Special

HsaINT0029140 @ hg38

Intron Retention

Gene
ENSG00000135205 | CCDC146
Description
coiled-coil domain containing 146 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29296]
Coordinates
chr7:77167658-77237029:+
Coord C1 exon
chr7:77167658-77167824
Coord A exon
chr7:77167825-77236946
Coord C2 exon
chr7:77236947-77237029
Length
69122 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTATAT
5' ss Score
7.3
3' ss Seq
CCTTATGTTCTCTTTGCTAGTTA
3' ss Score
8.1
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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NO


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
Other assemblies
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
Zebrafish
(danRer10)
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Autistic and control brains
  • Pre-implantation embryo development