HsaINT1022623 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000152601 | MBNL1
Description
muscleblind like splicing regulator 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:6923]
Coordinates
chr3:152432717-152445539:+
Coord C1 exon
chr3:152432717-152432920
Coord A exon
chr3:152432921-152445281
Coord C2 exon
chr3:152445282-152445539
Length
12361 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTAGGA
5' ss Score
8.24
3' ss Seq
TGTACTTAATGACCTCATAGGTA
3' ss Score
5.9
Exon sequences
Seq C1 exon
CCAATGTTTTCAGTTGCACCAAGCTTAGCCACCAATGCATCAGCAGCCGCCTTTAATCCCTATCTGGGACCTGTTTCTCCAAGCCTGGTCCCGGCAGAGATCTTGCCGACTGCACCAATGTTGGTTACAGGGAATCCGGGTGTCCCTGTACCTGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCACAGAAATTAATGCGAACAGACAGACTTGAG
Seq A exon
GTAGGAATGACTAGTTGGTGTCTTTATATACTACATTCTAATTCTCAAAGTGTGGTTTTTTGTTTGTTTGTGTGTTTCCATGGCCAAAAAGTTGTAAAAATTTTAAAACAGATTTTGGCTTAGGGTTTGGAACATTTTACTAGAGTATAGATAATGCTGTATTTGATTAATGTAACGTTTATAAAGGCTACAACATCCATGTTTAGAATAGTGGATAAGAGGTTGGACGCTAAAGTCACATTGCCTGGTTACATCACTGTACCTCAATTTCCTCATCTTTAAAACGGCGCTTACCTCAAAGAGTTAGGGGAATATCTGGCACATAGCAAATGCCTCCTGAATGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCAGCTATCAAGAATAACAAATATTATCAATCCCCTAAAAATTGTTCTCATAAAGATTAACAAATATTAGTGTCTATAAAACATTTTACAATTTATTATTGCAAGTTTCCTCATAAGCTGTACAATATTTTGGTTGAAGTAGAAAGAAAACCTTATGAAGTATGCTCTCATAAAAGTTTTTTGCGGCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGACAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGTCGGGCGTGGTAGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTGCATAATCCTCTAAGTTCTAGAGTAAAGGATGATCAGATGTGTGGGCTCTGCTGTTGGTACATGAAAAAGATATTAAAGTTTTAAATCTTATTTCAAAGTGGTTGTTCAGAATTTCAGCATGACTGTGAATTAATGAATTTGGTAAACTATAGATGTAGAGAAAAAGTGACAGCATCAAATGTACACTGAAGGTACAAACGTGTCATTCATTGAACCCACCTAAAGAACAAAATGACCTTTTCCTCTTTTCCCTGGTGAGGATGAGGCAATATATTTTTTTAACTTGCATTTTAGGTTCAGGAGTACATGTGCAGGTTTTTATATAGGTAAACTTCATATCATGAGGGTTTGGTGTAGAGATTATTTCATCACCCAGATAATAAGCGCAATACCCAATAGGTACTTTTTCTGATCCTCTCCCCTCTCCCACCATCCACCCTCAAATAGGCCCTAACATCTGTTATTTCCCTCTTTGTGTCCATGAGGTCTCATCATTTAGCCCCCACTTACAAGTGAGAACATGTGGTTATGTGGTTTCCTGCTTCTGTATTAGTTTGCTTAGGATAATGGCCTCCAGCTCAATCTGTGTTGCTGCAAAGGACATGATCTCATTCTTTTTTATGTCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCAGGCTACTATTGATGGGCACTTAAGTTGATTCTATGTTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAGTGAATACACGTGTGTGTCTTTATGGTAGAATGATTTATATTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTACTGGGTCGAATGGTATTTCTGTTTTTAGGTCTTTGAGGAATTGCCACACTGTGTTCCACAATGGTTGAATTAATTTGCACTCCTACCAGCAGTGTATAATTGTTTCTTTTTCTTTGCAACCTTGTCAACATTCATTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGACATTTTAACTGGTGTGAGATGGTATCTAGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATAATGGGAATTTTTCATATGCTTGTTGGCCACATGTATATCTTTCTTTGAAAAGCATCTGTTTATATCCTTCACCCACTTTGTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTGCTCGTAAATTTAAGTTCCTTACAGATTCTAGATATTAGACCTTTGTGGGATGCATAGTTTGTAAATATTTTCTCCCATTCTGTAGGCTGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTGGCTGTGTAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATATCATTTTTCCATTTTTTTTTTTCGTTGCGATTGCTTTTGGCATATTTGTCATGAAATCTTTGCCAGGTCCTATGTCAAGAATGGTATTTCCTAGGTTATCTTCCAGGGTTTTTATAGTTTTGGGTTTTACATTTAAGCCTTTAATCCGTCTTGAGTTGATTTTTGTATATGGTGTAAGGAGGGGGTCCAGTTTCAATCTTCTGTGTATGGCTAGCCAGTTATCCTAGCACCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTCCTCATTGCTTGTTATTGTCAACTTTGTTGGAGATCAAATGGTTGTAAGTGTGCTGCATTATTTCTGGGCTCTCTGTTCTGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTTTTTTTGCACCAGTACCATGCTGTTTGGGTTACTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAGTCAGGTAATGTGATGCCTACAGCTTTGTTATTTTTGCTTAAGATTGCATTGGCTATCCAGGCTCTTTTTTTATTCCATATGAATTTTTAAATAGTTTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTGGACAGGAATAACATTGAATGTATAGCTTGCTTTGAGCAGTATGGCCATTTTAATGTTACTGATTCTTCCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCAGTTTGTTATGTGTCATCCATGATTTCTTTGAGGAGTGTTTTGTCATTCTCATTTTAGAGAGCTTTCACCTCCCTGCTTAACTGTTATTCCTAAGTATTTTATTCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGAATGCACTCCTGATTTGGCTCTCGGCTTGGATGTTGCTGGTTTATAGGAATGCTACTGATTTTTATACATTGATTTTGTGTCCTGCAACTTTGCTGAAGTTGTTTATCAGATCAGGGAGCTTTTGGGCCGAGACTATGGGGTTTTCTAAATAAAGAAACAAGTTGTCTGCAAACAGGGATAATTTGACTTCCTCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCCTCCTCCTGAGGATGAGGCAATACTTAGTGCTGATAAATTTTACTGAGAAACTGGCAAACTGAGGCTGTTGTATGAACATAATTGATTCTAATACTTTGTCAGTTTAGCAGGAATTTAGTTAATAAGCTGATTTATTATTTATTAACTTTTGTTGCATATATTACAAAGGCTGTCAGATTTTAGCATATTGACAATCATATACCAGACACATGCATCGCAGGTTTAATGCTCAAAACAATCTTATGAGGAAGATACTATTATTAATTCTCTTTTACAGGGAAATGATTTTAGGAGAAGAGATGTGAAGCAACTCTTTCTTGTTAGGTAGATACACCTGATACACCTGGATTTTTGAGTGATTTGTCATTACACAACTGTACTTGCTTATTAATTAACTAATGCTGTTTGCAGATGGATTAAGAGGAAACTTAAAAATTTTTAAATATCTGAAATTATTGGATCCTCAGCATGTGAAGCAGTTTTATTCCCCCAACCTTTCTAAAGCAAACCCTGAGTTCTTAATGCATAATTGTTGATTGATTAGTGGGATCCAAATAAGAAGTCTGAGATTAACTTTAATGAATTAATTATTAATAGATGATATTCAAAAAGCTGGTTATAACTCTTCTAATCCAATCCTGCCACATTCACAGTTTCAGGTAGTTTGTTACTGGTTATATTTTGTAGTGCTTAATTGAAATGAAGACTTTTGTCTTTGAGTTTTTTCTTTTTGTGAGGAGCTACTTAGCGTATTTTGTCTGTTTTCTTTTGCTGTAGTCAGCACAAACGGTTACAACTGCATCAACTGTCATTTCCCTTTTATCTGAATCCTGCTGATCTAAATGCTTGATTGTAGTGCAGCTTCCTGTCTTATTCTTGTTAACAGGATCTGATCCAGTGTCACAGTTACAACCTGTTAGGATACTGCCGTGTGAAGCTCAGAGGCTTATCTTTCTGCTCTGTGCTTGTGATTTTAGACAATCCTATCTGCAGGTTATTTCCTCGCATGCTAATTGCATTACGTATTGAAGTCTAAAAGACATGGCAATAAATGCACACACTTATTAATTGACCAAATGTTTGGTCATTTGGCATTTAAATGTATACTCTACTTCTTCCTTGTGAAATTCTGAAGCATATTTTTGAATGTTGAGTTCCTTCTGAGGTGAAAAATTTTCGGAATCAGTTAAACTATTGGCCAGTTCTTCTTGCCACTTCTTCCTCTCTTTTTACTGCAACTTGTTAGACAGTAAAGAAATTTAAAATACCATAGATTGTCAGCCTTCTGGTTCTTACATAATTGCTTAAAACTGACATCTTTACAGCACCCAGTGTGATACTACAGAAAAAAAATGTTAAATTGGAAAACAGGAATTCAAGAATTACTGCATGTGATGTTGCTAATTAGGTGAGTCAGCTTGGATCGAGATGCTCTTATTCTCTGGGCTTCATATTCCTTACATGTAAAATTAGGGGGTTGCACCAGATAATCTCTAAGGTCACTTCCAGTTAGAACATTCTAGGGACATTTAGGTCATTTTCTTGTTTTTAACACCAGCCACAAGCTACTGAAACATTTATTTTTAAAAATTATATACATATATCTATAAGCATATATTACATATATCACATATACACACAACATGAGATTTATATCAATATTCATATTATCCTTTCTTTACTGACTATCTTTTAAAAGACTTTGTTGCCAAGTACTTTCTGTACTCCAAAATTCATACTTTTTTTTTTTTTTGACACTAAGTCTCACACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGGAATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGAGATTACAGATGTGTGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTCAGTGGAGATGGGGTTTCACCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAGCAATTTCTTTCCAGGATTATGTTAAGAAATTATTCAAATCTGTAGAGTCTAGGAAAGACTGAGTGTTTTAGCCATACCCCTGCTTTACTACAAAGAGTTAGTAATTGGAGAAATCATTGTTTGACTTATTTTCAAGATGCACAGTAATTTTTTATGGTGCAAAAAGAATTCATGAATGCATTCATTCTCTCATTTACTGAACGATATTCAGTAGAAAACTGTTGAAAATATTTCAAGTAGAAGATGTGAGAAATGTCTTTGAAATGCTTTAATTCCTGTCTTATCAATGACAATAAAAGATCCACATGAGAATAGTGCCCAAACTCATGACTGATGCCCAGTAACTTGTTAAATGAATGGATAAATGAGTCAGTCAACCAGTTACTCAGGTAATTAAACACAGAAAGATACATCCCCTTATTCAGGACTCAGGGTAATCCCACAGAGGTACTAAAATATAAAAAATGTTTATCATGTGTTAACATTCTCCTTGGAAACATGTTTGCATTTTGAGCACTTCAGCTATAAAATACAGCATCTTGGTTATGCACCTAGACCTAAAGGAGTGGTTTTCATACTTTAATGAGATTAGAATCACATGGGGTGATTGTTAAAAATGTAGGACCTCATCCCCAAAGATTGATTCAGTAGATCTGCAGTGGGGTTTGATAATATTTTTCTGCCATGTGATTCTAAATGCAAATAGTTAAAAACACATGCACTAAAAGATACTAGCATCTCTTATTTAGGCTTCAACTTTTTCATCGTTTACTTAATGTATTTGTAAATGATATGGTTTTTTGTGAAACTTAATTAAAAATCTGTCTCCTCAGATAAGTTGGTAAGAACACTGTGCATGGCATAGTGAAATACTTTAGGTAAACAATGATGACTGTTAAGGTAATTCATATTACATAGGCGTAATCCAATAAAAACCAGGGGACACGTATTCCAGACACTGATGAAAACATTAGATTGACATTTGGTTAGCTGCACCATTTTTACATCAGCAGTCTATATGAGAAAAGCATGAGTATTCCAGGAAAGGTGGGCAAACGACTTGGTTTCTGATAGTTTCAGTTCGCGTTTGCTTGTATTAAAATATAAAATAAATTATTCTTGGCTGAAAGTTTTATTCTGTGAGGTAATCATTACACAAGTTTCTAATTTGGGCCACTAATTGTTGTATGTTTCCATTACTTACACAGAAGAATCTAATAACCCTTTTCATGTAGGCAGAAAAAAATATAATACCCATTGACTACAAAAAATAGAACGTTTAAAGCTAAATGAGGATTAGAATGACAGTGAAAAGCATGCCTATGTTGGGATTTTTTAGGTGTTTAGTGGATTTAACATGATGGGATAAAAGACTTTCTATTCAGAAAAGATTAGGAAAGAAGATGCTTTTAATAATGTAGGAAAGTCTTATCGGTAGGATTATTTTAATTTTGCATTTTTGTAGAGGATGTTTGGCTACTGCTTGTGTGACTTTTTTTACTATCTCCAGAAAATTGCCAAGAAACCTTAAGAGTTTTCACATAGAGGTTTATGTAGGTTGTTTTTTTATATCTGTAATAAACTTTAGAATGGCTCTTAAAAATGTAGTCACATCTTCATTTAAACAATTTAATACACTATGGCTCTGTCAATTATTAATCTATGTGATTAGAGTTTTGATATGGTATAGAGTATAGTAATTGCTATATTAAGAACAGTGGTTCACACCTGCAGTCCCAGCTACTTGAGAGACTTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCAGGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAACTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGACTGAGTGACAGAGGGAGACCCTATCTCAAGTAGTAATAATAATAATAATAATAACATAAATGAAATAAGGTAATGGCTAATTTGGTGTATTGACAAGCTTGTTTCAAAGTTGTGTCTATTTTCCTGTCCTCTTGGGTTTGCACAGTCATTCATGGGAATGAATAAATGACAACGTGGAAGTGGATTTAATGGTTCTGTCTTTGGTCATTCCTATTCAGATTTTATTTTATGTTTTTATAAGAGATCAAGTGGTAGATTCTTAGTTCTGTTACCTATAGAAGCATGCTTGTGTTTTCTGGCCTGAATAGTAATGATGGAGTCTGCCTTTTAGGCTTCAAAGAATGCTCCCATTTGATCCTAACAGAAATACTATGAGGTAGCTAAAGTAGGTGTCCTTTTCTTGAATTTTTTTGGAAGGAGAAAAATTGATCAAATATGTACAATTATTGAATAACCAAATGTATTAGTCCATTTTCACGCTGCTGATAAAGACATACCCAAGACTGGGCAATTTACGAAAAGAAAGAGGTTTATTGGACTTACAGTTCCACATGGCTAGGGAGACCTCACAATCATGGCAGAAGGCGGAAAGCACGTTTTGCATGGTGGCAGACAAGAAAAAAGGTTGCACAGGGACATAACCCTTTTAAAACCATCAGATGTCATGAGACTTATTCCCTATCTTAAGAACAGCTCAGGAAAGATATGCCCCCATGATTCAATTACCTCCCACCGGGTCTGTCCCACAACATGTGGGAATTCAAGATGAGGTTTGGGTGGGGACACAGCCAAACCATATCACCAACTGAAACTAGAAATCACATCATCCGATATTTATCTAGGGATTTTAATTGTACAATAAATTGACTACAGTTACATTTACCTAATCACCAGAATTATGAGGATTACAAAGTAGATATTTTAATCCTTTTTAAATGAAAATAGAGATAATTTCTTTACATTAAATTATAAACTCATGATCAGCGATGCTGTGGACACTTTGATCAAAGTGATTGATCAAAGTGATTATCTAGGATTACTTTTTAAAGTAATACTTAGAAAAATTTAGCTTGTTAGTTCCAGCTTAATAGAAAGTGAAGTCCATGCTGCTTATTGGTGAACATGTAGCTATATGTCTTTGAATACGTTTCTTAATATTGGCCATTAACTATTAAATTGACTTCTCAAAATGTTAAAATGGACAAAGTCCCTGTTTCTTGTTATAATTAGCTTTCTGTTCCTGCTTTTGATTGTTATTCTCCAAGATGACTGAGTTAATTATACAAATATGGTGAACACAAAACATATTACCTCAAAGGGATATCTCCTTAAAGAATATGCAAATGACCCTCCACTTTTGAATAAATTCAAATATTGACATTAATCTCCTTAGAATCCCAGTGCTTTAACTTGAGAGCATTGCTGAGTTTAATACTACTTATAAAACTTACGTTATTTTGACCATTTTGAAATATAGTTTTTCATGTATTAAAAAATTAGAGATCAAATGACAGGATTATTCATATTATCCAGATTTGTATGGTGTGTTGTAAGCTATGCATTATTTTATTCAGTATTCATGACCTTTTAAATAGATGTTAATAGTGTTTTCATTGTGAAGATTCCTTAGCTAGTAAAGTGATAGGAACTGGAACTCACAATTTTTGACTCCAAACCCTATTGTCTGTCCGCTATATTATTGCTATTTAGTTAACAAAAGAAGGTTTATTTAGAATTAATTTACATTTTCTTGGGAAATTTTCCTGATTATGTTTTCTTTTGATTATTTAAAGTTTATAATTATTCCATAGATGTTTTTCTGGAAATAGAACTTAAATGTTTTCAGTGAATATCTTCATTGTCAAATCTTGCCTTAGTATTTGTAAAGTAAAAGGCTCATGTTGAATCACATTATATGTGTAGCTAAATAGATCTTATTGTTTTAATGCAGGTTTGAAAACCATTTATCAAACAATATTTTTTTTCTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCGACCTCCACTTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCGTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGCGCCTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTGGAGATGAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGTCCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACCAGCTTGAGCCACCGCGCCCAGTCAGAAAATATTTTTATGTGTTGACCCAGTACATACACATATACCAATAAATCTGTACATTTATCTGCCAAAAATAATGAAAAATGCCTATAGTCATGGATATATTCTTGGAATATTACTTGTAATATGGAAATACTGGAAATTATCTAGATATCCTCCAAAAGAGTTACCTGTATTATGTACACTATTTGATGAAATTTGATGCAGCCATCAAAAGTATTCACTCTGGAAATTATTTAGCAAAATGAGAAATGCTTATGCTGCATTGTTGAGCATAAAAGATCACCAAATAATAGCTATACTATAATTACAATTATTTTTAAAAATGTGTGCATACATACAGAAGACTGGATGAGAAGAGAAAAATGAACCACAGTGTTGTTAGAATTTTCAGATTTAATTTTATATTCTGTTTCAAATTCTCTGTATGATAAATGTTATAATTTCTTATCCTGTTTTTAATTATGAGATTAAATTTGTGAAATGTTGTCAGTTATAATTTACTAATGTAATAGTATGTCTAAGAGATTTATTTTGGGTATCAGCATAGTCTAAAGTGTCCTTGAGTTTATCAGAGAAACCAGATCAAACTCATATTGAGCAACCAAGGGATAGATCCCATTTTATTGATGATGTCTATTAGGGAAAATGTGTTTTAGAAGGTTTGGGAAGTTCATGTTCCCATAGGTACCCCACTATTCAGATGCATATCTAATGCTTGGTAAATTTCCAGTCCCACTGGCCTGTAACTCTCACCAGTACAAGTTTTCACAAGAGATTTTCTCTTCCTTATTTTTTCACAAGCAAGAATAATGTGAGAGTAGCTATTACAGTATGTTTCTGTCCTATTTCTTAGGAGAAACCGTAAGCTGTAAAAAAAAATAAAAATATGAAAGAGTCAAACATGCATATTATGCAAAAGCAGTTGACTAAGTTTTTTTTAACCTCAGAAAAGGTTGGTTTTATGACACATTCTGAGCTAATTCTTAGTTATTAAGTCTGCTTAAATATTTTTAGAATTCTTTCTAAATGTTCCACAGGAGAGTAAAGAACATGAAATTATAATAAACCAATCCTTAACCTGTAGAAACCCCCCCCCCCACACACACACACATGCAAATACATACACACAGAACCTAAATAAATTCAAGTCTTCTTTCTTGTTAATGCGGCAAAGAGTAACCTAAATTGGAAAAGTAGAGTATTAGTTCCCTGCTGCCAATTCATTTTGAGCATATTCAAGAAAGCAGGAATTACTGAGGGAGCAAATAGCAGCTGAGAGAGATCACTTATAGACCTTCTGCAAGTTTCCTGTTTGGTGATGCCTACATTGACATAGACTTGCTTAAACAGAAAAGTAGCCCTTTCGTTTATGCAGTAGTATATATTTAGCATACACACACACACACACACACACAACTTTTTATCATTATTTAATGTAGGCACATCACTCTTCCTGAGTATAGTGATGAGCCTCACATACAATAAATTTTGATTAGGTACTGGGTACTGTTTTAGCAAGCTCCATAGCTGATGCTAATGTTCAGCCAGAGAGGAGGATAATTATTCTCGGTAACAGCTTGATCATTTTTTGCTTTTAAGTTATAAATCTTGGTAATACTTTTTTTCTTATGTTCAATAAGATAAATATGCTAATAAAAAACCAGAATCTTGAATAACTTTTTAAGTCATTTTTGTGATCTTAATAACTGAGTGTAGTGGTGAATGACACTGGCTCATTGTATGTATTTGGAACACAAAACTTTAGCTAGGTTGAGGTTTCCAAGTAGTGCAAGATATCATTTATAATGCTCTTTTTTAAGATGTAGCATGATACAGATTATAGTATCTCCTTCTTTAAGAAACACTTTCCTCAATAATAGGATATGAATATAATGTGGGAAAACACCCAGATTTAAATGCAATCATTGTATTTATACAAATCCAAGAAAACCTTTGCTTCCTAAGTCGTAGTAGGGTTACAGTTTTTCTTTCTTGCTTAACTTCAAAATAAAGTGCTTAGTATCTGCGTTTGCTATTTGTGAAAAGATACTTGAACAATTAAAAACTGTTTCCTTGAAGCTTGAAGTAAGAGCACGAAAATATTAAAAGGACATTCTGTGTTTTAGATGGCCCTCTTGTGGTAAAAGGGTCAAAGTATCCTGAATGAAGACTGCTTTTAAATAGTAAGAGTCAAAATTGCGCAGATGAATGAGAAATAATGTTCTCGCCTTTTCCCTAAGATCTCCGTGGCAAAATTAACAGAATTAGCAAATATAAAACAAACAGACATAACAAAACCAATCTTTTTTTACTGCTTTATATAGCTACCAAGTGAATCTCTAAAGATCAAAAAAATAACTCCTGGAAACATTTTCATAAAAAGCTATCAAATTTGATTTTGTATATTTTTCACTTGGAAATAATTTTATATTTACACGAAAGTTGCAAAAATGGACCCAAGAGTTTCTGTCTACGCTTTACTGATCTAAATATTAATATCTTACATAACTGTAGAATCCCTCTTAAGACCAGAAAAATTAACATAGATATGCTGCTGTTTAACCAATCTACAGACTTTAATCAAATTTTACCAATTGTCCTCCCAATATTCTTTCTGTGACTCCAGGATCCTCCAGCTTGTGATAATATCTCAGTCTGTCTTGCATGACCTTGACACTTTGGGAGAGTACTAGTCGGTTATTAGTAAAATATCTTTCCATTCACTTCATCTGATGTTTCATCTTGATTAAATTCAGGCAGTACTACCTCTACTGTGATTGTGTGCCCTTCTCATTGTATCATATCAATAGATACACAACATCATTATGTCTCATTATTGGTGATATTAATTTTGATCACTTGGTTAAAGTGATGTTTTCCATGTTTCTTTACTGTGAAGTTATTATTTTTCCCTTTGCAATTAATAAGTTTATCAACACCATTTCAGATTGTATTTTTACCATAATTAACATTATACATGCATTTTCTTATGGACATTTATACTGAAATGGAGTTATAATTTGTAACTAAACTAGGAAATGCTGAAGTTACTTGTTGCCTTGTTTGAAAATCATTTTCCCTTTTCATCTATAGCCTTCTGTCACCAGTCTTGCACTTTAAGTTAAAATCTTCAGAAAGCTTCTTCTTCTTCATGTTGACTAAACCTCATGTACTTAATGACCTCATAG
Seq C2 exon
GTATGTCGAGAGTACCAACGTGGCAATTGCAACCGAGGAGAAAATGATTGTCGGTTTGCTCATCCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACAACACAGTCACTGTGTGTATGGATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGCAAATACTTTCATCCCCCTGCACATTTGCAAGCCAAGATCAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCCACCGCAGCTGCCATG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000152601:ENST00000355460:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (disopred):
C1=0.760 A=NA C2=0.347
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0064219=zf-CCCH=PU(11.1=4.4)
A:
NA
C2:
PF0064219=zf-CCCH=PD(81.5=25.6)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains