HsaINT0138319 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000213079 | SCAF8
Description
SR-related CTD associated factor 8 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:20959]
Coordinates
chr6:154778001-154788022:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
chr6:154787861-154788022
Length
9815 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAAGTAAGT
5' ss Score
9.72
3' ss Seq
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3' ss Score
8.03
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
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Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
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Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
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F:
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R:
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INCLUSION PATTERN[edit]
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- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development