HsaINT0137704 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000075391 | RASAL2
Description
RAS protein activator like 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:9874]
Coordinates
chr1:178436469-178448648:+
Coord C1 exon
chr1:178436469-178436556
Coord A exon
chr1:178436557-178442209
Coord C2 exon
chr1:178442210-178448648
Length
5653 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGC
5' ss Score
9.88
3' ss Seq
CCATGATTGGTGTGTTGTAGGAA
3' ss Score
7.46
Exon sequences
Seq C1 exon
GCTAATGGCTGTGGAAGAGGAACTGAAGAAGGATCATGCTGAGATGCAAGCAGTTATTGATGCAAAGCAGAAAATAATTGATGCACAG
Seq A exon
GTAAGCAGGCTTTGAATCTAATAGAAGGCACTTGTTTATAGTAACGATTATTTCCTGACTTCACACCCTTGCAAATGCCAAGGCAGGTACCCAAAAATGTGTCATTGAAAAGTTCTAGACGCTACATTTTGAAGATTAAATGAGTGTCTGTGTGACCTCCATTATTTTCCTTTCTTTCACTGGTGAGAAGTCTGTTTACTCAGCAAAGTATTAGCGTGTTTAGTGCAGTTGCTTGACAAATCTCAACCTAGTGCATGATGGGGTTTGCTTCTTTCCCTATGGAAAGGAGGGCATTTTCTAAGGGCGTAATTGTGAAAAGTGCACTGCATGTGCCTGGCTTGTGACCTCCACTGACCATTGCTTGGCTGTGCTGTTCATGGTCTTGTCAGTCACGTCCACTGCCATCAACCTTTTGCCCCAGACAGTAATGGAATTGCCAGGGAAAGACAAGGTTGTAAAAAGGTACCTTTCCTTGTTGTTCTTTTGGTTTAGGGTTTGGCATTGCTGCTTGGAATGTGCTTGGCTGCTCTTCTTTGTTGGTGCTGTGCTTAGAGAGCATCTTTTGATAAAACTTTAAAAAAAGAAAAGGTTGTTGAAATCAGAACCTAGGCTTCTGCTCACTGTAGCTCACACCTGTGACACCAATGACATAAAGGCTGCCAAGAGCACCTCATAGGGACATGTCAATGATTAGAGCAAAATCCAGGAGGCAAGAAGTGTTTCTAACTCCTTTTTATTTTATCATTGCAAAATATGGTTGTATTTCTTAGGGTGAAACAAATAACAAAAAGCAGTTACAGTTTTTATAGTTTTGATAGTGGCTGATCTAGCCACTGAATGTGTTGCTTCCCTGAAGATAGCCGATCCAGGTTTGCATTTTTCAACCTTAAATGACATATCATATCCCTAAGCTGTGAAATAAAAAATGAGAGCAAGGATTTTATGCATAGATAGCCTCCTCCCTTCTCTAGGTATCAGCTAGTAATCAACATATTTTAGAGCCCCCAGTATTCTTAAACATGTACTTAACAGTCTAGTTTCCTTACAGAGTCCATGTGGAATGGGTTTATTTTTCAACAAAATTGAGAGTGAGGCTGAAAGCACGGTCGTGGAAAGAATGCTTCATGGGCCTCACACTCCTTTAAACACACTAGACTTGGAAGTCAGGTGAGAGTTGTGAGGATGCAATCAGCACTGCTCCTTAAAATATTTTGGATTCTTGAACTCTATAGTTTCTGGATACTTAGACATGCGGAGAATCAGAAGAAAGGTCTGTAGTAATTATCTTACTTGGTCCTTTGAAAGAAATCTTTCTAGATGCCCCCAGGGTAGGTGAGGTAAGGGTAGTGGAGACTAGGCCATCTCACTATTCACACTATAAAAAATCATCCCAGAGACTTAAGAAAAACAGCCTGGATAAATAAGGCAATTGAGTCAGGAAAACTAATGTTAGTAGGTTTTCACTTTGGAAATTTCAATATAACAATATAAAGCAAGAAGAGTTCTATTAATAACCACACAAGGAGAGATGTTAGTACTAAGAGATAAAACAGACTTTTTAAATAATTTCAGCTGGTTTAAAAGTATCAGTCTTGGCCAGGCAAGGTGGCTGATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATTGCTTGAGCTCAGGATTTCAAGACCAGCCTGGGTAACATGGTGAGACCCACCTCTACAAAAAATGCAAAAATTAGTCAGACATGGTGGCTCATGCCTGTAGTCCCAGCTGCTTGGGGGGCTGAGGTGGGAGGATAGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGCTGTGGTGAGCCATATTTGCGCCAGTGCACTATAGCCTGAGCGACAAAGTGAGACCCTGTCTTGAAAAAAAATGTAATAGTCTTAAGCAGAGGGAGCTTGGGTGTGCCACAGTTGTGGTTCTGTACACAGGCTGACAGGACAGCCTCATGATTAGCTCCTGAAGATTTCTACCCCACCCCCTAATTTTATATTAGGGCTAGGTGACTGGGTATAAAGCAGAAGTCACCTGCTAGGCATAGGAGGTAAAAGCCAGGGAGGGAATCTGATTTATTAGGACTCAAATGCTCTGGAAAGTAAGGACTTTCTCTCAGTTAACCAGGAGGGTGTCATGTGTAGGAATGGGAGAAATGCTATCCTCAAACCGTAAGTCACTGTCAGACTGGTGGTCTGCTAAGCTAGTTAATGTTTTCAGTCCATACTTCAAGACAGTGGTTTTGAAATGGTTTGGTTCTCTGGACTATTTTGGTAGAATCCAGGCACCTTTCATAAATGAATATCCAGCTCCTTCCACTGACCACTCAACAGCAAGGACCACACTCTCAACTAATGAATCAAATCATACTGGGATTGGTTAAATATAATAAATTACCTACCCAAACACAAATATTACTATATAATAAATTATTCTACCAGAGACCCACTGTGGATCCCTAAAGAATAGTTGGGAGAATCCACTAAACTATATTTGGAAAACCTCTGCACCATGCATAGCACAAATCCTAAACACTATAGTTAAATTTTAAAAAATTATAGTGTCCTTAAAAGGAAGGTTTCTTAATTCCAGCTGTTGGCTTACTGATACATTAAAATCTTATTATAGCAAATGACTTTAAACATCCTTTGGCATTCTTTGTAATGAATGACTTTTGTATCAGATCCTTTCTTTTGTAAGGATAAATCTTCTCTCTTAAGTGAATGATGGAGCAGAGCAGCCCTTCTGGCATCATTTAATAGAATGAAGACGTGTTTGGGGTGAAAGCTTCCCAGAGAAGTGACTCTTATGTCAACACTTCCCAAAACACTACCAGCCAGGTGCCCAGTAAACTGGTTTTCATGTCTCTCAGCAGCCCTGTGCTCCCAGGAAAATCTTGTCCCTGAATTCAGCCTCTGCCTCTTTTTGAGTCATTTCATGCTACAAGGCACAGGCCTGCATCAGCCACTTTCTAACAGGAACTGCAAAAGGATGAGCACTCCTTTGGTGAGTGGCAGAAGCACCTATCCTGGACCTTGTAGCTTAGGGGCCATAGGGATCCTAGTGGTGATCATAAGGATCCATTTCTTAAATATCAGACCAGAGAATGTGCCACCTTTCACCCCTGAGCATGAGGAGACACTGTGGCTCCCAGGATCTCTCTATGTGACTCAGGTGGAGAACAGAGAAGGGCTTCCTCCTATGAGAAGCAAAAGCAGCTGCCTAGTTACTGTTGCAAGTGATATCTCCGCTGTGTTAAATTACAGGTCATAAATGGAGATGAGATTATTCAAACAGGCAAGTAAACCCCGCGTCCGTTCTCTAGCTGAGCAGTTCCCAGCCCTGGCCCAGTGCACTGGCCTCCTACACATTCCAGCTCCTGCCACTCCCCACATGGGAATCCTTCCTGTCAGGTGTGGACTAGATTGCTTTCCCTTACAATCCAGGCAGAATTGAAATGTCCGAGCATCTTTTGTCAACTGAACTTGACTTTCATAAGTCTCTATTTGATTTTTTTTAACTTTTTTGTTTTATTTTGAGAGGTTGGCAATAGGGGGAAATACAAAGGGAGTTTCTTTATGTGGAAACTTTCAGCTGTTTAGTAGGGGGGCTGTTTGTCTTCAGTTGTTACCTTTTTAGGCAGTAAGTAATTACAGTCATTCTTAGGCTTTTTGACCCTTTAAAAATCAAATTTTTTATGAATTATTTATTTTTGGATGAACCCTGGAGAATCCTAATTTCCTTATGAGGCCTTATAATTTATCCCAGTTCTGAAATATCTTTTCTTTAATCGTTCAAGAAATTATCAGTTACTCAGTTTAGAGATCATTCCTAATAATGCGAGTAGGGAGGGGGGAATATCATACTTAGCTCTTACCTCTTGTTTTCTAGTATTCACTGGCCAGTTCTTACCTATTGGCTTTTCAAAGATCTATATTTGTTATCCCAGTAAACTTCATTGGTTAAAATTTTTTTAATAATAATTATTTTTTAAAAGCCTTGCAGCTCTTTCCTTTAGTTTTGTCTATCCTTAAAATGAATTACTTTCCTAAAATAAAAAGCATTTTATACCAGATGCATGGGTCATTAATAGTGCTGATTTTGTATATCTTACCACATGAGTTCTCCATCAGGGAAAGAAGGATTTTTTTTTAAATGATAATGACAAGCAAGAGCTAGTTTGTTGTTGTTTCTTTTTTTTTAATATACTTTTGAAACTGTGACCACCAGCACTGCTGCCTTACGGATCCTACCCTCCTGCCCCCAGAAAGCAGGAGAGTAAAGGGAAGTATTACTTGATGCCATGGTGGTATGTGATTTTACCTAGATTTTTCCCCCAGGGCCGTGGTCTTCACTCTGCATGCTCCCAGTAGCATGTGTCCCAAAGTGTAGCACTACATGACAGCCCTGGGTAGCTGCTGTTTTAATAGCAAGGAGCAGCACCAGCCCTGAGCCCTGCTACTTCCTCTCTGAACTTTACCATGACTAAACTTTACCATGCTTTTCTCAGGGTCAATTTTAAAAACCCCTAAGGTAGTAAAACTCCTTTTGGCTTTGGAGGTATTCCCTATGTGTTATTTTCTTTTTAATTTTACAGGCATAGGTAAAGACTGTTTCCTGCGTTGTTTTCTGAAAACTATAGACTTCATGTTAGAAAGGTTCTAGAATGATTTACTGAGCTGCTGAAGCTAAGATTAGGGTATCTCTTCTAACCTAATCCTTAGGAGACTGATAATGTTTTGATAAAATGATTTTATTAAAAAAATTTTAGATAGTCCTACTTTCCTTTAGTTAGACTGCCTATTTTTTTTCCTCTTTTCTTCCCCCTTGGTTTTTGTGTGTGTGTATTCACCAATGCTTGGTTTCCAAATATTGTTTCTAAAGCATTTTTTTTCAGAGACTCAAAAGTAAAATGAAAGCAATCTCCGTATTGGGCAGCCCTCCTGGAGTAACTTTGAGCTGGAATGGGTCTAGGAGCCTGTGTTCTCTGTTTGTTCTCATGTGTTATGTTGATGGCATTCCCTTTTCGGCACATCTCCCTCCCCATATTCAAGTAACTCCTTGGTCTGAGCTTTTTGGCTGCTTTTTTCCCCTCTTGCTGTTGCAACCTCACCTTGTTGGTGACTCTACACTGCCACCATGTATTGTTTTAATTTTGAGCACAATGTGAATTCCTTCCAAATGTGACTGATATGCCCTCTTTTGGGGCTAAGAACCCATAGATCACATGCTCTTCTCCTCTGTGAAATGAAACCTCTGGTGCTTCTTTCTTTGCCACCTAATTTCCATGTTTCAATTTTGACCTAAAGCACTTAGTATAATAAGGCAGCTTGATACCTGTGTTGCATAGTCTGAGGTAACACATGGTATCACTTTTACATGACAGTCTAATGTCCCAAGAGATTGTTAATAAAAAGTCCTGCTATGCTGAAAGAAAAAGAGAGAGAGAAAAAAATAAACACAGATCCACTGGGCTCAGGGGAAGCTGAACCTGACCAGTGTGCAGAAAGAGGCAGAGACGTTCCATTTGTCTGGGAAGCACCATGCATACAACTGTTTGAGAGAAAGCACTGGACTAGTCATTCAGTAAAGAAAGCGTGTTACCTCCTGCCTGTAGCCTGAATAAAGCCATGATTGGTGTGTTGTAG
Seq C2 exon
GAAAAACGGATCGTGTCCCTGGATTCAGCCAACACCAGACTGATGAGCGCGCTGACCCAAGTGAAGGAGCGGTACAGCATGCAGGTCCGCAATGGCATCTCCCCCACCAACCCCACCAAGCTTTCCATCACGGAGAATGGTGAATTCAAAAACAGCAGCTGCTGACGGGCTTTGTCTGTGGAAGGAGACAGAAGGAAATTGACCCACTCTCCTATCTCCAGACCTTTACCTAGCCCCTCCAGGTTTACAGAATGTTGCTACTTCACAATGGCGATGTGGTGAGAAACTCCTGAATGAAGAAAGGAACCTTGTCTTTCAGGGCATAAGGCGGCGACTTCCAAGGTCAATGCTTTTCCCCCACATCTCTATGTACATAGGGAACTTAGTTCTGGGCCATGTACAGAAAATATCACTGTAATATACCAAAAGGAAGTTAATAATGTAGATTACCTTTTTGATTATTGCTATTTTTATTATTGTTTTCCTCTTGTTGAAAGCACTGCAGTTGTTACAGGAAGTAAAGTAGGAACTGTTGTGTGAGCGAGACATGAGCCTGTAGGTTCAGTAGGTAGAGACCAAGCATCTATCTGATAGAAGCACATGGAGTGCAATAGGACATTGTGAGAAGGAATTTTTCAGGGATTCATCTACTAGTTTAAAAACCCCACTCTGGCCCTCTTGTCCTTTCAGAAAACATGCAAATACCAAGATCCATACAAAACAATAATTTATTCCACTGATCAACCAAGACTGGTTCTGGTTGGACAGCTAATCTGATTTGGGGATTCACTGTTTCAGAGGACACAGACAAAAGCTGTTGCATCAAAACTGGACTTTAGGAGTAATTTCTATTGAACTCCTGTCAATATGTTTATTTCCTCTGTCTACAGCAGATGGGAGTCTTCTCTTTTAGACAGGGGCTTTTTGTTTTTAACCCCAATTGTAATAAAGGGTGTTCTTTTTCCTCTTTAGAGTTTACAAAACTATAAATATTTGTGTCTCCACATACCATCTTCATCTTCACACATTCACTGTGCTTTCCTCCCCATAGTGGGAGCTGTCATCACCAACAGGGTTTACTCTCCCCTGGAGAGGTTATTTAAATAGCTGTCCATAAGCCATCCAGATCAACACCCTTTCTTCCATACAGAAAAGGGCTAACCATACCACAGCTGGAATCTCTGAATATTTCCTATTAAAAATTTTTTCTATGTGTTGTTATAATTTTTGTTTGGGATAAAGACTCTATCCATTGTACTAGCAAATCTATGGGGGGTAATTTTATCTCCATCTTTAACTTTTAAAGTACTTCTTCCCCTTATCCCCTCAATAAAGAAAGGAAATCCAAATTTGAAGCATCACTCTCTTAAAAGAAAAAGAAAATAATGGAAAGTGTCAGGATGGCACATTCCAGTTATTATTCCAATGCTCGTAGATCTGACAATAATGACCCAATTTCAACACTTGTCATCCATAGCCTTATTATTATAGAACAGAAAAAGTCATGGAAACGAATTCATTTCCTTTTTTCCAGAGGTGTGCAATGTCATCTTGAATGCAACCTTGATTACCAGAAGTATGGAAGGTTACATGTTAAACAGACATTATATATACAAATATATATATAATATATATTCACACATATGTACATATAACTGCACAAATAGGAAAAGTTCATGCCTTCTATGCTGTTCAGATATAATGTTAAAAGGGTCTCAAACCTCTTTAAGCAAGATCTAAGTAGTTGTTTTATATTGAGAAAGCAACAATGTTTCTCGAATAAGTTGATGTTGATTTTAAATTATAAGCTTTAAAGAATTTTTTTTCTAGAAAAAGGGGATGGAAAAAAAAGGACCTGAGGGAGCCATATGCATCAAGTGAGTGTTTCTCCATAACAGAATATTTATAAGAGAACATGTATAGTGCCCTCTTTTGAGTGATGCCGACAGACACCAAGCCCTCCTTTTCACCAAGTCCCAGGCTTGCATTCCAGCCTCTTGAGCTCTGCCCTCTCTCAGGTGGATCTTTGTGTTGGACCTTACGTTTCAGCAACCTCACCATGGCCACATAACCCACAACCTTTTAAAACAGTTTCTTTCATAGCAATCCCTGTTTCTGCCAGACAGATCTAAAATGGGAGTTTCTCACTGTGTTTATCTGATCTGCACACTTTATATCCAGCTGTTTTGGCACTTTTACGTTTTCTTCACCTTTGGTTTTGGTTTGCAAATTCTTACACCTTCTCTCCAAGCGGAGGGCACACTGTGGTCAAAATCACTTATTTTATTAGGAAAAAGAGGTAACTGTTCCAAAGTGTAGTGTCCTTTGTTGAAGGAGGAGGGATGTAAGCATAGATTTGTTCTTGTTTCTGGCTATTCTCAGCTCAAGCCATGTTTAATTCATTCTTTGTAAAAGCCTTCAATTGTGCCACAGAAAACCTGGTAAGAGAATTGTCAGTTTCATTGGCCATAAGTATGTAATGTGGGTGATGTCTTGCCATTGAGGTTTGGAAGCTCTTAAGTGCCGATTATGGATTACAGAGGGCTGATAAAATTACTTATATTGGGAATTGAGAGAAGCCCCAAAAAATCAAATGTGCTTTTGATGGATAGAGTGTATCTTATTAGCATTATGGGAGCTCCTTAGAGGGCTGTCTTCACTGAAAGATTTAATGCCCAAAACATTTGGACAGATTATGCAGCCTTCTACTACCAGGTTATCTTGAATGAAGAAGAAATAGTAAAAAATAATAATAATAGAGCATTACCAATAAGCTAAAAGTTCAGAGTTGCTGATAGATGTTAAATGTTAAGTTATCCTGTGAGCCTACTCCTGTCCAACCTTTTTTCTCAGTATTTCTTTAGAGAATGCTGCAATCTGTATAAGTTACTCTGAAGGATTTTTTAAGAAGAGAAGCCACCAACAGGTGATAATTTTTATGGAGATGTTTCTTAATTGGCTTTCCCTCAGTTCAAGTAGGTAAATAACTTTGTTTGCTGGGAGGAGGTACATGGCTGAAGAGAGGCAAATAGATTAAGATAGCAATGTCTTGCACTTCCTGTTTCCCTCAAAACAACACCACATTGTGGGGCGCAGGATAGATCAGGGTTGAGTGGAATTTGGAATTCAGGTGAAGTGCTTGTAAAGTGCATGTCTAGCTGACAACAGACTTGACCATTAATGAGGACAGTGTTGGTAGGAGTCAGAAAAGAGCTTCATATTCCCCTTTTATATTACTGAAGCAATAAGCAATCTGAGCTGAAGCAGCAAAAAGAGTCACATTTCCATCAGGTCATCATATTCCCTGAGTCTCTGCAGCAAAAGCCATGTCAGAGGGGAGATTATAACTAGGTAACTATAACAAGCACTTGAGCACTTACCATGTTCCAAGCACTATCACCAAGGTACTGTTGGGGTTTATGGCAGTCTAACGGTAAGAAAAATGTGGTAAAATGAGGTAATCATGCTGCTATAGCTTTTTGCTTTTTTTCATATAGTATCAAGTTGGTCAGAATTAGCTTTCTCTGACTGGTCTGCTTCCGTGTTTCTCTGTGATGGTGTTAAGATTATGAAAGAAAAAGAAGATTACCTAAGACTGCTACAAGTGTTAACTATATGCCCTTAAGAATGAGCTTGACTTTGGAAGTAAAGCTTTTCAGATCTTAGTCTACCCGGGGCCTTTGTTGATGGGTCTGTGGTTCTGTAGACCCCTGGCTTTCACTGTGTTCTCAGAGGTACACCAGATTGAGAGCAGAGTTCTTCTTTGGAAGTCCCAGAGCAAAATAACTGCCATCAAGTGAGTTTGCATTCGTATTTGTTTCCCCTTCCATAGAGGGTTAGTTTTAGTTACCTCTAGCTTGGAGTTCCTGAGAAGGCTGGTTATAGGACTGAGCGTGGGAAAGGAACCCTCTTCAGGATTACCTCAGTCCCATCAGTCTACCCCATTGTGACATTGAGCCCAACACACACGCTTGACACCAGACTAGACTTGTCACAGGGCCAAACCCAACAGCCACATGCCATAGCTTCACTGCATTTTCAGCTACACCTTTGGAGGCCACCTTCTCCTATCAACTGTGGAAAGCCAGAAGGGCTCCCTTCTCCATTCTCCTTCCCTTTTTCAAGTCTAATAGTGAAATCTCCTGCTTACCCCAGCAGTAAATAGTTGCCTTCCTACCCCTTACCTGGGGGCCGATAATTTGAGATACTTTGTTTTTTCAATGCGTCAGTTGAAGGATTTAGTTTCTTAAAAGCAAGAAATGTTGGAGTGTTGAATTTTTAAATAGAATCTCTTTTCATGTTTGAATGATTGTTATTAGTTCTAGAAGCATTCTCTTTGTCATGACCCGATTATGTATACTCTTGGGTTTAGGAAGGACAAAAGTGATGAAATTTGCATGAGATAGAATAAATATCTTAGGAGGAGTGAAAGAACCTGAGGAAGAGACACGACCCTAAGGGAATGAATGCATAAGCAGTCTTCTCAGTAGCCCAGAGTTTCCAGGAAACAGGAATATTTATATCCCTTGCCCACTCTTAAAATACATAGATACATAAAAAGGCAGTCTCTGTAGACAACACATGCACACACCCACACAAAACATAATTCCTGGGGCTTCCTTTTTCTGAATGTTAATCCATTTTATCGAGCAGTGATTCCCAAACTTTGAGATTTTCAGATTTTATGCTCTCGTCTGTTAGATTTTATGACATTCTATCATCCTAAAAAATGTACTATATGTGTTATATGTATATATAAGTTAAAGCAACTTGAAATTGACTTGGTTTGGCATTGTCTCAAGAACCCTAGATATCATTATTGATACCATGGGGAATCATAGAAATAAAGTTGAATATCATTGATCTGAGAGTAGGATCCAGAAATAAGTAGTTTCAGTTCCTGATCAGTTAAGCCTCAAGTGTTTGAGTAACCAACACAGCAAGACTTGGGAAATGCAGTGAGCACCCGAGGAAAGGAAAGTGGTAGTCTTTGCCTGCATTTCAGCATGCATTTTCCTTTCCTACTCAGTTGCTATCTTCCACTTAAATACCCTCATTTGACCCTAGGAAGTTTTTTGTTTTTTTTTTTAGTTTGAGACTTAAAACCAGATTTATTTGTTGTTGTAGAGAGATTTCCACAGAAGTTGTGTTTTAGGGACCTCCATCATCTTTGTGGGGGTACAGATATTTATGTGTAAATATCATTTTATGTGATTTCCAAATTTTCGAGGGAAACATTTCAATTCCCAGTTCAACAAAAGGTTAAATACTAATTGACTCAATGACCACCTTCAGGAAAGTTAAATAGTAAATTAGGTTAAATTTTGACTGGTGCTTAGACATTTCCTAGTTATATTAACTTAAGCAGACAGCAGCACATTAACCTGAGTTACACCTGTGAGGAAATGACCTTCTAAATTTGATTTTGTTTTTCATCTCCAGGGCCTTAATAAGAGTGTGTTAACACACGACTATTTTACAATGATAGCTCTAAATAATTTATTTTTTATTTCAAGAAAGAGAAATACACCTTAGAAAAACAAAACCCAAGATTTTATTTTATTTTTAAAGCCATATTTTTGTGCTAGTAGCATTTAGATTATTCCGTATGTGAGATCCGTATCAGCATTTCATTACCTGGGTTTGTTCTAAAGAAGATTTATTTTTGTTCTGTGAATAATTTTTGACAGTTCTTGTACATGTACAGATATAGATACGTTTGAGGTCTTTTATTGATATTCCTACAAAGAATACAAATAAACTTTAACTTTAAACATTTCAGACTAAAGTTGCTACTATATTTGACATATTGCTGTCTTCTAGCATGCACCTGGGTGACTAGGACACTTGAAGAGAAACAAGAAAGGAAATGTATGCCGGAATATTCTTCTAAAAATATATTTTAACATTAAGAACAGTCTGTCCTAGAATTTCCCAACTTCCATGTAATAAGATTTCAATTTAGGAAAAATAACTAGCATTAGCATGTATTGTGATAAAACTGTTACTTTCGAATTCTGCAGAATTTGAAATCTCTTTAATAACTTGTGACAGGTAAAGAAAGTTTCATCTGGTTTATTAGGAAATGTAGCCCCACTTAGCTTCCTAGACCACTACCATCCTCTTGTAATTTTCCAGTTAGATTAATGGGGTTTGTTTTCAGGATTTTTGATGTTTGGTTCAGGTTTTTTATTTTAATTTCTTAATAGAAGTTCATTTGTCATTCCCAACATGATTGTTCCCAAATACACCCATCTTCTCCTGCATCCCTGTTTCATTCTGTAAAATCCAGGGATGCAGGTTTCATGTGTAGTCTTGTTTTGTGTTAGTTGTAGGTCTGTGCTTTTTGGCACATGTCGAGTTCTTCCTAATCTTGTTCTACTAGGGATTAAAAAATTAAAATTTACTCAAAATCCAGAGAAGATTGCATGAAACAGAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000075391-RASAL2:NM_004841:15
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.270 A=NA C2=0.666
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF120043=DUF3498=FE(5.8=100)
A:
NA
C2:
PF120043=DUF3498=PD(4.8=43.6)
Main Inclusion Isoform:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)