Special

MmuINT0122187 @ mm9

Intron Retention

Gene
Description
pleckstrin homology domain containing, family M, member 3 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:2443627]
Coordinates
chr1:64939326-64969056:-
Coord C1 exon
chr1:64968124-64969056
Coord A exon
chr1:64939472-64968123
Coord C2 exon
chr1:64939326-64939471
Length
28652 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTATGA
5' ss Score
9.46
3' ss Seq
CTGTCTTTTGCCTTGAACAGGGT
3' ss Score
9.79
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Fruitfly
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Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
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GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Pre-implantation embryo development
  • Muscular differentiation time course
  • Spermatogenesis cell types
  • Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
  • Hematopoietic precursors and cell types