HsaINT0163650 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000136560 | TANK
Description
TRAF family member associated NFKB activator [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:11562]
Coordinates
chr2:161136908-161179761:+
Coord C1 exon
chr2:161136908-161137063
Coord A exon
chr2:161137064-161179613
Coord C2 exon
chr2:161179614-161179761
Length
42550 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTAATC
5' ss Score
7.05
3' ss Seq
TTGATCTCATTATTTTGCAGACC
3' ss Score
10.35
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Protein Impact
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Features
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains