HsaINT0153453 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000188687 | SLC4A5
Description
solute carrier family 4 member 5 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:18168]
Coordinates
chr2:74285773-74304680:-
Coord C1 exon
chr2:74304489-74304680
Coord A exon
chr2:74285903-74304488
Coord C2 exon
chr2:74285773-74285902
Length
18586 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTCGTGAGT
5' ss Score
8.41
3' ss Seq
CTGCTGCCCCTCTTTTGCAGGGT
3' ss Score
11.2
Exon sequences
Seq C1 exon
AATGCCCTCCTATCCACATTGGGCTTCCAGTACCCACTTACCCTCAAAGAAAAACTGACCAGAAGGGACATCTTTCAGGCCTGCAAAAAGTCCACTGGGGCCTGCGGCCAGACCAGCCACAGCAGGAACTGACTGGCCCAGGGAGTGGGGCAAGCAGCCAGGACAGCAGCATGGATCTTATCAGCAGGACTC
Seq A exon
GTGAGTTCCTTGAGGGGTACATTCTGGGGAGCCATCCTGCTGGTGTGTCCAGATGGGACCCAGCAGGGCAGGGGGGATTTTCTGGAGAATGTGGGTAACGCTCCACATGGCTCAGCCTAACCTCTCTGGCCCCCTCTGCTCTGCTTCCATTGTTGGCCAACCTTCCTGCTCACTGACACTTTTGGTCAGACTGACACCCTGTCTTTCTCTGGGGACTTTGAGACCTCGACTCTGATCCATTCTATGTTGATTTCATGGTTTGATTCTCAGAATTATTTCCCTCATTTCCAAATTCCAAGGACCATACGGTCATTGCCCTAAGAACCAATAATGGACATGCGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCCGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATAATAATAATGGACATGCTTGTTTTGTATGAGGCATTGTGCTCAGTAAATTGAAGTTCTTGTTACATTAGCTCCACCCTCTCTCCTCACTGGAGCTGAAAGACCTGGTACAGAATTGTGTAGTCACCCTGCACGGTAGCTTGCAAGACACCTAGGAAGCTTTCTTCCAGGACAACAAAGCCCCCAGGCCTTCCTCTGCTCCTTCAGAAAATAGTTCTGGGCTAATTAAAAATCAGTCTTTTGCTCTTTCCTATGGAAAGAAAATGATCAATCTTAAGAGGAGTAAAAAGGACTGGAATCCTTAGAGCACAAATGTGACATTTTACTGTGACTTTACTGATGTTTCTGGGGACGTGATTTCACTCTCAGCATATCCCAAACCTGCCTAATAAACAGTATGAATTTGGTTTCTACTATATATAGCTCACTGTCTTGAGTGTGGAAAAGTTGGTTTATTATACCATCTATACCTTCCAAGGAGTGTCAGAGGCAGTGACTGCATCTTAGTATCCTGGCAGGAGACCTGATGCACCTGCTCTCACAGGCCATGGGAGCTACCCCCAACCCTGCAGAGCCCTCTACAACCCCCATCATTGGCATTAGGTTGACCAGGGCCTGTGGCTTTTACAGAGTAAATGTGCCTTTGTAGGAGATGGGGTAATGGTAAATCCTTTGGAGGAGTCCAGTGTAAGAGATGGGCTATAGTTAAAATACAACACACACACACACACACACGCACACACACACCACATGCACAGGCATACACAGACACACACCACACACACACAAAAAAACACTTCCACATGCACACACACACACACACACACACACACACAGTCCTGCTCAGGAGTGGGAACATCAGAGACCAAGAGGAAAGCAAGCCTGCTGGGAAGACCTCTTGCCCCCGTGTGGGTTCTGGATGCCTCACACATACTGACATGGTCTCTGAGATGTTCCCCTGTCACCTCACCACCTCTCCTACATTCAGGATTGAGGTCGTCCTTGGAAGGTGGAGTCTGCTGGGTCCTTCCTGAGCCAGAGAAGAAGAAAGCAGTTTAGATTTGGTGCCCTCTGCTCAAAGAGTTTAGAAGAGGTGACATAGAACATCACAGAAGTAGTTATAGATGGTGGATTTGACATTGCTTTGGTGGTGTCTTGTTCAGTTAAGTGGACACTGATTTTAAATGCAAACCAAAGGAAAAAGAATGTAGAACGCTTTGGCATATATATATTTTTGAGACGCAGTCTCATTCTGTTGCCCAGGCTAGAGTTAAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCGTGCCTCAGCCTCGCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTACCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTCACCATGTTGGGCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACATCAAGTGATCTACCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGTCCAGCCCTTTTGGCATATTTGTACCAAATATATTGGTGCATTTCCTTCACCGTCTGCTCTTCCTATACTATGTGTGTGTGTTACTGGCTTGTTCCCGACAGGGCTGTGGAGTAGGAAAGGGAGAATGGGAGAGCCTAGGAGGACAGGGAATTGTAGGCCATGTCTCATAAGCTGGAGTAAAGTAAAAACCCCTTTTAAAGGGAAAATAAAGTCTTGTGTACCCATGAAAATGCATTTGTATATTTGTAGGGCCCCAGGAAGCCACATATTCCAATTTGAGAAATAATCTAACTAATTAGGGTTTTATTCCATAAAAATATCTTCCAATTATGAATTATAACCCAAATTTTGCTGTTCCATCTAATAAAAGGAATATTTTTAAGATTATCAAAATGGAAGCAAAATTTAAAAGTTCAAGTAAAACCTTTCTACCCCTGAGAATACATTCCAGACCCCAGTTCCAGACACTCCGGTTTAAGGAAGCCACAAAGCCTGGTAACAAAGTCACCAACCACAGTGATTTTTCTGCAGCCCATGGGCATTGAGTTGGTTTCTGCTGTTCTTCACGGAGTGGAAGTCTCAACCCTCAGTCTTTCACTTCTAAGCAAAATGGGCATTGTATGTGTGATACAGATATAAACCTTGCTCTTGCCACATCTCAGGGATAGTGCCAATGCCCTGCAGAAGTCAAAATAAAACAGCGCCAGAATCATTTTACCTGCCTCATCTGGATAATTGTCTGAATCTCCCACTTCTCTTTGCTGTAGGACACCTGACCACATATGTTTTTCCTCTCTGAGTGTCCTGTCTGTTCTGTAAATCCATCCAGACACCTAGGCAGGGGGCCCAGCTGGTCTGGCTGCATAGCCCAGCAGGAACTCCCACTTCAGAGAACAGGGGCATCCTGCAGAGTATGAGGGGCCTGGGCCAGGCAGGGTGGCTAGATGTGTCTGGGCCTGAGGGTCAGGCACACTATGCAGATGGAGGATTGAGCAGAGACCCCTTCAGTTCCTGCCTTACAGAATAATGGCAAAGATCCAATAAGACAGTATATGTGAAGGGGCTTGGTACCTGTGAAAGCCCCCTGAGAATGATAGTTCAATATCATTTTTAACTAAATGTATAATATTAATAATCATAACTATAAAGTTGAAACAAAGGCCAGGTAGCTGACTTTTATTCCTTCCACAGAGACCCACGAGGGTGGCTTTAATATATGCTGCAAGGTTCCTAACCTCCAGGACAGTTTTGAAATACACAATCCAGCTGCCTGACGTGTTAGATGTGAATGGGGCTTGGGTGTCTGTACTTTTCTATTAAGTTCCAGTGTACCTGGTTAAAAAATACACTATCCTAAAGAAATTTGATGCTTCCTTGAACCACATTTAGCTTACAGAACCCTGTGAAGTCCCTGCTTTAACTCTAGTTGAGGCCCAAGTAACTGCTGGTCCTCATTCCCACAGCAGGTCAGGGGCAGGAAAGAGGCCAGCCCAGGCATCCTTGTCCTTCTTGTACTGGCTCCATGCGCTACATGGAAAGCAGCCCCTTGCTGCAAAGTTGCTCTCTGGATCATGTCAGAGCTCCTTGGAGAAAATATCTTGCACCTGGAGATGACAGACCCACAAACAGATAAGCATAAATTGGTGGGAGGTGCGTTGATGGAGGTCTGCACAGGAAACTATAGGAGGAGAAACAGGAGCACATAGGCCTAGGTGGTGAGTGGTGGCAGAGGGGGCAGCACAGGCTTCCTGGAGCAGGTGACACCTGTCATGAGTCTTAAATGATAGGTAAAAATTAGCTAGAAAAGGCAGCTGGGAGAATTAAGGAAAAGGAAATTCATACATTTCTCTTTTCTAGCTTTATTGAAGTATAATTGACAAAATTATACATGTTTAAGGTATAAAACATGATTTGATATACATACACATTGTGAGATGATTACCACAATCAAATTGGTTAACACCTTCATCACCACTCATAGTTACCTTTGTGCGAGTGTATGGTAAGAACACTTAAGATCTCTCTAAGCAAATTTCAAGTATGCAATACAGTATTATTAACTATAGTCACCATGCAGTACATTAGATCCCTGGAATATTTTTATCTTTGACCAACATCTCCCCATCTTCCACATCCGACCCCTGGTAAACACTGTTCTGCCCTCTGTTTCTATGAGTTCAACTTTTTCAGATTCCACATATAAATGAGAACATGCAATAGTTCTGGCTTATTTCACTTAGCGTCATGCCCTCCCGGTTCTTCCATGTTGAAACAAATGGCAGAATTTCCTTCTTTTTTATGGCTGAATAATATTCCATTGTATATATTTGTATATGCCACATTTTCTTTATCCCTTCATCTGTCAGTGGACATGCAGGTTGTTTCTGTTTTGGCTATTGTGAATAATGCTGCAGTGAACATGGGCACGTGGGTATCTTTTCAAGATACTGATTTGGCTTCCTTTGGGTGTATACCCAGAGATGGGGTTGTTGGATCATATACTAGTTCTACTTTTATGTTTTGAGGAACTTCCATATTATTTTCCATAATGGCTGTACCAATTTACATTCCCACCAACAGTGCACAAGTGTTCCCTTTTCTCCACTTTCTTGCCCATACTAGTTATCTTTTGCTTTTTGTAGCCATTCTAACAGGTATGGGGTGACATCTCACTATGGTTTTGGTTTTAATTTGCATTTCCCTGATGATTAGTGATGGTGAGCACTTTTTCATATACCTATTGGCTATTTCTTTGTTGTATTAGTCCATTCTCACGCTGCTAACAAAGACATAACTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGGCTTGATGGACTCACAGTTCCACATGGTTGGGGAGGGCTCACAATCACGGCAGAAGGTGAAGGAGGAGCAAAGGCATGTTTTACATGGCAGCACGCAAGAGAGAATGTGCAGGGGAACTGCTCTTTATAAAACCATCAGGTCTCATGAAATTTATTTATTTATTGAGATGGAGTTTCGCTCTTATTGCCCAGGATGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACCGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTATCTGGGATTACATGCATGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCCAGCCTCAGGTGATCTGCCTTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCTGGCGAGATTTATTCACTATCATGAGAACATGGGAAAAACCCACCCTCATGATTAAATTACCTGCCACCAGGTCCCTCCCATGACACATGGGGATTATAGGAGCTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGTGACACAGCCAAACCATATCATATGTCTTCTTTAGAAAAACATCTATTCAGATCCTTGGCCTTTTTTTAAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGACTTGAACTCCTGGTATCAAGCTATCCTCTTGCCTCAGCTTCCTGAGGCACTGGGACAACAGGCACATGCCACTGTATCTGGCTTCCTTTGCCCATTTAAAAATAGGATTTTTTTCTTTTTGCTATTGAGTTGTATGAGTTCCTTATATATTTTGGGTATGAAGCCCTTATCAGATATATGGCTTGCAAATCTTTTCTCCCATTCTGTGGGTTGCCTTTTCATTTTGTTGATTGTTTCCTTTGCCATGCAGAAGCCTTTTCATATGATATTGTTGCACTAGTTTATTTTTGCTTTTGTTACCTGTGCTTTTGGTGCCATATCCAAAAGAAATCACTGCCAAGACCAATGTTAAACAACTTTTCTCCTGTTTTCCTTTAGCACTTTTATGTTTTGAGGTCTTACATTTAAGCCTTTAATCCATTTCAAGTTAATTTTTTGTCAGTGGCATAAGATGGGGTCCAATTTTATTCTTCTGCACGTGGATATCCAGTCTTCTCAACACCATTTATTGGAGAGACTAATCTTTTCACCTTGTGTATTCTTACCACTCTTGTCAGATACTAGTTGACCATGTATGTGTGCATGTTTCTGTGCTTTCTATTATATTCCCTTGGTCCACGTGCCTGTCTTAATGCCAGTACCATACTGTTTAGATTACTATAGCTTTGTAATATAGCTTGAAATCTGGAATTACATCTTCTCAATTAATCCTCACACCAACAGTAAAAGGGAGATATTATTATCCCCATCTTCAGATTGTGAAACTAAGATTCAAAGAGATGTAGCATAATGCAGATGTTAATCAGTGAATGTGGGAAATAAAAACAGATCTATTGACTCCAAAGACTGTGCTTGCCCTTTCACTACATTGCTTTCCTTTATAAGATGTCATTGGTCAGTCACCATATTGGACCCTGGCTGATAATGATGTCCTTTCAAGTAGCCAAATTGCCTCATGTTGAAAGGAATAGATAGGTAGGAAATAATAGGCCATAGCAGTTGGTTTATTTATTTTCTCTCTCTCCCTCCTTACCACACCTTCCCCCAATGTGAATATATTAATAATTTAGGAAGTCAATACTTAGTAGCCAATCAATTTTGACTGAAGCAGAACTCATATGATGAATAGAATCATCAAGCTGTGGTGAAAGTCAGTAGGAGCCAGGGTTTCTACCCTGGGGGGAAAAAATGTGTTTTCTGGCTGTGAAAACCTCTTGAGAGGCCATTAGGAGAAAGAGGATTAGAAGCAGCTTTAGAAATGTGGTTGCACTTCCACTTTTCTAGGCTGCTAATAAGAACTGGAGCCAGTTTAAGAGAAACAAGGTCAGTCAAGCCCAACTGGGGTGTGTAGACCCTGGAGTCTCAGTATTCTCATCTGGAGAGTGAAAGATTGTTGCAGGGTGGCCAATTGTTTCAGTCTGCCCAGGACTGAGACTTGTCCCAGGATGAGGGAGGAAGGACTTTCAGTGCTAAAACCAGATCGGTCCTAGGCAAACTGCATGGTTGTTCATGCCAGATTGCTACGAGTTGTTAAATGAGAGATAAATAGATATTAGATACCTCACATGGTGCATGGTGCATGGTAGGCACTTAACATATAGTTGGTTCACTTTATACACATTAACCCAATTTAAGAGCACCACGCCCAAATCTTTTTCCTCTAAAGTGGGCATTTGTTTGATTTGGCTGCCCTCGTTGGTACTGAGAAGCTTATGAGATCCTTCTGATGGAAGGAGTGTGAAAAATATTCAAGCCTTCATCTATTTGCCAGGTATTGAGCAGCGCTGGGATCACCAAAAGATCAAAATTACCCTAAGATGAGAAGTAAAGGAGAGAAAGGCTTTCTATTAAGACACTGGAACCTCACAAGGTTCCAAAGCCTTAGGACCAAAGACATGTTTCATGTTGTCTTTCTTTTCTGATAAGAAAGGAGCCAAGGGTTAGGATAGAAAATAAGTTTATCTCTAAAACATCTCCTGCACTAAGGAGTCCCTGAGGCAGGCCACGTTTCAAACATGGGAGCAAAGACAACTGGCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCCGTCACCCAAGCTGGAGGGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCTCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCTAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTTTCAAACTCCTGACCTCAAGTGACTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGACGTGAGCCACAGTGCCTGGCCGACAATTGGCTTTCTTTTAGGGTTTGAAACTTTAAAATTGGGGTGGCTTCCTCACCTTTGTCTACTTAATTTGGATCTTGAAGGAAGTGGTGAAGAGGGGAGAAGTGAGAAAAGAGAAAAGGAGGAAGAAAAAGGAGAAAGGATAAAGATCATTCTAGACCTTTTATGCTCCCCCCAACCCTGGGGCTGGGGAAGGAAGACAAATTAAAATTACCTCAAGGAAGTCTGTTTCTACACCACTCTCTTCTTGCCCTTTAACACCTTAAAACCAAGATCGCCCCGAATTTTCAACATATACTGCATTCCCTCCCTAGCCAAGAGGGCTGTTCTCCTAAAAAACAAAAACAAAACTCAAGCAAAAAACCCTACCAGGAGAGAATCTTGAGTTAGTGACCTTAAGACCTTAAGGGGAAATGGGTTGAGAGCCTGAATTTGCAAGTGAACCAATGAAAATCCTAATATAAAGTTTTTATAACCTTATTCGATGTGGTTAACTAAAATAGACTCCAGCCTCCTCGCCACATTCTAGAATAGGCCCACACCTTTGCTTAAATGTCTGTGAATTTCCAAAGGCTTCTAGTCTCAGCGTTGCCCTGGCTCCAAGTCCCTGCTTGGTGGACTCAGTCTCACAGTGCTTCACCTTTGGCATCTGTTCTCTGCTTTCACCTCCAGGAAAGCCCAGGTATGGAGTTCTGCCCTGCTGTGGTTTCCTCAAAATTGGTCGTTTAAGGCACATAGGTGAGCAGCAGGCTTTGTTGAAGGTTCAGAACCATGGAGGGGGTTTACTTTGTAGAGATACTCAATTTTTTCTTTTTCTTTTTTGTTTTGTTTTGTGTTTTTTGTTTTTGAGAAGGAGTCTCCCTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTCTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGATTCAAGCAATTCTCTTGCCTCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTATCAGAGGCGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCACTTCGGCCTCCCAAAGTCCTGGAATTATAGGCATGAGCCACTGCACCTGGCCGAGATACTCAATTTTTAAAATGAGATATTAGATATCCCTGTTCTTAAAAATCCTCTGGCCACTGAAGGTTTCCCCTTGGCCACCTTCCTCTGTAGTTTCACCTTCCTACCATATTTTTGGCAACTCCCACCCCCCATCACTGCCCTCCTGAGTCTCCTCGTATCTCCTTGCTTCTCGGTTTCTGAGCCCCCTCTCCTCAGCGCCCCCTCTCCAACACACACACACTCACTCCACTCACTTTACCTGTCATATGATTTACCTCGGTCTCTCTCACCTTAGCTCAGAGCCCATTTTCACCCAACTGGACTCATAATGTGTTGAACTAAACACAAAGACCATCTATCAGTCTAGCGCTTATGCAGCATAAAAGAACTGAAAGAGGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTCGAGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAACATGGCGAACCCAGTTTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCAGACACCTGTAATCCCAGGTACTCAGGAGGCTGAGGCACAAGAATTGCTTGAACACTGGAGGCGGAGGTTGTAGTTAGCTGAGATTGCGTCAGTACACTGGGCGACAGAGCAAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATCCAAAAAACTGAGAGGCCTTTAAATTTTCTTCTCTCCTTTCTCCGTCCCCACTGGCCTCTGTCAGATGAAAGAAGCGGGATCAAGATTCAACTTCCTACTGATATCATTAGGCTCCATACCCCTCTTGGCTTGGAAGGAAAAAGCAGAGCAACTGTTCAGTTTGATTTTAAATGACAGCTTCTTCATTATACTGCATTTATATCTACCAAAACAGAACAATAAGGACAACATGCAAATTGAAGACTCTTGGTGACATTTTTAAATCTTAAATCATGAGTAATAATTGCCTTTTACCCTTTTGGTTTTCCAGAAACGTCTGATTCTCCTTCCCTTGTGCGCCAATGAGATGGATGTCGTTGTTCTCTTTTTGCTGTTGGGTCTTATAATGCTCGGGGCCTTTCTGATTTCACACTGAGGTTGTTGCCCTTCCCAGGCCTGGTAGGTCCAGAGTGGCGTAGGGAACTCAGATGGGAAAGACGGAGGGATCTCTTACCTGAATTTCTCAGCTAGCCTTGACTGAGTCTCCCCTGACCCCCAACATACTTAGGCCTTCTCCAGCCTTGGCTCCATCCACAAGCACTTTTGGGGGGCTGGCCATGCACATGCCAGGCTCTGCCAGCCCCTCTGACCCAGCTGAGCTTCCTCCCTTATCCAAGGTCACGGAGTGTTTCCTTTGCCTCTCTTTCTTTCTTTAGGCCTGCCCTGCCTTTTTTTACTCCCCGCTCTTTTACTTTTCACATGACTAGGCTTAATCTAACTATTCTTATGACAGTGACTCAACATTCTTTTATAACCTTTACACTTATGGTTTTCAAGAAGGTACTCAGAAAAAAATCTCCACACTCTAGAATTTCATACAAAGGGGACTCATGATTAAGAAGGTAATTTTATCACAATGCCAGAAACCTATTTGAACTGGCTTGGGGAAGCAGAGAGAGAAGGGGTGTGGGGAGAGATTGTTTATATTACAAGAACAAAGGAGTTTCTCACAGTCCCAAAGCAAAACGAAGAGCCGGGCTCAAGTGGGTGAGCGCAGTGCCTTCTCAGCCCCCTCTCTGGGTGTACACAGCCCTTTCCCACAGCTTCGCCTCTAGGCTGCTTCCTCTCTTTGCAGCCCAGCCCTTTCTGCCTCTTCCATTTACCAGCTCTGTCTCCCAGAAACCATCAGGAAAGGCCCAGCTAACTCAGAGACCCAATTCAAAATTCACAGGCTTGGGACAGGTGTCCAATGAACCATTCCTGCTCCAATTCATTGTGGCCAGGAGCACAGGTCACATGTCACACAAATACAGCTGCCCAGGGTCATCCTTATGGGAGGAGGGGACATGGGCTGGGCAGACATTCCAAAGCCACCCACCCCAGGAAGGATTCCCGTGAACACAGCAAGTCAGCAGATTCTCTCCTCTTCCTCTCTCAGAGGGCACACTTGGAGTTTGTATACAGCCTTCTAGAAAAAGAATGTTATTGCCCATGAAACTAGGACTCAGGGCCTCCAAGACCTACTTCACACAGTTGGCAAGAATGGTTTTGGCTCCTTTGGGTTCCCTCTCCCAGTCCCCAATAGTCAGTGGCCTGGAGTCACCCGAATCCCCCCATCCCTGCCCCCTCTGCTTCACCCTCAGCTCCATTTCCTTGTTCTTGGCTCCTCTCTTGCTGAGGCCAGCCTCAGCAAATATACTCCCGAGTGTCAGGCAGTCAAATCCATTCACCCAGCAAATATGCATTGAGTACACATGCTGTGTGAACCCATGTCAGGGGCCAGCAGTGCGATGTGAACAAGATAGGCCCTGACCTCACAAAGCTGACCGTGTAGCCACCCATCAGGGAGCCGATGAGAGAGAGAATGTCTGAAAGGACTTGCCCAGAGCTGAGGACCCCAGGATCGTGTCCTGATGTTGACTTCCAGATGGCCATAATGGCTCCCAGATCTTTACTAAGAGTTGAAGTCCACACTGCTTGCTAGTTTGCAGGCCACTAGATCATTTTGTGCTAAGTCAGTCCCCACCCAGTAAAAGCATGATTCTTTGTGTGGCTTTAGTGTGCCTCCTGAAGCGGTCCCCATGGAGGTTATGTTTCTCCCAGCAACTGCTGTTAGAATCCATTCCTATAGTTGGGCTGGCACTTTGTGACTCTTGCTGTTAGCTATAGAACAGAGGGGCTATTACCTGTGGCATTTCTCATTATGTGGATTAACTTCTGACGTGCTGCACACATGTGGGATCCGCAGGGCATTAGAGAAACCCTGACCCAGTGGCCCAGCATGTGGTGAGCTAAACCTTCTGTGGGCAGAAGGGAGGGGCAGAGACAGCGTAGGGGCCTGGGATGGAGGGCCAGAGGTAGCATGGGAGGAGCATGGAGTCTAGAAGCTGAGAAGGATTGGGCCCTTGGAATGTTTAGAGGGAACAGGCTGGTAACTGGTAGTAACAGAGGAAGCATCTCACCTGCTGGCATCAACAATAATAGCAATATCACCTATTGAGTGACTGGTGTACACGAGTGCTGTGCCAGCCAGTCACATTACATGTATTATCTCATTGAATCCCTGCCACAGTCCAGTGAGGGGGGCGTGATTATTACCGCTTCATAGATGAGGAAACTAAGGCTCAGTGGGAGCTTGATGTCTTGCCAGGATCCTACTGCTAGTAATAGCAGAGTCTGGAGTTGAGCCCAGGTCTGGGCTCTTAAAACACCACATGAATAAAGAGGGTCTTTTTGGGATCCTTGGCCATCTTTTTTTGGGTATTGAGGCCACCCACAGGGCCTGACTTGGTGTGGCCTGCTGTGGCCACTCAGAAGGAGCTGGGTCAACCTCAGCCACAGTGCAGTGGAAGCTGCAGAGCCTGGGACCCTCAGGCAGGGCCTGGTGTCCTCTGCTTCTGTTTTCTCAGCTTTAAAACGGGCATACTTGTGGCCACGTGTGATGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTATGGGAGGCTGAGGCGGAAGGATTGTCTGAGCACAGGAGTTCAAAACCAGCCTTGCAAAACATAGCAAGACCCTGTCTCTAAAAATAAAATAATAAAATGGGCGTACTTGATCCTCGAGCCTCAGGTATGAAAATGTCACCAGTGGAGCCAGCCTCAATGGGGCAGTGTAGGGGGAGAATGTCAGATGTCTGTTCTCCCCCAGGCTCTGCTAACCTGTGTTGGGGCCTAGGGGGCCTATGGGGTAAACTGGGTCTTGGTTTTCTCATCCGTGAAATGAAGGGTTTGGACTTGACCATCACTAAGCTCCCTCCCAGCTCTAAGACTTAGTGAATTCAGGGTTTGTAACTCCCTGGAGCAGCCACCACTCAGTGACCTCCAATCAACCTTGGCACATTCTAAGTACTCAGTAAGCACTTGTTAAACCAAACCCAGGAGATTAGGAGTTTCTCAGAAGAGCAAAATAATTCCCCAGTGGAGTTTACCTCACACTCTGAAGTGACGAGCTTCCACTGTCCGTGGGCTCTCAGAAAACACCTGCCGAGTGGTGACACTTGGCACTTTGCCTGAGAGGTGGAGGAACAGGAAGTGTATCAGGAGTTTGGGTTTAAAGTTGGGGAGGAAAGAAACCAGCTACATAGCACATTATCGAGCACTGCTTGGTCAGTGTGAGACCCCACAGCAAACACTCCCCTCCAGCAACCCCACTCCACCTTTGGGGCTGTGTGGTGGAGAGGAAGGGCCCTGCTAGGTTCCTCTCCAGCCAGCTCACCTGCCACCAAGGCTCCTAAGGAGGCCCTGGGGAATCTCACAGCACATCCTACCCCTGCCTTTATAAAGGGGCCTGCAGAGAGGATCCTGGGCTCTCCTAGAGACCACAGGCACATAGGAAGCACTCATGGGGAAGGGGGTAAAGGGGCAGTTTTGCCAGTCCTCTCACAGGTCCTCAGCTGCCACCACCCCTGCTGCTGTGGAGACCCGGCTTCCTGCTTGAGGTTCTGCTGCAGCCACTGAGCCTTTCTCTCTCTAGTGCACCTGAGATTTCTCTCTCACCCTCTCACTTCTCTCTCTCTCTTGCTCACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTCTCTGTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCAGATCTTTAATTAACTCAGTGTAGCTTTTCTCTCTCAAACACTTTTGCATAATCTTTCTCACACTTACACTTACCACACCTATATTCTCTCTACATATAGCCTCTCTCTCCACCTCCCCAGTCCTTCACACATTCCTTTTCTCTCTCTCTTTTTCTCCCCTCAAACCCCCCTTCTTCTCTCCCCACACCTCCCCTGGTGCTTAACTGGAAACAAAAGTGAGTTTGTTGTGTGAAGAAGAGGACCTGTGGAAGTAGCAGCCAGGGAGGCAGCAGCGGAAGCAGGCTGGGGCCAGAGGCAGCATCGACAGCCAGGGACCCCAGCGCTCAGCTGTTCCAGGGAGCAGGTAATGCCCCAGGCAGAACTGGTTTGCATCCTGCTCTCTGCCTGTCTCCTCTCTCCAGGACCTGTCCATTTATTTGCCTTCTTGTCTGGCCTTGAAGGGGAAAGGGGATTCCAGACTTAGGGAATGGCAGGCACAGGGGCCCAAGGAGTAGCATGCCCTCCTCTTCAGGGATGTGGTCTGCTGTGGCTGGGGTCGGGGTGGCTGGGTGAGGGACATGCTAGAACCTAGAAAGGCAGGTTAGGGCTATATTATGAGGGGTGGTTTGAGCCATGTCACTGACCCCTAGGCTTTAGGCAATAGAGAGACATTGAAAGTTTTTCAACTGGTGAATAACATAATCAAATCTACATTTTATTTTATTTTATATTTTATTTTCTTTTTCATGCCATCCTCCAAGGTACATCAAATCTACATTTTAAAAGAGTAGTTACTGATTTCTGATCCCAGGGAGAATTGGTATGGCCCCTCAGAATCAAGCAGTCACAGTTTTCTCAATTTTAAGAAAAAATAAGGTTATTTTCTCAATTGTTGGTTTTTTGTCTATAAAATTTCTTTAAACATTTGGTGTCTGCTAGCAAGCGCCAGCAATCAATAAGACAATGGAAAGGATGTAAGTTAAAAGTAATAGGCTGGGTCCAGTGGCTCATACCTTTAATCCTGGCACTTTAGGAGGCTGAAGCAGGTGGATTTCTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCTCGTCTCTACAGAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGACATGAGCTAGTACTCCCAGCTGCTCTGGAGGCTGAAGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGTGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTAAGCAAAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAGTAATAGAAAAATTGAGAAATTTAAAATTCATTTAAATACATGAGTCCATGAGTTCTGTAGATAATAGTGTGTTCTGCTAGTAAAATGATTTCTAACTCATATGTATAGTGTTTTATGGTGCTATTCAAAGAGAACCATGACTCCCAGGAGCCCATTGTGTGAACATGTTTGAAATGTTTTAAAAGCACACTCTACTGCTACATAGGGAATGGGATTAAATGGGACAACCAGAGGCAATGGCAACAGTAGGTGGCTATTGCAGTGATAGGAGCAGATGATGAGAGCCAGAACCAAGATGGTGGCAATGGGTGGGGAAAAAAGGAGAGAGCCAAAAAATGTTTATGAAGCAAATGAAAGACATTAGTGTCCAGTTGGACATGAATTGTGAAAAAGAAGGAGCTTCAGGAATGAGTCCAGCATTGTCTAGATGGGTAGGTGGCTAGAGGTGCTATTAATAAAAACAGAGGAGAGCAGGGCTGGGTTGATGGGAGAAGGGATGCAGAGCTGTTTTGAATATGTTGAGGTTGACTTGAGAAGGCTGCCGAGCTTCCAAAAGGAGCAGTCCAATTGTCAGTTGGAATGTTCAATACACATGGGTGTATTGCCTGGACACAAGGGTGACCTCATTTATAAAATGACACCACAAATAACGTGAGCTAGCCCAGAAGGAGTGTGGAGAGAGAAGAGAGAACAAGATGAAGCAGAATCCTGGGCAAGATCAAGATTTAAGTGTTAGCCAGGCAAGAGGAACTAGGGAAAGATATTGAGAGAGAATCTTCAAAGAGGGAAAATATCAAGAAACTGCCACGTTATAAGAGCCATAAGTCACATTTCAGTTCAGAGCGGCGATGATCACCTCTGAAGTTCCAGAGAGATAAGCCAGACCATAGCTTCTCAGTGCTGTTGGTTTGATTGATTTTATTAGCTTATTGGTTTGACAATTAAAATAACAAGAGGGATCTGAGGGCAGGGGTTGTGAATTTGGGTGCATGGCAATAAGTGAGATTAACGGGACACCAGTAAGAAGTAGTGGGGACTGTGGCAAACTAAAAAGCATATGTTTACCTAAGAAGGCACCATCATCAACTCTCATGGATTGTTGCCAAGCAGGAACGTGGGCACAGTGATCAGAACATCTGACTTTTCAAGAAAAGTCAGAGATCTGGATTTCTATATGAAATCTTACAATTCTTTATCTTAGCAATACTTTCAAAAAATTTCATACTCTGCGAGGCCTGAATTAAACACACCTTTGAACTGTCAGTTTGAAACCTCTGCCTTTGTCAATGTCCTTAGCGTGGTGGGGGCTGAGCCAGTGGCAGCAGGCCGGGAACTGATTGGGCAAGGAGGAGATGGAGACCATGAGCACAGACCACTACTTTAGGAAGTATGGGTAAAAGAAAGAAGAAGGCAAGCAGGAGAGCTAAGGAGACAGGCAGGGTCAGGGAACCTGTCTTGGGTAGGAAGAGCTGTTTCTAGGCTGAGAGAAAGAGGGTGGAGAGAGGGAAGTTGAAGATCCAGGTGAAGAAAGACTAGCTGATGAAATAAGGATCTGAAAGAGTTGAGGGGATGGAAGAAAGGATGTTGATGGATTTCATGCCTGGAGGCCTTTATTCTCTTGGTGAAGTGGGGTAGGAGTTGAATCAAGAAGCTTGAAGAGAGGAGCAAAGGTTAGGGACAGCCTTGAGGGACACAGTGAGGGCGCTGACAAGGATGCATGGAAGGATGCCGCACTTGAGACTTGCTGAGGGGAAACCCTTACAGTGGGGCTCATGGGCCTGGATGTGGGTGTTGGTGGTGAGGGGCTAAGCAGCTGTTACCTTCCAAGCCCTGTGTCAGGCATTTCATTCTCTTACCTGTTGTATTCCTCCCAGCAGTCCTGCTCACTCAACTGAGTTCGCTTGTGAATAAGTGGCAGCCCCGAGACTCACACCCTTGTCTAGCTGGATTGGGATTCTATTTGATTCCACCACACTACCACTCCGTGCTGCCATCCCCACCCCAGCCATCCCCCAGCCCAAGCCCTCAGACACACCTGCAGAGGAGACTGGGCCAGTGAATTCTTGTTTGGGCATTGCCTGGCTGGTTTGATTGGGAAGTCAAGGGGAAAGAATGGAGGATGTGATGAAGAAAAGAGTAGAGGTCCATGAAGAAATAAGTGAGGACAGAAGGGAATGATGAACTGAGGAAACAGGCTGGAGGAAGGGAAGACCTGATGAGGCCCAGGAGACAGTGAACGAGAGATTGCGTCGGGGCAGGGCAGTGGGGTTCCTGAAAATTTCAATATGAGTGTGAAGATGAGGGGAAGGGAGGTGAGGTAATGATGACTCCAGGGTGTCTAGCCTGTGCAGTGGGGTGGGCAGGGATGCCTTTAGTCATGGCATTGGTCACCACTTTGACATCATGCCATCTCTCTGTCCCTTGCTCACGTGCTGAACCACACTCACCAGCACGTTTCCACCACAGGGTGTCTGGAACATGCAGAGCACTCTTCCTCCAGATCTGCAGAGTGGCTCGTTCTCATTTTTCAAGTCACAGCTCCAGTGTCCCCTCCTCAGAGAGTCCTTTTGTGACCATGCTATCTACTGTAGCTCCCCTGGTCATTTTGTTTATTTTAGACAACTTATGATTGAAATGGTCATTTATGGATTTGTTGACTTGTTTATTCTCTGTCTCTATCACTAGAGGACATGCTCAAGAGAGCAAGGACACATAGGTCTTCTTCATAGCTTTATTTGGCACATAGTAGGTATTCACTGGAGAGAGAGAGAGATGAAGAAAAGTAAGGAAGGAAGGAAAAGAAAGAAAAAGAGAGAAAGAACACAGGTGAAGTGTGTTTGGGAGAGGAATGTCGAGTTTTGAGGTGCCTGGGAGACACCCAGGAAGTGACTTCCAATGGGCAGCTGGAAAGCAGGCTGGGGCCTCAGGAAATGGACTGCCATCTTGCCCAGGAAGAAAGTGGGCCCACATGGTACAAGGGTGTGCAAGCTGTCCTTTTGCATGGCTGACTGCCTTTTCAAGACCAGTGTTGGAGGATGGCTTGCTTGGGGCCCGGTGGGAAGAAGAACCCCCTCGGGTGGTAAGCTGAAGTTGGGTCAGAGTGCTTCTCACTTCTCTCTTCAGTTCTGGTTCTTGCTACTGCCCTGGCTTCGACCATTTCCCATCATTCTTCACTGCCAGCTGCAAGACCCTGGATCTGAATGCAGACTAAATCTTTTCATCTCTTTTATCTTAAAGAGTATCTCGCCCACCTCTGATTCATGGTTACAGGAGGCCAGCATCACCCAGGAGCTGGACTTAGTTTTACAGAATTAGAAAATACTTTTCCCTTGTGCTTGCCTCCTACTCCATTTCTGTTGGCCTTGTGGTCCTCCTGCCTTCCATGGGACACTCAGCAGACCTGCTGCCCCTCTTTTGCAG
Seq C2 exon
GGTCCCCAGCTGCTGAGCAGCTCCAGGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCCACCCTCTTTACAGAGATGGATACTCTGCAGCATGACGGAGACCAGATGGAGTGGAAGGAGTCAGCCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000188687:ENST00000377634:7
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=0.817
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains