GgaINT0099335 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000013568 | E1BYS2_CHICK
Description
NA
Coordinates
chr2:91687780-91697654:-
Coord C1 exon
chr2:91697476-91697654
Coord A exon
chr2:91688124-91697475
Coord C2 exon
chr2:91687780-91688123
Length
9352 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGC
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9.88
3' ss Seq
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3' ss Score
11.41
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000013568:ENSGALT00000022087:5
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
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Domain overlap (PFAM):
C1:
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A:
NA
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
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F:
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R:
No suggested primer sequences
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INCLUSION PATTERN[edit]