MmuINT0101688 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000029267 | Mtf2
Description
metal response element binding transcription factor 2 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:105050]
Coordinates
chr5:108494761-108510042:+
Coord C1 exon
chr5:108494761-108494984
Coord A exon
chr5:108494985-108509843
Coord C2 exon
chr5:108509844-108510042
Length
14859 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTGAGA
5' ss Score
7.66
3' ss Seq
TTGGTCTATTTCCTGAACAGAGA
3' ss Score
6.84
Exon sequences
Seq C1 exon
GGGCTGTTGCGAAGTGGTCTGTGTTTGAGGCCGGTGTGAGCACGCACATTCTCCTTCCTAACCCTCGTCCCCAAGGAACTCGGTGTGTGTGTGCGTGTGCGCAGGGCTCCCGCTGGGGCGGGTGCCCAGGGAGTGCCCGGACTCGCGGGGGAGCGCCCACGGGAACGAGATTGCTTCTATTTTCCTGTATGAAGCGGTTGGCACCACTTAAGTGACCGAATGAG
Seq A exon
GTGAGAGACCTTGGCCTGGGAACCGACTCTTTGGGAGGAGGTTGGGATGAGGAGAGACGAAAGAAAGGAAGCAAAAGAAAGGGGAAAGATGGAGGCTCCGCTTTGGGCAAGGGAGTCCTGTGTGGGGGTGTTTTTGCATTGATGCATATGTTGAAAGAATGGATCGGGAGGGGTAGTCAGTGAGATGTTGGTAAAAATAGGGACTGGGGGAAGGAGCGGGGCGCCCCGCTCGGGAGTCAGTTGGTGGAATTAGATAAAACGTTGAGACAGGGAAGCTGTGTTTGGAGGGCAGGAAGGAACCTGGGGGCGGGAGACGGTTGGAGGGGCAGGATGAACCTGGTGATGAGGGGGTGGGGAACCGAGGGGAGGAGCCGTCAGAATGCGGGGAGCCTAGTAGAGGGGCTGACTGGCACTTTAAGGGGTGCTAAGGAAAGTAGCAGTTTGGAACCAGAGGGTGCTGGAATTGTGTGGAATTGTGGTAGGGGAATCTAGTGGTGGGCTAGATAGCTAGCGTACGAGGATGAGGAAAATACCCTGGAAAGCAAGCCCTGGAAGCTTAAAGAGAAGAAGTGATAGGTGAATTGATACGGGGAAGAGATAGCTTTTATTTGGAGGCATTTCTTCCGTTCAATTAAAATTTCTTGCCCTGATAATTTGTATTCATCATTACAACTTAGTTACTTACGGCACTAAGGGGTTTAACCAAAATTTTCCAGGATTTCTTAACACATTTCCATAGTGCCAGAACTCTTAACTGTGATTTACAATCTGCAGTCCTTGGTGGTTAATTTTTTCTTTGGCAGAGATGGATTTATTGAGTGGTACGAGAGATTGTGAACAATAGGAAAAGGGGTATGGAATGCTGTTTTATTCTTTAAAACCTTTAACTTTGGTTGAAGATATTACCATGCAACAGTAGTTAGAATTTGAAAACCCAGACAAGCCTGTAATTGACATAGAAAAGTACCTCATGAGATCAAAGTAGAGCTAGAAATATGTTAGTGGTTGGTTGACTCCGTTTTCTCTAGCAGCAAGTACTTTCTCCTTCAAATAGATTCCATGTAATCTTCATAGGAACTTCTGCAGACTGTTTTCAGCCTTTATGTTTTAATTTTTCTTTTGGGAATTTCTTTTTTGGGAGAGAATTGTGGGTAAAAAAACTGATTCTTTTTAGGATGCTGGATAATACTTTAAATGTTTATTTTTTTATTTAATGTATATAAGCACACTATTGCTGTCTTCAGACACATCAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAATCGGCACTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCTGGACAATGCTTTAAGTGGAGGATTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTCCTTTTTAAGTTTTGAAGCAGGGTCTCGTTATATAACTCTGGCCAGCCTGGAACTCACTTTGTATTCCAGACTGGCTTGAAAAGACAGATCTGTCTGCACCTGCACACTGAATGCTGATGGAGATCACTACCATGCTCGGCTGTTATTACTTTACTTGAGTTCACATCAGCAACTATCATTGGGTATGCAACTATATTTAAATGTGTACTGTGGAGATTTCTTTTCCTTTTGTTTTCTCCTTTTCTTATTTATTTATTTATTTATTTACTTACTTATTTATTTATTTTTGGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTATAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGTAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTGAAAAATTGCCTGGCGAATTTTTTTTCCTTATTTGTTCAAAAAGTATATATTGGGGACTTTGTGTCATATGTGGTCTTAAATATTAAAAATACCGTTGTTGAACAATAGACATGTTCAGAGCTCATGTAGAGTATGCAGTTTGATTTTTGAGCAATGAGTAATGATAGAATGAACACACAAACACAAACGTGTACATGGGTGCACAGGCATACGTGGCAAGCACCATTTAACACCTTCAAGTTACACAATTGATATTTGATGGTAGTAATGATGAAAGTACAAAATAGATTCATAATGGAGTATGCAATTGAGATAGCTGAATTCAAGACAGTAATACAGCTGAGATTAAAGAAGACAAACATTCTGTCAAATGAATACACCCTGAATTTTGGGGAAAAATGTATAAGACATTTAAAAATTAAAAAAAAATGCATATGTGGTGGGGGAGGGTTAGGGGGGTATGTGCTACTGTCCATGGAGGCCAGAAGCATGAGAGTCATAGGTGGTTGTGAGCTGCCTAATAAGTGCTGGAAACCAAACTCAGTTCTTCTCCAAGAGTAATATGTGTTTTTAATGGCTGAGACATGTCTCTAGCCCCCATAAAGGATATTTTTCACCAGTTATAGTGGTTTTAAAATTTAACCTGCTGTAATGAATGCATTTTTCATTTTCTGTTTTATTTTAAGACTTAAAAAAAAAAAGATTATGTGTTTGAGTACACTATAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGTGTCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCTACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAATAGTCAATGCTCTTAACTGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCAACTTATTTTTATGTATATGAAGATTTTTGCCTGCATGTATATGTGTGCACCACATGGGAGCAGTGCCCACAGAGGCCAAAAGAAGGTGGTTTATTCCTTTGGAACTGGAGTTAGAAATGGTTGTAAGTTGCCATGTTAATGCTGGGAATCAAAGGCCCTGGAGATTGAACTCAGGTCCTCTGGAAGGACAGCCAGTACTCCTACTTCTGAGCCATCTCTACAGTCTAAGAATGAATTTCTTGACAGCAGATAGGGGCAGAAAGATCCAAAGTTCAAGGCTATTCTTAGCTATATATGAATTCGCAGCTAGCCTGGGACACATGAGGCCCCATTTGGGAAAAAAAGTAGAAATGATTACCAGGGGCTAAATAATAATCATAATATAATCATATCATAAAAGTAGGACTTAGACATAAAGTGATGGTTTAACTTCATTGTCAATTTGATTAGATTCAGATTCACCATGGAAATATACCTCTGGATATGCCTATGATTGTTTTCAGAAAGGTTTAACTGAGGAGGGAAGACCCACCCTGACTATGTGAGGCCACCATACCCATGGGCTGGGGTCCTGGATTGAATCAAATGGAGGAAGCAAGCTGAGCATGAACATTGACCTTCCTGACTGCAGATATCAGTGCGATAGCTGTCTCCTGCTTCTTCTACTATGCCTCCCCCTTCCATGATGGACTGTACTCTGAAACTGTGAGCCAAAATATACACTTTTTTTATGTTGTTTTTGTCAGAGTTTTTTACACAGCAATGAGAAAAATACTGAATGCATATATTAATAAAATTTCAAGACATGAAGAACAAAGGACTGTGGCTCAGTAGAGTAAGATTTTTCATCCTAGTGCTGAGTATAGTAAGTGAACAGCACCAGACTTTCTTTACAGAGGGAAATTCTTTACAATGTAAAGTTCTGTGTGTAGGAACTGAATGAGTCAGTTGTTATTTATTGCTTGGCCTCACCTGGCACTCCTGTGTTGAAACTTTGTTCCTTTCCTAGCTAGGACTACAGGTTCCTGCTACTCTACCAGTGAGTTGCAATGAGGACTGAGATATTTGTAGGTCTAGAAGAAGACCTTAGAGAAGCTTTGTGCACATATCCTTTTACTGTATGCCACGTCTCTAGCCAAAGAGTATGTGATCCAGAAAGCTTTGGCGTGGTGTGAACAAGGCCCAGCAATCCCAGATTGATGCAGAAACATTGTGAGCTCTAAAAGCAATGGTTATTCGTGGAAAGGGAAAGAAATTTAAATTATCTTTGACAACTTAAAAATGAAGTGTTAATAGGATATATTAAGGATTCTGGGCAAACAGTTTGTCCTATTCTGGTTTGTTTCTATCTTTTTTTTTTCTTTGATGTGATGCCTGTAATCTCATGAGAAAGATAAAGAGTATGGGTTTTGGTAGTGGGGAGGATCTAGGAGCAGTTGGGGGTAGGGGAAGTCATAATCGGAATATACTGTATGGAAAAAATCTACAATGAAAAAAAGTGTGACTAGAAATAGAGTAAGTACACTTTGTTTGGTTTTAAGAAAGAGTCTCATGTAGCCTAGCCTGGTCATGAACTCCTGATTCTAGAGCTAGGATCGCAGGTTGTATGCCAGTTAATACTACTACTATTAAGTAGTATTTCAGTGGTTAATTTTTTTTTCCTCCCCTTCTCTCTTCTTGCTTATGGTTTTATGGAATGGTCTCCCATCTCTTGCAAAGGGAAGTTTCTTGATGAGGAGTGAGAACTACACTTAACTGGGCATAAGTAAAAATATTTAGGATATAGTTAGGGGTTGATTATGCTGGTTTAGTAAATGATAGTTGTAGGTTCTCCACTAAGATCCCTGACTTCACTAGTCCTAGGTAGTTGACTAGATTTCCATTATTAACACAAGTTTTTTCTCTCTGAGTAGGGTCTTAAGTCCAGTTAGAGTTACTGGTTACCACCAAGGTATGCATTCCACTGCTGCACCATAAAGGTTATTGTGCCAGCTGTTATAGCTGGGTAGGAAGGGCTGTTGCTTCCTTCATTTGGCAGCTTGCATGGCACCTTCTGGAAACATGAAGCTAGTCAGTTCTAGTTTAGGTGTCTCTGGTCCCACTGTCTGAAGTTCATGGTATCATCAGCATTAGGAACTTATCTTCTACCACTTGGGATTGGGTAACCAAAGGCAATAGCAATAGTCTGCAATGTTTTAGGAGTCTCTTGGACAGTCCTGACCAACAACTGAAAGGTGGTATTCTCATGTTTAGTAATGGAGATTTTGTTAAATAGTTAGAGGGGAAATCAGAGGAATTTCAGAGAGTTGTTTCTGTTATGGGCCTCAGGGATAGAACTTACAGCTTATCAGGCTTCACGACAAGCATTTTATCTGCTGAGCTATTTTGCTAGCTCTTGGTTGTTTACATGTACTTGTTTTTATTTTATGTGTATGAATGTTAGGCTTACATGTATGTTCACCATGTGCTTGCTTGGTTTCCATGGAGGCCAGAACAGGATGTTGAGTCCCCTGGAACTCTGTGAGTTGTTAGCTACTGTGTGGGTGCTGGGACACAAAACTGCAAGAGCAGTAAGTACTCCGAGTTGCTAAGCCATCTCTAGATTCTCTATGGAGTTTTAATGAAGTAAAGTAACTCAGTGAGGTAGGGAATGGGAGTTGGAATATGTGGACTACCTTTTATGACAAGAAAGTAGGTCTAGGGGCTGGCTCAGTGGTTAAGAACACTTGTTGCTCCTGCACAAGACCTAGGTTTAGTTCCCAGCACCCACATGGTGGTGGTTCATAACACCAGGGGGTCAAATGCCTTCTTCTGACCTCAAAAGGCACCACCAAGTTGCATGTGGTACATAAGTATACATGCAAGCAAAACAAAGTAAAATGTATAAATCTAAAAATAAATAAAAGAATGTAGGTCTGAAATTGATTAAAGGCAAGTATATAAACACAATCGTTTGGAAATAAATACTGGGATAGGTTGGTGAATCTCTCTCTCTCTCTCAATATGTGTGTGTATGTGTATGAATATGAATGATGCTGGAGAGAAGGCTCAGGATTTAGGAGCACTGGCTGCTTTTCCATAGGACCTTGGTCCTATTCCCAGTTCCTACTTGGTGGCTCACAATTATCTGCAATTCCAAGGGAATCTAGTACCTTCTGGTCTCCCTGGGCACTACATGCAAGTCATATACATATACATATACATGCAGGCAAAACACTGAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGAGACAGGGTTTCTGTGTGTAGGCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGTACTCAGAAATCCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCACCACTGCCCGGCTTGAAACATAAAATTTAAAAATACTTTAATTTTGATTATGTGCCTGTGTGTATATGAATGTAAATGCAGTGCCCAAAAGAGGTCTGAAGGTGTCAGATCTTCTACAGGTTGTTGTGAGTCAAAGCAATGTATGCTTCTAACTGATAAACCATCTCTCTAGCCTCCTTTGCCTATCTTTTCCTTTATTTTTTATTTTATTTTACTTTGTTTTTATTTTTTGAGGCAGGGTCTTTAGATGAGGTTACCTTTAAACACAGATCCTCCTGTGTCCTTCTTGAGTACTGGGATTAAAGGCATACACCACTGTGCCTGGCCATTTCTTACTATTTAATTAAAGAAATTTAATGTATGATAATTTTTTTAATTTCTAAAGCTAAGAAATAGAGTAGAAGTAACTTTTCTAAAATTATTTTTTAAAATGTGTTTTGCCTGTGTAAACATCCTTGTTTGTGTGCCTGGTGCCTATGAAAGCCAAAAAGGGATGGGTGTCAGAGCCCCCTGAGACTATTTGCAAATAGCAATGACCTGTTTTGTAGGTATTGAGAATCTAGCTCAGCTCTACTGGAAGGAATAGCAGCTATTGCTCTTAACAACCACTGAACCATCTCTCCGGTCCTAGAGGTAGCCTTGAATCTGCCTGTGTTATGCCTTCTGGTCTCTGTAGAACTTTGGTTTCTTTGATGTTAGATGTTGGTATATTCGTCAATTAAAAAGAAGACATCCAGGCTCAGATTTTATTTTATCTATCTCAAGAGGTAAGAGAATTACTTTCTCATAGGTTTGGTGCAGGATTGCATCTGAGTCCTGTTGTGACCTTGTGGATTTGACTATATCTGAGTCCACCAAAAGATGCCACCAGAGTGGTTCCCTCATTTGTTGTTAGGTAATATCCTTCCCATCACAGGAAGTAGAAGAAATTCTGGGAGAAAGAATATAGCCACCATGGCAGTTTTGTGCTGTTTAGAAGACCTCTGAATGGTGGCTCATGCCTATAATCCTAGCCCTTTTAAAGCCAACTTGAGCTACAGTGTGGAATCCTGTTTCAAAACATTAAAACCAAAACAAAAAAAATCCAAGAAGATGAGACTTGTTGGTGGGGTTGGTGTCAGGATAGATGAGGTGGGTTTTGTCTTGTTTGCTTTGTTTTGTCCCTTAGCTCTGATTCCTTCCTACCCCCACTATTGCAAGATCCTTTTGCCTTATAGATTGGTGAATCAAGGGCAAGGTGGCGGTGTGAAGTAGGATTAGATTTTCCTTCCTTTTTTCCCTTAGCTGCCGAGTGTTTCATCATGGACTAGAGTAGTGGCAAGGGTACTGGAAACGTGATTGTGGTGGAGGTGTCATGGCTGATTGCTGTTACCAGAGAAGAGGAGGGAAATTGGAGCGGCACAATAGAGGGATGAAAGTTCCTACTAGGGAGGTGAGTCCTATTTGGGGGGTGGTAGCTTTCAGCCCTTAGATTAAACTACCTTTAATCTAGTCTTTAAACAGACAGTTGTTACAAGTAGTTTACTGACTGTGTATTGTTTATCTATGCATTGTGTGTGATAGGTGTACGTGAGGATATGGTAAGCAAGCCCTACAGTTTTCTAAGAACACAGACTGTACGTATACAGGGTGCAGAGTAAAGACTCATTTTTTTATTGAAGAAAAATAATTGAAATTACAGATTACTTTGTTCATTTTTTTTGAGAAATGATACTATGCTAGGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTGCTTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCACTGCCTGGCCTATGCTAGGTTCTTAAATGTATTTTCACAATCTGTTACTTTTAAAAAAAATTTTTTTTTGAGACTTTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCTTAGAGCTCACTCTGTAGACCAGGTTGGCCTCAAATTCAAGAGCTCCACCTGCCCCTGGCTCCTGAGTACTGGGATTAAAGGCGTGGGCCACTGCCATCAAGCTGATATCTTAGTCATCCCCAACTCTTCTCAGACCACCTCACCTCTAATTCCCCTACTCCCACTTTTGAACTATCCCACTAAGCCTAGATAGATTGTACTGGCTGTGTGCTCCAGAGTGTGAAGGCCGTATGACTTCTGTGTCTTGAAACTGTAGCCTCAGAAAGTACTTTAAATGCATTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTCAACACAGGGTTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCTTGTAACTGCCTTGAACTCAGAGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCCAGTGATAGGATTAAAGACATGTTACACAACTGCCCAGCTACATTTTAAAATGCTTGTTTGTGTGTGTGCAGGTACCTGTGTATCATAGCATGCATGTGGAGGTCAGAGGACAACTTGTTGCAGTTAGTTTTTTCTAGTTTGTGGGTTCTGAGGATCAAACTCATGTTGTCAAATTTGCAGCAAGATCCATTACTTGCTGAGGCATATTACTTACTGGTCCAGAGATTATTTAGATTAAGCTAGCTAGGCTCTAACAATTAATCATCTCCGAGATAAGTAGGGGAAAAAATTGGGAAGGTAGGATGGAGAAACTAGTCTTTTTTCTTTAATCTATATTATTTAAACTATTCAACCAATTACTAAGTTGTCAGGGCCTTATTTATTATAGGCTAGTAAACTAACTAATGAAGAAAGACTTTTTTTAGTCATTTGTTACCATTGGCTCTCAAAGAATTTCTTTTTCTATCTAATTATGTATCCCAGGAGCTGTCAAGATGGCTCAGCAGTTAAGAATGCAAATTGCTTTTGTAGAGTTTGGTTCACAGCACCCATATTGGGCAGTCCCTAGTTGCCTGTAATTCTGGTTATGCAGGGGGATCTGATACCTCTGACCTCCAAGGTCACCTGCACCAATGTGTGCATATCCCTATACAGTATATACATTTAATAAATAAAGATAACAATAAAAAACTTTTAAAAATCCTATTATATTTATTTGTTTTGTTTTGAGACAGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGGACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCCCAAATGCTGGGATTAAAGGTGTACATTACAACTTTGGCTCTACATATACAATTTTATTGTTAAAAATGTAATATTTTATTAAATATGTTTTGGCACCCTTAATTGGTTTCTTTTTTTAAAAGAAACTGTTCATACTTACTTATACACACACATCCCATGCCATGCCATGCATGCTGAGGTCAGAGGACAGTTGGTAGCAGGACAAGCACAGGCTATTTCTTTTGTTAATAGACACTCTTAACCTACCATGCCATCTTGCTGTACCACATACTCATACTCATCGAGTATGATGTGTATCCATACCATCCTGCATATGGAGGTTAGACGACAACTTGTTAGGTTATATGGGTTTGAGGGGAGTATTTCCCAGATGAGCCATCTTGTGTCCATTTCTCCCCCAACTCTTCATTTTGAGACAGGGTCTCACTAGCTGACCTGAAACTCACTATGTAGCGTGAGCCTTGAACTCAGAAAGCTCTGCCTGCCTTTGCTTCTCAAGGGCTGTGCTTCTTAAAAGCTTTTCTAGGGATTTGGCTTTGGACAGGATGCAAAAAGTGAGGTCAAAGGGTAAAGGTAACTGTTACTAGGATGGGTTCTTGTTCCCAAACGCACATCATCAATTTCAGGAGAAGGGAGAAAAATGACAACGTTTAATGCTTGATCTAAGAATGTGTACTGTGTAATAGAAGTAATACAGTGGAGCATAAGACAAGAACATAACATAACCATCACATAAAAGACAGGGTATGTTGAAATAATAGCAAAGCATATAACTGTGTCTGAGGATGTTTGCCTCTTTGATTGTATGGTTTCCATTCCAGGATTAGAGAGCATTCTGCTGGCTTATTTTTCATAATTATACTATTCAGGTTTGGGTTATTGTAGTGGTTTTTAAGTTTTATTTATTTTATGTGTATGTGTACACTGTAGCTGTACAGATGGTTGTGAGCCTTCTTGTGGTTGTTGGGAGTTGAATTTAGGATCTGTACTTGCTCCAGTTGGCCCTGCTCCCTCCAGAAAAGGGCATCAGATTTCATTATGGGTGGTTGTGAGCTACCAAGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTTGGGAAAGCAGTCAGTGTTCTTACCTGCTGAGCCATTTCACCAGCCCTATTGTAGTGGTTTGAATAGATTTGGCCCCCATAGATTCATGTTTGGAATGCTTAGCCATACAGAGTGGCACTATTAGAAGGTGTGGCCTTATTGGAGGAAGTGAATCACTATGTAGGTGGGCTTTGAGGCACCACATTTGCCTGCATGCTATTGTACTTCCCACCATGATGATAATGGACTAAACCTCTGAAACTGTAAGCTAGCTCTATTTAAATGGTTGCCTTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATTTCTTTACAGCAATGGAAATCCAAAGTGAAACAGAAAGTTGGTACCAGGAAGTGAGGTATTGTTGCCATAGGCCTGACCATGCAGCTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTGGAGGAATGTGGGTTTTGGGACTTTTGAAAGAGTGGGATTCTTTAATTGGGATCTGATGCTTAATAGGCCTCACTAGTAGAAGCATGGAAGACAGTGGTGCTGAGGGTAATTGAACTGTGAGGGCCTAGCTCAAGAGGTTTTAGAGAAGAATTTTAACGTGTGCCCTAGAAATTGTTCTTAGGGTATTTTATTGAAGAATGTAGCTGCTGTTTGCCCTTGTCTGAAGAGTCGGCTTGAGGCTAAAGTGAAGAGATTTAGATTATTTGCATTGACAAAGGAAATCTCAAAACACCCTCCTTAGACTTTGTCCCTTGGTTTACTCTTTCAGAAGAGCCTTTTGATCAGGTTTAGCAAACTAAGGAAAAGTACAAACTGTGGTTCAAAGGTTAAAGGGGCACCAGGAAGTTTGATGGAGTTAAATCCTGTGTTCAAGGATGTTGAATAGAATTAAGGGATTGGCGGCTTTGAGGCAAGATCCCACCCAGCTAGCTTATTGTTTTAAGTGGTTTGCATTTGAATAAGGGATAGTTATTCTGTTAGGCCTTATTGTGACCTGGCTATTGTTTTTATTTGGACTGAGATCTGATTGTGTGTCACGCTGACAAGGGATAGTTTATGAGGGCAATTCTCGGTTGTTAACTTTATGTGGAGTGAACTATATATAGTCCAGAAATGTAGAGCACATGTGATCCAGACACAGGCTTTTTTGATCCGGATTTTGAGGCATAGTGGTCAAGTGTGGTGGTAGGAGTCTTTAATCCCAGCACTCAGGAGGAGGAGGCATGCAGATCTCTAAGTTCAAGGTCAATCTACAGAGCAAGTTTTAAGGCAGCCAAGCATAGGCAGTAAGGGATTTGGAAAACAGAAAGCTTCTGATAATGTAATAGAAGAAGGGGGCCTTCTTCAGCTCTAGTAAGCAGCAGAACTTGGTTGGCAGCTTAGGCCATGTATGTGGCTCTGGTTTTAGTCAATAGAAGGGACAAGACTACTGGGACAATTGATGCTGGTTAGCTAGAGCTAGGAAGTTCACGGTGATTAAGAAGAGACCAGCATCATTGAAGTGAAATCTGGGAAGTGTTTTCAGAGAGCACAAAGGAGCCTGTGTTCCATTAATAGCCAAGGTTGTAGCTCATGTTTCAGCTGGAATTGGTAGTGTGTAAGAGATACCCAGGTGGACTGATTTTGAAGTTATGAAGGGGTCATGGAGAGCAGCTGAGGTTAGGCACTGTGAGAGGCTAGGAGAGGCCATCGTTGAAGGTACAGCCTTAGTGACATTTGAAGACCCAGGACTGAAAGGACCATGCAAAAGAGTTGAGGCTTGGTATTGTGAAGAGAACCTATTGATGAAGCCTAGTTGCAACGGAAGACACTTGTGTATTGGAGATACCAGTACCATCACCATGATCACCAAGAACAGCAGCAGCTGTGGAGTGAAGTCAGCCATAGCCTACCTAGCATGCTACAAAGATCATGTATGAATCCCAGACATTGGAACAAGAAGCTGTGAAGTTGAAGTTACATTGGAGACCCCAAGATGTTCGAGATGCCAAAGCCATAGGATATCTGCTGAGAAAAACTGTTAACAGGAGTGGGACCAGCCCAGGAGAAAGTGTGTTGTAGTTAACAAAGCTGAAAGGAATTGGACATGCAGATGGAGATGCAGAGTTGAGAGTTTGCCCAGCAGGTTTTTGGTCTTGTTTTGATCCAGTATTTCCAAACTCTTGATATTTTTGAAATGGTAATGTATATCCATTCTTTTGAAATATGCTGTCTGCTTTTTGATTTTATAGGGAACTGCAGTAAAGAGATTGCATGAATCTCAGAAGAGATTTTGAACTTTGAACTTTTAAACATTGTTGTCACTTCAATAGACAGACTTGTGAAGTTGGACTAAATGCATTTTGCATTGTGTTATGGCTATAAGCCTATACGGGCCAGGGAGTGGAATTTAGTGGTTTGAATAGGTTTGGCCCCATAGATTCATGTTTTATTGAGTGGCACTATTGGGTGGTATGGCCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCATGGTGTAGGTTGATTTGAGGCTTCCTGTGTATGCTCAAGTCTTCACCCAGTGCAGTAAGTAACTGAGACAGTTACTTACATAGGGATTCAAGATCCCCGAAGTCATCACTGGACTTAGTGTTTGCTTATTTATACAGGGTTAGACATATCCCAGGCTGGTCTTGAACTTTTCAAGCTATCTGTAGTTGAGGATGACCCTGAACTTCTGATCTTCCTATTTCCACCTCCCCAGTAGTGGGATTACAGGTGTGTACCTGTTTTTCTTTTGTTTATTTTTGTCTTGTGTTGGGGATGGAACCAAGGACCTTGTGTATGCTAGGCAAGCATTCAACCAACTGAGCTACATCCCTTGTCTTGTTGGTTTGAAGATTATCTTTCTGATTTTCAGTGATTCTGTTTACAGTTACTATACTCACAGGGTTTTGAGTTTGTTAGATACATAGATTAATATTTTTCACAATTTAGGGGAAAGGTATCAGTTCTTAATTCTTTTTAGGACAATTTTAAAATGTTTTTCTTTTATACCAAAATTCTGTTCCCATAAACATATTTAATCCTTCTCCTACCCCCAGATACTTCTATTTATTTGTCTATGAGCTTAACTCTATCTCAGATAACCAGAATTAAACAGTAGATGTCTGTTTTTTGTTTTTGTTGTTGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTCTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACACCCGGCTAGATGTCTGTTTTATTTGGATTGTTTTGCTTATGGTAATGTTTTCAAGGCTCCATGTTGTAGCATGGGCATGTTTCCCAGAGTTTGTTATTTTTAGACATTTCAAACAGGTTTCCTTTGTTCTTAGCTAAGTTACTGAGACTTTAATCCCCATTTTCACTTTCTGTTTTTTTACTAAACTTTTATGGTCTCTTATTTATATAGTTTTACATATTCTTGAATGTTAACCAGTAAAATGTCTAAAATTGGAACAATGAAGCCAAACACTTCTTTGTCCTTTAAGAAAGTTGATGTTGGGGCTGGAGACATGACTCAGCAGTTAAGAGAACTGGCAGCTCTTCTAGAGGACTCTGGTGGCTAAGAGATCCAACATCCTTTCTTGATCTCTTGTAACACCAGCCACACACATGCATTCAGACATGCATTCAGGCAAAATACCCATATACATAAACTTTTTAAAAAATTAATTGAAGGTATGCTATATTGTTCACAGTTTTTAATATGTAAGTTATAATGATTTTATAGTTTATTGTTTGGAATCATTTGCTTAAGAAGTAAAATCTTCCAGTTTTCACTTGATTGTAATTTTGTGGAATCTGAAGTTTTAATTTTAATTACATTCATTTTGTGTACTCATGTGTAGGTAGGGGACAACTTACAGGAGTCTATTCTGTTTTTTTGTGAGTACTGGGAATCAAATTCAGGTTGTCAGGCTCGTTGGCCTATACCTTTATCTGCTGAGCTTGTCACCTGATCAATTATCAACTTTAAAAAAAAAATTAAGTCTGTATATTTTGGTTGATTTATTCTCCCCTTTTTGCTTAGTGGTTCTCAGTGGAGGCTTTGTTACTTCCCTCCAGCGAATGTGAACAGTCATATCACCCAGAAGTCATGTGTCTTAATTACCTGTGGTCTAAGCTAAGAAGTTTAAATCTGTTTAAAGGCCAGGGTCCCAGATATAAAGCTTAAGTTGGTCTGGTACTTCTGAGTGGCCTCTGCTGGCCTGGAACTTCCCCTTGGGCTACCCTGCTTAGTGGTTCTTAGCTGTTATTTAGGAGGCAGTTACCCCGATACAGAAATGACTTCTTGAGTCCTGGCTTAGGGTATGCAGTGAGCAAGTATCATGAATTATTGTTCTTTTGTTTTAGTTACATCTACTTAGAAAGTACTTGTCATTTGAGTTATTTGTTGTTTTTTTCACAAATTAAGGATTTTATACCAAAAGTTTGGTTAACATGTGAGATTTATCTGGTATAAAATCTTATACGTCTTCTATTTGGTCTATTTCCTGAACAG
Seq C2 exon
AGACTCTACAGGAGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCTCAGCATCCTTGAACAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAACCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAAGATGTCTTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGAACTATCAAAAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000029267-Mtf2:NM_013827:1
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.525 A=NA C2=0.177
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF150571=DUF4537=PU(31.7=28.4)
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types
Other AS DBs: