GgaINT0078656 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000016409 | KIDINS220
Description
NA
Coordinates
chr3:98749721-98762617:-
Coord C1 exon
chr3:98762391-98762617
Coord A exon
chr3:98749868-98762390
Coord C2 exon
chr3:98749721-98749867
Length
12523 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CGGGTAAAT
5' ss Score
6.15
3' ss Seq
CACCTTCTTGCTTCTTGCAGGGA
3' ss Score
10.41
Exon sequences
Seq C1 exon
ATGTTCGTGCTGCAAGAGATCAAATGAACATAGGAGGACTTCCTTATCCCACATTGCCTTTACATGAGGCACCTGCCAGAGCAGCGTCTCTTTTCAGTCAGCCTTCATCAGCCTGCTCTTCTACAACCTCTTTCAATGGACCTTTCAACAGTGGAGTTCTATCACCCCAACCTCACAGCAGTTACTATAGTGGTATGACAGGACCTCAGCATCCGTTCTACAATCGG
Seq A exon
GTAAATAATCAAGAACCAATTCACATTCTTCTCATTTGACCTGGTAGTATTGCATGTGAAGTCTGTGAAATGTTTAAAAGACCCATGTAAATTATATTTAGAAATGGAGCCTTGTCCAAAAATCAGTACGTTTCACAGTAATGTTTGCTCTTGTAGTCTCTTAGGGAAATGTGGTAAATTGCTTTAGAATATTACCCAAAGGGGGAAAAATGGTCAAACACATTGAGATATGCTGCTTAGTTGTAGGGTATTGCAGGTACTCTTTACATGTATGTACACATACTGCTTTTTAAATGGTAAATTCTGCACACTTCTTCACATACTCACAGTCATTAGAGAGGATCCTGTATTTTTCCTTGATAAATTAGGTAAACTACAGAGACTTAAAAAAAATAAATAATAAAAATGCAGAAACTTTGTAGGAACTGCTCAACAAGAACGTTTCAAGACATGTCTTCCCTTTTATCTCTTTTTAAAGTTATTCTGGGATCTTTGTCCTTATCCAGTTCTGCACTAGTTTAAAGAATTAACATAAATTGCATAAACCATATAATTTTGAGTTATTTGTGGGCATCAGAAAACATAGTCCTAGACGTGGCTCACTTGTAATTTGCAGTGCTTTACTATATAATGGGATTGTATCTAAACAGTGTAAGATAAACTGTTCTTTTTAACACTGTTCCAAGTTATTAAGGTATAAATCAGCTTATTAGGTGGGACAGCCATTTATGAGAATGCCTTTTTAGATGCATTTTACAACGATATTCGTAGTACTGATCTACTTAAACTGATTTAGTGTGTAGTTATTTAAAATTTGAGCGTGCTCCACAAGTAAATTGTAACTTTGTATTTTTGTGAGATAGATTCAGTATTTTTAAACCTTATTTTTTCCTTTTTTTTTTCCTGCAATATTATCAGGGAGAAAAAGATATTCAGGAAGCGGATGCAAGTCATAGATTGTTTCTGTATGCAGTTTTAAGTAGTGAGGTATGATAGTAGGCTAACTAAGGTAGATAGTAAGGTTAGTCTAATAAGCTGGGAAAAAAAAATTGAGTTATTCATTAATGTTCATTAACCAAGACAGAAGAGAGTATATTTAGCACAGAGCCTTTTATCTGTTCTAACATTATTCTTATATTGACAGTATATTGAGCATATATACTGTTTTGTTTAAAATAACTTAAAATGATGTGTTCTTTGCCCAGTAGTGACGAATGCGTGTCTTAATAATCTTCCTGCTGATACTGACTCACTTAATTCAAGTGAGTGTTTAATTGGTAGCCCTGTTTTTTGTCTGTTCCTGTACATGACAAGGTTTTAAGTATGTGGTAACTTACAATTGAAACTTAGATGTTTTTTATGGCTCTAATGGTCAATAAAGAAGCTATTATTGGTGAGTCATTAGCTGTTTTTACAAGTATTCCATGTGTTCATTTTTATCAAGTGAATACATGGACTTCCAGGCATGATTATTTTTTCCTTTTTAAGACTCGAGTGTTTTTATTTTGGCCTTTCTCTAAGAAATTTTATACTGCTTTTCTAAGGTATAAAACACTGCATACTGTGATAAATAGTGAGAACCTTGTAACAGTAGAAAGGTTTTCTGAGAGCATTTTCAATCACATTTTACTTCTGGAAGAATGGTGTTTAATAAATGACCACTGACAGATGAATAGCCTCTCCTCAGCAGTACAGTATCTGAGGACGGTCTTTGGATACCAAAGCGGGGTCAAATGCTGCTCTGGAGATGGCTGAATTTTATGGCAAAGTGTTCTTAAGTTCTTCGGATGGGTACATTGCCTTTTTCTGACCAGATAATGGTTCCTGTCCTGTTGTTTATCAGTGGTCATTTGTTCTTAAGGAAAAAACAAAACAAACCTTTGAGCTCTTATGTAAAGCTCATGTTGCTTGTCTTCAGAAAATACTACTCCTATGTTCTGTATGTTTCTGCTTTGTTCTTCAGATGTTCCTGTGTTATGCTCTTGAACTTCCAGTCACATAATCTCTTCTTTTTTTTTTTTTAAGGCCCCATTCTCCCTGTGCATTGCTGTGTTACGGTTCCAGTTCAGCAGCTTTTCAACTTGGTACTTTTGCTCTCAGTTTTGGATAGTGATAGAGGGCTAACAGTTTACCCGTCTAGTTCCCTCGTGACAAGTTGGTGTCAAGTTCAGCTTCCCTAAATCTCTGCTGTCACAGAGCTCATGTTTCTAACAGAGAAGATCAGAGCAGTAGGCATGTCTAAGTTAACTGAGTGGGAACTAGAAATTATGGCATGTAAGGATTTTATTTGATTTATTTACATTGGTATAGCAGCACGTTCTTTGATAACGGGGCTGTGCTTATGATTTAAGGGCTGTCTGCAAACTTGGAGAACAGCTCTGCACTGGTTTATGCCCAGTGTGTATTTATACTGATGTCATGTTTTCACAATATCTGTGTTATCGTACCTTGAGAGTTGAGACTGCAGAGTTTAAATTTGATATTGGAGAATTAATTCCACAGGTGGGAAGCAGTGGAGTAGCTGAAGCAGGCACGAGGCATAATTAGACATTGTGAAAAAAACTGTGGTATAATTACCTTATTGGACAAATTTTTTCATTGCTTCCTAGTTTGATGACTCGCAACCAAAAAACAGGTGCTCACTTTGTTTCAGAGGGTAGTCTGCAGCGAGAGCTAGGCGTGTGAATGTGGTATCATAATTAAGCATCTCATGCTTGTGGGTTTTCCACGTGGTTTAAGCTGTTAGTGGAAAATGGAAGCATTTAATTATTTGAGAAATAGCAAACCTTTTTTGAGAAGAGTTTTATTTCCACGACATACCACAGAGCGTGTGCCTCTTGGCAGTGGATTTTCTGAATCGTCCTGTGCTAACCAATAAGTATGAGACAAAGCCTAGGCTTTGGTCCTCCTGCCTATTCAGCCAACTCAAGTTGAAAACCACAGAATAAACAACTCCCACGTTCTGAGTAATGATAACAGTGCATACCATGCATCTTCATATGTTGGAAGAGCATGTGAACTTTTTGTGGCAATAGCCTGAAAGTGTGTGCAAAGACTCCCTGTTGCAGCTAAGAATAGAGAATCGGATGTATTTCTTCGTAATTACTCGGAGTTGGTGCTTAGGCCATCTTAGTTGATGCACACACGAATTGAGTTTTCATCTCTCCATTCATTTACTGCTGCTTCTGAATGCAGAATACTTTTTTGTTTTGATTTGTTATTGTCCTTGCTGATCAATTCAAAGTGGAATGTTTCCACAGGTTTTATTCCTCTCTCCTAGACTGGCCATCGAGTTATAGCATGGTATAGTCTACACTAAATTTGGTGCAGTGGTCTACTTAAAGTCTTGTCATGTGCAGAAACAGAAACCAAGTAGTGTGTTTTGTTTGTTAAATGGTTAGTATAATTTTTAAATGTTACGTATAAAACGACCAGTATGTTTTTGAATTGTTTGTTTTTTGTTGGTTTTTTTTCTGTTTCATTGCTTTTGAAGATCCCAGTAAAGAATTGAATGTAAAGAGTTTTATAATCCTCCTTTTCATGAAGTCTGAAGACTGTTGGTTTTCCATTATATTGCCTTAAAAGGGAATTCATAACAAAACGAAGGCCTTTACTTCCAAACCTAATTCAAATTCATGGATAGGTCGAAACCAAAATTTAACAGTATTGGAAAGGCCTTTCTTAAATGTGTTACTGGTTGTAAGGTTTGTAATTCTCAAATGTACACACAAGCACGCATTGCAGTCGCATGGCAGTGGGTACCATGTGGATTTCAGGAAGTATGTTTGTGCAGCTGATTTTAGCACTTAAAGGACTGGAGCATATGGAGAACTTTGTTCAAAATGAAGTAATTTGTGATTTGGAGATCCCCGTATCTCTTAGAAGTGACTTCATCAACAATCACTTATTAATATCACTTATTTTTTGTACAACTGTTTCGGGTACTATGAAGCATTTTACTGAAAATCGGATCATGAGTTCAGCAGCTCTGAGATCAATGAAAAATATTAGAAGTGTGAAACCTTATCACGTTGTCAAAACAGCTGTTAGTGTGTAACTGCTACGAGCACCCTAACTCTGTTCCTCCTGCAAGCCACGTTGAGGCACCTGCTGGCTTTGGGGGGAGGGAGGGTCAGTTGCTGAGGGGTTTGAGTGAAGAACTCACTCCAGAGCTTTTGACTGAATTCTGCTAAGTGCAAAAAGTAAAGAACGCTGTTAATAATTGCTCTTTTCACTTTGTTAAACCCAAGTAGGGAATATGTTTTGTTGAAATAAGTTTTATTTTGTTATTACATTTTGATTTGTGTAATTGTTTGTCCCTTTTTTTTTTTGTTACATTTATTTTTTTTTTCCATAGCCATTCTTTGCCCCATGTCTTTACATGCCAAGGTATTACCCTGGCAGTTCTCATCTCATCTCACGTCCACTAAAAACGAGTTTGTCCAGAGATCAGAGCAATGGCCTAGTAAGTATTTTGAAGGTTAATTCACATGCTAACCTAAACAATAAGTATAGTAAATAATGTAAAGTTGTTAATGATGATGCAGTATTAAACAAGTACAAGCTCTATTTCATAAATAGTTTAAGCAAAGGTGTTATTGATATGTCATGTAAAATGTATTTTGTTTTAACTTTAGAAGCTACTGAGAGTTGAAAACAAATTCTATCATCCAGATACCGAGTTTGGAGGAGTTTAACCTTGTAATACTGGCAGGAAAACATTTCAGTCAATGTGCCAACTGTGCTGCAGTAAATAAACTGATAAAGTACAAAGTTCTAAGAAAAAGAGAATGCCAGTGATAAATTTATATTCAAATTTTATAATAATACAAATTCTGTGACATCTGGAGAAGATAAAATTACATCTCTTCATGTTGTAAAGTTTTCTACAAATAGAAAGGCCAAAGAAATAACAGCAATGTTTTAAACATCCATGTAAAACAAAATACATTTTGTCTTAAGCGTGCATTATAGCCTGGTTTTGTAAGTACATGTAATTCAACTTTATTTACCCAGTGAAAAGGAAGAGCTAACAGTCTTTTCTGGCATCCTATAGAATAATACAATTCCTATTAAGAATATTTATTTTACTGACAGATGGCTGTTCAAATGGAGTTAAGAACTAAAGAAAGCTTAAAAAAACCCCAAAAACCCACAAAACAGTGGCGGTAAAAGCCTTACTTGTCACTGCTTTAATTCTAGGATATTGATACATTGAACAAAGCTATCAAAAGGCTTTAAAATCTTCTTCTTTAATCACAAACAGAAAACAAATATGTTTCTGTCGAGTTCTGTATTATTATGAGATCATTCTCATTCATTATTTACTTCATATTTTTTGTTTAGCCCTTGATCATTTTACCCAAACCATAATATTTTGTTGTTGCTAGGATGTTATCAAGGAGGATGCTGATGAGGGGCTTTCTTCACCCACAGACCCCTCAATGGTAAATGAGTAGTCATGTGGTGTGGAAATTTTAGCATCTCATTGCTTTTTCAGCAGTAATGAGTCTGCATTAATCGTAACTGCAGTTCAACTAACACTGCATCGGTGGCTTTGGTGGGCATAGAGTAGCTGAAAACTAATGTAGTTTGTGAATGAATTTAAGAGCTAATATTTCACTTATAAGATATAGATTTTTTTTCCCCTGTAGTTTTTCCCTTGCCTTTCTCAGTAGCTGTTGTGTGTATTGTGGTAGCTAAACAGAGTGAAGAATGACAGGTGGTCATTTGTGACTTAGATTTTAGAGCAAAGTAACTTTGGTGTTTCCTGCTTTAGTCAGCATTCCTGATCCCTACTTCTTTAGCTGGTAGCGTAGAGCTGTTGCAGTTAATGCAGTATGAAGCAGCGTTCCATGGAAATAAAATAACAGGCCATAGGTTAATTGTTGAATCAGAATGCTAACACTGATATTTTCTGTGACTTGTTCTTTGTTTTAGTCTCAGTATTTGCACAAAGATGTCGTCTTTATGGGTATCTGTTTTAATTCTAACTGGGAATCAGTGGAAAGTCGTGTGGAGATACTGCCACCGAAGAGGTTATACAGTTACAATCATTTTCTTAACTATTGCTACCATTGTTGCTGTTGGCAACACTTAAAAGTTAAAGCTGCAGTTATTTTTTGTTTGTCCAGTGAATCATTACAAAAATAAGTAAATAAATCTGTGATACAGTACAATGTTAAAAAAGAAAGAAACAACCTACAAACACACAGATTCCAGAACCACTGTATTTAACTGCACATAAACTTCATTTATCAATTATGAAAATGCAATGGAGAATTTACCCTCAAGTTCTGTTTCCCAGGTCATCTTCTACCCTGAGTGAAGGGATGACTTTGAGGTAAATTTTTCTTGTAGTATAATTTTGGAGATGCTGATGTCTTCTCTGTATTTGATTTATCTCAGTATCCTGTTGTCCTCCCAGTCCTTTGCAGCTTGTCAGTGTGAGAAGAGAAAGCAGTAGAAGTATGTGTTTTTGAGTGTAAGAAAGGGACATGGGAGTGAAGAGTGGAAACTCATCTCAGGGTGAAGTAGTTCATCAGCTCCAGGAGCAGACCTGGACCTGATTGTTCCTCTGCTTGTTACCCTCAGTGTGTATCCTAAGCAGATAGGCTGCAGGTTCAAACAGTTGAAAATACTTGTGAAATTTACAAGGTCTGATTGCTGTAGGTTAGAAAATATGAGAGTTACAACGTAGGAAAGAAACTTTGATGTAATGGTAATGGAGGATTCCATTATATCCATTTTTTCAGAGTTTGCCTTACTGTGAAACTCAGTAGTACAGAGTATGAGATTATATGCTTTTTCTGAGGTTTACTCTACGTTGTCAGTGTAAAATTTTGAGTTTTTGAAGATCTCTTGGGTAGTTTACAATAATGTTGTTAATGTGTGGCATTCTGTGTGCCTGACAGGTTGCCTCACCAGGGTTTCCTCTATTCTAAAAACACTTACTTTGCACTCTTCGTTGAAAGTGCAGTGAAAGTGAGCAGTGAAAGTATTATGCTTGTTGAAGACATTGCAGTTGTCCATAGATCATAGTTACAATAATTCCATCCAGCTACTGGGTTGTTCTGAATTGATGGATCACTACCACCATATAAATGATGAAGTTTAAACTTAGATCTGAATATGCATACTGGTGCATGTAAATTAATGAAATATACTAAAAAAAATAATAAAAAGCAAAACAATCTGCATTGAGTAGTTAATGAGCACCAATGCTTCTAACTGATTTGAGGGCTGAAAACAAGAGGGGCATGCAGAATCAGAACTGAATTTCATACAAACCTAGGAAGAAGCCAGAAACATTGCAGTTCTACTATTGTGTGAAACAGAGTAAATCATTATTTTTAATGTGACAGGGCAGGAAACAGCTGCTGCAAGAGCATAACTTTTTAATACAGACCATCATTGCTACTCTTTGCATGAGCTGACAGACCTGTGCTGAGACAGCTTTGTGAACAACTGAGGCCATCTGACATTGTTGGCCATCTGACATTAGGGTAGAGTGGAAATCTAAAATTCCAAATCCTAATATTACATAAAACCAATGTAAATCTGGGTTAGCTTAATGAAAATGAGAATACACTGAGAGCGTACATCATATATAAATAATCTGGGAAGCTGTCTTTAGGGACAAAGGAATGAAATGCAGCTGGCATTCTTTGAGGACATCTTTGTTACAGAGTGCAGGAGCTCTCCATCCTTACATGTAAGAAATCAAGCAGGGGAAACAGGAAACCAGTAGGGCTGAGCAAGGACCTGCTGCTCAAACTGAGGGAAAAGAAGGACATGTACAGGGAGTGGAAGTAGGAATGTGTGGCCTGGGAAGAGAACAGGGATGCTGTCTAGACATGCAGAGACAGGATCAGGAAAGCCAAGACACAAATGGAACTGAACTTGGTGATGAGGGATATAAAAAGTAATAAGAAGGGATTCTGCAGGTACATGAAGTCAGAAAAGAAAGGCTGGGTAGAGTGTACCCCCTCTGATAAATTAGAAGGGAGAACTGGCTGCAGCACGCCTGGAGAAGGCTGAGATAGTCAGTTCTTTGCCTCAGTCCTCACGCACAGTGTCCCTGAACCTCTGGATGAGGTTGGGAGAACAAAATCCCTCTCACTGTAGGCAAAGAGCAAGTTCAAGACTACCTGGTAAGACTGAATGTGGACAAGTCTATGCATTCCAGGGTCCTGAATGAACTGGCTGATGTAGTTGTTGAGCTACTCTCCATCATATGTGAAAAGTCGTGGCTGTCAGGTGAAGTCTCTGGTGACTGGAAAAAGGGAAACATCACTCCCATTTTTAAGAAGGGTAGAAAGGAGCTCCTGGGGAGTGACAGGACAGTGGGCCTCATGTCCATGCCTGGGAAGATCATGGAGCAGATCCTCCTGTAAGCTATGTTAAAGCACTTGTGACGTGTGAAGGTGATCTGAGACAGCCAGCAGAGGTTCACCAAGGGCAGACTGTGCCTGACAGTCTGGTGGCATTCTTCAATGGAGTGATGGCATCTGTGGACAAAGGAAGGGCAACTTATATCATCTACTTGGACTTGTGCAAGACTGATACAGACCCACGCAACATTCTTATCTCTAAGTGGGAGAAAGATGGATTTGGAAGGTGAGCTTAATCATTGGGTAAGGAATTAGTTGGAAGGTCACAGTCAGAGGGTTGTGGTCAGCATATCTGTGTCCAAATGGAAGGTGGTGATGAGTGGTGTCCCTCAGGGTTCTGTCCTGGGACTTTGTGCTTTTCAAAATCTTCATCAGTGACATAGGCAGTGGGATTGAGTGCATCCTCAGCAAATACACTGATGACACCAAGCTGGATGGTGCAGTTGATGTGCCAGAAGGAAGGGATGCCATTCAGAAGGACCTGAACAGGCTTGGAAAGTGGTTGGGGTGGGTGGGCTGCGATGTCCCTTCCAACCCAACTATCCTGTGATCCTATGTACTTCAGGATAAATATAGGACACCCTCTAAGAAACTGGAAGTGCTTTCTTACAGTTTGAGCACAAATGAAGGTATGTGGCATAGGAGTTCTCTTTTTAAGTAATTTCCAGGTGCTTTTATGTGGCGTTGTTGCACTTTGAACATTTACTTGTTAATCCTGTCGTTTGTTCTTAGAAGTACTGCTTCAGTTCTGTGAGTGTGAATTTTTATTTAAAAACACCATGCTTAGAAACAAGGCTTCAGAATTATTTGAGGTAAAGGGCTGATGTAGTGTGATCTTGAAATAGCAGGAGAATGTGTTTAAAGCTAGTTTTTCCATTAGAAATATAACGTAAAACTTCAGGGCAAGCAAAGCGCAGAGTGTTGTGCTGTGCTACAAGTACAAATCAGAGCAGTGTTCTCTTAGGAAAATGGTATTCACATAGCATGTACTAATTGTATATTATGAAAGTGTGTCTTAAAAGTTTCAGTGCCTTATGAAAATATCCCAGTACAGTACTTTTCTGTCTTAATGTTGTTTGCTTTGTTTACTTGAGAGCATGTCATCTCTATATACAATCTTTTTGATGTCACTTTAAGCTGTTGTTTCTTTTTGTTCTGTTTTGTCCTTTCCTCAAAGCTGTGTAAGTCTGGGTTAAGCAGACCAAGACAGGTACAGCCACTTTCTGTGAATTATCATTCACTTTTTAGAGTCATTTCAGAAGCTATCATGCTGGCGCTTCATGCTGGGCTGTCTGTAAACTAATGCTCATTACTAGCCTTGAGGTTTGTTTTGACAAGCTGCTTTTAGCTTTTGCATGGCAAATACTTTTCAGACTAATGTTCTTTAAGCATCTTTAACAAAACCACTAAGGCTGAAAAATATGTCAGTTTAAGTACAGTTTAATTCACTTACACGATGGCGATATCCTTAAAGCTATTGCATTACTTGTTCTTCAGAGAGTGCTTTTTATAAAGAATGTTTTGGATTAATGTGCATCTATTTCAAACAGTTCACACTTCAACAAAAATAGTCTAAATATTAGATTGCTTTGCCGTATTTTTTTTATACACAGAAGGAACTTCCTAAACTAACCCTTCATGCTTGCAGAAAGTATGACTTGTTCGTGATTGCTAACAAAATATTTTGATTTGAAGGAGAATTGTTAAATTAGAAGTGTCTTAAAAACTCCATTTATTTGTAGATACTGATAGATATTGTATTTAATGGATTGAGAGAACAAAGGCGGTTGCTTGCACACATTGCTTGGGGGTCATTCACTGGAGTAGTACCACCATGTGATTTTGGGCTATAACTGTTTCTTTTGTTTTAATTGATCTCACTACTTTTTGGAAAGAAAGCTTTAATTTGAGTTAATTCACTGACTGCCTTTTGTTTATTGATATAGTATAACTCATCCCAATAGCAAATTGTGTGTTTATGGGAAAATATTTGACAAAACTCTTTGCCAGTCTGAAGGAAAAAATAGAAATGGTTTGGTGGTTGGCTTATGTCCTTATCTTGATGAGGATTTTAGCTGTGCTAAAAATCAGGCTAGATTGAGATCTGAATTCACTCCTCGTTAGGTGCCTAATATGTTAACTAGTCGGCATTGTAGGCACCTAAGTAAGAAGACATTGCAAAGCCTGAAAAGTAACTGTCTTGTCCTTGGATGGAATACCACTATGTTGGGTGCCTGCAGCGTAGTGAAGGTGTAATGCTTAATTTTATACAGTAATTTAGGTAAGCTGCCTACCCAGGAAGTGGGAATATCTGTTCTCTTTGATGTCCATTTGACATCAAATATTGATATATAAATGTTCAAAAGAAATGAAGTCAAGCTTCAGCTCTATTTGCAGCCAGATGAGCTAACCACAAGGCTTAGGATCCCCACCACCTCCTTTAGTGTTTTCGAGTGAAGTTGATGCATTGATTGTTTTAAGGACATTTCAAACATATTTGGCTGAGAACTGTGGAGAAATTACAGGTTCAGATTCAAAGTCAGATGCTTCTGAGTAGCCTAGGTGGGAAACTTTCCTACCTCCCCAGATTAGGATATCTCCAATAACAATGAGTTTGAGATAACTGAGGTTAAGGTCAATGAGAATAGATTTAGGGTTTGCTGCATTATAGCTGAATGAATTTTTCAATTCTCAAGTATTCTTTCTGACAATTTAGGTATGGTTAGCATCATTAAATATAATCTTGATTTTTATAGGTAATTATCTTTGAATATATTAACTTACTATCAGTTCTCTTGTGAGATTAAATAACTGTAGCATACATACATATATATGTATATTACGTGTGCATATGTATATTATATAGTAGTATACATATATATAGTTTTATATATATGTATATATATATGTAGTTTAGGCTTTTTCTAGTCCTTATATATATATATATGTGTATGAGTGTGTGTATACATATATATTTATATAGGGACTAGAGAAAATATATATATATATATATATATGTATATATATAACTGATTGAGAAATATAGCCCTATTTCGTTAATTGAATTTTGGAAATTCAAAATGAACTTCTACATCTCAGAGTTTATGCATGTGATGATAAGCTCTGAAGCTTTGGAAGCTCTTTTGTGTCCTCCCAAAATGAGCTTTATTTTGGTGGATTGTCTACAAAACTGAAACAAAAGCTTTACGTTTAGAAAAAGGGAAGGTACAACCTCCCTTCCTGGAAGAGTTTATACAAATATTTCATAGCTGATAGAACTGTTTCTGATTTTGCTGTTGGGAATTTGGAACAACTGAACTGTTCAGAGCTTTGCACTTTGTCCTACCCAGGGCAGGCTCCCATCCAGGAAGAACACATTATTTTGTGTACAAATGCATTTATTTTGTTTTTCCACACTTTCTTGGGAGTGCCCAGAAGTTGGCAACATTATCGGGGCAACTCTGGTATTAGGATCTGAGATATTAATAATTTCTACCTAAATCTTGCCAAAGCTCCAGGTACATGAAACATCCTTACAGTATCCTGGAGGGCAGCAGCAGTACTGCCCTGTATTTCTGTGCTGTGATGACTGTATGTAGCTTCCTGACTGATTTTGTGGAAAAAATGGAGAGATACTGATGAAAGTACCCAGTGAATCCAAGTAACTGAGGAGCTGTGTTTCAGGGCATCTTTGTCTTAGGCTAAACCAGGGATCTTTTCAAACAGGAAAGTCTTAAGTTCTGTCTGGGATACTTGAAAAAATAAACAGCTAACAAAAAACTGAACTAATTGCTAAAATCACCGGGAAACTTGGAATAAAGATGCATTTAAACTTGATTAACACTTACTTCATAGTCCTGTTTTTTATGCTGTTTTTCTTAAATAACGTAGTTTAGGAGAGTTATTTTTCACATTGGCAGGACTCAAGATGCTGTGTTTTTCTTCTCATATAAATTACTATAATAAACGTTTCTCAGGATATCGATATTCTGATATCAGTTACAAATGCCTGTGCATTCTTATTCTCATTTCTTAATTTTCTTTGGCTTGTTGCAGTGCATATTGTGAAATTCTGGGTGTACTGAGGTTTTTGAACAAATGTTTTATGTGCACCTTCTTGCTTCTTGCAG
Seq C2 exon
GGAGGAGGAGCAGGTGCAGGAGCAACCACAGGAGTTTCACATGTCTCTCTGAGCACAATGAGTGTGGAAGCTGTATGTGAGAAGCTAAAGCAGATAGACGGTCTGGACCAGAGCATGCTGCCTCAGTACTCTGCAATTATAAGAAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000016409:ENSGALT00000026464:24
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.143 A=NA C2=0.157
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF0053625=SAM_1=PU(52.5=63.3)
Main Inclusion Isoform:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]