HsaINT0047324 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000157680 | DGKI
Description
diacylglycerol kinase iota [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:2855]
Coordinates
chr7:137587097-137597907:-
Coord C1 exon
chr7:137597847-137597907
Coord A exon
chr7:137587211-137597846
Coord C2 exon
chr7:137587097-137587210
Length
10636 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ACGGTAGGT
5' ss Score
10.15
3' ss Seq
GGCCCCCGATACGCCTGTAGGTG
3' ss Score
5.51
Exon sequences
Seq C1 exon
GCTTGAATTGTATAGGAAAGTACCAAATCTGCGAATTCTGGCCTGTGGTGGGGATGGAACG
Seq A exon
GTAGGTCCCTGAGAGAGAATCCAGTTCTCTGCCAATTCTATCTTTCTTATTGTTTTCTTGTGGCACTTCTTTTTATTCGTTGCTCAGTCTTTCTAATCCCCTAACACATGTATATCTCTCATGTGAATCATAGCCCCTAAGAGTAACAAGGGACTTTGTTATTGTCCTTATGAATACATACTTGATCCTTCTAATGTGTGCTTCACTCCTTCAACTATGCTGTATTCTTTTGTGTGCCATGAAGTAGGGATGTGGTCAAATCCTTAAAATGAAGATTATAGATAGATAAATTCCTTTTAAAATATAAGCTGAACTGTTTCCATTTATTCTTAATAATTTGGCCACAGTAGGGAGAAATACGTGGACACAATTGAATTATTATGTTTTTTTTTTTACTAGTGGGAATAAAACTCAGAATATTGAGTGTTGTTTTGCCTTAAAGATTATTAATTGGTCCTATTTATGTTCTTTTTTGTTGACATACTTTACCTGTATATGGGGTATGTGTGATATTTTGTTATATGCATAGAATGTATAATGATCAAGTCAAGGTTTGGAGGTATCCATTACCTAGGCTATCATTTCTATGTGTTGGGAACATTTCAAGTTCTCTTTTCTAGCTACTTTGAAATATATAATACATTGTTGCTAACTGTACTCACCCTACTCTGCCATTGAACATTAGAACTTATTCCTTCTGACTGTATGTTTGTATTCATTTATGAAAAAAAGGTGGAATTGGGCTGAAGGTTAATATCATGGATATATTTTCTCCTGTTTATTATGCCTCATCGGTTTTCTCCATTTGGCCTCTACTTATGGTGATATATTTAACAAAGTAAAGAATTGAGAATCATGACATTTAGATTGTGTTGTCTGGTTCTTTTTCTTCCGGATTTGGAATCTGATCTCATAGGATCTACGAATGTATTATGAACTATCTTTAGCTTTTCTCTAATTTCCCTAATTAGAATGTTTTATTCTCAAAGGTAGCAACAAAATCTTCGAATACTATCTCTCTTAGCACATAAGCACTTAATGTAGGGTTGGATACACATTATATACCAATAAATGCAATGAGAATGAAATAGAACTGTGATTTTTATTGGTCTCTCAGATACTGTGTGGAGAGTAAAAACAATGTTCAGTTGGGAAAAATAGTCTTTATCTTTCTTCAAGGTTCATATTACACATTATTAGTTTATAAAATTCATTATAATGTCTTACAGCAAAGAAGCCAAACCTATTTAACTTTTTTAAACCCAACGTTTTTCAAAATTATTTGGCCATGGAATTTTTTTCCCCCACACAATACCAATTTCAATTGATTTTAGTGTTCTAGGGAGATCAATTTAAGGGATATGGTAGGGCAAAATTTCCCAACTTTCTTTAGTAAGAATTACATCCAAATGAACCCTCTGAGGATGGATATACTGTGTTCTTCCTAACTCAAGCATCCCCCAGCTTAGTTATCTTTAATGAAAGGGTAAACTCACTGTGACTCTTTACCATACCCATAGTTATCTTCCTTATTTTAGCATCTACTTGCCTTCTCATATGACTTCAGCATCTCACTCACATCTTTTCTCCTTTTCTAAACCTCAGTGACAAAAACAGATAAGTTGAGGATGTCGTCCTTCCTCTTTCTTAACTCAAATCCACATAAGCTATGCATAACATCCCCAGATCTTGGACTTCTTTGTTGCCTTGGGTGCTCCACCTCCCAGGCCTCCCTTTCTCCATGGAAACTCCCATTCCACCTCTCCCTCCCTCATTCTCTCTCCTTTCTTCTTCCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGTTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACAGCGGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGATGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACCCTGCCTGCCCGTTTTCCTTCTTTACTCAGCAGATATGTGGAGGAAGCACTGTGCTAGGTCATGTAGTATTGAGATATTCTCTGCAATTAGATGAATATTTGAAAGTATGGGATTCCAATGAATAAAAGATAAAGAGGAAAGAGAGCCAAGTCCACACACTTGTGAAATGTATAATTATGGGTCCGGAGCCAAAGTCCAAAAGGAAAATAAATGAAAAAATAGAAGAATAGGACAGCCACCAGTCTGTTCTGTCAAGTAAACAAACCAAAAAAGGAGTTTCAAGAAAGAGGCAGTAGTTACATTTTTAAGGAGAGACTGAAAAGTTACCATTGAATATGGAATTTCAAGAAAGCAGTTTCAATAGAGTATGTGGGGCAAAACCCAGAATGATGAGTAAGTGAAAGTTGGTACAATCTTAATAAATTCCTAATGGCCAGATCCGATTACAGTTTCGAATGTCTGTGATCTCTCTGATGCCATTGTCAGCCTCCTGACATGTAGACTACCTACTTCTCCTATTTTTCATATCCAGTCTTTTCAAGCAACTCTTCATTAATGATAGCATAACTATGAGTATTCCATAAGGGTAACTAATTTTTTTAATGTGGTAGGTACCTTTTCCTCTTAGGGACATTATCTATATTTTAACATCTGTTTTTACCTCCTCTGATGTAATTCACAAATGTACTAGTCATTTACACTTGGGTGCCCCATGGCCACTTGCATTCAGCATGCCTAAAATAAAAGTAGTACGTTTACCCTAGAGTTGGCACATTTAAACTAATTATTTTTGTCAGTGGTAACATCTGTAGTTAAAATACTTAGAATCAAAACTTTGCTTATCTTGTACCTTATGTAAACCCAAGTTTTATTTAATTTACCTTGTTAGGATAAGATGTTTTGTGAAAAACATGGGGTATATGAAATGTTTGTCATGGTATGTGATTGATTTTTTTTGTTTTGTTAGTTTAGAAAATGAAACTTTTAATTGTGGGCGGAGGCAGAGTTTATATAGAGGAAACAGCCTGAGGAATTCATGAAGAAAACTGCTGGCTTTAGGCAAGTGGAGTATAATTCTGAATTCAGGTATATATTTGACACAAGGTATTCAGCCTTTCGTTAGTGAGCACATCTGTCACTGTAGAAGCTGGCAGAATGCTGCCAGTAAAGTGACAAAGCTTAGGGAGAAATCAGAAATTGAATATTTTTCACTGACTGGGATGAGGCTATATTACCCCATAACCGTATTAGTTTAAATTAAGAGTATTATTTAAGGTATAGAAAGTATTATTTAAGGTATAGAAAGTTTGCATTACTTTGGAAAAAAGTTCTTAGGCTTCAATATTAGCTACTTTAATTGTATATTATTTAAAAAATACATGAAAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGAGCACATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCTTGGCCAATCTGATGAAACACCATCTCTATTAAAAATATAAAAATTAGTCGGGCATGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGTGGAGGTGGCAGTGAGCTGAGATTGTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGTGACACAGTGAGACTCTGTCTCAAGAAAGAAAAAAATATGAGAAAGCAGAGGGAAACATTCCCCAATAATGCACTTGGAAGTGGAGGTGAAAGAGGTGGTTCTGCTCTCATTTCTGTGACCTTTGGCAGGTTCCTTAACCTCTTTTGAGACCTTCTGAATCTACAAAGAAATGCATTCAGATCTCTAAGGTTCTTATAGCTGTAGCATTATAATAATATAGGCTATTGTTCAAGGGAACTTTAATGCAAGCCACATTTGTACAATTTTGAATTTTCTAGAAGGTACTTTTAAAAAGGTAAAAAGCAGGTGAAATTAGTTTATAATATATTTTATTTATCTAAAATAGTATCATTTCAATATGTGTTAATTTATAAACATTGTTAAGATATTTTATGTTCTATTTGTACAGTCTTCAAAATCTAGCATATATTTTATACTTACAGCACATCCAATTTGGATTAGCTATATTCGAGTGCTGGATCACCACATGTGGCCAATGGCTGCTGCGTTGGACAGTGCAGGTGTAGTCTCTTTGTTACTGGCTTGCACAGTTCAGAGGCTGTCACATAGTTACAGCTGTCAGATGGTCTGATCCCATTTTCAGATCTCTTGGCTGCAATAAATTCAGCTCACTCAAGAATGATCTCAAACCTTCATGTTTATAAATGAGAAATAGCCTGTCTTTGGTCATGTGATAAATTTGTATTTTCTCACTTCCTTGGCCACGTTGACACCTATTCAACTCCTAATGGCTGTCACCCTGCTGAAATATTGACGAGCACATGAACTGATCTCCTGAGGCTCACGTACTCTCATTATGGTTCCTTAAGGTGTGTGACCCATGGTCCCTATCTATCTGGCTCCTGACTTTGGTGAACTTGGCTGGATCTGCAAGTCCACCTTTAACCATTTTAATTATTTCCAAAAGGCCTGACATTAAATTGACTCCAGCCATCCACTTCATGCTTATTTCTTGTTCTATTGGCTTTTCTAGATGAAAAAGCATCCCAAATGGTAGACATCCCCATGCCCTGACTCACCACAGCCAATGCAAAGAAGGAAGTATTATTTTCCTTTAATTGATAGGGACAATCCCTCATCCTAAGCCCCTTTCCTCATTCATCCTCAGCCTAGTTATATTTCATCCTCTCTCACTGAGTAAGCACACAGTGTACCTTCAGTGTGGATTCTATATTGTTTCAAGAAAAGGTCATATTCTGATTTTTATCTTGATTTCTT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Seq C2 exon
GTGGGCTGGATCCTTTCCATCCTGGATGAACTGCAGCTGAGCCCTCAGCCTCCTGTGGGGGTCCTTCCTCTGGGGACTGGGAATGACCTGGCTCGAACTCTCAACTGGGGAGGG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000157680:ENST00000288490:12
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.026
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0078119=DAGK_cat=FE(16.0=100)
A:
NA
C2:
PF0078119=DAGK_cat=FE(29.6=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development