Special

HsaINT0145961 @ hg38

Intron Retention

Gene
Description
sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10596]
Coordinates
chr12:51794371-51812864:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
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Length
11640 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TGGGTGAGT
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Protein Impact

Alternative protein isoforms

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Features
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NA
C2:
PF0052026=Ion_trans=PD(79.0=43.3),PF0061222=IQ=WD(100=5.5)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Autistic and control brains
  • Pre-implantation embryo development