MmuINT0178377 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000026872 | Zeb2
Description
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Sequences
Splice sites
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000026872-Zeb2:NM_015753:9
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.123 A=NA C2=0.777
Domain overlap (PFAM):
C1:
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A:
NA
C2:
PF134651=zf-H2C2_2=PD(57.7=7.7),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=13.4)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
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Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types
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