HsaINT0100459 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000076770 | MBNL3
Description
muscleblind-like splicing regulator 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:20564]
Coordinates
chrX:131503343-131516300:-
Coord C1 exon
chrX:131516206-131516300
Coord A exon
chrX:131513706-131516205
Coord C2 exon
chrX:131503343-131513705
Length
2500 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTTTGG
5' ss Score
5.63
3' ss Seq
TCTTTTTTTTTCCATTTCAGCTG
3' ss Score
11.88
Exon sequences
Seq C1 exon
TGCCCATGATGCACGGTGCTACACCTACCACTGTGTCTGCAGCAACAACACCTGCCACCAGCGTTCCGTTCGCTGCACCAACTACAGGCAATCAG
Seq A exon
GTTTGGCCATTTATTTAAGCTGTTCAGATCAAGATAACTACAATGTTTTGGTAATGCACAGTATATGCTTTTTGGATTGGTGAGATTCTTATGTGTTTCTTAAGCCATTGTCACATTTAGAATTTTTATTTTTGTGTATATTCTAGAATGCTATATGTGCTTTGCTATTCATCCCAAGATGAATCAGAGGAGTTTTGCTCATTTTTAATTGGTTACCAGATGTTGCTCTTGATATTCTATATTTAATTACTGGTAACACACCAATCCTCAAATGTATATACTTAATGTTACTTAAATGCTTCCTCATTGGTCAAGAGAATTTATTTCACTGCCATTTTTGATTATTGTGTTTAAACTTTGGCTTAGTACAGTCATCACCTTTACCTTCAGATCCACTGGAGAGAAAACAAAATATCACATTTCTTTCCAAGACATGGATATCCTTATCATTTCGCAGTGATTACATCAGAAGTTCCTTCTCATATGGACATTAGATGTGCTTGTTGTTTTGATTTTTATTTGCTTTAGGTATTTCTAGGCAGAGTTCACAAGGCAGATTATAAGTTTGGGGGGAGTCTTGAAATTATAAGGAGATACATACAATAATTATTGTATAGTATTAGGGCCATTTTGCCTTATTAAAGTGGGAACCATGCTTATAGACTAAAAGATCCACATATATAACAACATAAACAGAATTCTCCCAAGAAACTATTTTAATCTAAAATCTTTTTTACTACTATAGATACCCCAATTATCAATAGATGAACTGAATAGCAGCATGTTTGTTTCACAGATGTAGAAGTTCTCAGTAGAACAGTAAGTTTCTTTCAGTATTAATATAAATAATATTTATAGGCTACATATTTTATTTACACAATTGCACTTCTAAAAGGCTTTCGTAAATATTTTCATTCATAGACATTGCTTGTGATGTAGAGCTTGATTTACACATTATAAATTTTCCAAATTGAAATGTGAGTGCAAATATGCAATATTTTTTATATGGCAATGACAGCTGGTACTGTATTTTCTCAATGAGCTAACACATTCTTAAATGTTTTCCTATTATTAAAGGAATATATAATTTGTTAGCCAGAGGCACAGATTACTTTTGAGTTGTAATTCTTTAACCATTTTATAGCTTCATTTTTTTTTTGAAGATCAAACAAGAATTTTCAGGATTTGACTGATATGATTATGTTAAACACAGTAAGCACTATGCCTGTCATGTGACATTGTATTGAATTTTGAGTGACATAATTTAGTAACTGAGTCATTATTTTCATTCCAATCATGTCTCTTTTTTAAAATTTTTGTTGTTGTGGGATTTTTTTTTTCTCCTTCACCCTCAATCTCCTCTTTGCCTGGTGCCCATCATGGCACACACTTTTTTAAGCAATCATTCACTTAAGAACATGTGATTTCTGAAGCCACTTAAGACTCCTAGGTATTTTAATTAATTCTAGGGACTTACTAAAATAGTGTACCAACTCTGAATTGCATACCTTCATCATCGAAAGTTTGAAGTTCTCACACCTGGAGTGTGTCATTTGGTTGAAGGAGGCAGCAGTTCTGTTCCCTCGTGAACTAGTTCCCCAGACCCCAGCTAGCCCTTCTTTCCTGCTGAGGACACACGGGCTTAGAACACTAAGTGTTCTGGACAGAGCAGATAGCCGACTGGACATTAAATAAATAGGTCTCCTCAATCATAAGGAAGGATTTTAAAAGGCACCTTTGAGCACATGGGATAACTGAAGGAGCTATAAATTGTCATTGTTTCCAGAGGTGTCATTTGGGATAGTGGCAACTTGGAAATAGCACTAAACATGATAATGTAGGTTTTGCCAACACTTGCCCAACTTTCATGGGCTGCTTTACGTCAAGGTAACCACAAGTTGTCAAATTAACTTTCCAACAGAGCATGTTAGGGAAGAGTGATTCCTTCTTGCTTGATTTTGTTAGAAATGTAGAGATATTTGGCAGAACATAATCACTTCAATATGTAATAGGTGCTAAAAATTCCTCTAAAGTTCAAAAATGTAATTTTGTACAATACAATACCCAGATTTCACAGGTAGGCTACTTCTGCATGGCTCTAAAACATTCAGAGAAAAAGTTGAAAGTGTATTTAATATTTGCATATTTCAAAATGTTCGGTATCAAACATGTTTTCTCAGTACATGCCTGTTGAAAGGTGGACACATGGGTGTATGTTCAACAAAAAGTAGATAGATAATGCCTTAAACATTGGATTGCATCTCTGTTAGGACAGTTCTCCACATTAGCACTCAAAGGGTATCATAGACTATCATAGATATATGGTTCTTTCATGATCATTCTCAAAAGCCCCATTTCAATCTGAAATTCAGATTGGGGATATTTTGGCACTGTTAACAGACAGAACTGGAACAAGACCCACCACACTCTCCTGACTCTTCCTTCAATAACCTTTCAATATTTCTCACTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTCCATTTCAG
Seq C2 exon
CTGAAATTCTGAACAGCAGAGTTATGGAGTATCAGAATCTTTCCATGGAAACCTCCATATGGCCTTTCTATATATATTCTCGTATGTCTTATTCTACCAACACAACAATAAGCGTGTTGCAGTCAATGTATTAAGCAAAGCAAACCTGCCAGCCAGCAAATTCAAATAAAAAATAAAGCATTAAAAATCAATGGAGATGTTAAAACAACACAAATAGAAAACTAGTAACTACCATCCATCCTATTTGAATTATCAAGCAGAACATGACCATAAAATTTGGTAACTTGTTACATTACTCTTTGTGATTTTCTAATAACCATGCTAAGTGTATTTCCACAGTGAGCTTTTGGCTTACTATATACATTCTTGGTGGATAAATTGTTCATCTGTTTTTGAAGTGTTACCTTACTATTTTGTTTACAAGATAGTCTATTGGGTTGATTCAGGATGTAACAAATATATTCAGTACCATTTCTTGTGTTGTATTGTGTTGTGCTGTGTTAGGTTTTTACATACTGTAGTGTTTTGCTGTATATGTGTGGTGTTTGATTTCAACTAAAGTGTTATTAGTGGGGAACAGAAGTATATGTGCTTAAGAACATGACAGGTTCATGCAAATATGCTCTCTTTCTTTAGAATATTTCTGTAGGTTTCTTGGGACTGACATTTAAAACGCCTCACTTTTGAATGTGCACAAAACCTGCTCATTAACATGCATGTGTATAATTTGTACCTGCAGATCTGATGTTGCATAATACAATCAAATTACTAGATTTTTTAAAGAGAGAAATAATTACCTGCACAAAGCAGAGAACTTCATAAAACATTAACCCCTAATTCACTCTTCTTAAATAGCTTGGCAAATAAGACTTTACCTTTAAATGAATTTCTCAGCATTTATACTAAAAATTATGTAAAGTGCTCATTAGATTTTTTGTGTGTGTGGCTTGAGAATCCCATCTCCTAAATTGAGTGTCTAAAACTGAGCCATTTGTCATCTTCAGCTGAGAAACTGGTACTTGGGAGCTTAAAAATATGCTAATTACAAGTTATAAATCAAACGGAGAGATGGGGGCATGGAGATAGTTTTTACGTACTGGAGGAAAGTGTGTAAAACCATGGCAATGTCACCTTTTACACAAATGCCATTTTCCAAATGCAAATGGCTCATGCTCTTTAGACTACTCTTTGAATAACAAGTAAGATGCAATCTAGCAAAAGTCAGTCAGGGTGAAAGAGAATTGGTTGCAAATGAGGACTTCCCTCCCCAAATGGACAGTCTTCTCTGTTGATCACAGAGGGAGCCTGAGTACAGGCTTGGAGAAATGGCTAGGACAGGGAACAGGGAAGCACTTACAATTATTCCTTGATTTATTCAAAAGAACTGGGAAAGATGGTTGTAGTTGTCTTTAGCTTCGGTTCAACTGAGTTTCGTTTTGTTAAACAGTTCAGTGAAGGAGAAAGCACCTGTGATATATGGCAAGTGTCCCCCTGCCCAAACTTTAACATCAGACCCTCTCACATCATAACCAAGCCTCTTTTATGCTTGTTTGGATTCGTTTGCCTTTATATATGTTTGAAAATGACAATAGAAAGGGTTTTATCACCCTTTGAATGAGACAGAGTGGCTATACTCCACAGAGCTCAGCTGAGTTCACATTACTAATATTTATGAAAGAATTTTACAACCAAATAATTCCTGTGGTGTGTGACATATCTCATCCACTCTACTCATTTATTAATGTTATTATACAGTGGTGGAAACACATGACATTTTACATCAAGTAATAGATTTAATATTTTCTAGTAAATAGGCGCTCTTCCACCAGAAAGTATAAAACCATCATATACATATATATATATATATATAATGGTTTTTCTCCTTCATGAAAATGACAAGTAAAAAGCAAATCTGATTGAGGATACCTTAAGCTGGCTAGAAGTGTTTGAATCACAGAACAATGGAATTAGCAAAATCCTTTTTATAGTTGATGGAACTGAATCCAGGGGCATATGACTTGCCCAAGGCTACCTTAGCCATTGTGGGACCCAGAAATATCTCCTGCTTCCCATTGTTCCTCCTTTTCACATTGTTTTTGCTTCAGAACATTTGATGCTCTCTTCCAAAGCAGACCCATTTGGCTCAGAATATAAGAGAGCAAAATTAGCTTTCTGGGAATTGATACTCTGTTGATCTTAATTATCCATCCAAATCCTGATCAACAGTGCTTTCTAAACAGCCTTGCTTGTATTGAGTCATTGTCAGCTGTTGACAATGTTGCGTGGAATTAGAGATCAAGAGTTGTCCTGACCTTTACCTATGGACTCTTTGAACCAGTTAATTTCTATTTCTGAAATCTTAACATTGCTATAGAAGAAAGTAGTGTATGCCTTTTTGAAATTCATCATGTATGGAACTGAGTTTTGTATGATCCGTGCCAGTGCCTCTCCAGAAGGGCAGATCTGATTACATGAATCCAGGAGGGATGCACCTGAGCTAGTCTGGATATATTCCTTAAAGGAGACAAGAACTTTTTTGTGCAAAATGAACTTTTGTGTAGTTTGACATCTGCATGCAGTGAACTGTCTCACTTAACTTTTTCAACTTTGGGCAAAGATATACATAAACCATAGATAATAGACCTACAGTACAGCTGTTTTCATGTTGCGTTAAGCACTGGAAGACATTAACAATGACTTACCTTAAAGTAAAAGGTTCCGTGAGGGGTATTTAGGGCCACTGTATTTTTGGTGCCACAATTTTCTACATTGTTGGCATTTTAAAAGTTGTTTTCTAAATGAACTTAAAGAAAGAAAGCTCAAAGCCCTAAAGTTTTGATCAAATTCAATAGAGTTTTCAGAAAAAAATACAATTTTAAGATAGCACTCTTTAAACTAGATGTGCAATGACTTATTCAAATTATCTTTATTCAAGAAAAGAGAAAAGAAGAAAGATAAGTCATTAGACTATAAATTTCCATTTAAAAAGACAAGTCACAAAACTAATCAGTGACTCTAAACAAAAATTTACTGGATGAATTGTATATATAAAATTCTAATCACTTATGATTCTTAGTTAACATTTTATAAGCTTTGTATTTTACAGGGGCCTCTATTTATCCAAATTTATTGTTTTTGTCCATTTTTCTCAGCCTTTTGCAAAAAATATGCAAGAGTGCTGAAACTTGGATAAAACGGGTCATGTATACAGAGAAAATAATCTAAAAGTTATCTTTAAGAGGGTTTTAGTAGTGTCAACTTTTTAAAAAAGTACTATGTGACCATAACATACGTATATTTTAAAGAGGGATTAAGATTAAATTAAAATAAATGGATTCATAAAATTGCTATTTAAATACAGTATTTACTTTTGTAATTGAAGCATGATTCCACAACCAGCTGTGGCATTTTATTTCACTTTTCTAGATCAGAGGCTTTAATTTGTAGTTAATCATGATGTGGAAAGTCATCTTCTCTCTACTCCATCAATTTTTTTCATCCGTTTTTGAACATGCTGAAGCACTTTGATCTTGCCATAAGTGTTGTCCTATACCACTAGGTGGTGTTCACTAATGGGAGGGCCTCAGCTCACCGGCTCTCCAATTTGGGAAAAAGCAAGTACCTCCTCCCTACCATCAGCAGAAACTGAATGAAATTAATCTTTGCAACTTGAATCTGTTTTAAGTAGCATTACCAATAAGCATAGTGGTATCTGAATAAGGAATGACATTTACATTACATTTTATTAAATAAGAGAGAAAGTTAATGTGCTACTTGAAATGTTATTTGGTTCTTTGTCCCCCTCATTGCAGAGTATAGATAAGGATGCTCTTAGGTAAAATGCAGCCACAAGTTTTCCGAGTTCCTTTAGTCTGTAGGGTAGGCTATGAGGTACAGAATGATTAGAAACTGAAATCCTCATTATTTTTCTCTCAAATACATTTCACATACATTGAAACAGAAATAGGCAAAATTTATGAGGGAAATCTGATTTCCCAATTCTGATGAATAGATATACTAAGACAGTAGCCTTGTTTAACCAGTGCCTGTAGAAGGCACTAGAATAAATAGCATGTCCAAGAGTATAACAACTTTTTTTGTAAATTTAGTTACTAGCCTAATCAAACTGTAAATATAACTCACTAATTGGTACCATATTTTCATTTTTCTTATTGTTCATCTTTAAGGTTTCATTTTATTGCTTTTTTGTAGCTCTAAGTAACTAATCAATTTAATTTCAAAGGAAAGTTAAAGAAAGTTTAAGCTTTTACTGCATGGATTCTGCCCGCCTAGCTAGGTTCTGAACTGACACTGAAGTATGACAAGATACAGATTATAGTCCAAAACTATCCTTTACAGTTCACAATTTAAGAACAAATTTAACTTTATATACAAATAATAATTGTTATCTAATTATATTTAGTTGTTGCTTTGGCAACAAAATTACAACATGGCTACCTTTAGACATTTGTGTATGTGAACATTTTACTTGTAAACTATAGGTGATTTGTGACAGTATGAGCCTGTAGAAAATACAGCTCAAAACTATGAAAACAGACATGGTTGAGTTCTTTTTTAATCCCAAAGGCCCATATATAAAAGCTGAATTTGTGTCCTTGTGTGACTTTTTGTGAAAAAGTTTATAACACATGGATTCTAGAATCAGGCTTTATAGTTTATAGAATTTGTTGTGTGGATAGGGTTATTCCACAGTATTTAGACTTCAAAACGCAATCATTGCATTTTTAATACATTACCTAACTTTTTTTATAACTTAATTCAAAATTACCCCATTCAAGTGGCATAGCTGTAGCTGCAAAAATTCTGTTTTCTGGAATTACATGAGCAAATATAGCTATATGAGGATTAATGTATGACTAAAGCCTCTTTTGAAATTAATTCATATTTTTAAAACTATACATAAAGATACTGTGGAATGACCCCTTAACAGTGTTTAAGAAACATATGCTGCAGTTAATTGACTGTCTCAGTTAGGGTGCGGATGTGTGAGACACACCTTTTTTGCACTTATGTACATAGTCCATGAAAGCAATCCTTGGAGCTTTTTTTAAATGTAAGAAGTCTGTGATAATAGTGGAAAAGTTAGTAAGAGAGAGTTATTTCTAAGGCTTTGAAAAGGAGGGTGTTTTTGCTCTAAGACTTAACTAAAGCATAATGTTGCTTTGCTGTTACGGAGGCTTTCTAGTTTGCTACAGGTCACCAAAAGAGAAGGCTAGTAACAGGTAACAGGTCAGCCTCAGCTAACAGCACTGAACAAGAGTAGAATAACTTCATCTTTTAACAAGATCATTAGCAAAGATTGTTTGCTTTTTAAATTAATCCCCCCTATAAACACACACACACGTGTGCACACACACACACACACACACACACCGGGCAGTTTCTAGAACAAGTTTTCCTTTTTCAGTGGTTGTAAGCAGTGAAATACCTCATGTATTACAAGATAGATATTACCGTTATGATAGAATAAGATTTCATCTTTCACAGAAAGTGATCAGCTGATATATGTGTCAGTTAAAATGTTTATCAATTAATAGGTATTTAAGTGACAAATTGTTAATGTTGACCATTGTTCCTCCTTTAAGATCCAGTAACCAAAACCAAATCGGTAACCATTGAAAGATGATATTTAACAGTTAAGGATGGCCAGCATAGGGCCGTTCATTCCCTTCAACAAAGGGAAAAAAAATGCTCCTGGCACAACTTTATAACTGGCTTCATTTACATTATACCTGTTCAGTGGAAGCTGTTTTTTGACCTACCTTTACCAGATTACAAAGTAGTTAACTGTGCCACTTCAGCCTCCCACTGTTTTGTTTTAACTAAACAGAAGAGAACCAGCCAAAATCTTACGTAACACAGGAGCTGGAAGACAATGTTTCAATCTGACCATCTCTGCCAATTTTAGCTCCCACGCCACCTATAGATAGCCAGTTAACTTTCTTTTTGCCCCCAGGCAATGAGGCCTAGAAGAGGTCAAGGTTAGAAAGGTTAAGCATTTGATCACTACAGGTACTTGTAGTACCTAGAGAAGGAACCCATCCTGGGGTTGGTGGAGTTGGTATTGCTACTCGTTTTGATAGTTCTCATTTACAGAGAAAGAAAAATAAGCCAAAGCCAGAAAGCAATCCAAGCCTTACAGTTGTCCAATACCTCAGGGCCAGTTGGCTAGAATTTTCTTTTCCCTCAGCCCATAATCACTTAGAGTTAGCCATACAACAAACAGCCTGACAATCTGACCAGCATTTCCATTGATATAAAATGTAAGCATTCCTTCATTCTGTAGTTAGGAACTCCAACTTCAGCCTTATCTCCAACATAATTTCCCAATTTAACCTATGTACTGATATGGACATTTCTTTGTGAATATGCCAGATTCAAGAATGTATTTTTCTAAGGTCAATAGAGATACGACATTTTAAGTCAGGAAAAATCACCTATAAATTAGTAGGAATAACTGTAGAAGCATCACAAAAGATACCCCATGAATAGATGGCATGGTGTGCATGCTGACAGCCACGGGGTCATACTCTGGAGTTTCAACATAGAGGCTGTGTTTCAATAAATAAGACAAATTGGGGAATTAAGTAAAACAAATGGATGTAACTGAGGCCCCCCCCCAAAAAAAGCCCTCTATTACTAACCTCAAGAAAATATTTAGTTTGACTAATTTGTGCAGTTTCCAGCTCTTCTACTTGTTCTTGCCTGTAAGAGAATCACTAATACTCAAAAGCTGGATTATTGAAGAGAAATTTTATCTTTAAATAGAATCCATCCACAATTATGGTATATGTAAAAAAAATGTATGACTATGAAATAAGTCGCAGCTCTTTGCAGATATTGCAAAATCCTTGCTAGGCATCTACATCATATTAGTTTTTTAAAAAATACCTCTGTAACAAGACCTAAAAGTAACCTAACTATTAAGCAGTGCTTTTTTCTCTGAAAACACACAACCTAAAGATTTATCTGTCATAAAACTGCATGGTTCCAGAGCTTTATTTCTGTGTAGAGATGCTATTTGTTAGTGATGGAAACAAATTACTTTGTTGCTATGTCTTTTGTGTCTAGCAGTTGAGAGAATGATATGACCATCATATCACTGGATTATGGGAATGAATGCCCTTTTCAAAATAAACTTATTTATTAATATTTTAATATTATTTTAATATTATAATATTAATAATATTTTAATATTATTGTTGCTGCTTTAACAGAAAATGAGCCATTTGTCCCCATGCTCCCAAATTACAATGATTTAAATTAAAAAACTTTTGAAGGATTTTCCTAAATATATTCTTTTTTAAAGGACTAACTTTGTGCATTCATATAACAACAATTTGGAATAATGTGAAAAATGGAGGCACATAATTTGGGTGGAAAATGGCGATTAAAAATATATATAAGAAAATTATTAGCCATGTGTAACATATTTAAATAATGACCAGAATATTTCATGAGTACCAACTCTTCCCATAGTAATTTTCCTCCAAAATGCAATAGCTCATTCCCTCAACTGCAGACGCTTTGATTTTTTTTCAAGTTATAGTGCTGTAGTGCTTGTTTATGTTTAAAAGTGCACATTATGCAGCTCATTTTAGTATGCTACTTCTATGTTTATTTTTTGTTCTTCTAATAAAATGCATAAACTTCTTGGTTATGTCTTTTTTTATGAATCCATATTCACACATTAGGAGTTCACTTGAAGGCTATTCATGCTCTAGTATATTAATCCTAATATTTAGTAATTCTAAAATGAAATTTAAATTTCTGATTTGGCTCAATGTTATATTTCATACATAGAGTAAATTTATTTCCAAATATACCATCAGTATTTTGAATTATGTAGATAATATATCCGTTGTGTTAGACCTATTACTCTTATAAGATTGAAGTTACTGACACAAGAAAAACACTTCTATTTTAATAAAAGAATACTTAAAATTTTGAGAGAATGCTTACTAGTTTCTCTTGTGCCTCAGAAATCCTGAGGCATATTCTAAGATGCATTATTAGAAGTTTCTCTTTCCCAGTTATTCATGTCTATCCTGCATCCCTAGTGTAACATATGAAACCAGTGTTGTTTATTTCATACTTTCCAGATGGGCATCAATCATTTCATAACAATGAGATGCATGAATTTTTCCATTAAAATGTTTTCTCTCACTTAAAATTGGTTATCTTCAACAAATGGCACAGTAATAAAAGGATGATCATTTTTGTTCTTTAAGAAAGTAAATGTAATTTAGTAATACTTTATTCTGCCTTATTTCAAAATGCTTCAAAAATGCGAATCTGGAACTTCTCTGCATTGACCACTGTTCTGGAGTTGGGCTGATAGAAAACTGCGGTGAAGAGAGTTTAGATCAGAGGCTATGGCAGAGCAAAGTATTACTGATGTGTCTCTTAACAGTGAAGAGGGTCGGGGAGGAGGTTGGGTCCTTGTCAAGTGTCAGCTGCCCTATACATAGTTCTCTTGCCCCTTGTGCCCTGTTTTACTATTTCTAAGGTGGTTCCCATGATGGCATTTCTTGATAAGCCCACTTTGAGCCGTTTAATGTTTTGTAGGTGTTTCTGTGAGTCTGATAATACCAGCACTAAAAACAGTTCAGTATATAGACATTTACAAGAGGTCTTAGGCCTCTTCAGAATTCAGTTAATGTCTTTCTCTTTGAGGCTGCTGAATGTTAGGTAAGAATTCAGGGCAAGCATTCCCGACCATCATCAAATTGGAGACTTGGAGTTTCTATTGGCTGGAAGAAAGTTGACCCACAGGCAAAACCAGATGTAAACCAAGTTTGTCTTGGGTACTTTTCAAATTCTTTTCACAGCATCCTTTTCTCATCCCTCATGGTGGCCTCTGGCCCTGGAAAATCCTCATGATAGCAACTTATCAGGCCTGTTTCCTCTGATAGATCTGGACTTTTCCCCTTAAGTGCTTTCCTGTTGGGCTTCTCAGACTATGGAGAACTGCTCATAGTTGAGATCTAAGAGACAAATTACCCTATGGTGTTCAAGAATGGCCGTATTTAGTATACTGCCTGTCCTGGAAGTGTTCACATTTAAAAAGGCATGACTTTCCAATGGGCAAATATCAGACACCTACATGCATAGATAAGGGAAATATGTTTTACTTAAGCAAACTTCTAGGCATTGAATCTCAGTGTTTAGGTGCAGAGATGGAATTCCTATAAGCAATGCAGTCATTCACCACATCAGGAAGGCCAAAAAATGAACACTCTCGTAATTTTGTTATTATCTGGAAAGTTCTGATATGATAATGAACCTAAAATACTGAATAGATAGTGAACATCCTAAAATTCCACTGACCAGAATCCATTCCCATGGTCATCATCTGTAGAGGGCATGATACAATGACAGGCCTGAGGTATGATTATAATTCTGGAGTAATTTAAAGCCTATATTTGTTAAACTTTAACAGATGGACACACATTCTCTGATTTTCTACTTGGCTCTTTCCTGTACTAGAAATGCGCATTTAACTAAACCTTCCCAGCTTTTCTGTTCAGTGCCTGACTTACACTACTCCCTTAGGCAGGAGGACAGTGGGTGTCTGGGGAATAAAAGCCAAGAGCTCCAAACAGAGGATTTTGGATACAAAGGGCAGCCACCAGGAAATAGCTTTGTGAGAGGGACAGACTATCTGATTCCCATTTGTACAAACATGTCCAAAGCAAAAGCACAGCATTCTAAAGTGGATGCAGAAATTAGTATACAATGGCAGTTCTGGCCAGTGCAGCCCAGCATTTTTCTGTTGTGCATGGAAAGAACACAGTGAAAAGGCAGGCAGGGCATCCGGTGCAAAGTGCAACAGACATAGACACACAAATCCAGTTTTCCTGATGAGAGAGGGAGCTATCTCTTCATAAGTGATGCAATGCAATGCAGGCATGTACAAGTACAAGGAAAGATTTATTTTTAAAAAATCATAGTGTAACTGGATGAATACCAGCAACAGCACCTGCTAAAGCAAACAGCCTGTTCATTAAAAACTGGACTTGAGGGAATGGAGAAAGAATCTGAGGAGCCTGCAGTCAGCATGCTTGCAGAGACCTTATGGCTACAGAAGACGATGATTAACCCATAGAGGTTCAATGTAGTTTTCAAGAAGAGGGTGGGAAAGCATAAGATGGGGACTAAGACTTTGCCTTTAACCTTCATGACATGAAGAATTGAATGACTCTTTGTTGGAAAAAATGGCAGTTATGAGATAATTGGATCCATGTTAATTATATATATTTCTGTATATATAGTAAGTGGTTATTGATGTGCCTTTGTTAACCATTTCACTATTTAATAAATGTGTGTGTAGTTTATTCAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000076770-MBNL3:NM_001170701:7
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (disopred):
C1=0.764 A=NA C2=1.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)