HsaINT0018586 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000137948 | BRDT
Description
bromodomain testis associated [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:1105]
Coordinates
chr1:92005119-92014421:+
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Length
8906 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000137948:ENST00000362005:19
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.738 A=NA C2=0.581
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development