MmuINT0122187 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000051344 | Plekhm3
Description
pleckstrin homology domain containing, family M, member 3 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:2443627]
Coordinates
chr1:64892752-64922482:-
Coord C1 exon
chr1:64921550-64922482
Coord A exon
chr1:64892898-64921549
Coord C2 exon
chr1:64892752-64892897
Length
28652 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTATGA
5' ss Score
9.46
3' ss Seq
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3' ss Score
9.79
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types