HsaINT0084457 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000157551 | KCNJ15
Description
potassium voltage-gated channel subfamily J member 15 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:6261]
Coordinates
chr21:38296926-38307357:+
Coord C1 exon
chr21:38296926-38297023
Coord A exon
chr21:38297024-38299243
Coord C2 exon
chr21:38299244-38307357
Length
2220 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAGTA
5' ss Score
5.89
3' ss Seq
ATCTTTGTCATTTCTCTAAGTGT
3' ss Score
6.08
Exon sequences
Seq C1 exon
GCAGTAGCAGAATCCCATGGTAGCCAGGTGGGTGAAGGGGAGCGAGGACGTTCTACCTGCCTTGAAGAAGACACCTGACCTGCGGAGTGAGTGACCAG
Seq A exon
GTAGTAGACGGTTCTGAGGGCATCACACACTTGAGGGAGGGAGGAGGACAGAGAGGGCCATGGCACCCTTTGACTGCTGAGTGCCAGCTGCTCTCTTTCCCACTGAGAAATGCTGCCCCCAACACACCCAGAGGCTCTAGGTCTTGTCCTGTGATTTCTGTCCACCAAGACTTGATAGGAGGTATGATAGATGCCATTAACTCCAGCACTATATACACAGGACTGCAGCAAAAGCGCTCTCAGCAGAAAGAGGAAACAGATACAGTTCATCCCAAGCCTGGCTTGCTGCCCCTTTGAAAGAGAGTTTCAAACAGAAGCTTCATGGTGCTGCCTTCATAAAAACAGGGCCAAGCTTTCCAGAATCTGGCAGAGGGCTGAGTGCCCGCAGGACACTTGTGTATCACTCACACTGGAAAACTTAATCCTCTGTTTTTATTTCAGTGGATTGAATGGCATGCAGTTTCCTCAGCAGCTTAAAAAAAATGCATGCAGTCACTTGCAGACAGGCTGCATTTGTCTCTGCTGGTGCTCATGTTACAAGTTTGTCTGTGCATTTGGGCATGCCAGAATGGCGTTTCATTTCCAAACCTTTATTGTGGTCACTTTCCTCTTCGTTACACTGAGAAGTGTTGCTGAGGGTATAGTAAGGCCCTAGTTCATCAATTATATCCTGTACTTTTCTTCTAACTTGATCCCAAGAACAGTGGAATTTGCTTCAAGGTAAACAAATTTTGAATAATTTATGGCCCTTCTTTTCAACAAAAATGAAAACGTGACTTTCTAAAGAAAAGTCAATTACAAGGGGGCATTTAGTAAATAACACACTCTTAATAAAGTAACAGGAAAATTAAAATGCCCAGCAGACCCATTGCCTCCTGAACAGGTGTTTGCTGCTAATGGATACAGTTTCCATTTCCTTGAAGGGATTTGCCCAGAGGATTACTTTCACAACTTCTATTGAGATAATACTGCTCTAACAGAAAGAGCAATGCATGAATCTGTATATCAGTTCCTTAATAAAAGGGAAGATTTTTTTAGTTCCTAAAATACCAATGAGGTGAAGAAAAACATGCCACCCAGGTAAAGTTACTCTGTAATCACCCGCATTATCTTTTTCAAGGAATGTGGGGGAAATTTATGTCAGTCATCAGGCAGGTACTAGAAGATGCTAGGGGCCTCACAGACAGCTTGTTCCCGGCTGTTAACATGGAGCAGAGCGTTCCCTGGGGCTGAGCATGGGAGCCCAGCACTTCTTATAGGTAGGTCTTTCCTACTATAATATTAGATGCCTACACTTATTGACTTTTTCATTTGCTCTTTAAAATAGATTTCTTCTGCTGGTTCTGCTTAGTTCTAAGGAGTAAGGTAGAATTTTGGTGCCATACCTAAATATCACGTCTAAAATGACATTGGTAGCACTTTTCCAAGAATAACCAGCATATTGATCAAGCCATTAATAAAGCCTAATTATTTGCTTTAAGAATGTTTTTGGTTGTTTCAAACTGAGTTTTTTCCAAAGTCATAACAAAACTAGGAGAGGCTGTAGATTCTTAATTATTCATTAGATTAGGGGGAAAACGAATTGCTATTACAAAGAATATCATGCAAAAAATAGGTTTTAAAAAATGCATTACTACTGAGTTTTAAAAATGTATACTAACATTCTCCATATCAAGAACTGTTTCATGGATGGTAGATTTTAGTTATAGCAGTACTGGACTTACACTCAGTCAAATAATTTTAAATTTTCTATAATTGGGAATACATGGTAGCTGAATATAAGCAAACATATTACTCTATGAAATAAATGCATAAGAGTTTGTTATCACAAAAAACAGCATAACATTATTTTTTTGAAACACAAGGCTCTGTTTTAACACTTTACCTTGTTTAATAGTAACAAAACCCCTGAGGAATAGGTTGTATTGCCATTTTAAACACTGGAGAGCAAAGGTCCAGAGAGGTTAAATAGCTTTCTGCAGGTCACACAGCTGATGAATTGCAGAGTCAGCATTTAACCCCGGTCTGCTTTTCTGCAAAGCCTCTGCTCCTCACTCTACCCTACCGACCACCTAAGTATAGATCAGTTAATCTTGCCTTCAGAATTCTCCTTTCTTGTGTACTTCCATGTACATTCATACTTACTTCACATGATGATTCTATTTTCTGGAAGTTCCACCACATATGGCGATAATGAAACATCTTTGTCATTTCTCTAAG
Seq C2 exon
TGTTTCCAGAGCCTGGCAATGGATGCCATTCACATCGGCATGTCCAGCACCCCCCTGGTGAAGCACACTGCTGGGGCTGGGCTCAAGGCCAACAGACCCCGCGTCATGTCCAAGAGTGGGCACAGCAACGTGAGAATTGACAAAGTGGATGGCATATACCTACTCTACCTGCAAGACCTGTGGACCACAGTTATCGACATGAAGTGGAGATACAAACTCACCCTGTTCGCTGCCACTTTTGTGATGACCTGGTTCCTTTTTGGAGTCATCTACTATGCCATCGCGTTTATTCATGGGGACTTAGAACCCGGTGAGCCCATTTCAAATCATACCCCCTGCATCATGAAAGTGGACTCTCTCACTGGGGCGTTTCTCTTTTCCCTGGAATCCCAGACAACCATTGGCTATGGAGTCCGTTCCATCACAGAGGAATGTCCTCATGCCATCTTCCTGTTGGTTGCTCAGTTGGTCATCACGACCTTGATTGAGATCTTCATCACCGGAACCTTCCTGGCCAAAATCGCCAGACCCAAAAAGCGGGCTGAGACCATCAAGTTCAGCCACTGTGCAGTCATCACCAAGCAGAATGGGAAGCTGTGCTTGGTGATTCAGGTAGCCAATATGAGGAAGAGCCTCTTGATTCAGTGCCAGCTCTCTGGCAAGCTCCTGCAGACCCACGTCACCAAGGAGGGGGAGCGGATTCTCCTCAACCAAGCCACTGTCAAATTCCACGTGGACTCCTCCTCTGAGAGCCCCTTCCTCATTCTGCCCATGACATTCTACCATGTGCTGGATGAGACGAGCCCCCTGAGAGACCTCACACCCCAAAACCTAAAGGAGAAGGAGTTTGAGCTTGTGGTCCTCCTCAATGCCACTGTGGAATCCACCAGCGCTGTCTGCCAGAGCCGAACATCTTATATCCCAGAGGAAATCTACTGGGGTTTTGAGTTTGTGCCTGTGGTATCTCTCTCCAAAAATGGAAAATATGTGGCTGATTTCAGTCAGTTTGAACAGATTCGGAAAAGCCCAGATTGCACATTTTACTGTGCAGATTCTGAGAAACAGCAACTCGAGGAGAAGTACAGGCAGGAGGATCAGAGGGAAAGAGAACTGAGGACACTTTTATTACAACAGAGCAATGTCTGATCACAGGGGCGCCATCCAGGTTTAACCCTGCAAGCTGTTTCCACATCAGAACTCCCTTCAAACACAAAGATTGCTGTGAAAACGAAAATGTGTAGACGCACTCTCAAAAACTGCACGGACATACAAAATCAATCTTTTCCTTTGATCTTGTGGCTAAACCAGCATTTCTGTGTTTGAGAGATTTCCTGTTAGGTGCTTCGTCTGAAAGTGAACTCTCATAATTCAAATTGTATAAAATAAAGCTACATTTCTAAGAGCTTGGTGTAGGGCAATTGGAATAATGTCCTGTTAGATAAACAGACATTTAGCAATCCTGACATTAAAAGGAAATGTATTTCTATACAAGATTATTAGCTGTAATACAAGATATTTATTTAACCAATGACCTTATGGCTGAGAGTTGAATTGTGGTTCAGTATTCATTGATCTCACTGCTTTAAAACATGCTCTTTTTGTTCAAGCAGGAAAAATATTATATCTAATTATGTCTATGTGGTAATACCTAAAAAGAGGTAGAGAGACTCTATGTTCACAAAATATAGTAATTTCATTTTTACCTTTCTTCAGTGGACTGAATTGTATGGAAGGAAATTGATCAGATCTGTAATTCACAACTGTGGAAACCTACACAAATGGGGCTGATGCCATTGTTTCCTCTATTTTATTTTATTTATTTTTGAATCCACTATCTCTTTCCATTCAAAATATTTCCATTCAAAATGTGGTTCACAGACCCGCCACATCAGCACCATCCGAGAGCTTATTAGTAATGTGTAGATTCTCATGTCCCAGCCAGACTTACAGAATTGGGGTCTGTATCTTAACAAGAACCCCAGATGATTTGTGTACAAATGAAAGTTCGAAAGCTGTGCTCTGGACAGTGTTCTCAAAGCAACTTTCTGAAGCCGTGTGGAAAACTGACTCTGTGTGGGTCCCGTATCCCTGTGGCATCCAGACCTGGCCTCTCTTCATTTCATTATTATTGGCCAATATTTCTTTCAGCCATTTCATTTCTTATCTATTAAAATGGCTTGCCCATAAAGGAACTGCATAGGATTATCCCCTGACATTCCAAGAGCAAAATAAAGCTCTTGAGAGTAATTGTTGTCTCAGTCATGCTTGCTGATTACAGTTAGCACAAAAGAAAAATTCAGCTGCCTGACAATACAGGAAATGTTCTCAGATGCTGATGTTTGTAAGGTCCGGTGGGGCCATGAGGAAGAAGAGGAGCTGAAGGTAAGAAACTCATAAACAAGATGACTCTTTGATGCATGAACAAGATTTGAAAATCTCAAGCCTGTAAAGAATACCCCTGCTATTTAAATAAAGCTCATACCAAGAGGTAACATTTTGCCCCGGGCCAAATTCAGGGGTCTAGTGCCCTGCATTCCTTTGAGGCAAAAAATAAATGGGCTATGACTGGTTAAATGTCCAAAAGGTGAATTCTCATTTCATTCAAACAAAGACAGATTTGCGCATTCACTCAAGCAGAATGTGGCCATGAATATTCAGCCCCTGCATACATACAAAGATGTACGCATGATTCCCCCCACCAAGCACACACACAGTCACACACGCACACACACACACATGCACACACGCGCGTGCACACACGCACACATGCACACACACATACGCACACGTAAACACATGCACACATGCACACACGCGCACACATGCACACACGCACACACTTGCACAGGCCCTGGCTCTTCAAGCATAATCATGGTAGTCATCAGTGAAAGACATTTGAGGTTAAGACAGCAAGTCCTTGACAAATATGTTCATGTCTATTTGGTTCTAGTTCTATAAAAATATGAACATTGGGACTCAGAGAAAATGGGGAAAATAAAGTGGATTCAGGTTATCAGTGAAATGATGGTATAGATTACAGCAAATCTGGATATATATTGATGTTACTGCATTTGCAAATGTCCTCCCATTAAACAGAAAATGTGGCTAAAATCCCTGGCCTGGAACTGAACTAGTTTAAGGCAGGTGTAAGAATAGTGGGAGGAAAGTTTGTGAAAGTTTAAAGAATGCCCTCAATCCATGAACGAGAGGGAGGATGTTGTCTTTAATTATTTAGAAGGTTTTTTTTTCCTTGTCTGTTGATAATTTTATGGAAGGTTGCTTTAGATCTCCATTCCTTAAAAAAATATTACATGTCAGTGTAGTTAGATATTATCTCTTTTAGTTATTATACTTGCTATTTTTACTGTATAGTGTGGTATAATCAACAAAAAATAATGCCACGGGCATGTTTACACCTTTTCTGTTGCACTATTAAATTCTTTTCACAGTATTCATATCAATGCTAATTTGAATGTGATGCCAATTAAAAATCTTGTTCATTTATATTGTATATGGTACAAGGACGTAGCATAAGATCCAAAAAAAATTTTGTATTGTCATTTAGCATATCAATTTCAGCCAAATTTGGAAGACTTGATCATCTTATCTTTTGCTCTACACACTCAAAACAAATATTGCAGCAGAAATATCACCTTAAAAATATCTTATTTTATATTTAGATAATATTGAAATCACAGTCTATTAAAATTGGAAATTTAATTCAAATAAAAATCAAACAAAATAGTTGTTTCAATTTATCTAAATATCTGGTCTTAAGAGTGCCTTAAGAGTGTCTCGTTTTTAAGAGTGTCTTAAAAACCAATATATGTATAAGTCAACAAATCATATAATATTCAATAAATAGCTCTGAAGTTGTATCTGATTTGAAACTTACCATTTTCCTGGAACCTTAACTATTATTACTTTGTACGTAATACTTTCATGTTACTATGCTAACAAAGGATTTAGGTAGCCAACTTAATTTATTATATCTGGTCGGTCTTCTGCTTGAAACAGATTCACACTCAACACCCAACTAAGGAGGAGCCAAAGTAGTGGAGTATTCCTGACCCAAAAAGGCTTTTGAATTTTGAAACATTTCTAATGTGTTAGGTTTTCTCAATGAGACCATTAAAAAACGTTGTGTTCCATTTGAGAAACCAGAGTCAACAGCAGTAAATCAGTGTGCCCCACAAGCCACGTCTTATTCAGCAATAAAATAGTGCTCACATGGTGCCTGGCAGACAGTGGCTCTGGACAGCAAAGCACTGAGTCACCCAACCCCACTCCTTTGGGATGGGGTTGGGAGTCATGCATTGGCTCCCTTTTTCATCCTGGGGAAATTACAACACAACGCAGAGTGTCCAGAAATCTAAAGAGCTGGTTTAAGGTGAAAAAAATGCCATGAATGAATGAACCAGATGTTTAATAAATCAAAACAACTATTTTGTTGGATTTTTATTTGAATTAAATTTCCCAATTTTTAATAGACTGTGATTTCAATATTATCGAAATGTAAACAAAGATATATTTTTAAGGTGGCATTTCTACTCCAGCATGAAAAAAATAGTGGCATTTGCACTCTAGCATTATTCTGTCTCCCTTATTTGAGTCTTCAATATATATGCCCAGCTGGAGGGAGAAGAAGAGAAAAATGAAAGCACTAGGCCTTTGACTAGGTTTGGTTCTATATGCTGTCATGATGTTCAAAATGTCAGACATTTGACCACATGGCACAGTGAATACTCTCACGCTCTCAATTTTGGCTTTCATTCTTGCTAGACTTTTCTTCTATTAAATTTCTGAAATAACTAGTTTTTTTTTTTTGAACTTGAAAATCAGCTTTTTATTTTTTTTAATTTTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAACGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAGCATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGTCCCCGGTGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAATTTCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTCCTTGAGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGTTTCATCCAATAACTAGTTTTATCATAGCTTTCCATGATGTAATTTTTTAAGCGAAAGGTACTAACATTTCCAGTCTTGATTTCCAAGTTTTGTGGTGTGCACTCGAAATCTAGTCTCTGATTGTTAAACTCTGGGTAGGTACAAGAGGCTCTTAATTTTCTTCCTCCCAGGAGGACTTACTTACACTTAAAGGTCAAAAGCTTAACATTCACTTCTAAATGGTTAACTGCATACACTTTACCCTTTGTAAACTTCAATTTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATACTGGGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGCTAGAGTGCAGTGGCGCGATTTCGGCTCACTGCAAGTCCGCTTCCAGGTTCACGCCATTCTCTCCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCTCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTGTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAACCAGGATGGTCTCGATCTCATGACCTCGTGATCTGCCCGCCTACAAGCCAGGTGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGACTGAGGCAGGAGATTCGCTTGAACCCGGGAGGTGGACGTTGCAGTGAGCTAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAAGTAAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAATAAACGTGGCAAAACTAGACCTTCAGACACTTCACTTCACTTAACCCTATGGCCCTCCTTATCTTGCACCCAATTTCTTTTCAACATCATACATGCTTGGTTGACTGTTTCTTCATATTTGCTGTTCATTCTATAAAGTCAAATAGATTGGTGGGTTAAAAAATAATCAATTCAAATTCAAATTAGGAATTTATGGACATTCAGATATCCACATATTTGAGGGCAGGAATTTTTACTTTTCAATTGGTATGTTGGCAGTGTGTAAAAATAGAAGACCAAGAGAAGGCGGTTGATTGGAGTTGATACTTAATAGCTAATAAAAATTACAAGAAAGGATGGTGGAAGTCAAAGGACAGAACTGATACACGAGTATAAAAGCCAACGATGTCATATATGTAGGCAAAGTCTTTGTAATCTGAATATAATGCCAGAGAGCTAGGGCTGCCAGGCACTCTGTATGTGCAGAATATGTCCTATATGGAGTAATTTTTTATTTGTGTAGACTTTTTTAGGATACCTTAAATGTCTTACATGCAACCTTTTTTTCCCCATATATTACAAAATTGCCTTGGAAATTAGACAAATCTTCAAACTTAACTGAAACTCCTGTCCTGAATAGTTATTTGCCAAATCTGACAAATTTACAAAGAGTGTTCACATAATCCCAAACTATGCCCATTTCTACAAGAGAAATACATGCCTCTTTATTTGGAGTTTATGATATTCATACAACTAGTAGTAGAGTCAGGGAGTATTCCAGAAACATATTTCCCTGGCTTGCCCAATTATCAAGGGAAAATTTCAGCTGAACACGGGGAACCCAGTCTTTGACACTCCTGTGTGCAGTGTGGAGCAGCGTGCACTGTCTGAGTCTCCATAGTGAGGAATGGTCTTCCCTGGGGCATCACCCTAGAAGGATGGGCTCAAAGTCGCCCTCCACGTGGGTGCACAGGAGCCCAGATTCTCAAGCCCCAGTTGCAGAATTAGGCTGATGGTTTTACAAAAGAGTCCTCCTAAAAGTCCATCACTAAGTTTTGTTTGGTTAGCAACCCTTGCCACATGATGTAGTACTTAGCTATAATTTTATTTTTATTCAAGGCCAAATCTTATCTGGTGTCCATGCCTTCCCACCTACTTAAAATTTCAAATTTCACCCTCAAAAATATTTCAGTAAATAAAAGTTAGATCTACTCAAAATTAGACTCCAAGGGAATTACTATAGTTGATTATAGAGTATCTATTTCCTTAAAAAAAAAAAACCATAAGTTGTTGACTCTGAGCTAGGAAATGCGTGATCTCTCAGCTGACTTACTTTATGCAAATTTACTTAATATTATAGAAGAGTAAAGAGCTTCCAAGAAGGTGATTGGAGGGAAGTTCAAAGGGAAGATTTTTTTCATTCACTGTAGTTTTAGCTGTATTCTTTCATCTGCAATCAAATCTCAGGATTAAGGATGTCGTATTACATCAAATCATTACAGGAAGTATGACTGTATCAGCGGCTTTTTACAAAAACAAACCTCCAGATCACAAAAGGAAGCTGTGTTTGTGTACTGACACGAAGTGTTACGTAGCAGCCAGGAGAGGAAGGATAGCAGCCGACTTGGATCCATTTTTGAGGAATTATTTCTGTAAGGTGTCATGGAATTGTAAGTTACAAAAATAAGGCTTTTGTAAACAGAATCTCCATTCCAGAAGGACGGACTCCAAAATGCTACTTAATGAAATTCATGGGAATGTTATGGTGATGGAAATCCCAAATGACATGTAGATTTTATATGCAAACAATCCCACTGCTTGTAACTCCTGGCAGTGTGTACTTACCAAAATCTTGATCACACTTAGGTCTCTTGCTATATATAGAACCACATCTGATCCTTATACAGTGTTGCAAGATATATGTCCTTGCTTTCCCATGGTTCTTAAGTGAGTCTTAAGCTTGGATTTGCTCCAGCAGAATGGTGGTTTGTGTTTCTCAAGGCTGAGCTACTATTTGGTGCATGTCGGAAATCTCACACTAACTGTGGATACTCTGTCATCACTGAACCCAATCATACAATGACCAGACAGCTTTAAATACCTACTTTTGTATGCTATGAATTCATCCGTTTACTTGTCAAATCCTTTATTTCCATATGTGTCTCCATCACCTTTTTTTTCTCTCCGGATAAATGGAATTACTGTAACTTGTGAAACAATGGCAAACACTATAAAGCTAATTTTACAGTCTTGA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000157551:ENST00000328656:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=NA
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
PF0100715=IRK=WD(100=89.4)
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
ENSP00000331698, ENSP00000381899, ENSP00000381901, ENSP00000381902, ENSP00000381904, ENSP00000381905, ENSP00000381907, ENSP00000381911, ENSP00000392951, ENSP00000400849, ENSP00000413013, ENSP00000414487, ENSP00000447111, ENSP00000448676, ENSP00000448770, ENSP00000448886, ENSP00000449140, ENSP00000449419, ENSP00000450254, ENSP00000479100, ENSP00000484960
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(galGal3)
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(dm6)
No conservation detected
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No suggested primer sequences
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- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development