RnoINT0105764 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000010011 | Osbpl3
Description
oxysterol binding protein-like 3 [Source:RGD Symbol;Acc:1564287]
Coordinates
chr4:80090037-80107884:-
Coord C1 exon
chr4:80107652-80107884
Coord A exon
chr4:80090154-80107651
Coord C2 exon
chr4:80090037-80090153
Length
17498 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGG
5' ss Score
11.08
3' ss Seq
CTGTTCTTCCGTCGGAGCAGGAC
3' ss Score
5.88
Exon sequences
Seq C1 exon
ATTTCCTCTGAGACTTCCAAAATGGTTTTCAGACACACTGGATAAGAGTCAGCAACTTCCTGCGAGGACTTCATACTTTCAGCTCTACGTCTTCCCATGGCATTTTGACCGCGCTGAGCCCAAGGGACCTGCTCTTCACAATGAGTGACGAGAAGAATCTGGGTGTGTCCCAAAAGTTGGTTTCACCCTCAAGAAGCACAAGTAGCTGTTCCTCCAAGCAAGGAAGCCGGCAG
Seq A exon
GTAAGGTTCAACTCCTGTGGATCTTAACGTGCAAACTGCATCACGAGGATTTGCTGGTACAGATGTGTGTTCACTGGGAGATGCCGTCTCTCTCGGTTTAAGAGCAAGTCCTTGTCTTCGTACCTGGTTACATGAAGAGAATCGGTTCACGGGCTTCCCAGGTGCTGAGAACTGCAATTGGCTCTTTGTCTTCTTTTGCACAACCTTTACAACTGCAACCAACACAGGCACTAACATTCCCATTTTCCCTCCAAGGAAGCTGAATCATACAGACTGGATTGCTTGCCCCAGTGAGGCCCTGATGCCAAATGAGAGCTCCGTCTCTTTTGCTCAAAGGCCTATCTTTTTCCTTTTAAAGATTTTTTTTTATTTCTGTTTACTGTTTATGGGTGTTTTGCCTGCACATATGTCCGTGTAGCACATGTATGTAGTGCTCTCTGAAGATGACAGGTGGCATCACTTCCCCTGGAAGGAACTATATTATACCTGGATACCAATTGCCATTCCATGATGCTGGGAACTCAAACCCAGGTCCAATGCAAGAGTGATAAAAGTGTACTAACTGTGGAGCCGTCTCTCCAGCCCCTCCCACCCTTCCTACACCCTATTAACCAAAGAAGCAGTCATCGCTTTCCCAATAACTACCTTACTACCTCTACTTCCTTCCATTCACCAATATTTTGATGAAAGCCGGTAGCTCCAGATTGTCTACGAGTAGCTAAAATCTTGCCTGCTATTTTTTTTCCCTAATGGGTTGTGGGAAAGTGGCAAAGAAAACAGCAAAACAGAGGAGAGAATCCTTAACTCTCGAGTAACTGTCCATGGTCAATGATTGCTTCTTGGTTTCTCTTGGCTTTGCTGGCAGATCTGCTGGTGTCCATTGGTAACCATAAGGGCATATTGATCACCGAGATCTGCCCCTGCTTCACTAAGGTAGTGTGGATGGGAGATATGCAAGAAAGCTGGATTACTAACCCGTGAGGACTTTGAATTGTTCAGTATTTACTGGCTCTGTCGGTATTGCCTCTGCCCTGTGAAAAGTCTGGCCAAAGGATTGGCTTTTGTCCAGATTTGGAAGCAGTAATTAAGCAGCGGCCCACTCGGGAACGTTGGACACTAGTGACTCAGCTAAGCAGCTCTTAGTCTGAACACTTGTCTCAGTCAGGGAGCTTGCCACCCACCAGTCCATGCTTTGGGGCAAATTAAAGTTTGCTGTGAGCATGATGTGTAGGGAGCCCTTTAAGATCTCTTTTTTTCCTTCTTAGCATTTATCTCTGTGTGTATGTGTGTATGTGTCCATGCCTGTGAATATGGCTGTGCCTGGGCCGTTATGTACATGTTAGAGGTTGGATTTTCATCTTCCACCTTGAGACAATCTCTTCCTTTGTTCTTTTCTGCAGCTTAACACCAGGCTGGCTGACCTAGGGACTCTCCTATCTCTACCTCTCATCTAGTAAGAATGTTGACATTTCGGATGCTTGGGCTATGACCTGTCTAGAATGAACTGAGGTCCTCATGTTTGTGTGGTGTGTTGGCTGGTTTTTGTTGTTTTGTTTTGTTTTCTTTTATTGGGTCTGACGCAAACGCAGTCATTTGAGAAGGTGGGACCTCAGCTGAGAAAATGCCTTGGTTATATTGCTCTATAAGCAAGTCTACAGGGGGATTTTTCTTCATTAGTGCTTGTTGTAGAAGGGACCAGCCCACTGTGGGCGGTACTATCCCTAGGCAGGGCCATCCTTTGGTTGAATAAGAAAGCAAACCAAGCACTCTATAGGGAGCAAGTCAGTAAGCAGCATTCCTCCATAGTCTCTTTTTCAGTTCCTGCCTTTAGATTCCTGCCTTAGCTTTCCTCAGTGATGGACTGCAATTAGGTTGTGAAAGCCAAATAAACTCTTTCGTTTCCAAGTTGCTTTTGGTTGTGGTCTTCCTAACAACAAAGAAAGCGAGCTAGAATTTGTGATACACACTTTTACCCACTGACCTAACTCCCCTTCCTCTGGGATTTTTCTTTTAAAGATTAAGTTTGTCACTGGTTAAATGCTAACACCATGGGTCTCTAGAGATCTGCTCTCATGGGAGTGAGTGTGTCTGCCCACTTGAGCAGCTGTCACCAGGTTTTCCCATTTCTTCAGAGAGCACTCAGGTTTGGACCTGAGTACAGTGTGTGATTTCTCCTCCCACCCCAGCAACTTCCTGCAAACAGGATCTCTTCTTCAACCCACCTTTGCTTCACAGGGAGGCTGTGCTCAGGGAAGCAGCAAGTCCTCCCCAGGGGAGCTGAGCCCTCATCCTCAGGCCTGTAACTCTTCCAAGGTCTTCAGTGGTTTTCTCAAGGCTAGCTTCACTCTGAGTATTCGAGCAAGAAATACTGAGTAAAGTAGCAAAAGGAACTTGCACCACCCAGTGCTTCAACTTTTCTTCTTTTGACCTTTATCAAATGGTCCTCTTTTCTTTTTAAGACCTTCCACTTCAATTTGCGTAACCGGGACACACAGCTGCTTTCTGTGCTGGTCAGGTTTCTGTCAACACAAACAAGTCACCCAGGAGAAAGGAATTCAGTACAGAATTGCTGTTATCAGATTCACCTGTAGGTATGTCTGAGGGACATTTATTGATTGTTGGTTGATGAGGAGGGGCCAGCCCACTGTGGGCCATGCCACTCCTACACAGGTGGTCCTGGATGGTATAAGAAAGCAAGCTGATCAAGCCATGAGGAGCAGGCCAGTAAACGGTGTTCTTCAGGTTCCTGCCTGCGGTTCCTACCCTGACTTCCTTCTGCAATGAGGGCATATAAAAACCCAGTAAACCCCCTCTTTCCCAAGTCGCTGTTGGTGCTGATCACAGCAAAAGAAAACAAACTAAAGTGCTTTATTAGTGTAGATGTTTGTAATTCCTCTGTGGCAGAGAAAGTAGGGAGTTCAATAGTTTTAAAATCCCTGTTGACTTTGGAGGGACTGCGCATCTGAGTCCACTGTCCCATTTTCTGACAAAGGTGTTCTGCCCCAGGCTAGCACAGCCCTCCCATCCGTGATGCCTCTGTCATCCATCATCAGTCTTTGCCTGCCTCACATACTGGTCGGGGCTCGGCTGCCGTCTCAGGAGCCGTGGAAGCTCTCTTTGCTGGCCTTTTGGGGGCTCAGCCATTTCCACTGCATCTGTCAGCTGCTAAATAAAGCCAAGAAGCCCATTTCCAGCCTCGTCACAGGATGTTTCCACAGCCACGGGCTACACTGGAGACGTGGTAAAACAGTAACTGTCGACGATGTGTGCAGCCACCTGGTTTCGAAGGTGCCACTGTGAGACTCCATTCAGGTCACTTTTCCTTTTCTCTGGAGTGGATCTGTGCACATCACTGGCCATCATCTGTGGTGCTAGTTTTCCTTGCGTGCTCTGGGCTGTGGTTAGAGCCTCATCTTGCAGGTCTCCTGTGAGATCTACAGTCACCTGTCTTGGTTTGGGATAGGCCGTTGCCTGCCTTCAGCTCCCAGGGACTCCGATCCAGGGCAAGTCTCACATGGCATTGGGGACTCAGCAGATAACCTGGCCCGGGTTCAGCTGCCTCCTTCCACTGCCCCGGATGAGCAGATGGCAAAACCTCCGTTCACTGTGCTGTGGTCACTGCACCATCCCAGTTTACAGCAGAGAGCCTGGCTCAGGTGGTGACGGACCGTTTTAGCTCCCTTAGCTCACAGAAGTAAGCCAACAAACACTTTTGCCCACAGTATGTTTTACTTCTTTACTTTCTTTCACATCCATAAAGACTTCCAGGCTTTTAAAACCATAATCTTTTCCCCCTTTAGCTTTATTGAGATGTGACTGACAAATGGAAATTATACATATTTAAAGTCTACACTATGCTGTTTTGATATTTGCATGTGGTATAAATGGCAAACACTGTCCAGATAACAAACGTACCTATCATCCTACATGGGTATAGCTGGTGTGTGGAGAGCAAGAACATTTAAGATCTGCTCTCCTGGACCCAGAGATGCTCAGTCTGTAGAGTGTCCAAGGACCTGGGCTCAACCCCCAGAAGCTACATTGGGTGTGGTGACAGACAGTTGTGAAACAAGCACTGGGAAGGTAGAGACAGACAGATTCCTGGGGTTCACTGGCCAGCTTGGGTGAACTCCAAGCTGATGAGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAGGTGACCAGTTCTGAAGTATATCCAAGGTTGTCCTCTGACCTCACCCACACATATGTGAACATTGTTCTCTAGCCTCATCTACACAGATGTGAACATTGGCCTCTGGCCTCACTCATACATGGGAACATGCACACACATGGAGACCTGCTGTCCCCACAAGTGTCACAAATAGTTTTCCCGTGGTATTCACAAGGGTATTGGTTCCAGGAGCCCCGCTCATAATAGAGTTCAGGAATGCACAGGCCCTGTGTGAAGTGTGAGAGTGAAACGTGAGACCACCGTCCTGTGTTCTTCAGGTGGTCCAGATTCCTGGTAGAAATGGTGTGTTAGCAGGCACTACACTCTGTTCAGGGCCTGGTGACGAGAGGAAACGTCTGCCCGTGCTTGGGCACTATTTCTCTCTGAATATTCTTAGGGTGTAGTTGGCTGACTCAGCAGACGGCAGAGGCCACAGGGACAGTGCAGTGTTCTCACCGTTGACCCCTTGTCACACCTCAGATCTTCAGAATTGGTTCCTCTGAGGAACTGGAACTTTGAGCTTTGGATTTATGACCTCGTGTCCTCTAATCTACAAGTGCGCTGTGCCTTAGTCCTACCTGTGAGCTCAACCTCTCACACGACATGTTTACAGAAGACAATGCATGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTGCCTAGTGTCCCCCAACTTTATCCACGTTGTCACAGATGAAAAGATGTCATCCTTTTAAAAGGCAGAATGATATTTCTTTCTGAAGAAAAGTTATGTATGTCTATGAGAAACTGTGGCACGTGTGAGTGTGTGTGCTATGTGTACTCATACTACATTTTCTTGTCAGATTCTTTTTTACCTCCATGAATACAGGACAGCCTAGAATTGCATGGCTTTGCAGGTTCTCACTATGCTTGGGGTCTCAGTGGCGGCAGGAAGAGGGCACTGAGAGCTTGAATTTACAACTCCATCTTGCACAGACACACGTGCGCACAGATCACACGGACACCTCACACTACACATACTATAACACGCTGCATATTTGCATAGATCACAGCACTGTACACATCACACACATATCACACTCATATACATCATACACACGATATTTTAAAATAAGAACAAAGCACCCTCTTGGTCATAGAACTCAGCCTTTGTAAAGCCTTTTCTCTTAAGTTCTCTTCCAGCACAGACAACTGGTGATCAGAGTCTCCATACCTTGGACTTTCTTTCTGTTCGATAAACTGACTTTGCCTGTCTTTGATTCTTGAATTGACTTGGACTTGTCCTTTCTATATGCATGTGTAAAATGTCAGGGAGTCATGCACTTCCTTGTAGGTCCCCCATGTGTGTATCTCTCACTTCTGTGTAGATCTCCAGCATGTATATATGCAGTCCCATGTGGATACCCCCCTGTTCATGTATCAGTGTTAAATGAACTTGCTTTCTTGAGGGAGAAAATGAGAACTAAGTGAAATATACGGGGAAATGCCTGGCTGGCATGTGAGCGATGTTCAGTGCACGAGGATCCAGTTATTGAGTGACTAGGCATGCAGATGCTAGGCAGAAAGATCCTATGCAGACTGTTCTGCAGATCCATGCAGTAGCTGGAGGGGTATATAAGTAGGAGGGAGAATTGCTATTTTTAAACTGATAAAATAGGAGTAATTATAATTTCCTTTTGTCTTTTCCCCACTGCCCCGTTCTATTCTTGCCTAGAAATGTCGAGGTACTGCATGTTAGAAGCCAGATGGGGCTAGGCAAATGGATGGGTATGTCTTGTCTACATTAGAAGAGCCCAGTATCCAAGGTGTATTTTGCTTTTGGTTGGTTTTGGTTTTTGTATTCTTTGAACATGCTTGAGCAGAAGATGTAACACTATGGAGGACAGAGGAGCCAAACAGAGCATTGCAGGTAAGAAACCAGCTGATGCGGGTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTGCCTAGCAAGTTCGAAGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGGGAAAAAAAAAAAAAGAAACCAGCTGATGCAAAACCCCTGGGTGGAGCAAGGCCACGGCTCCCATTCTTTAATGAGATGTTAGCATTTGGCATGAAAATCAGAGATGAGAGTGTAAGCTCTGTTTCTGCTGAAACAGTTCAGAAGCATGCTCCCACCTCAGCCTGGGATTTGAAAGGGAGAGAGATATTCTAGGGTGAATCTCCCCATGGTGACTCAGCTTGCTCCTGTCACCCACTGTCCCCTGGCTAATCTTTGGTGGCATTTGAGCTCCCTCAGGGTCACCCAATGAGAGTTAATTTATGCAGCCCTTAACTATGCTATAATTCAGAAACCACAACCAGCCTGGGCTCAGTGCCAGAATCTATAGAGTCAGGTAGGTTGACTGGGAGAGAATTTGCCAAGTTTGCACGATGAAGTAAACTATACTGTTCAAATGATGACATTTTCAGTTAATTATTGAACATGCTAAGATCCAAGCCAGGTGTGGTAGTGTGTGCCTAGAATCACACTACTTGGGAGACTGTGGCAGGAGGATTGCAAGTTTGATACCAGCCTGGGCTGTAAGACTCTGTCAAAGAGAAGGAAGAAGGGAGAGGAAAAAGAGGAGGTGAATGCAGTCATATTGTCTTCTGGTGTCACCTTGGTTCTTTTCCTGTTGCTGTCAGAGGATATCTGAGACTGATGGTTTCTAATAAGTAAGGAATAGTTTGCTTGGCTCTAGAGTCAGGGAAATCCAAAGCGAGCAGAACCCTGGCCTGAGTCACACCGTGCTGCTTGAACTTGCGGCAGAAAGCAGAAACGAGGAAGCCCCAGGAGTCCCTGTACCAACCTTTCCAATAACCTGCTTTAGGTGATTAGTGGAGAAGTCACTCCAGAAAGGAAGGCGGCCATCCCCTTTTAATGACTTTGGTACAGATCTTTGAGAGCAGTGGGAACTTCCTGGGTCCTGGCCTGCATGACTCAAGGACTTGGATGCTGGGCGTTAGCTTGAGACAGTAGCTCCAAGTTCAGTGTTCCGTACTAATTTATGGCCAAAGACATGAGCTGTACCATGTGGCTGTAATCAAAGTGAGAGCTTCATTAAGGAAAAGCGAGAAATGAAAGAAAATGGAGCGAGACCTCCCAAAGTGACTGATGAAGTCCAGATTGTTTGCTTCCACAGAAAGGAAAAATGAATGTTTCTGATGTTGACTGCTGTGTCCAGAGTCAGGGGAGCAAGGGGCCATCTATTTGGAAAGCACTGTCTTTAGATGCTAGATGTGCCTTCAGAAGTCAATTCAAGGCCCACATTCCTGTATGAATGATTGTCTAGAAAGGCCTCTGGGAATGTGAAGCAGAGCAGGTGAAGTAGCATGTGGGCCCCGGTTTGCCGAGAGCGCTGTCTCTTCCTGGTCATCTCAGCAGAGGAAAAGACACAGCCATCTATTTCTGTCTTCATTTCCCAGGCTTATTTTCTGGGCTCTTTACTTTCTTTGTCGTCCCCCCCCCCAGCCTTTTGGCCACAGCTATGTTGCGACGTTATGTTATGGATGTAGGAAGGGTGACAGTAAGAATTAGTTCACAGTATACTTTCCCACTGAGGCTTGCAGAGAAGCAGACATTTGATATGGGAAGAGGTGAGAGCGTTAGTGACAAGAACAAAGGCAGTTTTTCTTCCCTGTGTCTACAGAGGACAGACTCTATTCCTCCCTGTGTCTACAGAGACAGGCGGTTGTTCCTCTCAGTGCCTACAGAGGCCAGACTGTTACTCCATGCCTGATCAAAAGAGCAGGGAAACTGAACCCTAATGGCTTCCAAAATTCCCAACCTGTCTGGTCTGATCTGGAGTAAAAGGCAGCAAGTAGGAGCTAACAGACTGTTCCATGGGTCAGGGAATTGGACCTGGGTTTAGTTCCCAGCACCAACACGATAGCTTACAACCAAGTCTAGCTCCAGTGAGTCCAGAGCCTTCTCTGCCTTTGAGCACGCGTGATACAGACAGACGTATAAGCCAACACTCATGCATGGGATTGAAAATGAAATAAAAAGCAGCAAAGGTAGCTTTCTCTGTTTTAGAATCACTGCCTTGATAAAAGCCTTCTTGGCAGTACAGGTCATAGGAAGGAAGAAGCAGAACGCAGGTGTTCTAGGGTGAGCACATCTGGATCACTCTAGGGATGCAGCACCTGGATCACTCCAGGGACCCTTGAGTGCAGCCTTGGGCAGAGCCCGCTCTTTGGCTCTTTCTCATGGAAGAGAAAAACTGTCTCATTAATCTGATGACACCAAGATGGTGGGTCATCAGATTTTAGTGGGTTTTAGTGGCGGGCTAATGGCAGTCAAGATGACTCCCCCTCTAAAAGCGTTTGCCACACAGGAATGATAGCCTGAGCTGAATCCCAGGAACCCACTAAACAAACATAAACAAACAAACAACCTGGCTATGATGGTGAGCATCTATAATCCCTGTGCTCCTACCAGGAAATGGAGACAGAGGTGAATTTCCCAGAAGCTTGAACGCTAACGAGTGCAGAGTATGAAGTGCAATAGAAGTGAGAGCCACCTTCAACATGGTAGAGAGCTTTTACTTCTGAAAGTTGTCCTCAGACCTCCTCATGCACAGTGTGGCATGCATATACTCATACACACATCACACACACACACACACACACACACACACGTCACACAATCACACGATAATAAATAAAATAAAAAATGTCTAATGGCCCAGAAGTGACAGCGCAGGATGTAGGACAAGGCCAAACAGAAGACATCTAGGTGTTGGTGGTAGAGCAGTGAGCGTCTTCTGCCTTCTAGAGGACAAGCTGAATAACCTGTCTGCCTCTGGATGCTGGCCTTGGCACTGAGTCTAGCATATTCTTCTCTGTGCCTTTCACAGGGGTAGCTGAATCAAATGTTCTGGTCACACAATCACACGATAATAAATAAAATAAAAAATGTCTAATGGCCCAGAAGTGACAGCGCAGGATGTAGGACAAGGCCAAACAGAAGACATCTAGGTGTTGGTGGTAGAGCAGTGAGCGTCTTCTGCCTTCTAGAGGACAAGCTGAATAACCTGTCTGCCTCTGGATGCTGGCCTTGGCACTGAGTCTAGCATATTCTTCTCTGTGCCTTTCACAGGGGTAGCTGAATCAAATGTTCTGGCACAACTCTGCCCTCATTCTCTCCTTTACCTTGTGTATTTTGGTTGACACTGGTCCCCTAAGAGAGAGGTGCACATACTCACCCTCTCACAACCTGTGAATGTGCACTGTTTGGAAAGGGAGCCTTAGTGGACGTGGTTAATTTAAGGACCTTGAAAAGGGCAGGACATCCTTAGTTGTCTGAAGGGCCCTAAATTAATCAGCAAGAAATAAGCCAAGGAGACACAGGGAGGGCACGGTGTGAAGGTGGAAGCAGGCGCAGTCTGTAGTAACAAGCTAAGCAGCAGCTGGGAAGCTGTGGCTCCAGAGACCAGGATAGCCCAAGACAGTCTCCCCTCTGACCTCCAGAAGGAGCCTGGCTGTGCCTACACCAGGTTTGGGATTTCTGGCCTCCAACACTGTTGAAGAATTTTAAACTTCAGAGCTGGGTGGTGATAGACTAGGCCTATAATCCTAGCACACAGGAGGCTGAGAGAGGAGGAGCCTACATTGGAGGGCAGCCTGGGCTATATATAGCAAGACCTCATTTCAAAATCAAAACTAGAGAGAGATTTATTGGTTGAAAATTTAAGCAACTAAGTTCATGGCCATTTGCCACAACAGCCTCAGAAGATTAATTCTCTCTGCTTAGAGTCCCAGTTTGAGCCTTTAGTCCAAAGGCATGACACCTTGGGGACAGTGCCTGTCTGAGTCCCTGCTACAGCGTGTGAAGCCCTCATCTGGCACCTACAGATTTTCAGTCTGCAGTGCCTTTGCCTTTCTTGTGGGTGCTAACCTCCCGAGTGTCATTGCTTGGTGGTCTCAGCACTTCTAATGGGGGGTACTAAGGGTGAGGCATTTGTGTATGGGAGGGTTTGCCATTTTAAATACCTGTGACTCTAAGTCACGCACGCAGTATTTCCCAGAAGGCACCTCTATTTTGCTTTACAAAGTTCCATTAGCTCTCTGGACGCCCTGAGATGAAGACTAGAGAACACCACGGGTGTCTGGCATGGGCAGGGGTCTCTCAGGAGATACCAAGCACCGTCATGGAGTACCACTGTGTTTTCTCTGAGTACAGAGTCTGCATTTTTTTTTTCTTTCCAGTGCTCAGATACCACAGGGCCCTGTATGACACGAAAGATTTTTTTTAAAATCAAAAGTAATAGAGAAAGATAAAGGATGTTGCAGGGTAGAAAGAACAAAAATGTCAGACCTTCTTACTGTTGTTCACGTGGGCTCTGTAGGGGAGTTCCCACCCCACCTGAGGGTGGTGAGTTATCCTAGTCTCCCCTGTGGCAGGCTGGCTGCCCCCTTAGAAATGTCACTTTTCGAAAAGAGATGGAGAAAGGGTGCAAAAGGTTTGAGCCCTAGTCCCCCAAAACCTTTCAATTTTGTGACCCTCAGGTAATTGATTTCACTTAGATTCTTAGGCAAAAGAACTCAACAGGTGACCGCTATATCTTCCTTCAAATGTGAATTTCAAAACAGACATTTCGTGACTCTGGGGGAAAGCCATTGATTACAAAAGATGCAAAGAAAAGAAGGCCAGAATAGGTTCAGTGTCACTGGGTGGGGAAATCAGTATCTGCCCGGGTGTGTGTGGTGGGGCAGGGGCGTGGAGTTGGGTGGCTCTGAAGGGATTCCACTGGGTCCTACTGCACTTGTGGCTATCCTTGTCCAGAGGTGATGTCCAGCTGCCAGGCTCTCTGTGTGAGCTGCAAATGGACCCCGCGAATGTGTCCTGTTGCTTAGCACTAAGTCTTGGGCAGACTACTTTGGACTTCAGTGATGGTCACCCTCTGCATGATGAGAGCACACAGACACTCCTCTCCCTTTATCACTGCCAGGACCGCCATCATAAGAGCTGTAAACACGCACGACACATATGGTAGGCTGCTGTTGGCTCATGGGTGTCCCCATCATTAGTAGTAGCATCCCTCCCCCAAGGCCTGTTTACAGAAAGACATTTGTGAGAAATGAGGAAATGTATAAGGGATGTTTTCATAGCTGTTAAGCCTTTATACTATTAAAGGAATATTTAGGAATACGAATAACTTCCAAATATATCTGAGGAGCCTAAAAAGCGCTAACGTAATTACAGCTATAATGCTAAGTGAGTCATCAGCTGGCTGGAGAGACATTCTTCGCATGGGTGCTAAGGTTTTTTTTAAATGGAATTTTAATTATAGAACTGATTGTGGTCAGTATGGTTACAATAAGCATGGGTCTCTTCGTTGGAAACCCAAGGTGGTCTCAGGAGGAGCAGTGGGACAGCCGGAGCTCTCTTGGTGTCCTCCCTCTGCCGTCATCCTCAGCACTGATCCTATGGTTTCTGAAGGAACCAGGAGCCTAGAACTCTTCCAGCGAGTCTGTATGGTGTTTGTGTTCTGTAGCGAGTCAAGTAATAATCCCGGGAACATCTGGGGGCCTGGATCCTCTGGATATTTGCTCATCCAGCTCTCTGCACCTCAATGATGGGAGAGAAAGCCCAGTGCCTGTTGGCATGTCGTGACTGAGGATCCCCAAACAGCCCTGGGAATCAAAGTGGGCTGACCCATGCTCATCCCCTTCTAGAATCTTCTATCCTGAAGTCAGATTTGTGCCTGAGGTGTTATCATTAAAGCTGTGCTTCCCAGGGCAAGGGTTTCTGACAAGATTTAGTTGAGCTCTTAAGAGTTCATTTATTCTGACCTCTCTCACTCAAACTTAGCATCCCTCTGTCCTCCTAGGCCAGCTCCACTAGCCTTTGACGGAGCACTCCCTCTGATGGAACACTCCCGGGACTGAGGAGCACTCTTTCCTGGAGCAGCTAGTTCCCTGTTGATTGATTATTGGATGGTGTCCTGCAGAGCTGGACTCTAAGGGCTTGGGGCTCTGCTCATCAGTCTTGGTTTTTCTCCTTGGAGTCTACATCCTTTGGAGCTCTTAAAGACAGCCTGGGCTTCTGGAAGTGGTCCAGCCACAGTGACCAACAGTCCCTCCCCCACCTGCAGACTGAGGTGTGTGTTCACAGGATCTCCCAGTGATTTCTGTTGCATTTGACCCTCACACACCAATCTGCCTCTGACTGTTTTTCTTTTTCTTTCTATTGCTCTTTGGCCTGTTGGTGCTTGTAAAACCTTAGCTGAGAGAAAGGCACTTCGCGAAAGGCAACTCCAGCCCTCTGATTGCAGCCTAAGCACACAGTTGGTGTGACGTCAGCTTGTTTTGCTGACAGGTACTTTCATGTGCTCATAGAAAAACCGTGAAAGGTAATGTTAACTGAGCGTTAGCCTTTCGTGATAGGTTTACAAGATCAAAATGCCTTTAATCTCACTGATGATGGGTGCAGTCCTCGGCCACGTGATTTGATGCTGAGCATTGCCTTCTGGGCTTTAAAAACCAGGTACACAGATAACAGACTAGTTAGAACAACCTACTCTTCAGTCCACACCTCTCAGCTGCAGAAGAATGAAAGTTGCAGTCATTTCTATTTCTGATATCACAGGCCGGGGAGCTGAGAACTGGGCATGTGCGAGTTGCCCAGGAGCTGTGCACGCAGCTGGGCTGGAAGGGAGCAGCGTTTGCAATCCGTGCACTCAGCACTATGGAAATGAACTTGGCCCACTCCAGAGCATGAATCAGTGCCTAGCTGCCTTTCTAACCACAAAGCAGCTCTCTATCTTTGGCACTCTTTAGATGTTCTGTAAAATAGACTCGACTCAATGCCAGATGACGGCCAGATCGGCCTCATTTGAGCTTTAGCAGAAGCCTTGAGAAACTGCAGCCACTTTTCTCTCTCCGTCTCATAGTCTTGATGACCTTTCAGTCTGATCTGTGCAGGATGAGACATTAACCCAGGGATATTGGGTTCAGTGTTAGGCTCCGTGAGCAGAGTTAGCTGTTGCAGGACCTTGATGTCTGTGGTGGCCCCAATCTGTCCTGTAATGTGTCTCGGGTATTCACTGCACTCAGGGTGCATGCTCTATCTTCAAATCAGCATGGTGAGTGGAAGGGTGTCACGTGCCGCTCCCTTTAGCCTGGAACGCTGGCATCTCAGATTTATTTTTATTACATCGGTTTGTGTTTGTGAGTTTCTGTGTTTCTCCGTGTGTATACACAGGTGTGTTTAGGCACACATATGTGCACACATGCATTGCCCTGGCCATGTGTGGAGATCTGAGGACAACTTCTGGGGTCTGTTCTCTCCTACCGTGGCTCCTCTTCCAGGGTTGAACTCAAGTTTTTAGGCTTGATTAATAACTACCTTCGTCCACTGAACTTCTCCCCAGCCTGCATCTGATTTTTTTTTTCTGCTCTGAAAAGCAATTCACTTGAATAATACACTTAGTGGGCACTCAGGGCCCTTTCCATAGGCTCCTGCTCTCAGACTTGCTCAGTTCATATTTACTGAGGACACAAATGATAATCAACAAGACAAGGAACCCACGTTCTAGCTGGACAAGCACAGGCTAAGCTGGGTTTTCATTATTACTAATTCTTTTCAGAGGAGAGATGGGCTTTCTTCAGGGAAGAGAAGGTTTGAGGAGAAAGAAATTCACCAGAGAAGGAGGTTAGGCAGGAGTTCAGGCGGGAAGGGACAAAGGGGCAAAGGGTTAGCGTCAGTGAAATTCACGGACTGATTTCTTATCCACTTGATACACGTGTGACCAGAGGGCTAGGAGCTCTGAGCAAACCCAAGGCTTCTGAGCAGCCCCTTCTTCCACTTGTCTTTAGACGGGGGCCAGTTCCATGATTCACCCCCAATATACCCTTACCACTTAGGATGTTTTCCTGTTCATCATTGGAATTTATACATCTGAAGATGGGGAAAATAACACTTTACAATGAGAGCAGAATAATTAAAACCTCATGGGCTGTGCCATGGGCTGGCTGTAGCACTTGGCAACTTAACCATATCAGGAAATTTACCTAATTCTCTTCCTCGCTTTCTACATTAAAAAAAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAACCCTAATCAACATGCTCTTGAAGGGTTATACAAGGGTTAAGCCTGATTTAAAAAAGCATGTGTCAGCTATGACATCAGCCACAGTAACAGTTTCTGACTCTTTCAGGGCGTTTATTAATGTCTACTATGGACTGATTTAGGTCAGTAAACTGAGAAAAGGCCCATGGTTGTGTGGCTCTAGAATGCGCTCTCCAGTCCTTTTGTGAGGTTGTTATAACATTCATCTGTGTGTTTAAAATGCCCCCGTGTTTAATATTTCTGTGACTCGGGTGGCATGTTATGGATGGTGACTACAACTTAACCCCTTCTTATAAAGCCCACTACTTAGTGTCATTTACTTGATTCAAGAGTTTAATCTACTTCCTTGACTGGAGACTGCAACAGATACCACATGGAGAATTCTCTTAGTGGCTACTGCATGTACTGTACCACACTGCTGGAGTTGTACACAAGGTCAAGAAGGTCTCTATGGTAGTTTGGAAAGAAAACACCAATGTCCTGGGGCTCAAGTGAAAAATCAACAACTTATGAGTTAATTAAAGGGTAAATTTATGAGTTAATTAAGGGTAAATTATCTCGTAACACACAGTGACTTCTTTACCGCCGGGTTGACTATGGCTGAGCAGACTCACAGCCCAGCTGAGCTGTACCCCAACCCTTTCTGGTCAACTGACATCAAGCAGATCCTTGCTTACAAAGATGTCTCATGGTGCTTGCAGAATCTTTCTGGATGTAGGACACCCTTGTCACTGTGCAAGGCTGAGGAGTCAGGAAGTTTCCTATTGTCTCACTGTCCCGTCAGTTAAAGCCGAGATGCAAGACTTCGTCCCAACACTGTCAATCAACAGTGCCCCAGTTCCCCAGCCTCAGAGAGAACAGCTTCAGGCCACTGTGAGCCTTAGTGATAGAGGCTGCTTCTTAGCCATCACCTGCCAGCTCATTGGTGACTTGGGAAGAAGCAAGCATTTGAATGAATACAGGACCTACGAAAGGCATTTGAGCCTTCTCTCCCAGCCAAGGAGAGCCACCCTGCCTTCTTTCATGGGCTAAATCAAGCTTTTCTGTCTGCCAACATTTTCAAGTTTCTTAACCTAGGAAGAAGACAGAACCTACAAAACAGATGATATTTATCAGGAAGAAAAAAAAAATACACGCCCTCCCTTACTTGTTGACTTGAAGGGAGAGCGATCCTACTGTAGCCCCCTGACCTTCGTGCTGGCTGGTTGGGAGGAGTAAACCATATCTCCAGAATTCTGGGGCACCTCCTTTCTAACCTGAGTCACTAAAGCCACTTTTGAAATTCTATTCTTCTTTCCCATTCAGCCACAGATGAGACCGTATCTACGTTTCCGCCATTTTGGGAAGCATGGAGTAAAGGCTCACCCCTCCTGACATTTGCACTGAGCACCAGAGGGACTGAGCAGATGTGTGCAGCTGTTCTGGAGTTAGTGCCTTCTGCCTGAGAGTCTGAGGGCAGCTCCAAAGGCTGAGCCACTGAGTGCTTTCCAGAGGGCTGGGCCTTGGGTTTTCATGTGATGATACCCCCACAACCGTCTTACACAGATCCTGGTCTGTTGTATGTAACTTGAAAACAGTCATTTGACTCAAGGGCACTGGGCACACTTTGGATGTGCACAATATAGCCTTACTGGAGTTGGTTATCAGGAGTCTGCTGTTCACAAGACGGGAGGAAAGGGAAGGTGCTCTCAAGGGGCTCCTGCCCATGAGGGATAAACCTCATACAAGTTACCATGAGTAAGGCAGAACACTGGCGTGGTGGAGTGAGGGGGTGAAGGAATAGCTTCCTCTGAAGGAGGGGTGTTGTTGCAGGGCCTTAGAGAGGCACTGCACTTAAACAGGAAAAACACAGTTAATTCCAGCAGTGACTTTCCAAGCCGAAGTAAATGATTTCAGGATCGTTTGGTGTTTTACAGTGTGCTGCTTATCGCCAAGTAGACATTTTCCAGTTTTTGTCTAGGCATATCTGAGTGGCTGGACAGCTGCTGATGGTTATTATAACAAAATCCCATTTGAGGCTGCTACCTCGCCTAAAAGTTTCTCTAAATGAAACACTGAATACCACCCCATCCCCCGTTTTAACCATTGACAAAATCCCTTTTACAGCTCCAGATTCGGAGATACCTACAGTGGTTATTTTTAAAAACTAGGATGTGTCTTTATCTCCATTCACAGTGACAAGGGCTCAGATAAAAGGCAGATTATCAAAGAGTTCAGTTGTTAATGTAGGGAAGGATCCGGTTGCTAGAAATGATGTGCTGGGCTTTGGGAAACTTGGAAAAGAGCCCAGCGGGGCCTCTCCCTGCCCTCTGCCCTGGAGCTATCCAGATTCATGGTCGAACTCCTGGTGTCCACTTATTGCCCTTTGGCTGGACCATCTGCCCAGGGATTGGAGCTTTGACTCAAAGCCAAAGTGTCTATAAGAGATCTTCTCCAGAATCATGTATGCAAAACTATTACCCACGTGCAAATATCTTATATTATATTTAGTGTGTGCATCCAGACTCAGGTTGTTATCTAGTGTGTGCATTCCATGTGTATTTGACCTAATTCTTCTCTTCCTCTTCATCTTCCCCCTCCTCCTCCTCCTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTGCTGACTGTACAGTAACTGTGAGATGACATCAAAGTGAGCAAAAATAGAATTTATAGTAAGATCTTTCCCTTTGACTGTGCTGTCAAGGTTCAAAGACCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTAAAAAAAATCTAATTTGGGGGTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTGCCTAGCAACCGCAAAGCCCTGGGTTCGGTCCCCACCTCCGGAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAAAAATTAGTGAATAAAAAAAAAAATCTAATTTGATGCCACTAAACTACAGCTTTGAGTCTATAAAGTCTAAGGAATGGGTGGAAGTTAAATTTACATGTCTTCTTATCAAATGTGCCCAGGCTCTCTCTCTTGGGTCATTTCTCTGGTAGCTTGCTGCTCCGTGGTACTGTCTTTTCAAGGTGTGACATTTAGCCTCTGTTCTTCCGTCGGAGCAG
Seq C2 exon
GACAGCTGGGAAGTGGTGGAAGGATTGAGAGGGGAGATGACTTACACCCAGGAGCCGCCTGCGCAGAAAGGATTTTTGCTGAAAAAGAGGAAGTGGCCCTTAAAAGGCTGGCACAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000010011:ENSRNOT00000013828:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.516 A=NA C2=0.026
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF154091=PH_8=PU(16.7=38.5)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]