MmuINT0043189 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000044647 | Csrnp3
Description
cysteine-serine-rich nuclear protein 3 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1925021]
Coordinates
chr2:66002303-66019736:+
Coord C1 exon
chr2:66002303-66002562
Coord A exon
chr2:66002563-66019439
Coord C2 exon
chr2:66019440-66019736
Length
16877 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTGAAA
5' ss Score
4.51
3' ss Seq
TTGCTTCCTTGTGTTCCTAGATG
3' ss Score
10.11
Exon sequences
Seq C1 exon
CTTCCTCCATCCTGAAAAGGGAGAAACGGCTGAGGACGAAGAATGTACACTTCAGCTGTGTCACCGTGTACTACTTCACCAGGAGGCAGGGCTTCACTAGTGTGCCCAGCCAGGGTGGCAGCACTCTGGGGATGTCCAGTCGTCACAACAGCGTGCGCCAGTACACCCTGGGCGAGTTTGCGCGAGAGCAGGAGCGCCTGCACCGGGAGATGCTGAGAGAACACCTCCGGGAGGAGAAACTCAACTCTCTCAAACTAAAG
Seq A exon
GTGAAACATTTGTTCACGTTTTGCAAAATCTCATGTTCTTAGAACATCTGAACCAACCATTTTTGTCCATGGGTCCAACTCTATTTTCCGTGACAGAGAAGCTGCCCACGAATCTCTTTTCTCATATTTCCATTCCTTTCTTTCTTCTTTTTATAAAGCTGTATTCTTTCCATGGGACCCTTATCTAATATTATCTATTCGTCCATTTCACAAATATTTACTTTTGGATGTTGCTACATCATGCACCACCTGTCTGAATGTGCTTGGACTGGGGCTAGCAGGAAACTAGAAATACATGTGTTTTCCTGTCTATGGGAGGTTACATTTTAGTAGGAGTAGAGAATATCAATCAAGCGGTCAAAGGAAATTGAATCAAAATTTCATTTTGGGGGCTATGAAGGAAAGTTGTAAGGTGTTATAAAAGTTTTTGATGAGAAACAGATGTGGTCAGGAAGTCAAGAAATGCTCCTGGAAGGAGAGAGAGGAAGATCTGAATGATGGACTAGGCACAGAAGGTGCTCAGGGGTGTTTGCTGGGCCTGAGGCAGGTGAGTTACATAGGAGGCTATGGAACAACAATAAACTGTCCCTCATATCCTCAGGGAATCAAAAGTTACCACAAGTCTTAAGCACAGGCTGGAGTTGTAATATTATGACCACCATCACATAGTCATGTGAGGGTAGTATGAGGGTGAAGAAGGCTATGTTAGGAGAGCACCGGTGTACAGTCTGACCTGTCAGTGAAGCAGCTATTAGGGCTAGCCAGGAGAGAGGTGAAGGGAGGGTAGATTGGACTGAACAGAACAGAGAGAAAGAGACATTCAAGACAGGGACTGAGGAACTCAGATAGGCAGACCTGGGCGACGAGCTGGATTTACAGAGACAGAGGGACAGGGATACAGGGATCTGGCTTGCAGATGAGTGGCTGTACGTGACACATTATTGCTTGCTCTCTATGATGCAGGAAGACAGAAAAGTCTAGAAAAAAAATTTGTGGATAGATGGTGAGGTCTTCTCAGACATGAGTCGGAAGATGTTTATGTTGTCAGGAAGCGTGGGGACAGTATCTAAGTTAGAGAAAACAAAATCCAGAAAATACCTTTTGCAGACTAGAAGCATGGTTTTGTCACCTATTAATGTATAAGAACACCCTCCCATTGATATCTAATGATAGAGAACAGTCCCAATGAACCCAATCATTAAGGTCTGGAAACACACTAAGAACCAGTTACCCATCCTAACCTTCAGTTAATAAAAGCAGAGGTGTGCTGTATGCTTCAAGATATCACCTTTTTTTTTTTTTTTAAATATTTCACCGTTTGTTTATATGTCTGCTCTCCATGGTGTGAAAAGACAATAAGTGAAATTGATCTGCACACTCCCCAGTTTGGGGACGTCACACTTCCTTTCCCAATATGTTGGGGAAGTAAGTTTCAGTGGAAGTTCCTTACCATGGTGGTTTTTTGTGTTTCTGAGTGATTTCCAAGTACATCATTTAGCAAGGATGCTTAAGTTTGCTTGTGAACTCCATCCAGCCTTTCCCTGCAAACTAACTCCCCTGCCACCGCCAAATGTGACATCATCCTCCAGGTTCAAATATTACTGAATCAATGACAGTGGCTGCCAATCGGATTTTTTATTCGGTAAGCCTTTGGAACATGCATTTGAACTTAATCCTCACAAAGAGCCAATGGGATAAAATCACCAGAACATAGCTCAGATAAACGGATCATGAAGGCAGTAGAACTACCTCACGGTCTAGAAAACTGGTTGTTATTATTTTGGTCCTTCTTCTTAAATTAGTTGATTACCCCATATAGGAACTAGGAAGGACACTCTATCCCCTTCCAGGGTCTAGTGGTATATGCGATGGATTCTAACGACTGAGAGATGTAAAGTTATCTGAGAGCCTAAAGGCTTACCATGGCGATTGTACGTGCAACTTTTTAAAGGAATTGCAGGCGGCCTTCCGCACACGGGGAAGTAAGCCTTTTCGTGTTGCAGTTCTTCCTCCTCTTTTAGTGCTCTTTTCTAACAAGCAGAACTGGAAAGGAAGGAATAAAAGAAGCACTGTTGGTGACTCATTAGTAAAATTATGGTTGGGGACAGGTAAGGATGTGTGGTCATCTCAGTGGGAGACACCTAGGCAGGTGCTGTCCTTCCTTGGGTGTCCTTCTCATATGAAAGCACGCAGTTCTGTTGTGAGGGCGTACAGCCTTCCCTTTTGTGAGGTTGCAAATGGGATGTTTTTGGTTATCGCCCCCTCTTCCGAATGACCAGGAAGCTAAGAGTTAAGGCATTCTGCAGTGATCTGAGCTTACCCTCTCCTGACACAGTGCACATGCCCTCAGAAACACATGTTCCGTGAAGCTAACACCTCACAGCCGTGTGGACCGGTGTTCTAAAATATGAAGGGGGAAGCCTGGATGTTTTCACGGCAGTTCTTCTAGCATTCATTTTCATGATTTTGAAGAAAAATGTCATGAGTTATACTTGTCTAAGGTTTTTTTTTTTTAATCCAAATTCCAAATTAACTAGCACAAAATGATAGTTGTGCCCAAAATTTCACCCAATACTAGGAATTTTTCTTGTAACACATTTGTTTCCACGTGAAGGAAATGTCACAAAGTTGATTGATTGCATGGCTTTGGATGGGGCCAACAGAAAAACCTTGGAACAGAAGGGCCGTCCAAAGAGGAGAGAAGGGACTGGTTAGGGTAAGCTTTGCTGCTGGATGTGGTGACACACACAGTGCTGCATTCATAGCACTCCAGAAGCACACGCAGAAAGATTGTCAGCTCAAAATGGGGCGGGGCTATTGATAAAACCTCACTGAGACACAAGTGGGGAAGAGAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGGGTTTTACCTGAGATGTTTTTCTGGGAATGTCAGTAAACACCTTGTGAGGTAACACAGAGCAGCCTGTCTGACACATTGGCCTTTCACCAAGCCCTCATCATGAAGGCCCAGTACCTCACTGGACTTCACTTTACCTGTTTGAAAAGACAATGGCTTTATACAGCAACTATAAAGTCCTCACACACAATGACTGGATTTCTTGGGGAAATCTGCTGAGTTCCAAACAGAGGAGCAATTTCTACATGGTTCTAGAAGTTTCCTTTTAATAAACATAAAGAATAGACATTTAGATTTTGACTATAAAATTGCTTCTAATTTGGTAATCCATTTCCTGTGGTGTGAGTTAAGAAATTGTAGAGATTCAGACACTTAGATTTGTAGAATAAATCCAATTTTATTGGAGGGTTTCAAGTGTATCGTGTTCGTTGGCATCGAGGTTGTTTCACACATTGACTATAAATAAGTAATGGAGAAAACTAATTGAATAAAATACATGCTCCTAGAAGAAATAAGTAGCTTTAGATTTCTAAATTACAGAGTACAGTTCCGTTTTTCCTGTCAAGCCCATTCAGATGTCACACACTTCATGGTAATCAATGCAGTCATCGTAATCCTATCCTCCTTTGCAAATTAAATGCTTAGATTTAATAATCTGCACCACACTCGCGAACAATTACATTGCCCTTTATTCCTATCTTTCTCTCGTTTCTGGGGAATGCATCCAGCAGCTGTTTGCAGGTTCCATAGAGGGTTGGTGTCCTTGTCGCCTCCGGTTTCACCCTAGAGGACTCTACTGCATTGTTCAGAGAAATTGAATGTAGCTTCTACAGATGTGACTTGCTTTTCCTTGCCAGTGTTTCTACAATCCAAATCACCCGTTTACTTCCTGGGATCAAAGCTCTGGTCTTCACTTCTGGTTACCATCTCTAGCTGCTCTCTGAGATTACCTGCTCCTCTGGGTTTCTTCATTGGATATTCATGAATGATGCTTGGTTGCTAGCCCTTCTATGCAAATGTAAGGCAGAGAATGGCCAGCCTTTAATGATGGGTCCTCTAGAAAGAATCTATCTAGATAATTTTCACCCAAAATCTTGGATTAATGAGTACTGCGGTTATTTAGAGGCCTCCTCATTCACTACTCAAATTCTCCGCTTTACCTCCAGCCCATCTCGCTACACCTCTTGGGTTCATTGTCCAGATAAAGAAAGAACTTCCTTGTTCTTGGAAATGCTCTTGGGTTAGGCACTTGGAAGAGATGGACAAATTATTTCTCAAACCTACAGCTTCAACATTTTTAGATGTGCTTTTAATTTTATTCCTTATGTCACAATTCGTTTTTAGATCTGTCTTATCTTTTTGGTCATGGTATTGCTGCAAGCTAATTACTGTTCCAAACTTCTGTGGTAGACTCTGTCGAGATGGCTCCAGAAAAATACTAAGTAGCAAAGCTTCTAAAAATGCATCTTAAATGGAGGCAAGCTTCAGCACCAAATGAGAAACTTCGCTGTGCCAAGTACCTGCCTTGCCTTATTCAGATTTATACAACCGATTTTGATAAGTACAGAGAAAACATACCTGACCAAAATGATGGGTCTCTACCCTACGTATATATGATGAACTTAAGAATGTGTTCTTTCAGATGATTGCAGTATTTTAGTTGGCAGGGAACAATTAAGCATATGTAATCGGATTTTTACATTCTTCCTGTGCAAGAAATATTTTTTAATTCATGAAAAATTCTGCATAAATTCTCCTAATTTCATATGGGGTGCACCCAGTGATATTGCTTACTGGGATGAATTGTGCTTTCGTTCTTCCCCGTGATCTCTCAAAATTAGCTAGGAAGGGAATATCTGAGCCCCAGATCTTGCCAAACATGAGCAATGATAACTGTGTTTTCATAGTGTCAGTTGCTTAAGTATGTCCTGGCATGCTGTTGGATGCATCCTTATTATTATTTGTCACTGAAAGGGGCAATATTGCCCTAAGCTGCAAGAAGGGTGAGTTTTTAGAAAAGATAGATTTTATACGTTGATATAATCATTTCTGGTGACTTTTGCGGTGCTCTGGATTCCAAAGAGTTCTTATGATTTCAGATGGTAAGACGACTCCTACTTCTCAAGCTAGAAGCCCTCATTGACTTCCTACGTTCTGGCTGAAGTAATTAAAATGGTTTTCATTGGCCACGTGAAGATCATAGCTAATAAACTGAAGAGCTATAACATAAAATTGACTAAGTCTCAAAGTGTTATGAATGTTTTCCTTCAGTTTGCCAAAGACCTCATAGACTTGGTCATCGTAGGAAGTCTTTCATACACAGTATATCTTGTACCCAGTAGCCTGGATTATCCCTGCCTGATTACCCAGAATGCATGACTTAGTTAAAATAGTGTGTTTTCTTAAAACAGCTTTAACAGAGAGGTCTATCTTCCATAGAGAAACCTGCTACCATATTTCATACCTTTAACCCCAACTTGGCACTGTGGAACACAAAATATATTGATTATTGGAACTCCAAGTGTTTAAAAGCAGTGCTTGTAGACAGGCACATATCTGAAAATAGTTTATGGTTTCTATGTATTTCTGTTCTGCACTGTTCAACATTCCTAGTTCTCCCCACTGAGTCTGCTGGGGCAGGGATTTGTTGCCCTGGATTCTCCGCCTCAGTAAAATACTGTTCACTAATATCCACCTCATGCTACTTGATCTAGTCCTACAGATGCACCAGTGTATAGATCTTCCCAGCGTGCAGGAACGTTACTACACTGCCTGCTCTCAACTCGAGTATGTTCTTTCTGTAAGTGCACATGAAGACTACGGTAGCTTTGATCAAGTACAGACCTTGATCAGTTTGTTCCTAATAAGTAAGTAGACCAAAGAAGCAAGTAAAAGAAGAGCTAAGCAAGCAAGCAAGCAAACCTCAAATTAAGCCAAATATGCTTCATGATATAAATAAAAATTTTAGTGTCTCCACCTGCAGAGCTCTCTTTAATGCTAGATATAAAGTTTGGTTGTATTTTAACAGCAATTGTGTTGTTCTTGTCCAGGGCTTTATTTCAAAACTATTTTACAAGGCAGAGCTAAGTTTGAGAAATTCTGACAAAGCAGTGACCCTTAAGAGGAATGAGGGAGTAGCTCATACAACACCTCGCTGTGACCTCGACCAGGGATCCTTGCCCGTAAAGAGCCCCTGTCACTGATGGAGCTTTAGAATGGAGAGTAGTCTGCCTTCTAAGGACCTCTGAGTCTGTGGGAGAAAAGGGTGTAATAGATATGACGCAGTGTAGTAAGTACATGATATATTAATATGCAATATTATATATTTATATACAACTATATAAGTATATTTATATTCGATGTACATATGTCTATATTTTATTATTTATATTAATATATAATTATATATAAATTATATATAATTTAAATGATGGAGTCTCCTTCCTGGTCACCCAGGTAGTGCGGCAGAAGCCGAGTCACGGTTGTCAAAGCTGTTTTCTTTCCACCACCATACTTGTTAATTCAATACTATCGTTTCATGTGAAGAATGTTCATGGAATCTTCTCAGAGCCTCAAAACGAGTTCTTAAAAGGCTTATAAAAGAAAAGCGAATTCTCAAAACAACAGCATTGGGCTTTCCAGCTGTGCTGCGTGGATTGTGGGGGCAGGGTCCAGGAGAGCTGAAGACCGAGACTTCTGCTCCTCGGTTTTAGCTTTTCTATATTGAGGTTCTGCATAGAGTTCACCTGAACAATGGTTCGTTTTCTCTCTCACGAAGCCCGTCCGTAGCTTAGTATGCACGGCTCTCGTTTGTCCCCTTTACGGAGACCATCTGTTTAATCATTCTTTCTAGAATATTGTTTTCCAGAATTAGCATTTTTTAAAAAACAATTCATTCCCATTTTGATCGTCATTTAATTTCTCTCCCCGAGACTCCTCACAGATGTTACAATGAGCAATCATAACTTACGCTTTCTCATTATTGTGAAGCGTGAGTCGTCTGGGCCTGAGGAGTCTCACACAAAGCAGCCGAGAGCTCTTCCATGTCGCTACTTCCTCATCTTTGCTGTAAATCCTTCCTGACAGGTCTGTTCTCCCATCTCTGATTTGAAGATAATTTTCCTCTAAGACACTATGAAATCAGAAATGCAAACAAATAAGTAGGCTTTTATCTTGGTACCTTGCTTCCCTTTACCTTTTGCTTTTTTCCTCCTCTTCCTCCTACAGAGTATGTGTGTGTTTGTGTGTGTATGCATATATATAAATAAATTATTATAAATAATTATCTCGCATATTTTCATAATTTATATATAATTTTATATTAATATAAATAATAAAATATAGATATATGTACATCTAATATATATACTTATATAGTTGTATATAAATATATAATATTGCATATTAGTATATCATATACTTACTACACTGTGTCATATCTATTACACCCTTTTCTCCCACAGACTCAGAGGTCCATAGAAGGCAGACTACTCTCCATTCTAAAGCTCCATACTTGCCATAGGAACTGGTAGTATTGCATAGTGGTTAAGAAAATCTATTCATTTACTAAAACCAATTTATTAACCAATTATGTGAGACTTAGCATTACCGAGGTACCAGAAATAGAATAAAAAGCAAGACAAACAGAGGCTTTACCCACAGTGTGTACACAGTACAATAGGTGAAATATATGTGAAATCAGCCAGTAAAACTAATGTGGTATGATATTACTGTAAATTAAGGAAAATCTATGTTGGTTAGATGCAATCCACAATAAATGACTAAGCTGAGAAAATCAGGACTCCCACAAAGTCACTCAGAGTTGGCCAGTTTCTTGTAACAGTATTTCCATCAGAATTGAGACCCCCCCCCCACTGCCCTGCCCCTAGTGCTCTGTTTTCGTTTGTTTCTTTTGCTCCTTGTCTGAATACTATCCTGTATTTCCGAAGGCGCTAAACTGAAGAAAGTTTGTACCATCCTTTGTCATTTGGCCCACTCTTGTACAGAAGTCAACTCTCCAATCATAACTGTTATCCAATGATCTTTTGTTTGCCTGCTTGTTTATTTTTGTTTGATTGTTTGGTTTTGTTTGCTGCTTTTTTTCTACCATCATTTTAAAGAATTCTCTCTCTAAACTTGTCTCGACTATTTGGAAACAATTTTAGGGTCAAGTGCATATTTTTATAATTTATATATAATTATATATTAATATAAATAATAAAATGTAGATATATGTACATCTAATATAAATATATTTATATAGTTGTATATAAATATATAATATTGCATATTAATATATCATATACTTACTACACTGTGTCATATCTATTACACCCTTTTCTCAAGTAAGCCCCGAATTAGATTGTAACATCAGCCACTTGTTAGTCAGTAAGATGACCTTTTGCACATGCCAGTCTTCCAAACTATAAAATACATCCTTCTGCTTCCACATGAACTGCGATAGTTATAGAGCTCAAACTTGATGCTGAATATGCAGCATCCCAGGTCCCTCTCAGAAGCAGAATCCTTGCTGGGATGCATGGCAATTGGTGCTTCTAGAATAGAGTGACTTTTCAGTCATATACCCACTTTACTCTTTATTTATGTTAGTAATTTTGTAAGGACCAGAGCATTTCATTACCAGACAAACCTTAAATGCTTTACTTGAGTGATCTTATTTTCAATTTTACATAACACTTGAGTTGTTCATATTTTCATCACTTTTCTCATTGAAACCATTTTGCATTGAATTGGTTGTTTGCTGTTCTTAATGGCACCAAAATTTTTAACCTTATTCTTTCTTGAACACAATGCATTCATTAGGCTCCATGTTATCCAGATTATTGAGTTCACAGAAACTGTCCATTTCTCAGTCCATAAACAATTAAATAAAATGGAAATAAATGTTAATCTTTCAAAATGGACCCTTTCTCCTGCCTTGACTGTCTCAGAACTGAGTAGTAGTTGACTTGTAATTGATATAATTGTTTCCCATCACCTTATATTTTTCTTTAATTTATATTCATTTATTTATATCATTGTTTTTGGATCATGACATGTATTGACAGTAGAATTTATCTACTTTGGCATGAAGTAAAATAGATTTATGGTTACCCATAGTCCAGGAGATGGTCCTACCCCATTCGTGTACATGCAGCAGGAAAGGGGCTTAGTAGGTTTAAAAGAAAAAGACAGCAGTATTCCATGAAGTTGGGAAGGGAACGTAGTGGGGAGGTAGAGAAGGGGCTGGAGGGGCAAGAATGGTCATGGATTTTTTTTCAGAACCTCTTATGTGTATGTGTGAAATTATTAATAATAAAAATTAAGTGGTAGGGAAGCAAATTAGGTTGACAAAATGGAAGAAAAGTGTGGAATGTCACTTTTTCTTTGGGCGTTTGTCTCAAAGGACCCAGAACAACCCTCTGACTCTCACACTACTGTGCCTGGTGTCTCTGCTGTGTCTGGAGGTGCAAAACGAGCTTCTGAAATGCCTTACTAATATGTGGAGTGTGTTCAAACTTTCAGAATTGAAATGCTTGAATTCTATCATTCTAAGGCAGGTTATAAGACTTTTAGTCTCAGAATGAGTCTAAAGGGGTTTATGCAGATGCTCAAGAGTAAACTTCCATGCCCAGAGTTTTCACTGATGCAGCTCAGGACTACATCTTACAGGGCAAACAGTATGAAATACACAAATGCATACAAGTAAAGAAAAATATAAAATCAAAATAATGGAATCAAACCATAAATCAAGTGCTCACCAGCTAAGGCAAGAGGAAAAAGAGAAACTTCGCTGTGAAGGGTTAGCCTTTACTTCCATTTTTCTTTCCACTTTTTACTGCTTAAGGACCAAGGGTGAGAGAGATTCCATGAGCCCAATCACCCGGATAACATGCAGGTTAATGAACGCACCGTGTTCCGGTCTATATCAGACTTTTTTTTTTTTTTTAAGGCATTCCTTCATCATTTTTATTTCATGACTTATTTTAAGATATCTGAAAAGTACTGTATTTTCCATTGGAAGTTGGTTTTGTTTGTTTGTTTGCTTGTTTGGTTTTGGTTTTGGTTGGGCTTTTTTTATTAGATATTTTCTTCTTTTACATTTCAAATGCTATCCCCTTTCCCAATTTCTCCAAAAATCCCCTATACCCTCTCCCTGCTCCCCAACCCACACACTCCCATTTCCTAGCCCTGGCATTCCCCTATACTGGGGCATAGAATCTTTGCAAGACCAAGGGCCTCTCCTCCCATTAATGGCCAACTAGGCCATCCTTTGCTACAATGCACCTAGAGACACGAGCTCTGTTGTGGGGGTACTGGTTAGTTCATATTGTTCCTCCTATAGGGTTGCAGACCCCTTCAGCTCCTTGGGTACTTTCTCCAGCTCCTTCACTGGGGACCCTGTGTTCCATCCAATAGTTGACCATGTGCATCCACTTCTGTGTTTGCCAGGCACTGGCATAGCCTCACAGGAAACAGATATATCAGGGTCCTGTCAGCAAAATCTTGTTGGTATATGCAATAGTGCCTTGGTTTGGTGGTTGTTTATGGGATGAATCCCCAGGTGGAATAGTCTCTGGATGGTCGCCCCTTCAGTCTCTGCTCCAAATTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTATTTTTCCCCCTTCTAAGAAGGAATGAAGTATCTACACTTTGGTCTTCCTTATTTCTCACTTATTATATCACAATATAGTGATATCTGCTTTATGAGTCTGTGATGCTAAATGCACTAATGCAGGTAAAATGCATTAGAATAACGTTTGATACATAGATTCAACAACGTACTATTATTGCCTCACAACTGTTTCTACGACCCTTTCACTTCGACTTCTAATCTCTCTTTCACATGCAAACCAGAGCATGAAACCCAGAATTAAAGGCTGGGATTCACATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAATATTTTTTCAAGTGCTTCTCAGCCCTTTGGTATTCCTCAATCGAGAATTGTTTGTTTAGCTCTGTACCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGAATTTCTGGAGTTCGGCTTCTTGAGCTCTTTGTATATATTGCATATTAGTCCCCTGTCAGATTTAGGATTGGTAAAAATTCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCTTTTTTGTCTTATTGACAGTATCTTTTGCCCTACAGAAGCTTTGCAGTTTTATGAGGTCCCATTTGTAGATTCTTGAGACAAAGTTTGGAGCTAAGATGAAAGGATGGACCATCCAGAGACTGCCCCCGCCCCAGCCCATCCCATAATCAGCCACCAAACGCAGACACTATTGCATACACCAGCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCTGATATAGCTGTCTCCTGTGAGGCTTTGCCAGTGCCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATAGGATGGAACACAGGGACCCCAATATAGGAGCTAGAGAAAGTACCTAAGAGCTGAAGGGGTTTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAATCAGTATCCCCAGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTCAGACATCATTGGGAAGAGTCGCCCCTTGGTCTAGCAAAGTTTATATGCCTCAGTACAGGGGAACACCAGGGCCAAGAAGTAGGAATGAGTGGGTAGAGGAGCAGGGTGGGGGGAGGGTATAGGAGACTTTTGGGATAACATTTGAAATATAAATGAAGAAAATATCTAATAAAAAATGTGGGAAAAAAATAAAGGCCAGGATTCTTGATAGTACCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGCTAGTCAAATGCTCTATCACCAAGGTATATCTCCACACCTTGGTCTTTTGAAATGGGTGTTTATATGTGTCTGAGGCTAACCTCAAACTTATAACCCTCTTGCCATTACATCCCAGATACTGAAATTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTTTTTTTAAAAAATGACTTATTGTCAGTTAGTGTAAAAATAATGGATTTCATTATTTCCATAACATTTTCATTCATGTGTATCACTGAACTATGTTTATGTACCCCTGATTGTGGCCCTTTCTGATGTTCTTCTTTCCTTAAAAAATTCCCTGTTCTGCGTTTGTGTTAGATGATAGGTGATGGATGGATGGATGGATGGATGGACGGATGGACGGATGGATGGATGGGCAGACTCACATACATACATAATACATACATATATACATACATACACCCGTGTACATACATACATACGGATGGATAAACAGACAGATTCTGCATATGAAATAGGAGAAGCTATATTTGTCTTTCTTCTCCCAGTACATCTTATTTCTCCTACTTGTCTTTTCAGTTCCTATAGGCATATATGACATCTGTATATAATAATTCACACATGATATATTTAAATATATGTATTAGTTGTAGATTTTACATATAACAATATTTGTTTCTCTGAATCTATTTTTCTTTAACTTGACATGATATTCTCTAGTTTTATCTATTTTCCTACGATTGACTCAATTTTATTCTTCCTTAAAATTAAGTAATAACCATTGGAATGTGTGTCCTATTTTATCTGGTCCTGTGTTAATGGACATTTGGCTGGTTCCCTAGCTTAGCTGTGATGTTCTGTAACAAACATGGGTTCACAAGATTAACCACTATGGTTCCTTTAGGTTTACAGCCAGGAGTGGAATTACTGGATCGTATGATAGTTCTGTGTGGTATTTGCTAAGGAGCTTTCATGCTTATTTCCATAACGGCTGCTCCAGTTTGTGTTCCTACGAGCAGAGTATAAGTGCTTTGTTTTCCAGACATCTTTATTAGAATGTCATTTGTTGTCATTTGTTTTGTTGATGATGTTCTGACCCAGGTTGAAATGGAATATCAATGTACTCTTAATTTTAATTTTTCTATTGCTAAAAATGCTGAATGAATTTTTTTACATAATTATTGACCATTTGTATGTCTTCTTTTGAAAACTGACCAGTTAATAATATGCCCATTTGTTGGCTGAATTAATTGGGAATGGTTTAATTTTTGAATGTTTTACATATTAGTGCCTGGTCACGTGTATAGGTGACTAAGAGTTTTCTCCCATTCTGAAGGCTTTATGTAGCTTTGAAACTCCTCAACGGTGAATGTATGTTTCAAAGCACTTGTTATTATTTATGCTGTCTGTCTTAACAGTTATTTTGTGTTTAAAATAGCATATCCAATAACAAGTACTTTCAAATTAAGCATTCCAAAGCAAAAACATCCAATCAACAAATGAGCATATTAACTTGTCCCAGCCCTATACAAGGTACTTACGGAACCTTTAAAACTATAAGGTATAGACATAGAATACTACATGAGAATTGGATCCTTTCAGTCTACACTGGAGGGATCTCAGGGAGTCTGAGACTCATTGGTGTATAAAATATGGAGTCTCCTCGTAGAGAGCAGTGTCTGGCAATTCAGTGGTTCTCTTTTGAGGTAGGAAAAACCATCGAAAGCATCACTCATATCATGGGAGAAAAGTCTCGTAGAGCCTGAATGTTCTCAGTAGAGAAGAAGGCCCTGGAGTACATACAAAAGCAGAAGAGGTGATGCTGGTAGAGCCCCTGAGACTCTGTACCAGATCTTGGAAGCAAATAGATAGGTGTTGGAGGGGGAAGAAGGGAGCTTCTTGGCTTCCTCCTATATTGCTCTCAATGGGGAAAATATGTTTAAAAGCAGCATGTGTAGCAGCCCAATTGTAAAGAGCCTTTAAATTGTGTGGTGTAAGCTTTGACTTAAAACAAAAAAAAAAAAAAAATGGGCACAGACTGCACTTAAGGGGTGTGGTAGGGAACATGTCTCAAAGGCAACCATGACGACTGATCTCCACTGTCAGTTGGACTGGGTTCAAAGTCACTCAGGAGATACCTGTCTGAGACATTGTTTCCAGAGAGGTTTAACTGAGCATAGAAGTCCTGCTCTAAATGTAGGTGGCACTGTCTCCTGGGATTAATAGAAAGGACAGAGAGGAAGCGAGGTATCTGCTCTCCCTTTTCTGGTCTTCTCAGCAATGAAAGGCTGTCTCATATTCCTGCTCCTGTGTTCCTGCCATGGTGGACTGCGTCCTCTCAAACAGTAAGCCCGTCTTCTTTCACGGTCCTTTTTGTGAGTTACTACATCATAGAAATGAGGGGGGAAAGCTACAGATAGAAACAACATAGAAACCAGAAACTGGGCCAGCGATTGACCAAGCTCAACTACATTGTCCCCAGTCTTCATTAGATATGATCCTCAATAGGGAGAAGGGGCAGGGGGAGAGGGTGGTAAACCTCATAAGATCACCTGCATGATGTATGTGATTTGGGGAAAAAAAAATACAGCTCTTGAACAAGCGTGGAAACAGGTTATAGCTATGTGAGAAGGAATTTTGATTCTTAGTCTTTTATTTTGAAATGAAATTATTTGTAATGGAGGAATATGAATTATACAAGATCTGGAATTTATTTCTAACATTTATAACCAGAATATACTTAATCTAAAGTCAGACGTACCAATATTTAAATATTTTCTTAATTGTTAGGTGCCAATTGATTATGTTACCCTAACAACTTTACTATAGTTGTAAATGCTTGCTAAAATCTCACTTCTTATTCCTTTGTGGTAAAAACTGTTTCACAGCATTACCCAGGCTGACTTCAAATTCACCGTCTTTGTCTTTCAGCTGTTGAGTGCTGCAATTTCAGGCCCATGCTCCCAACCTTGGCCTCACTTCATCTTGCTTTAAGATTTTTGATTTTCTTATGATAGCTGCTTCCTCCTCTTTTGGGGGAGAAATCTGTGACTTGTCATCTAAGCTATAGATTTTGTTGTGACAGTGTATGAAAGTGACATCATTAGAGTATAGTGTGTAGTGAAATGTAATGTCATATAAATAGCATGAGAAGAATGTACTGGAATGAACATCTCCACGTACTAGAGTAAGACGCTTGCTGCAAATCACATAGACCAGCCAGGGATTAGCTAAAGAGACCTTGGTGCTACTGAGGGAAGTGATTGTCAAGAAGCTTCAGTCAGTGAGAATCTAGGATGCTAGATGGTTTTGCATTTGAATGTCTTAGAAAATCAAATCCTTATAGCTGGAAACATGTGGAGTGTTAGTAAGAGAGAATCAGTAGAAATGCTAACCACAACCAAAGTAACTTCCTGATATTGGACATCCCCGTTTAAGCAGTACATATATAAAGGATGCCAGGTTGGTCAGAAGGCCCAGTCGGAAAGTACTTGTGTGTAAGGACTTGAGTTTAAATCCATCTCCCACAAAAAGAGCTGAGTATAGCAAGTAGAGACAGGGGAATTTGAGACAGACAAATCCTGGGGGCATGTTAATCAGTCAGTATACCTGAACAGGAAACTCCAGGTTCAGAGAGAGACCCCCCCCCCAAAAAAAAACTAAGACAAAGAATGGTAGACTAAGATAACCCAGCATCAACCCCTCACACACACGTGTACATACATGCATATGTACACATACATATCCTCATATGTACAATTTCATGCAAATGCCAACGGGGAAATATAGAATTATTATACTAAGAAACAATGTCTAATAATAAATATTTTCTGAGATAACAGGCTCAAGTTCTAAAATAGTCACAAAACATAACTAAGTAGCTTTAGAAAATATATCACAGGGCCTCGTCGCATTATATCTTAGTATGCACTTATTCCTGGTTCTTTCTTCTGTGGAAATTTCCCTACGTGAAAGTAAAAGTCTAATTTTATTTTTTCTCTGCAGGACATTCAGAGTTGGACAATCTAAATAGTAAATATTTCTATCTAAATATGGACTCTTTCCTACAAAGATGAAAGGATATCTGATCTCTAGAGTATTTTCACTACTTAATGGATGAATTGTCAAGTTCACCAAGCACAGTAATAGCCATAATTAATGAAATTTAGAGGGTAATAAATTAAATAATTAAACTGCCTTCTATATTTAGAACATCCTTGATTTACTTCTTATGAAGTGTTTTGCCTTTATTACTAAGCTGCTCCTCACAAAAATATTTTGCTCATGTTCAGGGAAAACTCAAGATGGTTTGTATGAAGGAAACAATAGGTGTTTTTATACTTATAACAAGTGAAATCTACATTTAGGGCTTACTGATGGATGAGATTAATATGGAAAGGAAATATATATAGGCCCAGCCATCACGAGTAGGCAAGGAGCGAGTGTCCCCATGAGCTGTTACACAGAAAGCAAGCCTTTGCACTGAGGTCTGCATGCACTCCTTTGAGAATACAGTTTGTCTCCGCCGTGGGTTGATGAGTCCTTGCCAGCATTAATCTATGTCCTTGTCTCACTGAGAGCATGCTGACCTGACCGATTGCTTCTATCATGCCCTCCTCCTTGCATTGTTCCGGGTAAGAAGAACTGTGCTTACCATCCCAGCAGCACAGTTCGGCTTTAAGTCCCGTAGGTGTGCTTTTCAGGGGCCTGAAAGACACACATATTATTTCAAGGACGTGATGTTTGCTGAGTAAGGTGGTCATGGCTCCCACTGAGATTCAGTCACCTCTGATCCAGGGCACATTGCCTCTGACATCAGAGATGTCACTGTGAGCTGAGTGTAAAGACAGCTTTTGGGTGTCTGTAACCTTTGGTCTGGTTATCCTGTGGGTCGCCCCGGCTGTATCTGTAGTTACCGACGTTGAGAGGTTAAGGGATGCATGTAAGCATCTTCTGTGGCCAGAGCATTTAAAAAGCCATCTACATCGACACCATTGTTTCTCCTTCCTCTGACTTCTGCCGTCCCGGGGACTCGATGCGTGACAGCTCATCCTCAGCAATGCTGAAGTGGGGATTTTGGACTCTGCCCAAATGACATCCCTGTTTGCTTCCTTGTGTTCCTAG
Seq C2 exon
ATGACTAAGAATGGCACTGTAGAGTCTGAGGAAGCTAGCACCCTGACCGTGGATGACATTTCCGATGACGATATTGATCTGGACAACACCGAAGTGGACGAATACTTCTTCCTACAACCCCTGCCCACAAAAAAGCGGAGAGCTCTGCTGCGCGCCTCGGGGGTGAAGAAGATCGACGTTGACGAGAAGCACGAACTGCGGGCCATCCGCCTTTCTCGGGAGGACTGTGGCTGTGACTGCAGAGTGTTCTGTGATCCAGAAACCTGTACCTGCAGCCTGGCAGGCATTAAGTGTCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000044647:ENSMUST00000122912:5
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.420 A=NA C2=0.114
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types