RnoINT0113478 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000023760 | Plekhm3
Description
pleckstrin homology domain containing M3 [Source:RGD Symbol;Acc:1307151]
Coordinates
chr9:71592693-71617701:-
Coord C1 exon
chr9:71616769-71617701
Coord A exon
chr9:71592839-71616768
Coord C2 exon
chr9:71592693-71592838
Length
23930 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTATGG
5' ss Score
9.99
3' ss Seq
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3' ss Score
9.79
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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NA
Other Skipping Isoforms:
NA
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Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]