HsaINT0116411 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000162631 | NTNG1
Description
netrin G1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:23319]
Coordinates
chr1:107407682-107481853:+
Coord C1 exon
chr1:107407682-107407708
Coord A exon
chr1:107407709-107480610
Coord C2 exon
chr1:107480611-107481853
Length
72902 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GTAGTAAGT
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8.01
3' ss Seq
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Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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NA
Other Inclusion Isoforms:
Other Skipping Isoforms:
NA
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Other assemblies
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development