGCATCCCAAACATGGTGCCGGAGAGATATGACTTGCTCTATGAGTGATAACACAACTGCATGTAAGAGCCCATATGCTGTATTTGTGCTCCTTAAGACACCCACGTTGGCTTTTTCTACATTGTTGGTAAAGTTGTTTTGTAGATTCGATGTTGATCTTCAAGCGGTGTCGTTTGAGCACTGTGCTGAAAGGATCAAGTTAAAATTAGAGTGTAAAATATAAAAGCAAGAGTGCAAGAAGCGGAGCAGCAGGCAAAGACGTCCGAACAGTAGCAAAGCAGGAAGCCAGTAATAACTCATCTCTAATAACTGATTTATAATAATAATACATTTTATTTGTATAGCACTTTTCCAACATACATGCATCTCAAAGTGCCTCACAAACAACAACAAAAAAGCGTTAAAACAGACCACATAAACTTGTCACATATACTCAGATATAAGCAAATATAATCATATATCCACATGATCACGCACACAATAGTCCTTATGTATGCAAGCACACACCATACATCCATACATAAACCTACAACAATAAAGATAAAATGCATACACCTAAAAAGCTTGTGTATTCATATGCAATTTTAAAAAGATGTGTCTTAACACGCTTTTTAAAAACATGAATACTAGGGGATTCTTTCACTTCAAGAGGGAGACAGTTCCAAATTTTAGGAGCATAATGGCTAAAAGAAGTGCCGCCAGATGGCATCAGGTTTACAGAGTAAAATTCTAAAAGCCCAGCGCTAGAAGAGCGTAGCAAACGGTTTGGGTTATATTTTGATAAACAGTCGGAAATGTAGGAAGGTGTCATGTTGTGTAGTGCTTTATAAACCAATAAAACAATCTTAAAATCTATTCTTTGGTGCACGGGTAACCAGTGTAATTCTATTAATACGGGTGTGATGTGCTCTCGTTTCTTCAATTTCATTAAAACTCTGGCTGCTGCATTTTGTATCAGTTGCAACTTCATTATAGAACCCTTAGGTAGACCAGTATAAATAGCATTGCAATAATCAAGGCGAGAGAAAATAAAAGCATGAATTAATTTCTTGGCATCATCAAAAAATTGGAAAGAACGAATTTTGGCGACATTTCTTTAATGATAAAAACAAGTTTTTGTAACTTAATTAATATGAGATTTAAAATTAAGATCACAATCGAAAATAACACTCAGGTTCCTTAATTCTTTTTTGGATTGTAAACCTAAAGAACACGCTAGAAACATGTTTAATGCAGGAATGTAACTAAAATTCTGCAATGACTCCTTTAAATATGAGATCAACGTGGTGAGTTTTGACGCTCTCGCCACTTTCGGTGTGAACGCACAGTAAAATGCATGGAAATTAGGCACCGAAATTCATATGTTGATTTGATCCAGTGTATACCGGTTCCAAATGCGTATGGCACCGGGTTTCAGTACCCAACCCTAGTAATTAGACAAGTCATTGTAGAACAGGGGTTTGTTCTGCAGACAATCCAAAACTAATAATGCTTAAGGGGGCTAATAATATTGACCTTAAAATGGGTTTAAAAAATTAGGGACTGCTTTTATTTTAGCTGAAATAAAACAAATAAGACTTAAAAATATTATAGGAAATACTGTGAAAAATTCCTGAATCTGTTCAGCATCGTTTGGGAAATATCTGCAAAGAACTTTACAGGAGGGCGAATAATTCTGACTTCAACTGTACATGTATTGAGTTTTATCTCTGGCGTTATGAATTGAATTGGCAGCGTTTTACGGCAGAAGCAGCAGAATGTGTGTAAAGCTCTGGCACAGGTTGTTAATCTGCTTTAAGAAGCAGGCAGATTCATGCTGAGACGGCGGATCAAAACTACAGCTCAACATTTGCACACTCACCGAAATATAAATGAGATTGTGCTGCTGCTGGAAGCCAAAGAAACATCACAAGTGCATTAGTGCCGTCCATCCGCGGCTTCACATCTCATGCTAAACACTCTCTAATCAATTGAGATTAAAACACACACGTATTCAATTTAGCTGCAGCAGGTGTTTCACACACACACACACACACACACACACATAGACTCGACGCGTCCCACACACACAGTCTGTGCACTTTCACATAGTCTGTGTGATTCTCCGAGAAGCATTTACATACTGGGAAATGTGTTAAAATGATGCTAATTAGTGTCTAAATGCCTAATGGAGTTATGTGTAATGATCTCTCCTGTGAGACATGATGATGTTCTCCATGCAGACCTACAGTGCAAATGTATTGTTTTACTGTATTGTTAATGTTGTAGGGTGGCTCAGTCAGTCACTGGTTCAAGCCTCGACTGGGCCAGTTGGCATTTCTGTGTGGAGTTTGCATGTTCTCCACGTGTTTGCGTGGGGGCTCCGGTTTTCCCCACAGTCCAAACACATGCGCTATAGGGGAATTGATGAACTAAATTGGCTGTAGTGTATGAGTGTGTGTTTGAATAAGTGTGTGTGGGTGTTTCCCAGTACTGGGTTGCGGCTGGAAGGGTCTCCGCTATGTAAAACATATGCTGGATAAGTTGGCGGTTCACATTATAAATGTGGATCTCTGACAGATCTATTCTTTTCAGTTATATTTTTCTATTATTTTTCTTTTTTTCTCTCTTTGCTGTATTTCTATTGCACCTTCCCTCTTTTCATTATTAATATTTTTGTTATAATTTTAATAAATTAATTTAAACAAATAATAATAATAATAATAACACATTTGATGTTTTTACAGTCTATTATAATTAAAACATTACTGCAGCTTTAAAATTTTTTCTTAATAATAGTAGAAGTAATAATAATTATACATTAATAATATTATTAGAATTATATATTTTTATATTGATAAAAATGCATTTTGAAAATAATATATTTTTTACCAATATTTTTGTAAAAGATTAAAAACAATAGAATTTTTTTAACTAAAAATACATTTATTAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACAGTTGAATTATTAGCCCCCCTTTATTTTTTTTTTATATTTCCTAATTGATGTTGAACAGAGCAAGGAAATTTTCACAGTATGTCTGATAATATTTTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTGTTTTATTTCGGCTAGAATAAAAGCAGTTTTTAATTTTTTTTTAAACCATTTTAAGTTCAATATTATTAGCCCCTTCAAGCTATACTTTTTTTCGATAGTCTACAGAACAAACCATCATTATACAATAACTTTATATATTTATAACTTTGTAATTGTATTAAACATGTAATTATAATATAAATATAATTTATGCATATATATATATAGGCTTGTCTTGATAAGTCATTTCTGTTGTGGGATATATTGTCAGAAATTAGTTTAATAAGTGATATTATTGTCATTTTAAGACCAATTTAAAGCTGTTTATATAATGATTCTACAACAGGTTTCTACAATATGTTAATCTGCTTTTTGCCTTTAATGTAATTCCTAAATCATAACTTTTCTGGAAGAGGACTGCAGATTCATATCAGTGCAGGTTGTTTTATGATTATTTATTGTAATTATAAATGTGGATCTCTGACAGATCTATTCTTTTTAATTATATTTTTCTATTATTTTTCTTTTTTTGTCTCTTTGCTGTATTTCTATTAGACCTTCCCTTTTTTCATTATTAATATTTTTGTTATTTTTTTAATAAATACATTTAAGGAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACACATTTGACGTTTTTTCAGTCTATTTTAATAAAAAACATCATGGCAAAGAGAAAAGAAATCGGTTATTAGAAATGACTTATTAACACTATTATGATTACAAATGTGACACATTTCAAACATAAGTTGGTGGGGGGGGGGGGGGGTGGAATAAATAGGGGGGCTAATAATTCAGACTTCAACTGCCCCTGTGGATTGCATATGAACACAATGCATGCTGATTTGATGTAGTGTTGTTTGTGGTCTGACTGAAGCTCTATTGATGTTCATGAACCGATGTTCAGACTCAGGCTTTGTGTTGAGCTGCTGAAGATAAAGACTGACTTCAGCTCATCCGTCTTCATGTGTGTTTCTCTGCTCTCGGAGGCCTTCATCAATGCTGCATGACTTAAAATTGCTCTGCTTTGATGCTTCTCCACATTTAGTTTGATTTACCTCCAGTGTTTTCATGAGCTCGGGGATTCTGTGTTGTGTTCCAGTCTCATTTCTTTTACAGATCGGCTCCTTTGTTGCTTTTGCGGTTTGCTCTTTTCATTTACAGAAGTGTTGTATTGTGATAGTTCATCTACGAAACACGATCATGCCATTGTTTATGATTCATCGCAGTGATTCGAATCATTGTTCACTCAAAAGATTCGTTCAGTGTTTCTTATTCTGTAGATTTATGTGGTGACACGGTGGCTCAGGGGTTAGCACTGTGGTCTCAAAGCAAGAAGTTTGCTGGTTCAAGTCCTAGCTTGGCCAGTTTCTGTGTGGAGTTTGCATGTTCTCTCTGTGTTGGTGTGGGTTTCCTTCGGGTGCTCCAGTTTCCCCCACAGTCCAAACACATGCGCTATAGGGGAATTGGGTAAGCTAAATTAGCCATAGTGTATGAGTGTGAATGAGAGTGCATAGGTGAGTAACACATTTGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCCGCTGTGGCAACCCCAGATTAATAAAGGGACTAAGCAGAAAAAAAAATGAATAATTGATGCACTAATGAACACTAATAACAACTTTTAGGTTTTTTCAGAGTTTATTATAATTAAAAACATTCTACTACAGCTTTTCAATTATTCTTAATAATAATTTAAAGTAATAATAATATTAATAATAATATATTAACAATAATATAATATATATAACTAGATATTAAAGTTTGAGGACAAACTTTATGGTGGCTTGAAAAGCTGAGTCTGAAAGTTTGAAGTGGTTTTAAAGTGTAAATAGCCTGTTAGTATGATTCTAGCTTGAATTAGCATGTTTCTGGCATAATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATAATTGTAGCATAAATTATCATGTTACTAGTATGAATTACCATGATTCTAGCATAAATTAGCATCATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGTATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGAATTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGTATGAATTATCATGATTCAAGCATGAATTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGTATGATTCTAGCTTTAATTAGCATGTTACTTGCATGAATTAGCATGATTCTAGCATCAATTAGCATGTTACTAGCATGAATTAGCATGATTCTAGCATTAATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGTATTTGCATGTTGTTAGCATGATTATAGCATTAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAACATAAATTAGCATGCTGTTAGCATGATATTAGCATTAAATAGCATGTCACTAACATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAACATGAGTCTAGCATGAATTAGCTTGTTTGCATGATTCTAGCATGAATTTGCATGTAACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCTTGTTAGCATGGTTTTAGCATGTTGTTAGCATGATTTTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCTTGTTAGCATGATTTCAGCATGATTTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCTTGTTAGCATGATTTAGCATGTTGTTAGCATGATTTTAGCATTAATTAGCATGTTACTAGCATTATTCTAACATAAATTAGCATGGTGTTAGCATGATATTAGCATTAATTAGCTTGTTAGCATGATTCTAGCATGCATTTGCATGTAACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCTTGTTAGCATGATTTTAGCATGATTTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTTGCATGTTACTAGCATGATTAGTTATTTTAATTAAAAATTAAAAACGAAAAATACATCTATTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGATAAAAAAAAGCATTTAAAAATATTTAAAAAAAATTTCCACCAAATAAAATAAAAATTAAAAGCTAAAAATACATTTATTCAAATATTATTATATATATTAAAGTAATAAATATATTATATATTGGGCGGCACAGTGCCTCAGTGGTTAGCACCATCGCCTCGGTTCGAGCCCCGGCTGGGTCAGTTGGCATTTCTGTGTGGAGTTTGCATGTTCCCCCTGTGTTCATGTGTGTTTCCTCCGGGTGCTCCGGTTTCCCCCACAGTCCAAACACATGGTATAGCGGAATTGATTAACTAAATTGTCGTAGTGTATGTGTGTGTGTCTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGAATGTGAGAGTGTCGGGTGTTTCCCAGTACTGCGTTGGAGCTGGAAAGGCATCAACTGTGTAAAATATATGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCCGCTGTGGTGACCCCTGATGAATAAAGGGACTAAGCAGAAGGAAAATGATGTAGGATGAATATTATATATTACAATTCTCCCACATGATCTTCAATACAGTGTTCAAAAACTTTATTCTCTTCGATCACAGTTTCCATCCAGATCATTGTGTTTAGCTCATTCTGCAGCTGATTCCCCCAATTCTGCTTTTAATTTCACACAGAGCCTTTTTTTGTTGGCAAACTTCAAGGAGCAAACATTCGGCTCTTTGTTTTGATTAAGGTTTCTTTGTTTCTCTGTGAATCAGCATGTAGCCGACCAGCATTTCTGTCCAAAAGTGTCCCAGCATGCAGCGCTTCAGCAGGGCCTCTGGAGAATCACATCTGTTTTTGTGCTGAAATGTTGAATTGTTAAAGGGGTCGAAGCGTTTCAGAGAGCTTCAGTGCTGGACAGAGGAACACTGTTGGACAGACGGACAGGAAAACACTAGACTTTCACTCTCTCAGTCATCAATCACAGTCACACTGAGCTCATTTCACTCAGGACTGAAATCTGGAGGCCGTTGAGTTTAGAGAAACCCGTCTCAGACGATCTGACTGTATGTATTTGCAATAGTGATTGAGTGTTTTAGCTGTGAAATAAAAAGCTTGATTTACCCTATTTGTACTGCTCAGTTTGAGCTTAAAGTCCCAACCCAGGCTCATTCTGAAAATGTACCCCAATATACATTTCTGGAGAGCGCCAAATACATCCCAGGAGATACATTTTTTTGCCGTTTTTGTTTTCACGAATCCACCAGAGGCTGCTGTGTACGCTTATTCAGATCTCAAATGTCACTGTTATACGATGACTTGCCTAATCACCTTAACTTTACCCTAATTGATCTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTGAAGAATATCTAGTCTAATATTATTTACTGTCATCATGGCAAAGATAAAATAAATCAGTAATTAGAGATGTGTTACTAGCATGAATTAGCATGATTCTAGCATGTATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATTAATTAGCATGTTACTAGCATCATTCTAACATAAATTAGCATGCTGTTAGCATGATATTAGCATTAATTAGCATGTCACTAATATGATTCTAGCATTAATTAGCATGTTGTTAACATGAGTCTAGCATGAATTAGCTTGTTTGCATGAATTAGCTTGTTAGCATGATTTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGACTTTGCATGTTACTAGTATGATTATTTATTTTAATAAAAATTTAAAAACAAAAAATACATTTATAAAAAAATATATATATATATATGGATTAAAAAAGCATTTAAAAAATATAAATTTTTATTTTCCACCAAATAAAATAAAAAATTAAAAGCTAAAAATACATTTCTTCAAATATTATTATATATATTCAAGTAATAAATATATTATATATTGGGCGGCACAGTGCCTCAGTGGTTAGCACCATCACCTCGGTTCGAGCCCCGGCTGGGTCAGTTGGCATAGTTATTAAAACTATTGTGTTTAGAAATGTGAGAAAATCTCATAATTGTACAGAAATCGGGGCTAATAATTCAGATATGCTAATAATTCTGACTTCATCTGTATAACTAATGCATTGATTAATATTATCAGTGGCTGGTTTGAGTGATGCGTGTGTTCAGTCTGATCTGCAGTCAGACGTGTGACTGCTCGCTGTCGTTTCTCACACTTCGCTGATCCACTAATAGATGTTGAGGCTCATGAAGGCTCGCGCTTCGCTAAACTGCGGCCTAATTACAGTCACTTAACTAGTGCTGCTCTGTTTGCTCGCTTGTCACTGTATTCAATTATTTTAATCAGCATGACATTAAGATGATAATGCAAAGGCACAACGGTTTAGCAAAATGCCACCAAGTACCCAACATTTTGTGTTTAAAGGATTGATGTCTTGGCTAAAACAAGGCTAATCTTGGGCTGTCAGTGAAAATGTAATAGTAGTCTGACAATTATAAGAGTCAATAATCTAATTTTCAAACAGATTTCACGTGTGCAGTCATTCATGCCCATCTATTTGAGTCTATTTTTTGAGATTTTTTTACTGACCAAACAAATTTAGCTTTGTTTTAGCCGAGACGTCTGTTTAAGTGTCTAATAGACTCCTTTTAAACACAAAAATGCTTGCTGTGAGTGTTTTGAGCAGGTGAATGAGGAGTTTGTGTGGTGTGCTTCTTGACTATATTTCAGTATTTTACAAATAAACCGTAAAAAATGCTGGGTTCCACACAATTCATTCATTCATTCATTTTCTTGTCGGCTTAGTCCCTTTATTAATCTGGGGTCGCCACAGTGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCATATGTTTTACACAGCGGATGCCCTTCCAGGTGCAACCCATCACTGGAAAACATCCATACACTCTCATTCTCACACACATACACTACGGACAATTTAACCAATTCACCTGTCCCAGATGTGTTTGGACTGTGGGGGCTCGAACCAGTGACCTTCTTGCTGTGAGGCGATCGTGCTAACCACTGAGCCACCGTGCCGCCCTCCACACAATTCATTCAGGTTTTCCACAAATCGGTTAACTTAAATTTAAGTGCAGTGAACATAAAACAATTAAGTTGTCCTAAAGAAATCTCAAAAATTGTGTTGAATGAGCTCATTTTACAGAAGTAGTTTGAACAATCATAAATTAATTATAACTGGATTACACAGCCATTTAAATTTGATCTACGCTCATCGGCCACTTTATTAGGTACACCTGACTAGTACCAGGTTGGACCCTTTTTGCCTTCAGAACTGCCTTAATCCTTCACGGCACAGATTAAACAAGCTACTGTTAATATTCCTCAGAGATTTTGCTCCATATTGACATGCCAATCTCCCGTTCCACCACATCCCAAAGGTGCTCTATTGGATTGAGTTCTGCTGACTGTGGAGGCCATTTGAGTACAGTGAACTCATTGGCATGTTCAAGAAACCAGTCTGAGATGATTCACGCTTTATGATATGGTGCGTTATACTTTAATAATACTCAGGAAGGCTATGGCGTTGACATGACGCTCGATTGGTACTGATGGGCTCAAAGTGTGCCAAGAAAATATCCCCCACACCATTACACCACCACCACCAGCCTGAAGTGTTAATACAACAGTTGAATGGAGCCTTTGTGAATTGTAGCCTCAGTTTCCTGTTCTTAGCTGACAGGTGCGGCACCCGGTGTGGTCTTCTGCTGCTGTAGCCCATCCGCCTCAAGGTTGGCCGTGTTGTGTGTTCAGAGATGCTCTTCTGCAGAGCTCGGTTGTAACGAGTGCTTATTTGAGTTACTGTTGCCTTTCTATCAGCTGGAACCAGTCTGGCCATTCTCCTCTGACATCAACAAGGCATTTGCGCCCACAGAACTGCCGCTCACTGGATATTTCCTCTTTTTCAGATCATTCTCTGTAAACCCTAGAGATGGTTGTGCGTGAAAATCCAAGCAGATCAGCAGTTTCTGAAATACTCAGGTCAGCCCGTCTGGCACCAACAACCATGCCACATTCAAAGTCTCTTAAATCCCCTTTCTTCTCCATTCTGATGCTCGGTTTGAACTGCAGCAGATCATCTTGACCATGTCTACATGCCTAAATGCATTGAGTTGATGCCATGTGATCGGCTGATTAGAATTTTGCGTTAACATGCAGTTAGACAGGTGTACCTAATAAAGTGGCCGGCGAGTGTGTATACAGTACACTATTTATGACAGAATGATATTTTATTTTTTGACACTCCAAAAGACACACATTATAATTAATGCTATATCTGTTTAGTTTTTGAGCGGGGAAATGAGTTCTGTTGCTCAGACGTGTTGCATCATAAACTTGTTAAATGGTTTGTGTTTCTCCAGGCGGCTTTATTGCTGTTCTTCATCAGCGCTTCATAAAAGGTGTACAAACCCAATGTACATCATGTCAGCATTCACAATAACAATGAACTCTACCCTATCTGTTCCACTCACACACACACACACACATGTTTGCAGCTGAAAGTGTGACTGTGATCATAGATCCAGCATATGTTCATGGATGTGACACAAGCTCTCAGACTCCAGGCGTCCCTGCTGTCTCTCAGACTATAAATAGTGTTTTTCTCCATGCAGCGGCGGCGGGTGACATTTCATCTGTTCTGCTTTCCTCCCACACACATTCACACCTGCAGACCTGACACACACAACACAGCGGTCTGAATCAGCTCTTATTGTGTGCTTCATTAATAATGCTGGACACAGTCACGTCTGATCAGATCAAACACGCTTACTGACATTTACTGTGTTCACAAGTACACGCTAACATGCTGTTACAGCCCTGTGCACTACTGAATGCACTGTTTACACTGTGGACAGCATGGAAATGGTCCATATTTGTAGTCTGTTTATTTCTTTTATTTCTATCATACATCCATTATCAAATCTTCTATTTCTTTCCATCCATCCAACTGTTGAGTTTGGTGCTGAAAAGCCTCATTTCACGTTTCACATGTTTAACATTTTTCTTAATCTCATGTGTTGCTCTTTGACAG
Seq C2 exon
GTATGAGCGCGTGCCTGTGATTTTGGTGGGCAATAAGGTGGACCTGGACAACGAGCGCGAGGTTTCGTCGAGCGAGGGTCAGGCTCTGGCTGAGGAATGGGGCTGTCCGTTCATGGAGACTTCGGCCAAGAGCAAGACTATGGTGGACGAACTGTTCTCGGAGATCGTCAGGCAGATGGACTACGCTTCTCAGCCGGATAAAGAAGACCCGTGCTGCTCCTCCTGCAATATACAATAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000040246:ENSDART00000058877:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

Alternative protein isoforms

No structure available
Features
Disorder rate (disopred):
  C1=0.019 A=NA C2=0.165
Domain overlap (PFAM):

C1:
PF0007117=Ras=PU(61.7=95.2),PF0020517=TPP_enzyme_M=PU(9.2=6.7)
A:
NA
C2:
PF0007117=Ras=PD(37.7=76.2),PF0020517=TPP_enzyme_M=PD(89.5=85.0)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]