HsaINT0176094 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000033178 | UBA6
Description
ubiquitin like modifier activating enzyme 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25581]
Coordinates
chr4:67612652-67622925:-
Coord C1 exon
chr4:67622831-67622925
Coord A exon
chr4:67619133-67622830
Coord C2 exon
chr4:67612652-67619132
Length
3698 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AACGTAAGT
5' ss Score
10.74
3' ss Seq
TTCTTGCTTATTTTTCTTAGAAT
3' ss Score
6.77
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGAAGTATGGAATTGAGCCAACAATGGTGGTACAGGGAGTCAAAATGCTTTATGTTCCTGTAATGCCTGGTCATGCAAAAAGATTGAAGTTAAC
Seq A exon
GTAAGTATTCAACATTATATGCAGCGATTAACAAGAATTTAAATGTAAGTTGATGCACACTAAAAAATTAAATATAGAGGTTACTATAATTCAGATAAAAGCATTAGTCTTGTCTAATGACATTAATAAAGACAGTGAATCTGCCAGGTGAAGGCCAACAGGCTACCTCTCGAGAGATTCAGCTCTTCAGTTAATAGGTTTAGAAACCTGATTTGGCCAGTACACTTAAGTAAAAGTGGATCCGTCTCTTATGTTGAGACACTTAATGACCAGGCTTATGAGTAATCTAACTGCCAAATCACTATTTTTGTTCATTTATTCAACAAATTATTGTTTAAGGTGCCAGCTGTGTGCCAGGTACTATTCTAGTCATTAGGGAGATAGCAGTTAGCAAACCAAAGTTCTTTCCTACTTAAGGAGTTTGCATAACAATAAGGCAAGTATGTTAGGTGATAGTAAGTATTATGGAGAAATTAAAGAAGAATAAAGAGAAAAGGAAATATGGGGAGTTGGGGGTGTTGAGTTGCTATATTATACTGAGTAGTCTAGGTTTTCCCTTTGCCTATCATAGTCTCACCTGTTAAGGTGGAATTTGAGCAGAGACTGAAAGGAAGAAAGAACCAAAGAAAGCTAAAGTCTTTATCGTGGTCTGCAAGACTCTAAATTTAGATTCCTAGTTATCCTTCTAAGTTCCTTCCTTACTTTCCCTTCACAATATTCCAGCTACACTGGCCTCCTTATTTGTCCTTGAATACTCACTCTAATCATGCTCCAGCATGGGACCTTTGCTTTAGTTGTTCCCTCTGCTTGTAACTCTGAGACAGTGACCTGGCCAAGTCTCACCCCTGGTCTTTGCACTTCCTAAAGAGGCCTCATTTAATACTGCAACCTGTCCTCAGCCCCAGTCTAGTATGTCTAGTCCCCTTTACTCTTCTCTACTTTTTCTTTTTTTCAGAGCACTTATTACTGTCCTATGACTGCTGTGCTGCTGTGTATTTTGCTTATATTTATTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTCTCACTGTGTCGCCTAGGCTGGATTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGAGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTATAGCTGGGATGACAGGCACCCAACACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTAAGGTGATTTCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCCATGTACTGTATATTAGCTATTTACCTGCTACTAGAACATATATTTCACAAGAGTGGGAATCTTTATTTGATCTTGTCACTGTTGTATCTCAAGCACTTAGATCAATACCTGGCAAATAAAAGGTTACCAACAAATATTTGTCAGACTAGTAAATGAATCTCTGCATGATGGTTGTGTTTAACGTATCTATTGGCTTTAACTATGATAATCAGTTGAGGTTAATCATTCTTAAATTATGATCTAGTCTGAATTATCTGTACCTTAAAAAGTAAAACTACTATTTTATTAGCTAAGGCATTAATTTGCCTTATATTATTTTTCATTAGGATCCCTCAGTATCTTTTGGATCAAGCAAGGCTAGTGTTTAGAATTCCTTTATTTTATGCTGCAGTGGACTGTACGTGATCATAAAGTGTATTGACTAGTGGAGTTTAAAATTTGCGGCAGGTTATTTAAAAATGCTTTTAAGATTTGGCCAATATTTGAAACCTCCAGCATGATAATATTTTTCATTTTATTACATTGACCTTTTAGCAAGTATTTATTGAGTACCTGTTAAGTACTGAACACATTAAGTCAGTCAGTGGGATTATGATTAATAGCATGAGGTTGGCTTTAGAAAGACCTGGGTTCACATTCTTGCTCAGCTGCTTAGTTTTGTTACCTTGAGTAGCTTTTGAAACTTAGTTTCAAAAAGCTACAAATCCACAAATAGGGATGACTGTGCCCATAGTTGAGCACTGAAATAATAGTAAGGGCTAATAGTGTAATGGCATGTAAGAAGTATTCCATAAATGTTAGTCCTGTTAATATTTTGTTATCATACATGGTCATCAAGCCCTGCCCTCAAGCAGTTCACAGTCTATTAAAGGAAATTGATTCCTAGTTATCCTTCTAAGTTCCTTCCCTACTTTGCCCTCACAATATTCCAGCTACACTGGCCTACTTATTTGTCCTTGAATACTCACTCTAATGATGCTCCATTGTAGGACCTTTGCTTTAGTTGTTTCCTCTGCTTGTAACTCTTGAGACAGTGACCTGGCTAGGTCTCACCTCTGGTCATGTTAATCATTAAAGTATAATTGAATAACTGTGATAATGAAAATTTTTACAGAGTATTGTGCTAACTCAGACCTCTAGTTCAGGGTAGATTTCATTTGAGCTACCTTTGAAGAAGGATTATTCCAGGCAAAAGCAACAGTCTTTGCAGCTAAAAAGAGCATACATACAAAAGTAAAGCTACTGTTATATTAGCTAAGGCATTAATTTGCCTTATATTGATTTTCATTAGGATACCTAAGTATCTTGGATAAATTAAGAGTAGTATTTAGAATTCCTACTAAATTCTGAATTTGGGAATTTAGAATTCACTTTTTTTTTGGAATGACTCAAGTATGAGGTGATGATCATGAATGGTGGAAAGAATGAAAAGTTTATGTACGGGACAAAATATCTTTGTGAAATGGAAAGAGCTACTGAGGATTAAATCGATATAGTTCAGAGCCTGGCATGAAGTAGGTACACAGTGTATGATAAAATTATTAGGCAGGAGAATACATCAAATTTATATTTTAAGAGAATTCTAGGAGCAGTGTAGATTGGAAGTAGAAAAGAGACTAGAGAAAGCTAGCTAGAAGCCAATACAATGATGTAAGGGGTGTGTAGATGATGACTTCATTTAAGGCAGTAGTGGCTATAGCAAAGAGTGATTTTTCAGTAAATAGGATAAAGATTGGACATAAGGGAAAAAGCTAAGAATGTCTTTTACTTTGTATTTCTAGCTTACATTTTAAGGTTTAAATTCTAGCTTGCTTTTTTACTGTTTACAGAGAAATGCTTGAATTTATGATGCCTCCAAACTTAAGAGGAAGTTTAGGAGGAAAATCAATTTTTTAAAATCGTTGCAACCTCTGTCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACGGGCATGTGCCACTGTTCCCGTCTCGTTTTTGTATTTTTAGCAGAGATGGGGTTTCGCCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTGAGGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCTGAGCCTTTTTTTGTCTTTTAATAAATGGTTTGTATTCTTTATCATGACCAGTGTGTCCAAATTTATTCACTGTTAGGTAAATGAGTGTCTTGAGTATAAATGAGTTCAGACCTTTTAGTAAAGAAAAATGAATATGTGAAAGCAGATTATTATTAGATGTTAAAGTCTAGATACAAGTCCAGGTTCTCTGGATGGCATTAGTCAGCAAATCATTTTTTCATTTTATAGAATTTACCAAAGTATTCATTCTTGCTTATTTTTCTTAG
Seq C2 exon
AATGCATAAACTTGTAAAACCTACTACTGAAAAGAAATATGTGGATCTTACTGTGTCATTTGCTCCAGACATTGATGGAGATGAAGATTTGCCGGGACCTCCAGTAAGATACTACTTCAGTCATGACACTGATTAATACAAGTTGTCTTAACGTTACTCCAGGACCACTTGATTTTGGAAAGAGTGCACTTAATTCAGAAGCTAAAGAAAATCAGTTCATAATACTATGGATTTCTCTTTCATTAAGCCTTAATTTTAAGGGAAACATCAGTAAGAAACTGCACTGAAGAATTATAAAACATTTTGGGGCATAGCATACACTTGTCTAACGGTTCACACGTGGCTATGATCACAAGCAACTTTGAACTGGAATGCTATTTACAAAAGTTTTGTGTATTAATCTGTGTATTAATCTCTCTGGATAAAAAGAAGGAAAAAATATGTATGACCAGAACAGATATGGATGAAGAAATTGAAAGCAACGAATGCAACTATTCAAAAAGTTTAATTTTATGAATTTCTTTTTTGTTTAGTCTTGAAGACTGATTTTCTATGCAAATAGTGTTTGGCATCCTGCACCTCTGATATGATTTGGCTTTGAGAATTTAATACCACTGGGAAGAAGTATGGTAGTGGTGGATGAAGGGTGGATATTTTAAATTGTGCAGTTACAGTTTACTGTCCTATTACCTCTGCTCGTTTAACCAGTTTGTTATATCACTGTGTCCCCAAAATCAGGATTTTTGTTGATAGCATCAGTGTTGTAGGAGCAATAGGTCAGATGAGACATATTAACTTAGACTAAACGTGAACAGTATTATATGGACTCTCACAACGCTCTTAGAGAATCCGTGAATGTGAACAGACAAATGTGGCTAACCATTTGATTCTTCAGTATGCCTTCTAATGTGGCTATTTTATTTATGTGAGACTCTAAACCTGATTGTCCTAATATATAAAACTAAAAGATTTTGTAAAGGGAGTGTCTTTAGAAATAGATGAAATGTAGAATGTTAAAAATTATTGCTAGGGTAGTCTTTTTTTTTTCCAGAAACCTAATTAGGGTATTAAATTTTGTGTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAACAGAAGCATGTTATTTCATTCCCATTCCCAGAAAGGGAGTTAATGAAGATAAAAATTTATTTTTTAAGGTCTTTATTGAGAGAAACTTTGTTTTCTGATATGAACTATTGCAGATGTTTTTATAAATACTTTCATTAAAATGATGTAAACAGTAGTACCCAACACTGTAAACTCAGTGAAAATAGTAAATGATTCTTTTATTACTAAGACTGTCATGCATTCTGAAGCAGTTGGCTTTTTTTTAACCATAGGAAGTAATTTCCCTCTAGCTCCTTTCCTTCTACTCTCCTGCTCAGACCATTAGTAGGTACTTTGTTAAATAAAAAACTAGATTAACATCAATATTACTCCAATTTGGTATCTTTTACACTATGTATTATACCTACTTTCTTTTTATTTCATTTACAAATAGTTTAAATTACTTTATCAACCAGCTGTATTGTTTCCCTCTTGTAAAAGTACCATCAAGTGGGGAAAATGTATGTGGAAGTGGAGAGTGAATTTGTATGACTAAAGGATAATCTGTACATGGGGAAGTGGGCAAAAGTGGATAGGATGAATTTAAAGAAAATGACTACCTTTGGAAAAAAGAAATTAAATTTTGTTCACATATCCTACCCTTTCCCATTGTGCATATCCCAAGTGTCATATTTAAAACTAAGGTTACTTAAAACAGAATCCAGGAATATCAAGGCTCTGTGGCTTGGAATTTTAGAGGATAGGACTAATAAAAGGACTTTTGCAAAGAAGGCTTTTTTCCACGTTCACTTTGTTTTGTGTTCTTTGAAAGTAACTGATACTTTTCGGGTAGTTAATTCAGCAGTCCATAAATATGATCCAGTAACTTGCTTATATTTTATTGAAGTCTCGACAGCTCTTCAGAAGTAAATTTAGAACGATGCTGTCAGTTCATATTTATAGATATTAGTGTTTTAGCAGATAAAACAAAATCAACAAAAATTAAGTTCATTTTGTGATTAAACCTGCAACCATTTTTCCATTACTTTTTTTCTATAGTTAATGGTTATTGCCATGATTTCTTCTGTTTGGTTCTACTAAGCTAGAAAGCCAGGGTGAAGTTAATGATAATTCCCATTATTTTATTTCTGTACCATGAGATTGCTGTTGATGACTGAAATACCAGGTGCAAAAATTAATGATTTGATTTTTGTACAGTTTCAATGAGTATTTTTTACTTATTAAAAATAAATTAAGAAATGTAAGAATATCTTTGTAAATCATGTTTCATAAGTTGACTCCAGAGATTCTGATTTTGCTGTTTATTTTGTGAGTAATGTTGCTTTGGTGTTTCCTGATTTTCAAGTTTGCAATCATGGAGATACAGCAGTTATTAGGTGTGGAAGGACATTACCTCAAATGTCCTCAGATGGCTCCAGGAAATTCTTTTAAAACAGTTGGAGAGAAATAGTCGTGACCATGTAAAACCTAGAGGATCTGGTAAATCCCATACTACTGGTTAGGGATTTGTAAAGTCCATTTCTTTTTAGAGTTCAAAGCAGTTCTGTTACTTGTCCATAAGTTCCTCATAAATTGTCCCAAAGGTAGGACATGGAAATAAATGTATATCTTTATTTTTTAATCTACTATGTCACACTCTGGTGATATTCATGGAACATTAAAAAAGCAACTATGTTTATTTTATAATTAGTAAAATGAAGATAGAAAATTGTTCTTTTGAAATTTTTAGGGAAAAAAAAAATCTCGTGACCTAAATCTTTCCACTATAATGAATATTCATTGTGATTGCAAATATCTAATTTTATATAATCACTGTGTATGGATTTAGCGATTTTACTTTTCATAGATTCAAAAACATATAATCTGAATGCTTTCTCTGAAAAAAAAAAAATCAGAGTTGAGCTCTTGAGGATCAGAGTTAAGTATCCATTGATAATATGTGTTCATTTTGCTCTATGTCATAACTTTGTTTTTTTATTGAGAAATATATATTTTTCAAAAACACATATATATTCAAAAATACATAAAATATAAATATGCAGTTCAAGGAATAATTTTAAAGCAACTATATAACTAGCACTCAGCTTAGTAGAATATATTGACAGCAGTTCAGAAATTACACATGTAGTTCCTTCCCAGTCACAACCAGCTCCCTGCCACGTACCCTTTGGTAATTACCACTATCCTACCTTGTATGATAATTGTCTCTTTGTTTTTATAGTGTTACCACCTATGTGTGTAAACTTAAACAATACAGTTTGCTTGTTTTTGAGTTTTATTTAAAATCATACATTCTTTTGTAGCTGCATTTGTTCAAGATGGGATTGATTCATGTTGGTTGTAGCTGTACTTTATTCTTCATTATGTCTGTGTAATTTACTTTTCTGTTAATATGCCACAATTTATTTACTGTAGACAATTGGGATGTTTTTAGTTTCAGGCAATTACAGTTTCACAATGAACATCATTTTATGTAACTCCTAGTACAAAGAGTATATATTTAGGAGTAGAATTTTTTGGTCATAGGGTATTCATATCTTAAATTTTATTAGATGATTACAAATTTTTTTCTAAGCATTAGTATGTTGGTTGGTTTTGTGTTGCTATAAAGGAATATCCAAGACTCGGTAATTCATAAAGAAAAAAGGTTTATTTGGCTCATGGTTCAGCAGGTTGTACAAACATTGCACCAGCATCCCTGCAATCATGGCAGAAGGCAAAGGAGGAACTGGCGTATCACATGGCTAGAGGAGCAAGAGAGAAATAGAGGAAGTCCCAGATCATTTTTAAGAATCAGATCTCACATTAACTCATGGAGCAAGAACTCGTCATCTCAACGAGGGCACCAAGCCATTTATGAGGGATCCAGATATCCATCCCCATAACCCGAACACCTCCCACCAGCCCTCACCTCCAACACTGGGGATCACATTTCAACATGATATTTGCAGGGGACAAATATCCAAACCATATTTCTCCATATCTTGGTCAGTGCTGGTGTTAACAGTTTTTGTTTTTAATTTTGCCAATCTGGTGGATGTGCAATTGTATCTCATTGAAGTGTCACTCTGCATTTCTCTATTACCTGTGAAGTTGAGTATTTTTTCATAAGTTTATTGGCCAATTTGACTTTCTGTTTTTGTAAAGTATCTTGTCAGGACTGCCACACGTTTTTGTTGTGTTGCTAATCTTTTTCCTCATTGATTCATAAAGGATCTTTATAAATCTTATTCTTTGTTGGCTGTATAGTTGCCAATATCTTCTCCCAATTTGTGGCTTGCCTTTCCCTCCCTTATGATGTTCTTTGATAAAAACAATTTATTAATGGTTAAGTACTAGGAAGTATGAGTGTTTTAAAATTAGAGCGTGAGTTGTTTTAAAAAACCATTCCCTACCCTGGAGTCATGAAGATAGTCTTATATATCGTCTTCTTAAAGCTTTAGTTTTGCCTTTCATATTTAAATTTTTTTCATGAGGAATTAATTTGGTGTATGCTAGGAGATGCCTCACTACCGTTTATTGAAAAATCTGGGTTTTATTCCTCCTTTCTATAGTGCCACCAAAGTCATGTATTATACCCGTATGTGAATACAGATTTCATCAACATCTGTTGATGAAAAGAGTCAAACTCTGTAAATATTTTCAGAGATTATTCTGAGCCAAATATGAGTGACCATGGCCTGTGACCCAGCCCTCAGGAGGTCCAGAGAACATGTGCCCCAGGTGGTCAGAGTACATCTTGGTTTTATATAGAAGGCATGAGACATCAAATACGTTTAAGAAATGCATTGGTTTGGTTCAGAAAGGCAGGACAACTCAAAGCGGGGGCTTCCAGGGTATAGGTTAATTTAAAACATTTTCTGGTTGACAATTGGTCGAGTTTATCTGAAGACCTGGGATCAATAGGAAGGAAATATT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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000033178:ENST00000322244:32
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF093585=UBA_e1_C=FE(25.2=100)
A:
NA
C2:
PF093585=UBA_e1_C=PD(28.5=76.1)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
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Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
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F:
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R:
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