HsaINT0036323 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000169504 | CLIC4
Description
chloride intracellular channel 4 [Source:HGNC Symbol;Acc:13518]
Coordinates
chr1:25124233-25140710:+
Coord C1 exon
chr1:25124233-25124342
Coord A exon
chr1:25124343-25140584
Coord C2 exon
chr1:25140585-25140710
Length
16242 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGA
5' ss Score
10.57
3' ss Seq
ACCAATATTTTGCCCAACAGGAA
3' ss Score
9.01
Exon sequences
Seq C1 exon
GCTGGCAGTGATGGTGAAAGCATAGGAAACTGCCCCTTTTCCCAGAGGCTCTTCATGATTCTTTGGCTCAAAGGAGTTGTATTTAGTGTGACGACTGTTGACCTGAAAAG
Seq A exon
GTAAGACATGGTCGCAGTTTGCAATCAACTTAAGCTGAACTATCTTTTCAGTTTGATCCTATTTTCACCTTGATGGCACATATTCTCTAAAGGAAATATATTGTATTAAAGTTCTGCTGGTTTATGGACAAACAACTTGTATATAACTATTTTGGACAAGTCACGCTGTCAGTATACTGCGTGGCTACTCAGTCTTTTTTAGGAACTTTTGTATGTTTACCTTAAATTTCATGAGTAGCACTAGGAGCTAAGTGTTAGTGTGGATGCAGTGAAATCCTTGACTTCTTTTTTCCAGTGTAAACATGGAGTCATGAAGAGCTTTCTAAGCAGACATCATCTTGGCCCCAAATGTGTTAAGCATGTGATCTTTATAATCTGGATCTTCAAAGACAAGGATTTTTAGGAGGTTGAATACCGTTGTTGTCAATTTCATTTAATTTATTTTTCAGAGAATAACAGTAATTTTCTATAGCATTTTAGCTATAATGCAAGTATTTTAATCATATTTGTTTAAATGTATTGTAAAATAAGAGCAATTATCTGTGGCCCGGTGTCTGTTCTTGCTAAGTGAAGAGTTGTTTGTAGGTTTCTCTCCTGGATGACTTTATGGCTTATTTTCCATAGTGGAGAGGGCTGAGAAGAGCCGTGATGAGTAGAAAGCTCTGTTTTATTCAGGAATGTCTATTCACCTTTAGCAAACAGGTCTGAGGTGAAGAACATTCATACATCCCCTTCCCCAAAAGATTTAAATCAAGGGTTAAGAATAGTTGTATTGCTCTTCCTCTCCCTCTCCCCACGGTGTCCCTCTCTTTCCACGGTCTCCCTCTCTTTCCACGGTCTCCCTCTCATGCGGAGCCGAAGCTGGACTGTACTGCCGCCATCTCGGCTCACTGCAACCTCCCTGCCTGATTCTCCTGCCTCAGCCTGCCGAGTGCCTGCGATTGCAGGCACGCGCCGCCACGCCTGACTGGTTTTGGTGGAGACGGGGTTTCGCTGTGTTGGCCGGGCAGGTCTCCAGCCCCTAACCGCGAGTGATCCGCCAGCCTCGGCCTCCCGAGGTGCCGGGATTGCAGACGGAGTCTGGTTCACTCAGTGCTCAATGGTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCGCTGCAACCTCCACCTCCCAGCCGTCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCGAGATTGCAGCCTCTGCCCGGCCGCCACCCCATCTGGGAAGTGAGGAGTGTCTCTGCCTGGCCGCGCATCGTCTGGGATGTGAGGAGCCCCTCTGCCTGGCTGCCTAGTCTGGAAAGTGAGGAGCGTCTCCGCCTGGCCGCCATCCCATCTAGGAAGTGAGGAGCGGCGCCTCTTCCCGGCTGCCATCACATCTAGGAAGTGAGGAGCGTCTCTGCCCGGCCGCCCATCGTCTGAGATGTGGGGAGCGCCTCTGCCCCGCCTCCCCATCTGGGATGTGAGGAGCGCCTCTGCCCGGCCGCAACCCCGTCTGGGAGGTGAGGAGCGTCTCTGTCCGGCCGCCCCGTCTGAGAAGTGAGGAGACCCTCTGCCTGGCAACCACCCCGTCTGAGAAGTGAGGAAGCCCCTCCGCCCGGCAGCTGCCCCGTCTGAGAAGTGAGGAGCCTCTCCACCCGGCAGCCACCCCATCTGGGAAGTGAGGAGCGTCTCCGCCCGGCAGCCCCCCCATCTGGGAAGTGAGGAGCGTCTCCGCCCGGCCAGCCGCCCCGTCGGGGAGGGAGGTGGGGGGGTCAGCCCCCCGCCCGGCCAGCCGCCCCGTCGGGGAGGGAGGTGGGGGGGGTCAGCCCCCCCGCCCGGCCAGCCGCCCCGTCCGGGAGGGAGGTGGGGGGGTCAGCCCCCCGCCCGGCCAGCCGCCCCGTCCGGGAGGGAGGTGGGGGGGTCAGCCCCCTGCCCGGCCAGCTGCCCCGTCTGGGAGGTGAGGGGCGCCTCTGCCCGGCCGCCCCTACTGGGAAGTGAGGAGCCCCTCTGCCCGGCCAGCCGCCCCGTCCGGGAGGGAGGTGGGGGGGGTCAGCCCCCCGCCCGGCCAGCCACCCCGTCCGGGGGGGGGGGTCAGCCCCCCCACCTGGCCAGCCGCCCCGTCTGGGAGGTGAGGGGCGCCTCTGCCCGGCCGCCCCTACTGGGAAGTGAGGAGCCCCTCTGCCCGGCCAGCCGCCCCGTCCGGGAGGGAGGTGGGGGGGTCAGCCCCCTGCCCGGCCAGCTGCCCCGTCTGGGAGGTGAGGGGCGCCTCTGCCCGGCCGCCCCTACTGGGAAGTGAGGAGCCCCTCTGCCCGGCCAGCCGCCCCGTCCGGGAGGGAGGTGGGGGGGGTCAGCCCCCCGCCCGGCCAGCCACCCCGTCCGGGGGGGGGGGTCAGCCCCCCCACCTGGCCAGCCGCCCCGTCTGGGAGGTGAGGGGCGCCTCTGCCCGGCCGCCCCTACTGGGAAGTGAGGAGCCCCTCTGCCCGGCCAGCCGCCCCGTCCGGGAGGGAGGTGGGGGGGTCAGCCCCCCACCCGGCCAGCCGCCCCGTCCGGGAGGGAGGTGGGGGGGTCAGCCCCCAGCCTGGCCAGCTGCCCCGTCTGGGAGGGAGGTGGAGGGGTCAGCCCCCTGCCCGGCCAGCCGCCCCGTCCGGGAGGTGAGGGGCGCCTCTGCCCGGCCGCCCCTACTGGGAAGTGAGGAGCCCCTCTGCCTGGCCACCACCCCGTCTGGGAGGTGTGCCCAACAGTTCATTGAGAATGGGCCAGGATGACAATGGCGGCTTTGTGGAATAGAAAGGCGGGAAAGGTGGGGAGAAGATTGAGAAATCGGATGGTTGCCGTGTCTGTGTAGAAAGAAGTAGACATGGGAGACTTTTCATTTTGTTCTGCACTAAGAAAAATTCTTCTGCCTTGGGATCTTGTTGGTCTGTGACCTTACCCCCAACCCTGTGCTCTCTGAAACGTGTGCTGTGTCCACTCAGGGTTAAATGGATTAAGGGTGGTGCAAGATGTGCTTTGCTAAACAGATGCTTGAAGGCAGCATGCTCGTTAAGAGTCATCACCACTCCCTAATCTCAAGTAATCAGGGACAAACACTGCGGAAGGCCGCAGGGTCCTCTGCCTAGGAAAACCAGAGACCTTTGTTCACTTGTTTATCTGCTGACCTTCCCTCCACTATTGTCCCATGACCCTGCCAAATCCCCCTCTGTGAGAAACACCCAAGAATTATCAATAAAAAAATAAATTAAAAAAAAAAAAAAGAATAGTTGTATTAATGGGAAAAACTAGGGTTTGGCAGTGGATTCCTCTTGATGCAAGTGTCACAACATGATTTGCTATTATACTGATTTTTAAAACTATTAGTCTGTTCTCACATTGCTATAAAGAACTACCTGAGACTGGGTAATTCATAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTGGCAGTTCTGCAGGTTGTACAGGAAACTTGTCTGGGGAGGCCTCAGGAGACTTACAAGTATGATAGAAGTCAAAGGGGAAGCAGACATGTCTTTCATGGCCGGAGAAGGAAGAAGAGAGAAGGGGGAGGTGTTACATATTTTTAAACAACCAGATCTTGTGAGAACTCACTCTCTGTCACAGGAACAGCAAGGGAAGTCTGCCCTTGTGATCCAGTCACCTCCCACAAGGCCCCTCTTCCACCATTGAAAATTACAATTTGATATGAGATTTGGGCAAGGACAGAAATTTAAACCATATTATATATCAAGTCATGAACAGTGTCCAGGAAAAGATATTGACAGCCTATCACTTGATAAAGTGGCAGAATTAATCTATGTTATCCCTCTGAGCATCACATGCTGATAGTTACCTGAGAGCTATAATTCCATTCCAAGTTCTAGGTTAGTGTACTCAGATTTCTGTCATTCCCTTAAAATACATTTTTACTTACTGCTAGTGCATATATTTGAAATTTTACAGACTTTAAAATTTATTGAACATAAGCCATAAAGTCATCAAGGAACCCCTTTAGTTATGTATATAAATGTAGAAATAAGCCTTTGGGAATAGTGAGTTAAAACTACAAGCTCTTGGGAAGACATTACCTTATTCATGTTGGGCAGAGATGTAAGAATGAAATAAGTCATGTAGTTACCCTTCTATTACTGTTTTTTTTTTATACATGTGTACACAAAGCAAGTTTCCCAATATAACTCCTAAAAATAGAGTGTGCCACCAGGCACACACCCTTACTGTGTCCTAAAATACATGAATTTCTCCTATTCCATTTTTGGCTTGGAGCAAGTGAGTTGACTGCCATTCTTTGAAAAAGCTGTCATTGAATAGTTTAATACAGTGCTTTAATTGTGATACATACCAGTAATAGTGCCATAAACATGGGAATCTGGGTCAGAAAAGGAAGTAAACCCATTATAGCTATTTCAGAGTTGTCTGTTTCTTTTCATTTGCAGATTTTTTAAAGGCATTATTCCTATAGGTTGATTGATATTTGCAGATTTGTATATATATGTTAAAGTGTGTATGTGGAAATATGTGTAAGTGTATATGTTAAGTGTTTATATATATAAAAAGTGGCGCATGGGAGGTAGGCATTCAGGGCCTTATAATTAGAAAATATCAAAGAAGATATATGTTTATTACCTAGGGCTTTATGTAAAATCAATGGTAGAGAGCACTTAAAATTGAAGCTTATATTTTTTGGTCTTTAACAATCATAGGTCTCCAGTAAATATAAAAAATGCTTCTTAGGGCAACTAAAACTAAGCAAGTAGTACGTGATAATGAGTCTGTACCATCCCTACCCCCTAGTCATCAACTTCCCCTTCAGAGAGATAATTTATTTTAGGTTTGGTCTTTATTCTTCCAAATCTTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACACGGTCTGCCTCTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCACAGCTTACTCTGTAGCCTTGAGCTCCTGGGCTCAAGTAATCCTCCAGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTAGGACTACAGGCATTTACTGCCATACCTGGCTAATTTTTTATTTTTAAGAGACAGGGTCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCCTCTGGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACTTTAGCCACTGTGCCTGGCCTCGTCCAAATCTTTTCTATGAGTTTACACACTTGCAGTCTTGAACAAAATTTTAAAGAGAAAGTACCTCAAGAAAGTGAGCATTGGTTCAAAAAACAAAAACAAACAACCCACCAGTATATATGAAAGTTATCACAGAGGAATAAAACATCCCTGTAGTACTTTTCATAATATATTCTTAATCTTAAAACATTAAATGTGACTCTTTTTAGAAATCTTGGGGGAGAAAATATGCCTACAGTGCTTATTTTCCTGCTTTTCCTGGTAATTGCCTAATATCTTGGTGAGAAGTACTGACTCCAGAACAAACCAGTGGAGAACAATAGAACTCCTCTGAGAGTTACTTAGCAGCTCACTCTATGATTTGAAAAAAATGATTGTTACATGACATTTCATCCATAAGAACAAGCCCATTTCTAGTTCTGGCACTGTATGACATGTTCTCTTTGAATCTCAGTTGGCATTAATGACTATGCTGGTAGTATTCATGTGTCCCTTGTGAGGCTGTGAACAATCTCCCATTACTTGCCTGCCAGAGCAGCCTTCGTGCTTTGGTGGGAGTCATTTCCAAATCTAATTTTCTGTTCATATTGCAATTTAAAGAACGTTTAGATAGAAAAAAAAGGGCCCAGGCTTCACAAAGAATTTCAATTTACATCAACGATTTGAACAAAAGCTTCAGATAATATAAGTGAAAATACTAAAATTGGGGCAGAGTTAAAGATGTTCTGGCATGTCATCAGTTGGGAAACAACCATGGCATAGTATAGAAAATTTCAGGAGTGAGACCTAGCTGTGTATGGAGAGAGCTCTATCACTGATTTCACTGGGACCTGGGGCGAGCTGCCTCATCTTCCTTGGAGTTAGTTACCTTATATTTAAAATCAGGAGAAAAGGGAAAAAAACTTCACTTTTGTAATAGTTTAAAATGTTACAATGGAACTATGAAACTGATAGTTCTGCATATCTTAAAAGGCAGTTAGAAACTCAGAAAAAAATCTGATTCCCAAATAGACTCTTCAGATAGTTTTATCTTCATGATCATGTCTCTGTGGTTCCACCTTTCTGAAAACAGTCTTCAGTAACTTAAGAAATCATTTCAACTTCCATGATCTTCAGTAGCAGCAGCATGAATGACACATGCCAAGAGACTAAATGGAATGAGATAAGCCTGTCTTTCAGAGACATCATCTATTTCCTGCTGCTGTCCAGACAGGAAAGTCAGACTCCATTTTTCCCCTTTGTAAAGTTGACTTGAGCTACATGAAGCACTTGTTAGAACAGTCCAATTCAAGATAATTGTGCTTTATGACTGCATTCAGAATCACATGTGTACCCACTGTGTGTGTGGGGGGTGTGTGTATGTGTGTGCATGTGTGTGGGTGGGTGGGTGGAGGGGGTGTGTGTGGGTAGGTGGGTGGTGGGGGTGTGTGTGTATGTGTGGGTGGGTGGGTGGTGGGGTGTGTGTAGGTGGGTTGGAGTGTGTGGGTTGAGGGTGTGTGTGTATGTGGGTGGGTGGGGGGATGTGTGTATGTGGGTGGGTGGGGGGATGTGTGTACGTGGGTGGGTGGGGATGTGTGTGTGTGTGTGATTGAGAGGGGAGGGAGATATAGACACACAGAGAGGGAGTATTTTGTTGCTATGTCTTTATGTTCTTTTTTAAGACGATTTCAAAGATGATACATCCTGTTGAGGCTGCTAAGAGCTGAATTAATAGAATTATTAGTGAATGTTTTTCTAAACCTGTTATCAGTATACACTTTACTCCTAAACTGTTATCAAGATGGTAAAAATTATAGACTCTATATTTGGGCCAGGCAAAGTGGCTCACTCTTGTAATCCCAGCGCTTTGAGAGGCCGGGGCAGGTGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTCGGGCATGGTGGTGAGTGCCTTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGCAAATCACGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAAAAACAAAGACAAACGAATTATGGAATCCATATTTGAAATCTTTTCATGGGTACTATTTTTTTTGAAGTATTCCTCCACAGATTGACAATAAAATTGACATTAAAAGTAGACAGATTAACAATATTTAATCCAAATCAGTAAAATTCTTTAACTGGTTGAACTGGGACAAAGACAAATTCTTAGTGACAAGGGGTCTTGGTGTGTGTGTTTTGTTGAGTCCATGATTAATTTGTTCAATTAGTGACTTGACTATCAGTCAAACCAGAATATAGCAAATCTAGTAAAGAATAATTAATAGTAGTAAAGCGTTCTGAAACAAATAATTCTGGTTCTCTGGTGTTAACTTTTGTGAGGTTTTTTGTTGTTGTTGTTATATGTTTATATAGTGTCCAGTAGTGTCTTTGATATGTGTGAATTAATTTTATGCCCTGAAAATCAGCACCTTCAAAAAGGAACTCGATTTTTTTTTGTTATTGTTCTCTTTCTGGAGAAAAAAGGAGCTCCATTTAAAAGATAAGGCCTACATACCTAGTACTTTTTTCTTCGTTGGGCAAGTCAACTTGTTACAGATGGGTCATCTTCAAGAGCCAGCTCCGGTGTTCTCTAGCTATGCTGCACTCATTTCATACCAAGCAGCTGGAACTGAGTCACCAGCCCAGCTTCCTCCAATTGTTGCAATTGTACTGAACTACATTTTAATAGAAATTAAGCCACTCAAGTCTCTTAAAATATTAGCTCCTATAGGATTCCTCCTTTTCATTCGTTTCTTTTCCTTTTGGTTTTTGTTTTTATTTCCTTTTCTTCATCTAGAAAAAAAATGGGAAACAACAGAATAATTTATTTCATCTGAAAGACTACCATGATACATGAGGGTAAAAATAATACACCCCAAAACACTGGAGAATATTTGCACCCTGTTGCAAGGCATGAGTTCTGTGCACTTTGCTCTTGATGTCACGTAAGGGAAATATTTGAATGAGTTTTAATCAAGTGTTGAGTATTTACTGAAGGCCTTTTTGGAAGTAAACCAAAGATGTCTTGAAATTTTTTGCCATTGCCTATTGGCTCAGTTTCATTTATCTCAAACTGCAATTCTTACAGTGTTACATTTCTGTGAAACATCTGTAAAATGAGCCTTTGTGGGTCAAACAGAACACCTGAGGCCTGAGAGGGCAGGTGAGAACTGCAAGTTGAAGAATCTTAGATTCTGTTTTGTTGATACATAGCTTGTGAGTGAATCAGATTACTGTTTAGAACTTGTCCATTTATTTGAAGTCTACTAATACGTTTGAAGGCACTAAAGTTTCTTCTCAGATTCTTCATTTGGAATCAGGACCTGCCATGGTTGTCTGTCATCTCAACAGTTAATCCTTGGAAACAGTTTTATCGCTTTATTTATTTAAAAAAATATATATATAGCCTTTCAACCAAAACAAGATAGACTATTCACTAATCACAAATATTAATGGAAAATTGGTAATCATATGTCCTTTAAACTTTCCTTGGTTGTATATATGACTCTAAATTAATCAGATTTTGTTTATTACCAATCAGTTAATGCTAGGTAACCATTTATGAACCATCAGCTCTATTAAAGTTAAAACTGCCAATCTGATTTCCTGCATAATGCTTTGTTAATATGATACTAAAAGTGGTAATGGCTTTCATTTGCATACTTTTAGTTCACTTTCACGTGCCTTATTTGATTTAATCTTTACAGACAAAGCAGATCTTATAAAGAGGAAATCCAGACCCAAAGAGGTTGTAATTTACTTAGTCATGTAGCTGGTAAATGGTAGAGCTTTTCCATTTGGGACTTCAAGCCAGTCCCTTTTCTTCAGCCTTGGTTCTTTTTTCTCTGATACGCTAGTTTTCTCCCTCTCCCAATAAATATTTTTATTTGGGAGCCGGGTGCAGTGGCGTGCTCTCTAGTCCCAGCTACTTGCAGCTGAGGATCATTTGAGACCAGGAGTTTGAGGACAGCCTGGGCAACATAGCAAGAGAGAGAGACCCCCATCTCTAAAAAAAAAGAAAATTGAATAAAAATTTAAAAAATTAAGAATCTTTCTGTTTAGAGAGCTTAAAAACTTTCATAATTAATTATAGAAGTAATAGGTGTTATTTATTTTGTCCCACATGCCCTACCCGACCTACCCCTTTGGGTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGCATTGAGACTGTTACAAATAAATTTTTGGTGCTGCAAAAGAAATAACACTTGAATATAAAATTTTCTTTTTAATTCTCAGCAAGGCAAGTTACTTCTATAGAAGGGTGCGCTCTTACACATGGAGCAATGGTGAGCACACACTTGGATAAGGTAGGGGAAGGGGTTTTTATCCCTGACTCACGTGGCCCCTGCTGCTGTGTCTTTCCCCTATTGGCTAGGGTTAGACCGCACAGACTAAAGTAATTCTGATTGGCTAATTTAAAGAGAGTCACCGGGTGAGTGGTTTGGCCAGAAAAATGGTTATGACAGAGCAGGTAATTGGAATGAGTCAGGGTGGAGCAGGTAATCGAAAATGGTCACTTTATGAGGAAGTTAAATTTAAAAGCAGAAGGTGAGGAATTGAACATACTGACATATTGATTATTTGAAAAGAAATTTAGAACTCATATCTAACAAGACCTTCTTCCCCTTTATCTAATCTACCGTGTTCTTAAAAAAAACTGTTTGTGAAAAACAGACTTATATTATTAACTTACAGTTAGGCATTTAATTGACTGTTCATTATAAAAATGTTAATGGATATGTTTTATGAATTTGGAGTGAGAAAATTGTTTTCCAGGTAATCACAATTTATATATGACAAGATTAAAAAACATTCCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAATTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTTCACCTCCCGGATTCAAGCAATTCTCCTTCCTCAGCCTCCTAACTGGGATTACAGGCGTGCGCCACTATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGTGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGGCTGGAACTCCTGACCTCAGCTGATCCGCCCGCCTTGGCCTGCCAAGGTGCTGAGATTATAGACATGAGCCACTGTGCCCGGTCTACAGTCATCTCTTGGTATCCATGGGGGATTGGTTCAAGGACCCCTGGTGGATACCAAAATCCACAGATGCTCAAGTTTCTTATATAAAATGGAATAGTATTTGCATATTAACCTACAAATAGCCTCCCATATACTTTAAATCATCTCTAGGTTATAATACCTAATACAGTGTAAATGCTATGTAAGTTGTCATTACACTGTGTTTAGGGAATAATGACAAGAAAAAGTCTGTACATGTTCAGTACAACTGCAACCGCCCCCGCCCCCGCCCTGCCGCCCTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCATTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTACAGTGTGTGATCATGGCTCGCCTCAGCCTTCCAAGTAGTATGTGCAACACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGATGGGAGATCTATCTATCTATCTATAAAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAGTAGCTAGGACTACAGGCACCCACCACCACGCCTGACTAATTTTTTTTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACAATGTCGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAAGTGATCTGCATGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGACGTGAGCCACTGCACATGGCCTTTTAAAAAATATTTTTGATCCTCAGTTGGTTGAATCCACAGATGCTGAACCCATGAATAAGGAGGGCTGACTTATTTCATTTTGTGAAAAACTTGAGCTTGTCAGACTAAAGAATGTTCAGTGAAAGCATCAGAGTTGAAAATCAAATCAGGTTTTGACTTTTAAAAGTCCTCTTTTGGAGGTTAGGTTCTTACAGAAGTTGATAGGAAATATGTCTTATTTTTCTTTGTTTAGGAAGCAAGATAGGCTCTAGAACTTGGACTTTGAGTTAAAAATTTTAAATTAATGAGATAATTAAATAAATCTTTGTTTCTTTGGTTGGAATGTAGTCATAGAAACCTGAGGCTTTCTAACCTAAATTGAAAGATGGAGCCAGAGAGAGAATATGAATAAGACCAAGGGAAATTGATAGATTATAAACTGGTTATAGATTTTTGATTCCCCTCTATCTTGAAAATTCTGATGACGAAGTATTTCACTTTCATGATATATTTAAAAATACTATTTTTGGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTTCCAGCAATTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCACTACTACACCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGCCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCTTCGGCCTCACAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCACCATGCCCAGCCAATATTCTTTATTTTATTCAAATTCTGTGCATTTATGGTCAGGAAGGAAGGAAGAAGGAAGGCAGGCAGGCTAACTTAATAACAAGATAAACAGCTCTGGGCTATAATAGGAGGCAGAAACATTCTTTGAAACTATATGTTGTTGTATTACTTTTCTTGAAGTACACATTTTTATGTTTGCTTTTATAATTATGAAAGTTTTCAAACATGCATAAGAATAGAATAAACTTCTCCGTAAACCCAATTCAGTTATCAAGATCTTGCCACATTTGCTTTGCCCCTTTTTTCTGATTTTCTTTGCTGAAATGTTTTAAAGTAAATGCTAGACATCATGTCGTTTCATCCCTACTTAATTCAGTGTATGTCTTCAAACAATGTGGACATTTTCTTCCCTAACCACAATGCTCTGATCTCCTGAAGTTCCTAGTATACAATTTGGGATTTCCCTGGTTATCTCTAAAATATCTTTTTATTTTTGGTTGGTTTGTTCAAATCAGTATCCAAGTAATTTCTACTTTTTATGTTTGATTGTTATATCTCTTAAGTTTTTCTTAATCTATAACAGTCCCCCACCTGTGTCTGGTAAAAATACCATTCAGCTGAAAGGTAGATTGTCCCAAATCCAGAATTTAGCAGTTGCTTCCTTGTGGTAGCATTTAACTTTGTCCTCTCATTTTCCCCCTCCCTGCATTTCCTGTAAATAATCTCAGGACCCCTTTGTACTCTTAAATTATTGAAGGCCTCAAACAGCTTTCAGTTATGTGGGTTATATCTACCTATTTTACTATATTAGAAATTAAAGTTGAGAAATTAGCCTAGGCAATATGGTGAGATCCTCATCTCTACAAAAAATTTTTTAAAAATTAGCTGGGCTTGATGGAGTGTGCCTCTGGTCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATTGCTTGAGCCTAGGAAATCAAGGCTGCAGGGAACCATGATTGTGACACTGCACTCCTGCTTTGGTGACTGGTCTCAAAAAAAAAAAATCCTGAGAAATTTTAAAAATGTTTATTTATGGCCGGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGACCATCCTGACTAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATACATCAAAAATTAGCTGGGCTTGGTGTGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACTTGGGAGATGGAGCTTGTAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTTCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAGGAAAAAAAAAAAAAATCATTTACTAATTCATTAAATATAGAACAATAATGAACCCACTACTTATTACCATAAAACATTTTTAATGTAAAACAACTATATTTCCCAAAACAAAAAATAGTGAGAAGAGTGGCATTCTTTTACATTTTTGCACATCTTAGAAGAGGTTTCTCGTGTCTGCTTCTGCATTCATTACCTTGTGATATCTTGTACCAAGTAGCCAAGTAAATTTGGAAAATTTTACTATATGTGCACGAGAGGAGAATGAGAGTGAAAAAGGCAAATGATGCCTTAGTATTATAAGAATAGTTCTGACCTAATGGATCACCTGGTGAAAGGGTCTCCTGGCTTACAATTTGAGAAACAGCTGCCCCAGAGGCTGCTTTGTTTTGGTTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGATATGATCACTGTTCACTGCAGCCTCGACCGCCTGGGCTCAACCAATCCTCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACCACACCCAGCTAATTAAAAAAAATTTTTTTATAGAGATGGGATCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGCTTGAACTCCTGGACTCAAGCAATCCTCCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTAATGTTACAGGTATGAGCCACTGCACCCAGCCTGCCCCAGAGGCTTGATTAGATTCAGGGTCAACTTCTTTGGTAAGAATACTTCATGGTGCCATAGGAAACACACCATATCTGGTCATCTCATTTTTTGATCCTAAAATTCATTGGTGGGTTTGGGTGAGCCATTTTGCTTTTTTAACAAGATAGTACAAACACTTCTTGCTGTTAGTAGTTGTCAGCATAACAGTTTCACCATCTTTATCAGTGTTTTGTGGTGTTTTCAATTTTTCCTAATCAACAGGAGGAAGACATCTTATTGTTTACTTTTAAATTCCCTTTATAGTTGTGCTATTTTACATTTTTCTGTGTGTTCACTTGTTTTATCTGTCTCTCATCAATTTCTTTTGACCCATACCTATTTGATTTTTTTGATGACCTTTGGAATGAATTTGGACAAAATCCTTAGGTAATGTAGATTTTAAGCTTTTCTCACTCAGTACTTTGTCCATTCTTTGTTGCTTTTTACCCTTCATTATGCCATCTTTTATGTATTGAAGTAATTTTGATATTAGATAGTCTAATCTGGTGATCCTTTTCCTTGTCAAGCCTGGACTTCTAGAATAATGGGAAAGAAATAGCACCAGAATTTGGAATCTTTTGAAGTTGAAGATGACTGCAGGATTCAGCTGCTTTTCTCTTTTATTTTGCCAAAAAGAAAAAAAAAGGCCTAGGGAAGTCATGACTTACCCATCTTTACACAATTAGTTGGGGCCAGAGTTGAAACCAGACACTAACTCTCCAAAATCTTTTTTCCCTCCTCATTCTATCACTATCTCTAATGAGTGACTTAGTTAATTTGGAATGAGAATGATGGATTTTGTATTTTGGTTAAAAAAAAAATCAAAGCATTTTCTTACCATAAATTATGTATTTTGTGGAGGCTTGCTTCTTATTAGAATACTATTACAGCTATTATATCTAGTGGAAAAGTACTATTTCTTTCTTTTTTTTGAGACAGAGTATTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGGTTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAACTACAGGTGCATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGCAGAGACGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGAGGGTCTCAATCTCTTGACCTCATGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTAGAGGCGTGAGCCACCACACCTGGTTGAAAAATACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGTGAGATCTCTGCTGACTGCAGCCTCTGCTTCCGGGATTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACATGCCACCACGCCCAATTAACTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTTCTGACCTCGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCGTGAGCCACCGTGCCCGGCTGAAAAATACCATTTCTTATTCAGTTTTATATACTTTAAATTTTAGAACCACTTTGATCTCTTTTCTTTTTCTTTTTCTCTTTTTCTTTTTCTTTTCTGACAGGGTTTTACTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTACATTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATCCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAACTACAGGTGCGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGCAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGGGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCATGCCCGGACAATTTATTTATTTTCTTTTTGAGACAGGGTCTCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCATGGCTCACTCCAGCCTCAACTTCCCAGGCTCAAGTGATCCTTCCACCTCAGCCTCCCTGGTAGCTGGTACTATAGACACGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTTATGTTTTGTGGAGACAGGATCTTACCATGTTGCCCAGGCTGGGTCTCAAACTCCTGGGCTAAGCAGTGTCCCACCTCAGCCTCCTGTAGTGCTACGACTACAGACGCAAGCCACCGTGCCTGGCCAACTTTGAGAATTTAAAGTATTATTGTTGTTTAAGAGTAAAAAATGATCTGATTTTGACCAATATTTTGCCCAACAG
Seq C2 exon
GAAGCCAGCAGACCTGCAGAACTTGGCTCCCGGGACCCACCCACCATTTATAACTTTCAACAGTGAAGTCAAAACGGATGTAAATAAGATTGAGGAATTTCTTGAAGAAGTCTTATGCCCTCCCAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000169504-CLIC4:NM_013943:2
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.047
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF134171=GST_N_3=PU(41.1=81.1)
A:
NA
C2:
PF134171=GST_N_3=FE(57.5=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)