GgaINT0027390 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000007631 | MEGF11
Description
multiple EGF-like-domains 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29635]
Coordinates
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Coord C1 exon
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chr10:17671844-17671900
Length
16129 bp
Sequences
Splice sites
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Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000007631:ENSGALT00000012349:20
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
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Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0005319=Laminin_EGF=PD(18.9=8.9),PF0200911=Rifin_STEVOR=PD(93.4=72.2),PF153301=SIT=PU(70.3=65.8)
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]