GgaINT1022912 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000011078 | PTPN13
Description
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13 (APO-1/CD95 (Fas)-associated phosphatase) [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9646]
Coordinates
chr4:45309446-45330749:-
Coord C1 exon
chr4:45330731-45330749
Coord A exon
chr4:45309566-45330730
Coord C2 exon
chr4:45309446-45309565
Length
21165 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GCGGTGAGC
5' ss Score
8.02
3' ss Seq
GACTGTGTCTCATTTTGCAGATA
3' ss Score
11.36
Exon sequences
Seq C1 exon
CGGAGGTCCTGAGGCGGCG
Seq A exon
GTGAGCGGGGCCGGGGGGCGGCGAGGCCGGGCACGTCGCTGCGGTGCGCGGGGAGGGGGAGAGACCGGGCCGGGAGCGCAGAGGATGGAGGGGCCTCCGGATCTCCACCGGGCCGGTACGGAGCGGGCGGAGCTGGGGGCCCGGGGCCGCCCGAGAGAAGGGCTCGCAGCCTCTCGCAGCGGGACGTTTTCACGCTTTCTGAACTCCTTCTGGTCGGTGATGAGAACCAGCGTGGGTTTCGCCGGTTTTTTTATCTCCAGCAATCGACACCTCCGCAAAGTGCGGGGTGATTTCTCTCCTGTTGGAGGTTGTGTCACTCTCTCGAAATTGCACGTTGAGAGCAACAAAGGCGGCGACTTCTTAGGAGCCGCCGGGAGCTGCTCGGTTCCCCTCCTGGGTAGTGGGGAAACGACTGGAACCGGTTTGCTTCCGTGGGTGCGATGCGAAGTGGATGTGAGACGTGAAACTGCGGGGTTGGGTGCGGGTATCTGTGGGGTTGGGCGTGGGGATCTGCGTGGGAGGAGAGAGCCTGAGCGTGGGGCTGGGAAGGAGCGTGATGGGGTCCTGCCGCCTCTCCGGCGGGATGGAATGTGTTTGGTGAGATGAGGTCCAAGGACCGGGCTGCTCCTGGGGGCTGAGCCTGTCGTGCTCAGGTTGTGCCCCTCCTGCCTGCACCTGTCTGCCATAATGTGACCCCAGTTACAGCATCACAGAATTATAGGGGTCAGAAGGGACACCTAGAGATCACTGAGTCCAACCCCCCTGCCGAAGCAGGCTCCCTACAGCAGGTTGCACAGGTGGGCATCCAGGCGGGACTTGAACGTCTCCAGAGAAGTTAGCTCTCAAGAGTTGGATTCAGCTGGGACAAAAGCACAGCTGGGAGAACATTAGCAGTGGGTTGGTTCTTGTGCAAGAAATACTGATGAGGAAAGAGTCAATCTGCTCTTAGATCTTTTGTTTGGCAGTATGTTACAGTGTTACAGCAGATTCTGCCACCACTCCTCTTGCTATCAGACACACCTGTCTGTGCAGCTTGTACACCGGGTGTTTGTGCTTCATCGGAAGAACCTCTCCTCCCATCAACAAGAATGTCCATCTAGTGCAGCCCTTAAATGTAAGCAGTATAATCATAGAGTCATTGAGATTGGAAAAGGACACTAAGACCATGAAGTCCAACCATCCCTACCATGCCCACTAACCATGTCCCTCAGTGCCACATCCACACAGTTCTTGAACACTTCCAGGGATGGTGACTCCGCCACCTCCCTGGGCAGCCCATTCCAATACCTTACTGCTCTTTCTAAGATGTTCTTCCTAACCCTAATCCAACCTGAACCTCCCCTAGCACAACTTAAAGCCATTCCCTCTCATCCTATTGCTGTTACCTGGGAGAGGAGTCTGACTCTCACCTCTCCACAGCCTCCCTTCAGGGCATTGTAGAGAGCAATAAGGTCTCCCATGAGCTTTGGGGACTGATTCTTGCAATGTGCCTCTGCGTGGCAGTTCAGGCCAACAACAATCCAAGGCACTGGAGAGTTTGCATTCACGTTTCAGCTTCTCTAGAATGAGCTGCGGTTTTTTTAGTTAAAGGTATTGCATTTGCCAGTTCAGTGGGAAGGAAGGTGTTGTGTTTGACCACTTTGCTTTGCTGTTTTTACTTTAAAGTGGGATTTGTCAGCCAAGCGGTTCCTGTAAGTATGGGTTAAGTACAGCATTGAAGGGCTGCAAGTTGAAATGCAGTCTTTATCTGTTTGCTTCCTAGGGAGTTCAGCAAAGCAAGGATGTTAACGTTCACATGTGGAACAAGAGACAGTTCTGACATAAACTGGCACACAGCTATTTTCCTCTCAAATGAATGTGGGTCTGAGCAATAATAATTAGCAGTTTGGTAGCACAGTAAATCTTTCAAGTGCCTTCAAATCATAATCAGCCAACCCTAATAGCACGCTGCTCCTGCAGGAGAGGTAATTAGACAGATAAAATGAGACTGGGCAGCCTCTGAAACAGAGCTGATTGTTGAAGTGACAGTCACCAAAACAAAGCTCTGCTTTATCACTGAACCTCTGAGAGCTGCTGTACATTAAACACTGCCTCAAATATTTGTATGTTGAAATAGTGACCAATAAGGCCCAGAGGGGCCTGGCTGCTACAGGCACCCTTGTTGGAGCTCTCTACAGTTAGGGGACCTTGGTCTGGAGAGTCTCTGGTGGTTGTTCCGCAGCACCTATCAGAACATAATAGTTTGGGCAGGTGTGGCATCAGCTCCTTGGGGGAAATGGTTTTCACTGGAAGAGCCTTCCAGTTTACTCATGTAACAAGCCTAGAACTTTATGCTGTTGATGGTACTCTAAAACTGAAAGTGATTTCACCAGCACATTGTTAAGCCTGGGAACACGTAAGCATTGGTCTGCCTGCCACGTTTTAGACATTGTAGAGAAAATGTTGTTTAACAGTTTTGTAGTTTTAAAATGAACCAGTCGGTGAACCAGAGTTCTGGGATAGCATGTCACGGTGCAGGGAATATCTGTAAGCGGTTGCCCTGAGCTGTCGCATTCCGTGGGACAAGCGTGGATGGAAAGCCATGAATACCAGAATAAGTTAATGTTGTGTGTCGCCAGTTAGCTGTTAATGAAATCTGTGCATCTGTAAAGTAGGGTGGAACTCCTGAAAGAAGTGGTTCCCAGCCCCACCTCCTCCTCAGGTGCAGAGGAGGAAGCTGACGCTTATGGATGGGAAGGGCTGGAGAAGACTCTTTGGTGCTGTTTTTGTTTTGTCCAGGTTTCTCTTTCTACTATGCCACTTAAATACGTGGTGAGCAGGTAGGCATATTCCTTGTGCATCATTATCTATTAAAATGCCTTCATAAAAGGCAATTGAGTGCCTGCCTTGGGACAATGATATGTCCTGTGAATTTGAAATCCAATTGCCAGGATAGGGATCTGCTATGCTTAGCTTATGAAACTTCTTAGGAGGAATAACAGGTGAGAAAACTTTGTTCTCAGGGTTTCATCTGTTGTTCCTCATCTTTTATGTGTAAATTTACAACGTCATGTCAGCACACCACAGAAATTCAGTGAGAAATAATTGGAGGACTACAGGAGACATAGTGTTAAAGCTGCCGATATTTGATTGCTGATATTTGAAGGCTATACTTTTTCAGGTCATTCAGTGTCATTAAGGGTTTGTAGATGATACTGTAATGTCAGGTTTAATACTGGATGTTGTGTCAGCGCATTGTTCCTGTTGGAACCAGTTTATAGTCAGATGAGTGAGGAAGGAGGTAAAGCTGCCCTCCCCTTTCCAAGTGCCCCATTTCCAAGCTAGAAGTGAAGCACAGAGGGAGAAATGTGGAAACAGTGAAAAGGTAAGTGCTGAAACCTGGATTTGAACACCAGCTTCTTGTTAAGCTCTTGCTTGAGCCAGCCTTTCAGAAAACATCACTTCTGCAGATTTTTAGGTGGCAAGACTTTCAACCTCTTTGTGCCTGTACTTTGTCAGAGGAAGGGTGTATTTGGGGTCGGGGTATTCTGCCAGCTGTTTCATTGCTTGTGAAATTGTCTTAGAAGCATTTGTCTGTGTCTGGGGGAGAAGCATTGGAGGGAAATTCCTGTAGAACTTGCTGAGTTTCTTGGAAATGAATCTGAGAATGGTCTTTGTGTTTTATTGTCCTCTTCACTGAGTGCCTGCATGTAGTGTTAGGTACTTCATTTCAGGCATACATGCAGAGAAGTTCCTCGCTGAAATCTGCTTTATTTACAAAATATATATATATATATATCTTGAGCTGAAAGATGATTTGGGTGACTTTTCTTGATGGTGCTGTTGCAGATGATTTATGGTTGTACTGTAGGCTTGAAATTAATGTTGAGTTTAACAGGAAATGTTCTGATCCTACTCAGCTCTTTCCCAAGTGAGAGAACTTAAACACAAGTTCTCTACCACCTTTCCATGAAATCAGATTTTTTTTTTGGTCTTGAATTTGTTGGGGTGTAGGGGGGAAACTGTTGCAGTACACAAATTGCTGATGTTTTGAAGGTCAAGCACATAGTCATAAGTAGGTACAGCTGATACTCCACAGAGGCCAGGTGCCTGGAGACTTCCCATTAGGTTCCAGCATGCCCTCATAGGTTGGAATCTTAATGCCACGGCTGTTTGCTTTATAAAACTGAAGGTACAAGTTCTCTGTACTACTGCAGTTATGCCAAATTGCTGTAGAAACTGTTTCATTCACTGCTGACTTCCTTTCTGTTTTGGAATCAACACTGAAAGGCATAAAAAGTCGTAAATGTAAACAATATTTGCAGCCAAATGGCATGCTTGAAGATGTAAGCGTTTGTGAGTTCATGTCTATTCTGTAGTCCTTCTTGGTTTTTCTTCGTGTAATAGTTGTTGTTGGGATCAGGTAGTGGGCAGGCCCTCAAGGGGAAAAAGCAAGGAACTAAATGTGAAGACTTTGTAGCTCATTACTGAGTGCAGACAGAACATGACTTATCTTGTTATCTCAAGGGTTATAGACACTCATTTGCAGCTCCTTGTTTGTACACGGAATTGGTTCCCAGTGACTCATTTTATGCTTCAGATGAGGCTTTTTCCCTTTTTAATATTATTTTCTTCAGCATCTCAATGATGCGTGTAGATTGGTTGCTGTGTCTTTCATTTTTCACATAGGCATGAGTAGCTATGCAGAGGGCATAGAAACCAATGAACCTGTGATGTGGGTGGCCCCAGGTCTCTAATGGGGTCACCAAAGGAAGGCGGTGGGATGTGGCTTGAACTCTTCAAGCCCCATTTGGAACATGGCAGGCGTTCTGAGAGCTGGAGGATGGAGCCGGGGAAATCTTAATAACATTTCAGACTTATTTCAATTATGTTTGGAGTTGTGTGTCAAAGCTTTTTGGTAGGGCTTTTGAGATCTACTAACCACTCTGTTGTCTCATTTTGAAAGATTAAATAGATTAGAGGTGACTAAATTGGAGTTTGAAGTTTACTTAAACTGTTAGAAATATCTGTGTTTCCTAGCAGAAGCATGCCTGGTTTTAGTGATGAAAGATCTGCATTTGCACATTGCCTGAAGTTATGAAGGCATGAGAAATGGAATATTTTGGTCTTCTTTCCTGTGTCATATGTGGGTAGTTGAGCAATATAACAATTTTATTCCTAGAAATACTGAAAGGAATCTTACTTATTCTTGTTCCTCTCTGTCACAGCTTGTGGAGTGCAACAATTTATTATTACTGACTTCTTCTTTTATTTGCAAAACTTAGAGTTTCAACAAGAAGTTACAGAAGGGAAAAGGAGTGGACGTGTATTGCCTTTTATTATCTTTCCCATACAATCACTGAGTGGAAGATCCCTTCATACTACTTAAGTTTATGGTCTGTGAAATAATAGGTTTGTATTTGCTGCCAGTAAATTAACGGGGAAATTGGCTGCCAGGCAAGCAAATGGTTTGATAGGGTAGTGCAAGTTCTGCTTCTGTTATTCACTTGTTAATGTCAGTGAGTAATAGTGCACGTGTTGCTTTGGGAGACGGTCTCTGTAGTATGCATTGTTGACTGGACAACCATGTGGTTAGGTTTATAGGGAGTTATCCCTCCAGCCTCATTACAGAGTATATGTAACTTCCTTAAATATGTGTTTCACCAGGTAATAAGTCACTTTTTCTCCTTCAGAGGTCTTGTATTTCAAACATCTTAGGCTATTTCAACTGTTCAACCTTAAAAGGATTGAGATGCATTTTCTTGTTTATTGTTCTGAAATAAATTTCCTTTCATTTTCCGCAAGGATCAAAATTGAACCAATTTGCATTAATTTGGCTTCTAGGAAATGAGAGTACTGCCTATCTGCATACATTATTGCAGATTTCATTTGTAAAGAAGCACTTTATAGTAAAAGATCTATCATTGCAGATTTTACAAAGGAGGTTCTGTCCAGCCTTCCTTTTGAGTTCCTGCATATCCTGAGCCATCTTTTCACTGCTCCGTAGACCAGTGCCCTGTGCCTGAAGAGATTTCCTCTTAACATTTTGAAGGGGAGCTTTAGACAAAGTTAGCGTGTTGGTAGAAAACTGTAGATGGTATGGCAGCAAAAGAACCCACAATGAATAGCCACTGGAATATATATGTATGTGTATATATCTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATAAAGTTGTTATGTTAGAATTAAGAATTTTACAATATTACTCCTTAAAAGTAACTTTCTCCATGATAAAGTTTGGGGTGAGATTTCACACCTTTGATCTGGGCAGGATCTCCCACTTTTTGTCTGGGAGCTGGTAATCCTTGGCCTTTTTTAGTCTGAAGGTTGTTCAAACTCCAAAAAATGAGACAGCTGCCTGGGAAATCTGCTGTGGTGACCCACTGAGCAAGATCCGCAAGCAGTGGACCACATATTTGGAGGCAGTAGCAGAACTTCAACGTTTTGTTTCCTCAAAGAGGCTTCTTCTGATGCTGTGTACTTGGCAAATGAACATGCTTAGGGAAAGAATCATATCCCCAAGAACTTTTGAACAGCCTCATTTTTCAGTGTGCCCTGTCACTGCAGTCTCTTGAATGACCTTAGTGCTGTGACAAAGATGTACTAGCTGGCAGCGATACAAGTTTGTTTCCATCAGCTCTATAGACTCAGTTATTGAGTAGCTACACAGTTGGGTTATCACGTTGGAGCAGCCCAATCAGCCGAAGCTTTAAGCACACGTGCTTACTGTATTTTCCAGGATGGTAGGCTGTTTGGATTTGTTGGGACTGTGGTGGTAGTGCACACAATAGAGGCAGGCAGGGGAAAGCATTTCCTTATGTTCAGTGGCTGCAAATGTGCATTGCTAAATGCTGTTGAAAGCCAGGTGGCCTTCATAAGGTGGCCATGAGGCATGAGAGATACCTCAAGGCACTTGGCCTGTTCCTCTCCAGCAAAATTGGAGATGATTAGTGGTATCTTCACAGCAAGCAAAGAAAATACTCCTTGTGTAGTGCCGAATTAGAGCTGTGTTACTGGAGAGAATGTCATGTGAACCGATAGTGTCAGTGTTTTCAGGAAGGGATTAGACGACCTGACAGCATGCTGGGCATTACTGACAGTTACATGTGACTGATCAGATCTCACCTTTGCTCAGGAACCCTATGGACTGACAGCTGCCAAGGAAGGATGCTGAGAGGGGTGACCTCATCTGTATAAAAGTTCTTAAATTGTGCATTGCTTAGGTTCCTAAATATCTTATCCAATAGAAAGGTCCTCTAAGTAAGATTTATCTTGGCATTTTTAACATTTTTTTTCCTTATTTTTTGCCCATGGAGCTCATGCACCTCTGCACGGGCTTCTCTGCTGTTCCCAGGGTTGAACTCAATGCAGTCGAAGAATCCAAGCCTTGGGAACTGCTGCGCCATGGAGATGTGGTGCTGAGGGACATGGTTTGGTGAGCATGCTGGGGGTGGGTTGACAGTTGGACTTGATAACCCTAGAGGTCTCTTTCAACCTTAATGATTCCATGATTCTGTGTACCCGAGAGAGAAGCAGGATGTTGAGCTATCTCATTCAATCTGCAGTCCCTTGCTTTTGACCTTTTAACCAGGAGTCCCCAATCCCTTCAGTCATCTTAGGAAGGGATGCAGTGCCAGGCAGTCATGTTAGCCAAGGCGGCTCACTGTCATACAGCTCCGTAGAATCAACTTAATTGGTTGCGAAGAGAGGAGCAAGTTTTAGCACCAGAGTGGTTCTCAGCATGGATGGCTAAGATCTAGGGTAGGTTTTCTGATGGGCACCATGTATAGTGTACTTCTCAGAGCAATGTGAGGAATCATGAGGTTCTGAATCTCACCCGCACAGCCTGAATTATTCCTTTGGGATCTGTTGTGTGAAGTTGTTCTGTGGTGAACTGAAAGCAGAAAAAGAGCCATACAAACAGTAATTCAAAGAACAGGACTAGTGAAACAAACAAATAGAAATCAACTTGCTGAGATGTAAATTGGTTGACTTCGTTTACAGGTAAGAGACACGTTGCTGAAGAACTGAAGGGCGTTCTGTATTGATAAAAGGCATTCTTTTTGTTCTTGCCTCAATGTCAGATTGCTATTTTCTGTTGGCACGAATACAAGTGCTGTTTTGCTGTGTGGGCTCTTTGGCCCTGCTTGCTGAAATAAGCATAGAGGAGTCAAAAAGAGGATTTTTTACCTTAAACCTTTTAGTTATGTGATACCGTCCAACAGCTGTGCACTCTGTCTTTCAGTACTGACTATTGAACAGCCATATAGAAAAAGCAAGTTGTATTTAGTTTGATATGTGAAACTTGCTTGCATAGTGCAGAATATATTTTTCAATATTAGAGAAAATATTTAAGTTTGACATGAACTGAATTTTTTGATTTATGCATCCTCTCTTCTTCTGCCCCACCCATTGTTTTTGCTTTGAGAATATTAAAAAATTGAAGATCACAGCATTTAACTTTTTACCGTGGCGTGAACTGCAGCTTGGAAAGTCTGCTGATGATGCAAAATGTGCTGCTTCTGCTTCCCTTTTTGGTGGTTTTGGACAAGGGGAAGAGAAACGATTGCCTGTCTAGACTTCAATAATTTCTATATAAATTTACTTGTTATGCAGACAGCATTCAGTTCGAGGTTTATGATGTATTTTCAATGATATGCTATGAAACCAGTTAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGGAAAGGCTGTTGTGCCAGAACTAAAATGCATCTCATGGGAGTGATTGCTTTTTGTAGTACTTTGGAGCCCCAAGGTACCCTGTCTATAAACTGTTCTCAGGACACTTTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCATGTCACCTGGAGATGTGGGGGGCTTTACTACCTGTTTATCTTTACTACCAGTGTAGAATACAGGGTGAAGTCTTACAGCCACTTTTGCGGAAGTCTTATTGTGGAAGCCCACTGACCAATTGAAGGAGGTACTGATCAGCATGATAAAAAGTGAAGGCTCGTTTGAGTGCCAGCTGTCTTCAGTTAGTATCTCTGCCCATGCTAAACCTTTTAATCTTCGAATTTCAAAATACAGCCTGTGAATTGCTGTAAGCAATTATTTTGCCCTAAATGATTGGGGTATATTCAGTTTTCAGGTAAGTAGATGAAAAATTGGTAATTAAGCAAAGCATTAAAATGCTACCAGAAGAAAAAAAAAAAAGTAATTATAATAATGATAACAATGATCAACAGTATGTCTTATGTTTGCCAGTAAGACTTGGCACCTGTAAGGTATTATGCCTCTGTGTTGGGTGTCCCTTCCCCAGTTGAAGCAGTTTGTGGGTGCACTCATGCAGCTCCTCTTCTCTCCATCCTGCTTCTCTCTGTGGCTGATGGCATTTGGTTCTGTCCCTGTTCCTCTGCATGGCCAGGAAGCTGTGGATTATTCTGAACAGATATTACATTTTCTACCATTTTGAGATTTAACTTGTCAAATTTTGGTCTTCCCATTTTTATTTTCTCCTCACCTCCTTTTGTTAGCATCACTTTGAGGACTTCTGTAAGTGGCCGTGCTAGGAACGGGTTTTGTTGCTTCGTTATAAAGATCATAGGAAGGTGAAAAGATGTGGAAATTGGTTCCCATTCGGGTGCCTGTGATTATAGATAGCTGTGTGATCTCTTCCCTGTTACAAAACAAGAGAGATTGTCCTGCTGTGTTCCATTAGTTGGCTTAGTCTGATAATTAATCAATTAAGAGTGATACTAGGCATGGGGATTCGATCGCTACTGCGAGGCATTCCTCAGTGGAGCAGGGAGTTGTGGTAGTTATGGCTTAGAGTCTACTTTTGCTTTTAGGTCTCTATGGAAACTCGGTGGATATTATGAGAAAAATTGAATTGCATCTTTTGACCAGAGATAAATCCCATAGTCCTTTATGCTATGAGTTAAATGGATGACCTTTTAAGCCAGTACTTTAAAATGTAGCATAAAAAATAGATGGTGGAGAAGAGGGGCTTGGGAGAAGGAAATGTAACTATTCTCAGAACAAAGTAACTTGATGCAGATGGCTGTTGCATTTCTTCTCAGGGGTTTGACAAGTTGATCAAAACCTTACCAACCAAAGGCAGAAAATGAAGTCCTCCAGAAGAGAAGAAATTAACCTAATCAGTGACTTCAGGTGCATACAACTATTATGTTAAATGTGGAAAAAATGGTGTTCCTTACTGTTGCATTTCTCCTTTTGTCCCCATTAAGACCTGCAGTTGCAGTGAGTAACACAGTTCTAATAACAACAGCTTTATGGTTTATTTCTCTTCCCCTTCCAAAGTTAATGGCAGAGTGCAGTATTCCACTTGGGTATATGAGGGAGATAATTGGAGTTGAAAACACTGATTACTTGGTATGTTTGAGTTCTGTATGTTTTCATAATGAAATTTCTTAATATTTTCTACTGCTATGGATTTAGTGTTCCCTCTATTCATTTTTATTTATTTATTTATTTATGGTGTAGGGTTGTGTTTGGGATGGCTGGAAACCTAATACTGAACCTAATATTTGGGGCCAGGGGACGTCTAAGTGCCACACGCTTTCAAATCTGGACAGTTCTTGTCTGATCTTTGTAGACATTTGTTAAATAACCTGGTTTCTAAAGCTATCCTTTTCCCAACTTCAAAGCATTCAGAAATTCTGGAAGCATTTTCCAGTTTGATAACTTTCAAATTCAACATTCTACTTCAGCATTTGATAAGCACAATTGATAAGGAACGTATGGTAGTGAGACGGTGTATATAAAAACTGAAAATGTTTTGAAAGCCGTGGTATAACATTCTAAAGTTTGTGGATCTGTTCTGTAATACTTGGGTTGTAAAAGTTGTACCTGTGCATGGAAGGAATGAAGCCTAGTGTGAAGACCATGTTTTATAAGAGTTGAGCTCTTAGATTTTAGTGGTCACATTTTTTGGCCTAGCTGTGGTGTTTCTCCTTCTTGTATATTCTAGTTAGTGTTTCTTTGGGTCTCCATGAACTAAAAGGGTTGGACTTAAGCTGCTGAATGTGGAATTACCAAAATGATGTTGAGAACAGCAAGATCTGATGCATTCCTTAACTGGTGTAACTCTTTGTGGTCTAGCTCTGCCGGTAAACTCAAGTGTTCTTCTATTATCTTTCCATTCTTATTTCCCTTAGTGCCTCAGTTGAGCAGTGCTATTAGAGGTTCATACAACCTTCTGCTTGGTTCCATCCCAGTTCAGTGAATGCAGTTCGTGCCTGGGCACTGTGTGCATATGTCCTCAGTCTGACTTGCTGTCTGTTACTGCTCACAGAACATTGTCAAAAGAGTAGAAAGGTGATGCCAGGACTTGCTTTTCTCTCATGGCAACTAAGCCTGCAGAGGAAAAGGTTCTGCCGGCTTGTCCTTGTTATGCAGCCAAGGGTGTAATACGGCTCTTTGTCCTCTGACTCTACTAATATGAATGAACTGAGCATCCATACAAAGCAGAACTTCCCTGAACTCTTTTTTTTGTTGTTTTTTATTTTGCAACAGAGGGCTTGTCATTGTGTAAGGGAAGGGAGGAGGTGCTGCTATCTTGTTTTTCCTGTTTTCTGGCAATGCTATCTTCTGTAGCCTGTTCTGTCCTGTCATCTCTCCAAGTACCAAAATACTGCAGTTGGATGGAGCATTGTTGCATTCCAGGACATGGAGCTAAATGAGATGTGTGACGCTGGGCCATCTCACTGGCTGTGGCTTTAGGTCATCTGTTGTGTGTGTGGAGGATGTAGTTAAGAGTTCTGCACATCATTCTGCAGCTATTCATGTTGCTGTCAAATAATACCAATGCTCATATTCTTTGTGGCAAGGTTCCTTCTATGCTCTGAAGCTAGTTTAATTTTTTGTCTCAGAAACCATAAGCTTGGGTAGCAGTAACAGGCGGGACAGCCTCTTAGGAAAGGAATTAACGTCTTGTCCCATCTAAAAGGAAAAGGACTACTAAGTCCTAAGTCACGTCGCCACTGAGGGCAGTTTAAGAGTGAAGAATGTCGTGGCTGTAGGACTCAATAAACACAGCGTGTCTTAATTGGAGATGAATCAGAAATGGGGTGTGTGTGTGAACTGTGTTCAAGGGGCAGTATAGGCAATTTAATAATTGTTAAGTTGTAAACAGCATATTGAATCATATAACGTGTAATTATATATATTTTGTCTGAAATGCGATAAGCAGTGAGAGGCTGAGGGACTCGCGTTACCTGGCCATGTTCCTGTTAACATGTGTTATTTTGGGACAAAGCCCTCGTGCTGTGTCAACTAATGTTTTAAAGCAAGATCACAATTTCCTAACCATAGGCATTCCAAGTTTTCAAGTGGATTTGTCTACTAATTAATCTAGAGCTAAAAACTCCCTAATTGCAGGATTTAAATAAGACACTGTAAGCTATTCTGGAAGCTTTTGGCTTTCACAAAGAGATCATTTGAAAAGCAGACATTCACGACCAAAGAATTTCATGTTTTTTGTCAAAGCCTTTCAGCTGATGGGTAGTTCTTGACGTTCTCATCAGGGGGTGATGTGTGTTACACTGACTGCACTGTTCTTGCTGCTCAGCCAGCTCTACATCTACAGAGCTGAGTGCTGTCTGGCAGATGGGCAACCAGGAGGTAAATCATGATGGATATTTTGAGCTGCAGAAAGCAGATCAACTGTGGATCCTTGGGTACAGAAAGTCTCTGAGTGGAAAAGGCAACATCTACGCACTGCTTGCAAGGTAGTAGTGCTTAGAAACCCTGCTGAGTATAGATTTAACAGAGATCCAAGGCAACTTGAGAGTTTGAGAAATAATGGAATATGAAAACGCCAACGCAAGTGGATGCTTCGGCCTTTTGGGAAATCCTATAATGAGCCAGTGGGGAATAGTGCCTTCCTATGAAGTCTGGCTGCCTTACTGTGGCTAACTGCTCTGTTTGATAACATGAAAGCAATGCTGTGTATTGTTTGCTCTTGTTCAGATTTTTCTGATGTGCCCTGCAAATTGCTTGCTGCCTAGGGAGTGTGTGCAGACAGTGTGTATACCTTTTGTCTCAGTCAATTTCTCTGTCTGCATGAGTATGGAAGAAAATGCCAAAGGAAGGGATCCACAGTCTAGAAGAGCAAATAATCCCCCTCGTTGCCAAGAACTTTGCTTTTGCCAGACAGCTGTTAGGCAGAAGAAGGAATCTCCATGTTTGCAGCTGGTGCATCTGAATCAGGGCACAAGCATCTTCTATGTTAACCAATCTATTTATATTTTTTTTTCCAATTTGGTTTCACTGAACCATGTTTAAGACAAGTGATGTGCAGACCTTTTTGCTGGCTCACTTCAGAGGGTGGATATTGATAGGAGAAGGGGGAATGGCTTTAAACTAAGACAGGGGAGGTTCAGGTTAGATATTAGGAGGAAGTTTTTCACAGAGGGTGGTGAAGCACAGGAACAGGTTGCCCAAGGAATCTGCGGATGCCCCGTCCCTGGAGGCATTCAAGGCCAGGCTGGATGTGGCTCTGGGTAGCCTGGTCTGGTGGTTGGCGACCATGCACATAGCAGGGGGGTTGAAACTGGATGATCATTGTGGTCCTTTTCAACACTGTGATTCTGTGTGCCTTTAGCAGACTCAATTACTGGGTATAAAAACGAGCTGTAACCTTGCTCAAGTACAATACTGCCTCATTTTCAAGAGTCTGCTTCTCAGTTGTGCTTTACTTCACAAAGGGGAAACATCTTTTCTACCACTTAGCAGTTGCTTAGTGCTTTCAAGTAGGAGCTGTTAAACTGAACATTTTTTTTATGGAAAGCAGGTCAGGATGGAGGGAAGACCTTTCTCTATAGAGCAGGTCTTTGTGCTCTGTGCAGATGTCATCCAGGTGCTTCTCCAGCAGTGGTTCTGCCCTGTACAATGTGTTGGTGCCAGGCTTGCAGTACTGTGCATGTGGAATGAAGAGCTGCTTTCTGGACAGATGGAGCTCTGCTGCAGCCCATCTGCAGCTATCAAATCTACTTTTACAAATGCTTAGAGAACCTTGCTTTAAAGCTGCCTTAGCCAAAACCCTTAATAGGTTTTAGAGACTTCTAATTAAGCTTTCAAGTAATCGATGTTGACTTCTAAAAGTAGATTGGTGTTCCTGTTGCTTTACAGCTCCATTTGCCCCTCAGGGGTTTTCTCCTGTTCTGCAAGAGGAACACAAAAATGAATTATTTGGTACATATGAACTATATATACATATGTGCGTTTACCTACATGTATAGATGTGTGGTAATGTAATACATGCACATGTGTATGGGCTCAGCCTGTGACATGGGCATATATTACAAAAAAAATTATCCTTCCTGAAGGCTGATGTAAAGTTTGGAGAGGTAGGCACATAACTTCATTTGAAAGTGCTTTTTATTTCCTTCACAACAGTCTGCCTTCATCTGAGGAAAGCACGAGGAAGCAGCAGCTTATCAACTATTGTCCTTTGCATTGCTCTGTAGGATACTTATGCCACGGACCAGTGAAATGCAGCCAGCAGCTTGTTCACGTCTCTGCTTTCCCCTTGGAACATGTGTTTCTTGGTCTGTTCTCCAGACCAGAGCTGAGGTCTCATCAGCTACCTCCTCTTTGAAGCAGTAGTTTCCTTGAATCTGGGTCTCACTTGAAAGCGTATGAAATGGAGTTATAAAATTGGATGTTGATTTCTCCCTACAGCCTTCCCCTCCTTGGATTTCTTCAACAAAAATCTTTGTACAGATTTTAACACCTGCTGGAAGAAACATAGATCATACACCTTCTAAACTGTATTTTGAGCATCTAAAAAGTGTAGATCTAGTGCATTGTAGTACCATAACTTCATCCTTATTAATATCTTAAGAATTTTGCGTATAAATTTTTGCTTGTCCGTGGAAAGAATGTCATTTTTTCACTACAGAGGAGTGAAGAAAATGCTGTGCTCTAGATAGCAGACTTGATACCTGCTACTGACCTTGAATTAATTCACTTGAAGTGGAACAAAGATCTCCAAGCTTATGCATTGGTCCTAAAAATGCCGTTGTTCTTGTGTATACAGTTCTTGACAGCTGAAATGTAGGCTTATGTTCTGGCTTGTCTGTTTTTCAGGGTAGAAATGCAGAATTTCACAATGGGAATTAGTCACATCTTGTGTGAGTAATAGCTTTATTCCCAGACAGGTGAGTTCACAGATAAGATATCCATGGTGTCATCGAGCTGCCAACCTTGTAATGCTCTGTTCCTTATGCTGTGTTGCCCAGCAGTTTTCTTCCCAGAAATAGAACGTGAAGTGGTAACTGTCTGGAAAGGTGACACACTTCTTTTTCTGCTGCAGGTCCTGGGATTCTCTGGTGATTGCTTGTGTCGTAGGGCTTCAGCAGTCATGTAGAGAGGTTTATATTTCTGAGAAGCTGGGAATGTTGATGATAGGTAGAAAATGAATTTCTGCTTTGCTGATGGGAAAGCAATTTGTGGAAGGATTGAAGTATGTTAGAATAAAATTTAGTTCTGAATAACCTATGATGGAGCAAACCTTCATACTTGCTAAGACTGTTATATACAATAGTGATTTACAGATGCTACTGCAATGTTAACATTTATCTTTCTTACTAAAGTTAGTAGGTTTTAATATTATTTTTCCAACATTTTATCTCATTTATATCACAATATTCTTATATTTACCTGAGAGTCAGCAATTGTTTTGAGTCAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAAAACAAGAAACCCAACCTGTAAAGTTTCCTGAAGTGAACTTTCTTTTTGTAGTTCTGCATCCAAGAAATGTGAGGACTCATGCTCTTGGCATGCTGTGCCAAGGTTCCTGCTGATCCAGTCGTGCTGTCTTCATTTACATTCATTATTACCTTCCTGCAAAGGGCTGTAGAAGTGAGAAGGGATAGCTATAAAGTGAGGGATTGTTCAGTTATTGAGAATGGAGAGGTTCGTATCTAAAAGCATCTGAACCAGCAGTACTGGAGAATTGATCTAATGTAGCACAACTGATATTGCTTTATTACCACAGAAGAGTTGAAGCTTAAGCTTTTAAGAACCCAAGCTCTTTTTGCAGCCTTGAAATTTCTGCTGCTCCCTTCATGAAGTTTATGTTAGTCGCAGGTATCCTGCTGCTACTTAGCAATTAAAATGAAAGTTGAACGTCTGAGGAAGGCGGTAGGAGCTGTGCCTCTCCCAGGTAGAGCTGATTAGCAGCAAACTCAGGGAGTTGCCAAGGGATCCTACACTGACAATTAAAACAAGAGAGGGGTATGAGAGCCATGCCCCAATTTACGTGGATTATGCTAACTTTGTAGTGATAATTGTATGCTCTTCTGAATATGATTTTAATATCAGATGTGAAACATCAGCTGCCCTGATGTATAAAAGAGCAGTCTCCAGTTGCCTAGGAAACAAGACTTTCATGATGATTATTATATACATTTTGGACTGGATTTACTAGTTTGCCTTCCCTGGAGCCTCAGATAAACAAGTTGATCTGGTTCTGATGATAGAGAGGCAGAACAGCAAGGGAGGGAGCATATTGTCAGCTACAACTCTGCATGTCTTCCACTGAGTCTTCCGTCCAGTGCTGAAAGCTGATTCCTTTCCACCTTCCAGGGAAGAAAGCTAACACTTCTCCAGCAAAATGCACACCGGTTGCTCTGGAGTGCAAGCTGGGATTGTAAAGTCCATTCCTCTGTCCTCCAGACACTGGAATCCAGGGGTGATGGAAGGCTTTGCAGGGAAATGCTGACGTCTCATCTGGCAGTATGTGAAGGCATCACTGTATGACCAGAACAGAAGGGATAGAAGCCTCGTATGCTTCTGGGAATGTTCAGCATCCCTCAGCTTTCTTGGGTGTTATTGCAAATGGGAGTTAATTATTGCTTTTTTACATAGGGGGTGTCAGGTCAAGGAGAAAGCATCAGTTTGAAGAGGCGATGTAACTGTAAAGGAACTTTCTTGATAAAATGTGAGGTTTGGCCCAGGTGTATGGCACTGTGTTACTGGGATTGCATCCCATCTGTCTGCAGGAGCAAAACAGAGATGAAAGGAAAACAGGAATGGAAGAAATTTCCACAAATCAGGAGGGAAAGGTGTTCTACTGTGTTAATGCTAGTGTCTCCAAATGAAAAAGGGACTGATGGAATGAGAAGAACCAAGAAGCACGTTTGGTTCAACAACTTCCATTCACATCATTTCCAGTGGTTATTTAGAGACTTAGCAAAACAGAAAAAAAAAAAAGAAGGGGGAAGAAGAAGATCTGTACCTTGTGGGGCTCTCCTCTGTTTATGTCTCCTATTCGTATCTGTAGATGTGAAAATGGAGGGCATAGCACAGGGCTTGTTTCTTTATTCTCTAAGGCAATACATGGTAATACTGTGCAGTAAGTATCTTGAGTGTTGGATTCTAAACAATTATCCATAAACACAGCAGATCTGATTAGCTTATGTATTTACCCTGATTGCATGCCTGACTTGAATATTTGCAAACAGTGCCTTATTTTGTGGAGAGTCTATGCAAATTGGACCTGCAGCTACAGGGAGCCACACTTGACGTACACTCAAACCTGTGTGGATTTGAAAATAAGGTCTCAAAGGGTACCGGAGCCTGAGCTTTTTGGGTTGGCTTCAGGGTTCCCCACTTAAGCACAGTTTCAGCAACGGTGTTACTGGGGATAAACTGTTAGATGCATTCTCAGTCTTCTTCAGGGATGTGAGATGTGGGTCAGCATAAATAAATAGCATGGTGCCAGCACTCTGAGATTACAGGGCATGGCAATGACTTCAGGTGCTCGGGCTCTGAAATGGGAGAGGCCAGGCTTGCAAAATGTCCTGGTACAGCCCCAGTTTGGTTTCAGTCAGCTCTGTGAGCACTGGGTGCTTACGGAAAGCACTTTGCATTCAGCGAGCGCTCAGCACGACGGTGTGCGGTTTGTTTTTGAGCAGCTAAGAGTGGCTTTAGAGATTTAAATTTTAAGAGGGTGTTGTGCCTATTTATTTATTTAATTTTGGGCAGAAATAGGTGTGACGGTGCTTCTGCTTTCAAACATTCCAGTCTTCAAAGCAGAAGTTGATAAAAGGGATCTTTCTGACTGCTAATAGAAGAGCACTCGTCAGAAATTGCCATTTTTGGCCAGATACACCAATGGAGCAGTGGGCAGTAACGTTCCCATTGCAGACAGATGAGGTTTGACATGGAGGAAGGGTTTCTTTTGGTTTTGTGTCATTTTCTTTTTCTTGTTAACCACACAGCAGATTTGGGACTCTCACAGAGCCTTTCTGCTGCCTCTCTTCTCTGTTTCTCATTTTGTCAAAGGAGAAAAATGAATCCCAGCGTGTTTTCTAGAAACTCCAATAGTGTTTTTATATTCTAGATTTTTATTTCCCTACTTCCAGTGAATGTAACAAATGACAGCGTGTAACCGGAGCAGCTGTTCTCTGCATTTCTTGGCAGTGTGCTCTGATGAGATACGCAGTAAGAATGAAGTAGCTGCAGGCATCTCAGTGAGCCCATGTTGTTAAAACACAGCTTGTGACCTGGGGTTTTGGTTCTGAACGTGGAATGTGGGGAAAAATGCTGATCTGGAAGGCAGGGTAAACAGCAAGGAACGTGTGTTGTTAAAAACCAACACACAAAGTAGTTGGCAAAGTTGTTGGAGCAGTTCAGCCTTCTGACTTTCAGTCTTGTGTTTTTAGGATCTCATTGACAAAATGACTAATAGTGCAGTCTTTATCAAACACAATTACAGCAATGCTTCCTTAATGTTTTGGGTGGCAAATGTTCAGTAAAATCTTGAAAGAGCAGGCCATGACATTTCTAATTCTCAGGCGCTATTTCCAATTTAAAACTCATAGGGAAAATTGTCAGTGGTTGGGGAAAGGAGAATTCTGAGCATCTCAGCTGCACACATAATTAAAAAGCAAGTTGATTTGCAGACTAAAGTAGTAGGAAGAGAAGTCAGTGTATTCTCGATTGATGAGAGTTTTACAGCGTTATTTGGTGTGGGGTTATGTGGTACTCTGTAGGTGCTGGGCCCTTGCTGTGGGCTGCGTAGTGCAGTGCAGGGAGGGGAGGTCACCAAGCATGCTTTGCTCGTTGCACTGCCAGGGAGTGCCTGAGCCATCTGCCCAAGAGGTGGGAGCTGGCACTGGCGCTCAGGAGCTAAAGAGGCTTTGGAAAGGAGGTGTTTGAGGGAGGGGAGAGGCCTTTGGCCTCAGCTGCATTCTGTCTTGAAGCTGTGCTGCCCATATGGCTTAGGGTGGAATGGCATGGAGGGTGAGAAACTGCACACAGGGCTTGTTGGGACAAATGGTTTACACTTGAGTTCACTCTCTTGTACCAAAGCAAATAAAACCATGATGTAACTCCTTTCCTGCAGAAATTGCACTTGTGCATGGTCAAGGAGTACATTCTGTCTCAGAGGGTAACCTGAAAGTCAACTGCATGTGTGTGCTTCCCCACGTCAACTCTTAATTTGGTCGCTGTCTTCCTGTGTTGTGTTCTGTTTCCCACTGTGCAAACATCACTGTTCAAAGGCTGTGTGGCAGGATCTGGTGTGCTTTTCAGTTGGATATGGCATCCCCACCTTCACAGCTGACACAGAGTTTGAGTCATGTAGCCCATGGATATGCCTGGGGATCACAGCTGTCCCAGACTTCCCTCTTTCTGCACTGCATTCACCAAGGGCCAGACGCTATGGAAGGATCCTAGAAATTGAGGAGACAGCAGGTTCAGGAGAACTGAGCGTTTTGAAGCACCATTCCAACAACTCTGTCATTGTGAAAAACCCACGGACGGTCTAGAGGATGTGGACAGTGCCTGCAGAGAATTGAAGTGTAGAATCAGAGAATCACCAGGGTTGGAAAAGACCTCTAAGATCACCAAGTCCAACCACCAGCACATCCCCACCATGCCCACTAACCGTGTCCCTCAGTGCCACATCTCCATGGTTATTGAACATCTCCAGGACGAGTGATTTCACCACCTCCCTGGGCAGCCTGTGCCAATGCCTCACCACTCTTTTGGAGAAGAAATGTTTCCTCTTAGAGTCTGTGAAAGTGCAGTTTCAGATATAATTTTCTTCTGACCACTTCCAGGGTTACAAAAGACCATAAATGGGTCAGCCCAAACTTCGAGGTAGAGAGAGAAATCGTGGCATTGTTTCCTTATTCTGTATGAGTACTGGTGAGACAGAACTGTTGTGAGGAAGTTCCGTTCAGCTGTGCTACCCTTCTTGTCTGTCAAAGCAGCCAGCACTGCAGTTTTAAGATGGTTTTCAGGAAGAAAAGATAAAATAAAACAAAAAATTGACCAGAATTCTCCTTAGGTGCCTTTCAGTAAGAAATTGCAGCTCGTGGCGTTTTGCACAGTACCATATTTGTAGTAATGGGTGCTTTTCTGTATTCTGCTTCAGTTTCCTACATCAGTTTTTAATTTATTTTTCTTTCACTCATGCTGTGCTGAATAAATGAAAGCTAAAAGCTGGAAAGATATGAAGTAAAGAAAACTAAACTGTCTCTGATAAAATGCAGCCAACAATATGTAATTTTCAGCACCATAATATATGTAGGCTGCTCCAAAAGCAATGCCCTCTATTTACTCCCCTGGGAATTACTATAGATACCAAGAGCACAATAATATCAGTGGATACAACAAATTCTCAGCTACAAAACACTATTTTTCAACATAGTTGCCACCATTAGCTATGCATTTTTGCCAGTGATGAACGAGAGATGTTGGTTTTTCATCTTCATAAGAGCAGGTGGTCAATTTTGTGTTGTTTTCTTTTTATCCTCATGGTGAATATATTATCTATGCCTGTTGAATTCTCTTAATATCAGAGGACTTGCAGAAAGTCACTGCTGTGTATTCTTAACTCGACTGTGTCTCATTTTGCAG
Seq C2 exon
ATAACATGCATGTGTCACTGGCTGAGGCTCTGGAGGTTCGGGGAGGGCCGCTGCAAGAAGAAGAGATATGGGCTATTTTGAATCAAAGCGCAGAGAGCCTTCAAGAGCTCTTCAGAAAGG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000011078:ENSGALT00000018050:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.026
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]