HsaINT0115666 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000119508 | NR4A3
Description
nuclear receptor subfamily 4, group A, member 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:7982]
Coordinates
chr9:102609719-102629173:+
Coord C1 exon
chr9:102609719-102609897
Coord A exon
chr9:102609898-102625901
Coord C2 exon
chr9:102625902-102629173
Length
16004 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGC
5' ss Score
9.88
3' ss Seq
CCTTCTCTATCCCTCTGCAGAAA
3' ss Score
11.53
Exon sequences
Seq C1 exon
GTCAAACACTGCTGAAGATAAGTTTGTGTTCTGCAATGGACTTGTCCTGCATCGACTTCAGTGCCTTCGTGGATTTGGGGAGTGGCTCGACTCTATTAAAGACTTTTCCTTAAATTTGCAGAGCCTGAACCTTGATATCCAAGCCTTAGCCTGCCTGTCAGCACTGAGCATGATCACAG
Seq A exon
GTAAGCACCACCTTGCCAAAACCGCATCCTCATTTCTCTCCTTCCCTTTGTTATGGTGGAATCTGGCCTTGACCACTACACACACCAGAAAAGTGGGAAAATGACTACCATTTTTCTGAAATCTGTTAAGTTTAACCTAGTTTAAGCAAAGAAACATGCATCTATAATTTGTTGTCATAAACTTCTAGTAAAGAGGATCCATAGTCTATTGAATTATCATTGTCAGTAAGCCCAATATACGAAAATCTAACTTCCTACTAGAGATCTGTGGACAGTGGGACTAGCTGCTTCAGGGTTTGTTTGTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCACACAGGCTAGAGAGCAGTGGTGTGATCATGGCCTAGTGTAGCCTCGACCACCTGGACTCAAGTGATCCTCCCACTTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGACTATAGGCACATGCCACCACACATTTGTCCTGTTTTGTAGCCCTGTTTCACCCTGTTGCCCAGACTGGTTCAGTGTTCTTGTTACAAAGCCTTTCCTAGGGAGATTACCTAACCCAGCCCATTCCTGTGGAGCAGAGGTGATGAGGTTTCCCCTGTCCCCAGTTCTTGGCTAGCGACCTAAAGTAAAACCAAAACACTATAGACATATCAAATACAACTTGATTTAATAACTTCGATTGGCAAAGGACTGAGAAAAAGCAAAAATGGTTCAACTCAGCAGTTTTTTATTTTTATTTTTAAAATTTTATTATCATTATTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGATGTGATCTTGGTTTACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGTCTCACCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTACCTGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATCTTTAGTAGAGATGGGATTTCATCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAATTGATCTACCCGCCTTGGCACCCCAAGTGCTGGGATTCCTGGCGTGAGCCACCACACCCAGCCAACTCAGCAGTTTTTTAACCACAAACATAAAAGATATTTGATTTATGCCTGTCTCCCTCTATAGATCTCTCTCTTTCTATCTTTTGGGAGATAAAGGATCCCAAGGTGGGGTGGGATGGAGAAAGGCGCGTGTTGGGCAAAGGAAAGAATATCATCTCCCTGTGGCCATGGAGGCCCTTGCCCCAGCTCCCTTTGCCCCGGGGGAGAGTTTCCTGTTAGACCTCATTCTTTCTGGTCAGACTGGGGCCTGGGGAGGTGGTGACAGAGGGTGGGGGCTCCAGAAGTGGCCAAATGAGGGGCTCATCCTTGACCTTTTGGTCAGACACAAGCACAGGCTTGGCTGTTGAACAGAGTTCAAGATCAGAATAATATGCTCTTGGCTATAGAAAACATGTTTCTCAAGCAGGTGGTGAGTTTCCAGAGCATCAAATGCAACCTCTGGTACAGATGGCCCCTTCTTTCTGTTTCACTGGAAATGTGCATTGGTTTGCCCAAGCATTGTTTACTTGCATTTCTTGGGATATCTCCTATTAGCTAAGGTTAGATGTGTCTGTGCCTTAAGAGGCTAGGCTGGTTCATCATTTGATGGTTGACATGCAGGCAAAGACAAGCAACTGGTATGGCTGCAATGAGGATTCAGACAGTAGCTGTTCCTTCAGTATTCCAAATGGAAACTGACTTCCTCCTGGTCTTTGGTCCAGGATGAGAAACTCACTTTTTTTTTTTAATGGGGCTGCTAGACTTCCAAGAGAGCCATTAACGAAACAAAAACCAAGGCAGTCTCAAAGAGTATGGATTCCATTTGGAAGGCTTTCAAATGGCATACTGGAGCATCTGAAGAAAATAAACAGATTTAAGGCACAAGCATATTACTTCATCAGGACTGGAAGGAAACTGGTTCAAGGCTGCCTTTGAACTAAAGCTCTTTAGTTCAATTTCAAAACCATTCAGCAATTCCTACGTCAGTTAAACATTCAAAACTAGAAAGTATGGAGTTTAGTTCATTTTAAAAAGACAAAAACAAAAAACTAGATCCAGCTTTGGATTCCTACAAGTAAAAGCAGTACATTGCTTCATCTCCATGGCAACGAGTGTTGAGTCTAGTTAATCAACAAATATTCACTGACCTAGGCACCATGCTGCATGTCATTGGGTTTTCAGAGATGATAACACACATCCCTAGAGGACATAGACATGCAAAGTACCACATGTGATGCAAGGTGTTGAGTGCCACCATGGAGACAAGGGAGTGAGTTCAAAGTGCTCAGAGACAGCAGGTGGGGGTGGTCTTCTCAGAAGAGATCACAGGAGCTGGTCCTTTGTAAGTGCAGAGGATGTCTCCAGGCTAAAATGGAAAAAGTGAGAATCCAGGCATAAACATTTGCCAAAAGCCATTGAAAATATGGCTAAGTTTCAGAAAGGAAACAGCTGAAAATTGGAGTGACAGGAGATGTGACTGGTCTGATAGGTCAGGGTGGGGCGGGACATAAAGAACCTTCCACGCCTAGGTGAGGGGAGCAGAGTTTATCTTGAGAACAACGAGGATCCACAGGTTTTGTCCAAAGGAGCTTGATGGTCAGGTTTGCGTTTTAGAAAGATTTACCCTGTCAGTGAGTTTTGGGCATAGATTAGAGTGAGAAAGAATCTAAGAGGAAAAAGGCCAGTCCAGGTGTGAGAGCCATGATTCAAGAGGAGGGTCCATCCCTGAAGGCCACATCTTTGTTTCACTCTTTAAATGGAAATTGACAGATATCTAAGAGGCCAGGACGTGTGGGTGCCAGGAAGACCCAACCTGGAGAGACTGGGCAGTTCAGTGCAGAGAATACAAAGTAGAAATTAGTAGAAGGGTGGTGCTGGTCCTCTTTCTGCATCCCATTTGTTCTATTCCCTGCAGTTACAGCTGCTCAGCCCGCTGCCCATTTATGTGGAGATTGGCTGGGGGAGGAGGCAGTTTGGCATGGCAGAAATAGCATGGACTTTGGAATCGAGCACGCCCAGATTTTAATCTTCAGTCCTATGTTTAATAAGTAGGCGCTATTGGGGAACACATTTCAGTTCTCTGAAATTCAGTTTCCCCATTTGTAAAATGGGGATAACAATGTCTATGTCATAGGGCAGCAGTGAGGATTACAGAAAATTTAGTTGGTGATGTAACCAAACTGGATTCAGGATAGGCAACTCTGAATTCACCTATGGTCCCCCTTGGAGTGATAGTGACAGATTCCCTCAAGTTAGGCATATGCCTTCCCCTACCCCTTGGAAGCATCAAACTCAGTGGCATGAGGAAACAGGTGGTGGCTTTAGAAGGCAGTATGTTTGGTGACAGTCTCCTTGGATGCTTAAGAGAGAGGCTCAAAGGAGGATAGTGATATTAAAGTAATTAAGCTGCACTTAACAAGCACTTACAATAGACCAAGTGCTCTACAGTGGTGTCTTTGGGCCTCCCCGACCAGGTAGCTCCTGTTCCTGCCCTCATTCCTGCTGTGGTTTTAGCCTACAACAAAAATAAGCCCTCTTCTCTCATTTCTGGACCTTACAACAAACACTCTCTTTGTGACTTACTGGTTGAAAGTGGGTTTGATAAGTGTGAAAATATCAGGAAATGGCAGAAAAGGCAATGCCTGGGAAACAGTGTGCATTGCTGTGAATATTAATTTTCATTTGAATATGAGCTGCCATGGATCTTGACTTCTGAATAAGCTTCGTTGATCATAAATGGTGATTGTGGAGTATCAGCTGGGCTATTTACATTACAAAATTCATCCCAAAACTGTCTTTTCTTAAACCACAGAGAGCTCATGAAAAGGAAATGGCATCTTAGAAGTTTAACTAGGCTTGCTTCCAGGAAAAGTATTAAGAATCTGGATTAGTATTGGTGGTTTGCACAAACATGGCTTTTTTTTCTCTCATTCTTTTTTTCTTTGTCCTCCTCCTCTCTGTACCCCCTCATGAAAAACTAGGCGGTGAAGTGGGGCAGGAAATGGTTTCATTCAGATCACTCTCCTTTCCTGCAGTAAACAGGGGGTTCCCCACAGTGGTTGGCTTTCAAACGTTTTTCAGGTTCCCTGTTTATCTACCCTAACCATTGCCCTTTGCCAGTGCTGCATCTCTGAAGTAATGCAAGTGCTTTGAATCTGGTGGGATACCAATGAGTTGATATCTGGTTGCAGTTAATAATGTTTCATAAATAAGAAGCCCCCTCACCAAACAGAAAGTTAGTGTGGCATTACCATTTTATAAATATCCACTCATTAAATAAGCATCGAGGGCCCACTATGTACCAAGCATTGTACCAGTCTCTTGGGATGCAAAGATGAGCCAGGCACGCATTCTGTTGCCAAGAAGTGGGCAGTCTACTAGGAAGTCATAGATTATGATATATAAACTTGATGTATAGTGATTAGTGCTCAGGCCCTGAAAAGGGACAGATGCAGTGTAGAGTAAGTCCAGATTACTGCTAACTTTTTTGAGGTGAAGGAAGGTAGAAGTGTTGGTCATGAATGACTTCCCAAAGAGGTAGCATCTAGACATGAGAAGACATAAAGAACATTCCAGATGAAGGAAAGAGAACAGCAAGGGCATGGCAGTTGAATGCCTCAGTACAGTTTAGGGTTAAAACAATTACAGTGGAGTTGCATTGTGCATATATTAAAATCACACATATGATACAAGTAGAAAGAGGAGAAAAATTAAGAGTGCAGGCTATTGCATTTGATGACTGTATGTCCTGGAGTGAGCATGAATCCACTGTAGGTCATGGTTTCTCTGCCTCTGGTGATGAGTGGTGAGATGATGTCTTGTGCTTTTGGGAAAGTTAAATGATTTTCAGGGATAAAACTAATTCTATGTGATATTTACCTTCTGGCTTGATGTGATGACCTAACCTCAGAGCAAAACGCTTTTCCTGTACAGAAATAGGGGAAATAAGATTGGAAAGATAGTTTTGAACCAGATGGCAGAGGGAATCTCAAGTGCTCAAATGCCATTTTGTTGTTCCCCATGGCTTTCTTTTCCCTACTCAGGTCATCTCTCAGGTGAGAAAATGACTCCTTTCTCGTCTGACTCTAGTCTTTTTCCTGGTCTTATTGAAACACGACCTCTAAGACTGAGAAGGAGGAAGGAGGGCAGAACCATGGCAGAAAGTAGTGAAACAGTGACACAGCAGGACTAGACAGGTGGCTGACCACGGCACACCCTCCACCATCTGTCTTTCCAGAGCTCCACTGCTCACTGTAAATGGTTACCTGGTTACCCCTGCTTTTGCATCAGATAAAGCCATCAGCTACATTGCAAGGAAAACTAAATATCAAACTTAGCGGGGCAAAATAGTTAAAAACAAAAATGGTGGGAGAGGGGAGAGGCCACAGGATTTAGAGACCGGAGATCTGAGTTCAGGTCTTCACCCTGAAATGTGCTGTCTTTGCAATCTTGGACAAGTTCCTTACCCTCTCTGAATCTCAATTTCCTTCCTTCTCACAGGGTTAAAGATGTCTACTTTCAGGTTTCTTATAAAAATTGAATGAACTAATATGTACTATGCAGAAAAAAAATTAGACAAACCTTCACTGTTATTATTTGTTTTACACACTTCCATGAAGAGCCAGCTGTCTTGCTAAGAATCCATAAAAGTGTTCATGCATCCCTGCAACTGAATATACACATTGTGTTAGGGAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTATACTCTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACATTGTGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGCTGGTGCGCTGCACCCACTAATGTGTCATCTAGCATTAGGTATATCTCCCAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCGACCCCACCACAGTCCCCAGAGTGTGATATTCCCCTTCCTGTGTCCATGTGATCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAATATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTTCTTGCGATAGTTTACTGAGAATGATGGTTTCCAATTTCATCCATGTCCCTACAAAGGATATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAATAAACATACGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATACTCATTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCGCCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCGCATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATAGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTCTTCATGTGTTTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGGTTGCGAAAATTTTCTCCCATGTTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGTCTTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTGGACATGAAGTCCTTGCCCACGCCTATGTCCTGAATGGTAATGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTTTAACGTTTAAATCTTTAATCCATCTTGAATTGATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGAGATCCAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTCTGTTCTGTTCCATTGATCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGTCTTAGGATTGACTTGGCAATGCGGGCTCTTTTTTGGTTCCACATGAACTTTAAAGTAGTTTTTTCCAATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTAGCTTGATGGGGATGGCATTGAATCTGTAAATTACCTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACGATATTGATTCTTCCTACCCATGAGCATGGAATGTTCTTCCATTTGTTTGTGTCCTCTTTTAGTTCCTTGAGCAGTGGTTTGTAGTTCTCCTTGAAGAGGTCCTTCACATCCCTTGTAAGTTGGATTCCTAGGTATTTTATTCTCTTTGAAGCAATTGTGAATGGGAGTTCACCCATGATTTGGCTCTCTGTTTGTCTGTTGTTGGTGTATAAGAATGCTTGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAGACTTTGCTGTGTTAGGGAATTTCTTTGTGTCTTTCTTTACCAGCTAGACTGTGGGGTTCTTAAGGACAGGGAGAGTCTTATTTATCTTTAAAATTACTTTAGCATTTACAAGTATCTGGCATATGACAAATATTCATTGAATGAATGGGCCAATTGTGAGTATCAGAAAGTCTCCCAAATTAGAAAAATCTGAATTAATAATTTTTAGCCTACCACTGTTATGATAAAAGTATGAATTCTTGAAAATTGCCTTATTTTGATTCAGATTAATTCAGTAAATATTTATTGAGCATCAACTGTGCACCAGACACACATTCCCTTACCCTCAAAGAGTCTGTGGTCTCACTGGAGAGAGAGACAGACACATACTCTACCAAATCAAAGACGGTCAGACTGAAAAGTACCATTTAAATCAGCCTCAACACAGACTGCTGACTTGACTTGTCGCTTCCTGACCAGCGTGGGCTCAATGTCTCTGGGACTGCCCATCAGTAAAGGATGTTGTGTATGACATGAGTGATAGCAATAAGGTGAATTCCCAGAGAAAGGGGTAGAGCTCCGAGTGGGGAGTCCTGTTTGTTTGTGTTTGAGCTACACATACCTCTCTCTCCAGGGGCCCACCTTTCCTTCCCCTTTGGCTGGAACAGCATTGTTGTCACCAAGTTAGCCTTTGCCCTAACACCTGCTCAGAAAGGGGAGTTACTTTTCCCCTTGGTGGGGCTCCTGATGGTTACTATCATCCCTTTCTTTATCCCCTACTCCCTGCCATGAGGAAGAGAATTTGACATTTCTCATATAAGCCCAAGAGGCAGAACTGGGAACTACATATAGCAGCGGTCCCCAGCATTTTTGGCACCAGAGACTGGTTTCATGGAAGACAATTTTTGCTTGGACTGGGGTCGGAGGAATGGTTTCGGGATGATTCAAGCTTATTACATTTATTGCGCACTTTATTTCTATTATTATTACATTGTAATATAAAATTAAATAATTGTATAACTCACCATAATGTAAAATCGGTGGGAACCCTGAGCTCATTTTCCTGCAACTAGATAGTCCCATCTGGGGGTGATGGGAGACAGTGACAGATCACCACGCATTAGATTCTCATAAGGAACGTGCAACCTAGATCCCTCACATGCACAGTTCACAATAGGGTTCACACTCCTATGAGAATCTAATGCCGCCACTCATCTGACAGGAGGCGGAGCTCAGGTGGTAATGCAAATAACGGGGAGTGGCTGTAAATACAGATGAAGCTTCACTTGCTTGCCTGCCGCTCACCTCCTGTTGTGTGGCCCAGTTCCTAACAGGCCATGGACCAATACCAATTGGGGACCCCTGATATATAGGATGGCAAATTTTAGCTCAATGTAAGAAAAACTTTCACATAGAAAGAACCATTTGAAATTGGAATAAGCTGCCTTGAGGAGTGAGTTCCTGCTTTGGGGAATGAGGCTTACAGAGACTAGATGAACACTAGGTGTGGACTCAGTCAAGCATCTTATGGGGACTAGGATTGACTAGAGCAGAGCTTCTCCAGCATTCACATCACTGGGCATCTTGTTGCATTGCAGATTCTGGTTAGGTAGGTCTGGGGCAGGGCCTGCCTAAACGGATTCTGCATTTCCAGCAAGTTCCCCAGTGATGCTGATGCTGCTGGTCTGGGGACCACACCTTAAGTATCTAGGAATAAGGGAACCTATTGGTAATTAGGAATCCATGAAATTAATAGCTACCATTTAAAAATACTCAGTGCCAGGCACTGTGCCAAGGGCTTTACATGTGTTATTTTGTTTAATGTTGCTTAATAAATAAACTTGGAAGTACCTGAAATAGATTATAGCAGATACAGGAAGCATGGAGATCAGTCAAGAGCTATTAAAATAATCTAGATAGCAAAGATATTGAAGATCCTCATCCAGAGGCCATGGGTATTGAGAGGGAGATATAAATGCAAGGAACATCACAGAGATAATAACGGAAGTTCTTGCAATGGATTAAATATGATGGCTCGGGGGGAAGAAATTGTTAGAGATGATTATAAGAGTGATGTGAAAGGCTGTAATATCATTAATAGACAAGCTTAGAGACGTGGCTGATTTGAAGGGGAAGGTAATGGCTTGAGTTTTAGATAGAGAGGATACTTGCAAATATTCACTAAGTGCTCACTATATGCTAGGCATGGTTCCAAATACTTGACATGTATTAACTCGTTTACTTCTCATAACAACCCATAAGGCAGCTACCATTATTAGCACCATTTTACAAATGTGGAAACAGACCCAAAGTCACCCAGTTAATAAGTGGTCGAGGCCAGGGGTGGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACAAGGTCAAGAGATGGACACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCCTTGGGAGGCCAAACAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCATCACTGAACTCCAGCCTGGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTCACAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGTGGTAGAGTTCAGGTCTACAGCCAGGAAATCTAATTCCAAAGCTTTGATGTGGTAGGTTTTAGAGTTTGTAAAGTTCTTTACTGTTGTTAGCTTCTTAATAACTCCCAACCTGTATATTTATTTTTAGCAGCTTACACTTTTAGTGCTTATATAATCATTTCTCACAGATTCTTGATCCTCTATGTATCAATTTAACAGATATTTATTGGGTGTCTCCTATGTACTAGGCTTGGTGCTGGAGATACAATGTTGAGCAAATACAGTTCATGCCCCCATGGTGCTTACAGTTAATGGGAGGAGAAAAAAATCACATAACTATCTGACTTCAAACTGTTGTGTCCTGCAAAGGGATAGATTAGAATGCCAGAGGAGAACATGATCTAGAATAGGGGTAAAAAGGGAAGCTTCCTTCAAGAAATATTTGATCTGAGATCCAAAGAATGAGTATATCTTAACCAGATGAGGATGGGAAAACATGAGCACAGACCTAAATATAGCTCTATTATTTCACTCCATCACTCTCTCCCCCTGACTCCTTCTTCCCTGGTTCCACCTACCTCGCAACCCCTCCCTCTTGCTCTAAGCAGAGATGTCTATGCCTGGATAGCCAAAATGCACAGAAATCCAACGGTGTCTTTAGGTGTTCATACCACACAAAGATTAGGAGTGTGATCTATCTGTCGCATCTCTAACCCCAGTGGTTATAACATCGCTTGCCACAGAATAGGTGTTCAATAAATATTTGTTGAAAGAAGTAGTTAGTTAATTTGGTGCACAGAAAATAGGAGAGAGTTATAGAAAAGCTAGTTCATCTCAGGACGAGGAGAAACTTTCTAACAATTAGAGATGTCCAGAGATGGAAGACATCTTGTTATAAGAGAAATATCTCTGGACTTAGAGTAAAAGAAAATAGCCCCGTGCTAATTTTGACTATGGGCAAGTCACTTAATTGAGGCTTACCTTCCATACCTATTACTTAAAGATAATCTTTGTCCTGCCTAATTCACAGGATTGTTGTGAGAGTGAGATAAGATAATCTAAGTAAAAGAGTGTTGTATAAAGTGCTATTAAATATATATGTGCTATTATGGCATAATATAGTTAACTCCCAGTCCAGCCACTACCTGACACTCTCTTTATGGTAGCTTGTAGTAGAGATTCTTGTCTTAGATAGAAATTTGAACTAAATAACTCAAACCCTTTCCAATCTATATATACAATGATTATGACACATAAGTCTATTACTTAACCATTTCTGTATGTTACATATCAAAGTTTTGAATATGTAATGCCAGAGTTAAAATACTAAAGCATTCTATGAAAATTATATAGATCAAAATGCAAGAAATATTAAGAAGCTTGTTTTGTTTAATGGTGGACAAAGACCTTAAACTAAAATCTGCTGTGTATAATTCTCTAGGAAGGGGGATAGTCCAAATGCCTGATTTCCCCCCGAATTTATGAACTCTGTATATTAGCTCCGTAGCCATGTTTACCAAGCTACAAGAAGAAAGGAGATCCCTTTAACTAAAATGTCAGTGATTAGGTTTTAAGGGATTTCAAATTACTAGGGAAGGACCCAGACACTTAGTGACTCCCTAGTGATTTGAAAATCTTCCTGGCTGCTGGCAGTAGTTTGCATGGAGACTGAATATTATCTCAGCCCTTTTGAAAAAGTAAAGAAGCTACAAATCCAGTGGCTGTTCAAAACAACAAAGAGGGTTGAGGTGCCTTTGGCTTCTAACAGGACTGTCTCTGAATTCCTCAAGGAATTCCAGGCCTAGAGTTGATCCAGCTGGCAGGAGGTATCGATCTCCACTTGAATTCACTGAATAAATAATGGTTGCCATAGTTATTGAGCAGTCGCAACTGGTTGGAGAGCAGGGAAAATTCTGCAGTACCTTCTGTGAGTTTGGCCATGAGAAAGTCTGGTTACAAGGTTCCACAATCAGCTCCCTCCCCAAATCCAGCCAACATATTACTCAGTTCCTGTATCCTGATGATGAATATGAGATCTTGAATGTTATGTAAGACATGAGACACTGAAAGGAAGGGAAAGCTTAAATCAATGGACTGGTATTTATTCTGAGAAAGGCGTCTCTCCCTAGGTTATGAATATAATTGAATATTTTTCATTATTAATTCAATTTAGTATCAGCAAGGTGATGTTTGATCATGTTATAGCATTCAAGGGCTTCACAAAGGACGAAATCCATCTCGTTCTATTTTAACATTATTATACAAAGAGCACAACCTGGACATTTTAAAAGGAAGGAAAATTTATCCCAAAACCCCATAGGTATTTTCACGTTTATATTTTCTTTCACCCTTCTCTATATGAAGAAATAATTTTTGCATAGATGGAATCACAGCTTTAGTATTTAATATTCTACTCTTTATTTAATGTTGTAAACGTTTTTTTTTTTAATTTTGCTTCATGGCCTTCACATTTGTTCTGTTTGATGTCTTCAGAATCTTCCCTTCCATATACCATTATTTACTTAACAGTTCCCCTATTCTTCAGCCCTTTGCCTTTTTCCAGTTTTTTGTTTGTTTGCTTTTGTTTTGTTTTGTCTTGGTAATAGATAATGCTGAACCAAATGTCTCCATGTATACAGTTTTATTCTTCTGTTAAATGTTTCCTTTGGATAAATTCCCAAGAGTGGGATTACTTGGTCAGAGGCTATGAACGATTTATAGCTCTTGAAATTTACTGCCAAATTTACAGCCTGTTCTTTTGTTTTGGGGAGAAAATAAAACTTTAGGCAGAACACCACTGCATGCAGGATTCTCTTAAAATTCATTCTCTTAAAATTCACAACAGTCTCTTCTGAGACTGAAACATGGAGCCTGTGTATTTAGTAATGATAAGCCGTAGGAGACAGGTCCGCACCTGGGCTGATTAGCTAATAGTTTCTCAGGGAAAGCAAAATGATGCACTGCAAAGCTTGGAAATTAGGCCACGAATTGCTTTTTGTTAGACCTTGTAGTTACCAGCCACTTGCCCACTGGCAAGCATTGTCTTTGGTTCTGATTATTCCATGTGTATAGCACTCTACAGCTGACAGACCACTTTTCCATAACATTATCTTAATTGAGCCACAATAATCCATGGAGTTGGGTTTTATTATCATTGTACTTTTTCTTTTAATTTATTACATAACATTGAAGACACACAGGAATAATAACAGCAAAGGCTGTGTATCTGCCACTCAATAATTCCGATTTTCCTGTGAAGACATTGAGCCTTAGAGAAATTAGGTCACCCAGCTAGTAAATGACAGAACCAGAACTAGAACCTAGGTCTGTCTAACTCCAGGGCCAGTGCCCATCTCTTTATAGCATATTGCATTGAGACAAGATGCCTGCAACTTACAGTCCATGGAGATCCCGCTGGCAATCTTCATGGTTGTATTTTAATATCATTATAACATATCAGGCCAGGTGCAGTGGTGCATGCCTGTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGCTCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCTGATATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACACACTTGTAATCCCAGCTACTTGGGATGCTGAGGCAGGAGGATCTTTTGAAACCGGGAATGTTGCAGTGAGCTGAGATTTCACCACTGCATAGCCTGAGTGACAGAGTGAGACTCTGTCAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAAGGAAGGAAGGAGGACACATCAGAGCTTTGGGACCTTACAGATAATGAAGTTCAACCGTCTCCTTTTACAGGGCCCCAAAGTGGGAGGAACTTCCCCAAATCATACACAACTAGCCAAACTGAGGATAATGCAAATTTTCTGGTTCCCAGGCCTCTTATTTGGGACAAGAAAAAAGTGTCTGGATAGTTCTTCATTTTTCTTATTGGCTTTTGCTTCAAGGAAATAACTTTTCTAACAAAAATGCCCCCAACTTAAAAAATTAATTTAGAGCCAGGCACGGTAGCTCATGCCTGTAATTTCAGTGCTTTGGGAAACTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAAGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGGCCCTGCCTCTACAAAAAATAATTTAAAAATCAACCAGGTATGGTGGTGCATGCCTATAGACCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCCCAGGAGTTCCAGGCTACAGTGAACCATGACTGCACCACTGCACTGCAGCCCAGGCAAGAGAGCAAGACCATGACTCAAAAAAAAAAAAAATTAATTTTGTAAAAATTAGAAACTATTGCTTGATTTCCCATTAGAAGGATGTCTTCCATCTCTCAAGAATTATGATTTTACATGTAAATGTACTGAGAGAAGAAAATTTCGAGATAACAGAGGCCAAGCTCTTCCTTTAGAAATGAGGCTCTGAGGCCAGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGATGGGAGGATTACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCATCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTACACACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGGTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCGGGGTGGAGGAAGTGGGGGAGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACCCCAGCCTAGGCAACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAAATGAGGCTCTGAAGTCTAAATGTTGAGGAAAAGCATAGTGATTTGTTGTGGATGTCAGGCTCCCTTCTCATTGCTTTGGAACAAGAGACCAGTATTTGCCTCAGAAAACTGGGTTCTAATCCTAGCTTTTAGCAGCTGAGTGACTTTGGGAAATTCATTTAACCTTATACATAAGATAGATCATAGTATTTAACATGGAGATCATTTTATATATTGTTTTGTAAAATATAAGATACTGGTATTTGTGTCTTAATACATTATAACATGCCTGCACCACATCCTTCTGGGCTTCCTCCCCTTCTCTTTGGCTTTTCCATCTCCACAGCAGGAGGACATGTGTATTTTGTACAGAGTGCCAGGTGTAGGTCAACAGGGGTTTCAAGTGGGGGGGAACAAAACAAGGAAAAGAAAAGCTGAATTCTTCTCAGTGCTGGTTAGCATGAAAACACAGGAATGCACTTTGCTGTGTTGGGTCTTTTCGAGCAGCCCTTGCATTAGCAAATGGAAGTTACAGCCTCCCCACCTCCCTTAAATGAGTCTGTCAAGATAGAAACATTAATTCATTTGCCTGGATGTGTTTCTATGTCACTCTGAAAAATAGTTGCCTACTGACAAGGCTTTGTGAGAGCTTAGTAGGATAATGTATGCAAAATAATAACCACCCTGCCATTCATTCCATGTGGCTGTGTGCCAGGAACTGTGCTTCCCTTGTGTTACTTACCTAAGCTGGCCATCCCAGAAACCCTGAATTGGGTATGATCATTTTCTTCATCTCATAAGGAAATGGGTGCTCAGAAGTAAAGAGACTTACTCTAGGGCACACAGCAAGTAAGTGTTGGGACTGGGATTCAAACCTTGGTGTTGCTTCATACCAAAGGCCATGAGCTATCTCTAACAGGGAGGGCACTTTGATTGCAAAGAAGCTATCCAAACTGGCAGAATGAGACACAGACCTCAATTAGGGATTCAAAGTGTCTTAAGATGTATTTGCCTCCTAAACTTCTTGCCCTTCTCTATCCCTCTGCAG
Seq C2 exon
AAAGACATGGGTTAAAAGAACCAAAGAGAGTCGAAGAGCTATGCAACAAGATCACAAGCAGTTTAAAAGACCACCAGAGTAAGGGACAGGCTCTGGAGCCCACCGAGTCCAAGGTCCTGGGTGCCCTGGTAGAACTGAGGAAGATCTGCACCCTGGGCCTCCAGCGCATCTTCTACCTGAAGCTGGAAGACTTGGTGTCTCCACCTTCCATCATTGACAAGCTCTTCCTGGACACCCTACCTTTCTAATCAGGAGCAGTGGAGCAGTGAGCTGCCTCCTCTCCTAGCACCTGCTTGCTACGCAGCAAAGGGATAGGTTTGGAAACCTATCATTTCCTGTCCTTCCTTAAGAGGAAAAGCAGCTCCTGTAGAAAGCAAAGACTTTCTTTTTTTTCTGGCTCTTTTCCTTACAACCTAAAGCCAGAAAACTTGCAGAGTATTGTGTTGGGGTTGTGTTTTATATTTAGGCATTGGGGGATGGGGTGGGAGGGGGTTATAGTTCATGAGGGTTTTCTAAGAAATTGCTAACAAAGCACTTTTGGACAATGCTATCCCAGCAGGAAAAAAAAGGATAATATAACTGTTTTAAAACTCTTTCTGGGGAATCCAATTATAGTTGCTTTGTATTTAAAAACAAGAACAGCCAAGGGTTGTTCGCCAGGGTAGGATGTGTCTTAAAGATTGGTCCCTTGAAAATATGCTTCCTGTATCAAAGGTACGTATGTGGTGCAAACAAGGCAGAAACTTCCTTTTAATTTCCTTCTTCCTTTATTTTAACAAATGGTGAAAGATGGAGGATTACCTACAAATCAGACATGGCAAAACAATAATGGCTGTTTGCTTCCATAAACAAGTGCAATTTTTTAAAGTGCTGTCTTACTAAGTCTTGTTTATTAACTCTCCTTTATTCTATATGGAAATAAAAAGGAGGCAGTCATGTTAGCAAATGACACGTTAATATCCCTAGCAGAGGCTGTGTTCACCTTCCCTGTCGATCCCTTCTGAGGTATGGCCCATCCAAGACTTTTAGGCCATTCTTGATGGAACCAGATCCCTGCCCTGACTGTCCAGCTATCCTGAAAGTGGATCAGATTATAAACTGGATTACATGTAACTGTTTTGGTTGTGTTCTATCAACCCCACCAGAGTTCCCTAAACTTGCTTCAGTTATAGTAACTGACTGGTATATTCATTCAGAAGCGCCATAAGTCAGTTGAGTATTTGATCCCTAGATAAGAACATGCAAATCAGCAGGAACTGGTCATACAGGGTAAGCACCAGGGACAATAAGGATTTTTATAGATATAATTTAATTTTTGTTATTGGTTAAGGAGACAATTTTGGAGAGCAAGCAAATCTTTTTAAAAAATAGTATGAATGTGAATACTAGAAAAGATTTAAAAAATAGTATGAGTGTGAGTACTAGGAAGGATTAGTGGGCTGCGTTTCAACATTCCGTGTTCGTACTCCCTTTTGTATGTTTCTACTGTTAATGCCATATTACTATGAGATAATTTGTTGCATAGTGTCCTTATTTGTATAAACATTTGTATGCACGTTATATTGTAATAGCTTTGCCTGTATTTATTGCAAGACCACCAGCTCCTGGAAGCTGAGTTACAGAGTAATTAAATGGGGTGTTCACAGTGACTTGGATACACCAATTAGAAATTAAATAAGCAAATATATATATATATATAAATATAGCAGGTTACATATATATATTTATAATGTGTCTTTTTATTAACCATTTGTACAATAAATGTCACTTCCCATGCCGTTATTTTATGGTTCATTTGCAGTGACTTTTAAGGCAGTACTGTTTAGCACTTTGATATTAAAATTTTGCTTATGTTTTGCTAAATTCGAATAATGTTTGAAGATTTTTAGGTCTAAAAGTCTTTATATTATATACTCTGTATCAAGTCAAAATATCTTTGGCCATTTTGCTAAGAAACAAACTTTGAATGTCAAACTGATGTCACAGTAGTTTTTGTTAGCTTTAAATCATTTTTGCTTTAGTCTTTTTAAAGGAAAATAACAAAACTATGCTGTTTATATTGTCATTAAATTATACAATCAAACAAATGCCAAATGAATTGCCTAATTGCTGCAAAGTATAACCCAGATAGGAAATCATATGTTTTTTTCCAAGAGTCATTCTAATATTTGATTATGTTATGTGTGCTTTTATGAAAGATTGTTATTTTTATATATCAAGATGATAGAACCTGGAATGTTAGGATTTTGAAATGTTAGACTTGGAAGGGGCCTGGTCTGTCAACTAGTCCAACCCCTTAAAATTCATAGAGGAGCAAACTGGGGCCCATTGAAGGGTGAAGAGTTACTCAAGGTCAAACAGCTGGTAACAGAATCAAGACTAAGACCTAATTTACCTTTCCATACTCTTTTTTTTTCTCAACTTCATCTATATAAAATCAGGCTTTTAAACATAACCACTAATATTTACCTGAAGATAACCATGAGTAAAGTATACTTTTGCATTAATTTTTTGAGCTTATATGCAAACATAATAAATATTATTAAATATCAGGAAAGCTAACATTTCATACAAGATAGCTTCAGACCAAATTCAAATTGAATTTGAATAAATTAGAAATACTGTGCATACATAACCTTCTTGTGCACCATGAGTATTTGGAAAGTTAATCCTTGTTTTTGTCGTGTCTATAAAGGAAGAACAAAACAAAATAAAAACAGAGCCCTAGAGAAATGCTGTTACTTTTTATTTTTACACCCATCAGATTTAAGGAAAAGACTTTTTAGCCATTATAATCTAGTGGTTGGAAGGAATGAAGAAGCTTTTTTAGTAATAGGTCCAGATATGAGTGCTAAAAATAAAGATGATAGCATGTTCTTCTGTCTTCCATAGTTATTACAACTATGAGAGCCTCCCAAGTCATCTTATCAACTCAACTCCCTTTTTTTTGTCTTAATGTTGCACATAAGTTTATACAGAGTGGATGACCACACTAGCACAGAAGAGAACAACATGTATTAAAGCAGGTGATTCCTCCCCTTGGCGGGAGAGCTCTCTCAGTGTGAACATGCCTTCTGTGGGCGGAAATCAGGAAGCCACCAGCTGTTAATGGAGAGTGCCTTGCTTTTATTTCAGACAGCAGAGTTTTCCAAAGTTTCTCTGCTCCTCTAACAGCATTGCTCTTTAGTGTGTGTTAACCTGTGGTTTGAAAGAAATGCTCTTGTACATTAACAATGTAAATTTAAATGATTAAATTACATTTTATCAATGGC
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000119508-NR4A3:NM_173200:6
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0010425=Hormone_recep=FE(32.3=100)
A:
NA
C2:
PF0010425=Hormone_recep=PD(34.4=77.1)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)