HsaINT0029140 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000135205 | CCDC146
Description
coiled-coil domain containing 146 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29296]
Coordinates
chr7:77167658-77237029:+
Coord C1 exon
chr7:77167658-77167824
Coord A exon
chr7:77167825-77236946
Coord C2 exon
chr7:77236947-77237029
Length
69122 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTATAT
5' ss Score
7.3
3' ss Seq
CCTTATGTTCTCTTTGCTAGTTA
3' ss Score
8.1
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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NO
Main Inclusion Isoform:
NA

Other Inclusion Isoforms:
NA
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Other assemblies
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development