HsaINT0137704 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000075391 | RASAL2
Description
RAS protein activator like 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9874]
Coordinates
chr1:178467334-178484147:+
Coord C1 exon
chr1:178467334-178467421
Coord A exon
chr1:178467422-178473074
Coord C2 exon
chr1:178473075-178484147
Length
5653 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGC
5' ss Score
9.88
3' ss Seq
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3' ss Score
7.46
Exon sequences
Seq C1 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000075391:ENST00000462775:15
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.153 A=NA C2=0.591
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF120043=DUF3498=FE(5.8=100)
A:
NA
C2:
PF120043=DUF3498=PD(4.8=43.6)
Main Inclusion Isoform:
NA

Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development